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DNA分子标记技术及其在羊育种中的应用研究
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作者 冯娜 曹凯鑫 +1 位作者 刘小东 李宜璇 《现代畜牧兽医》 2024年第7期80-84,共5页
羊是重要的经济动物,加快羊育种进程、促进羊产业的快速发展对整个畜牧业的发展至关重要。相比传统育种方法,DNA分子标记技术具有标记数量多、多态性高、遗传稳定等优势,其应用范围越来越广泛。文章介绍了DNA分子标记技术的发展情况,并... 羊是重要的经济动物,加快羊育种进程、促进羊产业的快速发展对整个畜牧业的发展至关重要。相比传统育种方法,DNA分子标记技术具有标记数量多、多态性高、遗传稳定等优势,其应用范围越来越广泛。文章介绍了DNA分子标记技术的发展情况,并概述其在羊生长性能、产肉性能和繁殖性能等方面选育中的应用,以期为我国羊育种改良研究及DNA分子标记技术在羊育种方面的应用提供一定参考。 展开更多
关键词 dna分子标记技术 育种 生长性状
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DNA甲基化调控园艺植物生长发育及非生物胁迫应答研究进展 被引量:1
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作者 池小娜 张欢欢 +2 位作者 顾文媛 张兴民 王玉萍 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1215-1222,共8页
DNA甲基化作为表观遗传调控的重要机制之一,通常发生在植物胞嘧啶碱基中,包含CG、CHG、CHH三种类型。主要影响染色质结构和基因的转录效率,在植物细胞基因表达调控、基因组稳定性维持等方面起重要作用。非生物胁迫影响植物的生长发育和... DNA甲基化作为表观遗传调控的重要机制之一,通常发生在植物胞嘧啶碱基中,包含CG、CHG、CHH三种类型。主要影响染色质结构和基因的转录效率,在植物细胞基因表达调控、基因组稳定性维持等方面起重要作用。非生物胁迫影响植物的生长发育和繁殖最终导致植物死亡。基于已有研究发现,DNA甲基化可诱导非生物胁迫下植物的表型改变。DNA甲基化水平在植物非生物胁迫生长过程存在的变化机制受到甲基化酶和去甲基化酶的影响。甲基化状态上调(启动)或下调(关闭)基因表达以确保自身适应生长及发育,从而使植物在一定程度上适应和抵抗逆境伤害。这些信号转导通路可以引起植物形态、生理和生化的改变以适应逆境。本文对DNA甲基化功能及其在园艺植物的生长发育与非生物胁迫响应方面的研究进行了分析与总结,探讨了DNA甲基化在园艺植物表观遗传研究中存在的问题及展望,为园艺植物遗传改良及抗逆分子机理研究提供参考。 展开更多
关键词 dna甲基化 非生物胁迫 生长发育 园艺植物 表观遗传调控
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Effects of Nerve Growth Factor on Proliferation and DNA Synthesis of Cultured Human Fetal Retinal Pigment Epithelium Cells 被引量:2
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作者 LiWS WenJ 《Eye Science》 CAS 2002年第1X期45-48,49,共5页
Objective: To investigate the effects of nerve growth factor(NGF)on proliferation and DNAthesis of cultured human fetal retinal pigment epithelium (RPE)cells in vitro.Methods: Primary culture and subculture of human f... Objective: To investigate the effects of nerve growth factor(NGF)on proliferation and DNAthesis of cultured human fetal retinal pigment epithelium (RPE)cells in vitro.Methods: Primary culture and subculture of human fetal retinal pigment epithelium cellswere established in vitro first. Cultured RPE cells were treated with NGF by variousconcentrations 0μg/L, 50μg/L, 100μg/L, 200μg/L and 300μg/L(final concentration)for 48 hs.After 48 hs, cells proliferation was measured with methyl thiazolyl tetrazolium(MTT)assay method and the amount of DNA was determined by the absorbance at 280nm of nucleic acid & protein analysis.Results: The A values of 100 μg/L, 200 μg/L, 300 μg/L NGF was(0. 213 7 ± 0. 23 3),(0. 218 8 ±0. 018 1), (0. 232 2 ±0. 016 4) as compared with(0. 189 7 ±0. 015 2) of Avalue of 0 μg/L NGF respectively, q value was 3.63,4.40, 6. 42 and P value was0. 015, 0. 000, 0. 000(q-test). The DNA concentrations of 100 μg/L, 200 μg/L, 300μg/L and 400 μg/L NGF was (981. 220 4 ± 123.535 7), (1 375. 848 4 ±244. 471 8),(1 658.707 1 ± 176. 938 1), (2 353.086 3 ±609. 906 4) μg/ml as compared with(666. 818 8 ± 141. 330 2) μg/ml of DNA concentration of 0 μg/L NGF respectively, qvalue was 3.63,8.20,11.47,19.46, P value was 0. 024,0. 000,0. 000,0. 000 (q-test).Conclusion: The data suggested that NGF could stimulate the proliferation and DNAsynthesis of cultured of hRPE cells in vitro in a dose-dependent manner. 展开更多
关键词 眼色素上皮 神经生长因子 增殖 dna合成
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HBsAg/HBV DNA值与乙型肝炎患者TGF-β1、Tim-3水平的关系 被引量:1
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作者 姚博方 高芳芳 《医学临床研究》 CAS 2023年第2期234-236,240,共4页
【目的】探讨乙型肝炎患者乙型肝炎表面抗原(HBsAg)/乙型肝炎病毒(HBV)DNA值与转化生长因子-β1(TGF-β1)、T淋巴细胞免疫球蛋白黏蛋白分子3(Tim-3)水平的关系。【方法】两院收治的70例乙型肝炎患者,依据病情严重程度将患者分为轻度HBV... 【目的】探讨乙型肝炎患者乙型肝炎表面抗原(HBsAg)/乙型肝炎病毒(HBV)DNA值与转化生长因子-β1(TGF-β1)、T淋巴细胞免疫球蛋白黏蛋白分子3(Tim-3)水平的关系。【方法】两院收治的70例乙型肝炎患者,依据病情严重程度将患者分为轻度HBV组(22例)、中度HBV组(30例)、重度HBV组(18例),另选同期体检的健康志愿者30例为对照组。收集所有研究对象的临床血生化资料,比较各组肝功能指标及HBsAg/HBV DNA、TGF-β1、Tim-3水平,采用Pearson相关分析HBsAg/HBV DNA值与乙型肝炎患者TGF-β1、Tim-3水平的关系。【结果】不同病情严重程度的HBV患者及对照组间血清谷丙转氨酸(ALT)、谷草转氨酸(AST)、总胆红素(TBIL)、血小板计数(PLT)水平比较,均为对照组<轻度HBV组<中度HBV组<重度HBV组,且各组比较差异均有统计学意义(均P<0.05)。各组HBsAg/HBV DNA值比较,轻度HBV组>中度HBV组>重度HBV组(均P<0.05);各组TGF-β1、Tim-3水平比较,对照组<轻度HBV组<中度HBV组<重度HBV组(均P<0.05)。HBsAg/HBV DNA比值与乙型肝炎患者TGF-β1、Tim-3水平呈显著负相关(P<0.05)。【结论】乙型肝炎患者HBsAg/HBV DNA值与TGF-β1、Tim-3水平呈显著负相关。 展开更多
关键词 乙型肝炎 乙型肝炎表面抗原 dna 病毒 转化生长因子Β1
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Influence of edaravone on growth arrest and DNA damage-inducible protein 34 expression following focal cerebral ischemia-reperfusion in rats
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作者 Wei Wang Xiao-Mei Wu +3 位作者 Bo Jiang Chun-Yu Wang Hai-Nan Zhang Xiang-Min Shen 《Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine》 SCIE CAS 2014年第9期714-717,共4页
Objective:To investigate the influence of edaravone on the expression of growth arrest and DNA damage-inducible protein 34(GADD34).Methods:A total of 108 healthy male Sprague-Dawlcy rats were randomly divided into sha... Objective:To investigate the influence of edaravone on the expression of growth arrest and DNA damage-inducible protein 34(GADD34).Methods:A total of 108 healthy male Sprague-Dawlcy rats were randomly divided into sham operation group,model group and edaravone.group(36 cases for each group).Transient focal cerebral ischemia was induced by middle cerebral artery occlusion for 2 h followed by reperfusion in Sprague-Dawlev rats.Then.GAOD34 expression was measured with immunohistochemistry at different time-points after reperfusion in the peri-infarct regions of all rats.Results:The GADD34 expression was detected in the peri-infaret regions of rats 1 h after reperfusion,which reached its peak 24 h after reperfusion.And edaravone could significantly down-regulate the GAOD34 expression.Conclusions:Edaravon could down-regulate GADD34 expression,which suggests that edaravone may exert an important function in inhibiting endoplasmic reticulum stress reaction by scavenging free radicals in the upper stream. 展开更多
关键词 EDARAVONE Cerebral ISCHEMIA-REPERFUSION growth ARREST and dna damage-inducible PROTEIN 34
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Effects of Feeding Time on the Growth Performance and Variation of RNA/DNA Ratio of the Chinese Soft-shelled Turtle, Pelodiscus sinensis
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作者 Yingguang jI Haiyan LIU +1 位作者 Zhe SONG Zhencai YANG 《Asian Herpetological Research》 SCIE CSCD 2016年第4期271-277,共7页
The present study was to investigate the effects of feeding time on growth of the Chinese soft-shelled turtle. The experiment was carried out with a photoperiod of 12L (light): 12D (dark) with lights on at 06:00... The present study was to investigate the effects of feeding time on growth of the Chinese soft-shelled turtle. The experiment was carried out with a photoperiod of 12L (light): 12D (dark) with lights on at 06:00 and off at 18:00. Turtles were maintained at a temperature of 32 - 0.2 ℃ in tanks throughout the length of the experiment. The turtles in group 1 to group 6 were fed respectively at 00:00, 04:00, 08:00, 12:00, 16:00 and 20:00 with 60 turtles each (Initial body weight 88.27 - 0.09 g). Acrophases of postprandial RNA/DNA ratio in liver in each group was shown between 5h and 7h after feeding. A positive linear correlation could be seen between specific growth rate (SGR) and RNA/ DNA:SGR=t.1586RNA/DNA-0.7097 (r = 0.9328, P = 0.0066). The results indicated that the values at the acrophases of about 6h after feeding might be used as an instantaneous growth index in the Chinese soft-shelled turtle. The turtles in group 1 grew better than group 3, group 4, group 5, group 6, because they ate more, but they ate more and grew slower than group 2, whose feed conversion rate was also higher. Meanwhile, the SGR and feeding rate of turtles fed at 12:00 were the lowest from the six groups (P 〈 0.05). Turtles fed in group 1, group 2 and group 6 developed more heavy final body weight (FBW), higher feeding rate and SGR than the other three groups. This probably suggested that turtles fed in scotophase grew better than that fed at photophase in total. 展开更多
关键词 Feeding time growth performance Pelodiscus sinensis RNA/dna ratio
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数字PCR检测循环肿瘤DNA中HER2基因扩增对胃癌的预后评估 被引量:1
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作者 刘厚聪 周和凯 +2 位作者 王纪东 付晓红 杜冀晖 《分子诊断与治疗杂志》 2023年第3期368-372,共5页
目的探讨基于数字PCR(d PCR)检测循环肿瘤DNA(ctDNA)中人类表皮生长因子受体2(HER2)基因扩增在胃癌进展监测及预后评估的临床应用价值。方法选取2018年11月至2020年12月华中科技大学协和深圳医院收治的60例胃癌患者为病例组,以同期20名... 目的探讨基于数字PCR(d PCR)检测循环肿瘤DNA(ctDNA)中人类表皮生长因子受体2(HER2)基因扩增在胃癌进展监测及预后评估的临床应用价值。方法选取2018年11月至2020年12月华中科技大学协和深圳医院收治的60例胃癌患者为病例组,以同期20名健康体检者为对照组。建立dPCR技术方法检测胃癌患者ctDNA中HER2基因扩增及阳性阈值,评价其与免疫组织化学(IHC)联合荧光原位杂交技术(FISH)病理诊断HER2表达结果一致性,分析胃癌患者术前ctDNA中HER2基因扩增与临床病理特征的关系。同时选择24例Ⅲ、Ⅳ期的进展期胃癌患者纳入随访研究,分析术后监测ctDNA中HER2基因扩增与无进展生存时间的关系。结果HER2基因扩增比值的阳性阈值设为1.40,dPCR技术定量检测ctDNA中HER2基因扩增的敏感度、特异性分别达到0.90、0.94;胃癌患者dPCR检测HER2基因扩增、IHC与FISH联合检测HER2表达阳性率分别为20%(12/60)、16.7%(10/60),两种方法检测结果符合率一致性较好(k=0.778,P<0.01)。dPCR检测胃癌患者术前ctDNA的HER2基因扩增阳性患者的肿瘤组织高-中分化、远处转移比例明显高于HER2阴性者,差异有统计学意义(P<0.05)。进展转移组患者ctDNA中HER2基因扩增比值为(1.88±0.76),明显高于无进展转移组的(1.14±0.42),差异有统计学意义(P<0.05)。HER2基因扩增阳性患者的中位无进展生存时间(PFS)为8.5月,明显低于HER2阴性患者的18.9月,风险比率(hazard ratio,HR)为0.321(95%CI:0.12,0.90),差异有统计学意义(P<0.05)。结论利用dPCR技术不仅可以定量检测ctDNA中HER2基因扩增比值水平,还适用于晚期或进展转移胃癌患者术后监测HER2基因扩增变化,对于胃癌进展及预后评估具有一定临床应用意义。 展开更多
关键词 数字PCR 人类表皮生长因子受体2 循环肿瘤dna 胃癌
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BlueScreen HC在食品接触材料多组分迁移物遗传毒性检测中的适用性
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作者 李敏 林珺 +2 位作者 吴炜亮 隋海霞 杨杏芬 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期796-806,共11页
目的探讨基于人生长阻滞和DNA损伤诱导45α(GADD45α)基因的遗传毒性高通量筛选体系BlueScreen HC(BSHC)在食品接触材料多组分迁移物遗传毒性检测中的适用性。方法将人GADD45α基因开放阅读框上游2000 bp序列作为启动子,采用分子克隆构... 目的探讨基于人生长阻滞和DNA损伤诱导45α(GADD45α)基因的遗传毒性高通量筛选体系BlueScreen HC(BSHC)在食品接触材料多组分迁移物遗传毒性检测中的适用性。方法将人GADD45α基因开放阅读框上游2000 bp序列作为启动子,采用分子克隆构建入嘌呤霉素和高斯荧光素酶(Gluc)双标记的慢病毒质粒pEZX-LvPG04中,并用慢病毒感染人淋巴母细胞TK6,获得稳转细胞系TK6-Gluc。以甲基磺酸甲酯(MMS,终浓度0,1.56,3.13,6.25,12.5,25.0和50.0 mg·L^(-1))为非代谢活化条件下的阳性物质,环磷酰胺(CTX,终浓度0,0.78,1.56,3.13,6.25,12.5和25.0 mg·L^(-1))为代谢活化条件下的阳性物质,二甲基亚砜(DMSO,终浓度0,0.35,0.69,1.38,2.75,5.5和11.0 g·L^(-1))为阴性物质,分别在非活化和活化条件下验证构建的BSHC。将改性淀粉/聚对苯二甲酸-己二酸丁二醇酯(MS/PBAT)作为研究对象,采用体积分数4%乙酸及10%,20%,50%和95%乙醇作为食品模拟物,40℃、浸泡24 h获得5份MS/PBAT多组分迁移物,并用DMSO作为溶剂复溶得到5份多组分迁移溶液作为受试物。以终浓度为0,0.38,0.76,1.53,3.05,6.10和12.20 g·L^(-1)的不同受试物在活化和非活化2种条件下处理TK6-Gluc细胞。非活化条件下作用48 h;活化条件下,在添加体积分数1%大鼠肝S9代谢活化系统的同时,作用3 h后更换新鲜培养基,继续培养至48 h。处理结束后,采用CCK-8法检测细胞活性,同时采用Secrete-Pair^(TM)Gaussia Luciferase Assay试剂盒检测培养基中Gluc化学发光强度。另外,采用终浓度为3.05和12.20 g·L^(-1)的不同受试物对鼠伤寒沙门氏菌TA98和TA100进行微量波动Ames试验以及对体外培养的中国仓鼠肺细胞CHL进行体外哺乳细胞染色体畸变试验,检测受试物的致突变和染色体畸变作用,与BSHC遗传毒性结果进行对比分析。结果采用BSHC法,将相对细胞活性80%定义为生长抑制的最低有效浓度阈值,实验组相对细胞活性低于溶剂对照组的80%提示化合物引起细胞生长抑制。将实验组相对细胞活性低于溶剂对照组的30%定义为出现细胞毒性,此时将不考虑遗传毒性。在无细胞毒性前提下,活化条件下实验组Gluc化学发光强度大于溶剂对照组的1.8倍时,非活化条件下实验组Gluc化学发光强度大于溶剂对照组的1.5倍时,判定为遗传毒性阳性;反之认为无遗传毒性。与溶剂对照组相比,阴性物质DMSO所有浓度均未产生遗传毒性。非活化条件下,MMS 12.5,25.0和50.0 mg·L^(-1)产生遗传毒性;活化条件下,CTX 6.25,12.5和25.0 mg·L^(-1)产生遗传毒性。非活化条件下,MS/PBAT的95%乙醇迁移物6.10和12.20 g·L^(-1)和MS/PBAT的50%乙醇迁移物12.20 g·L^(-1)组细胞生长抑制,所有处理组均未观察到相对细胞活性低于30%的细胞毒性,且未观察到Gluc高表达,表明5种MS/PBAT多组分迁移物在非活化条件下均未产生遗传毒性。活化条件下,MS/PBAT的95%乙醇迁移物12.20 g·L^(-1)和MS/PBAT的4%乙酸迁移物6.10,12.20 g·L^(-1)组细胞表现出显著的生长抑制,所有处理组均未观察到相对细胞活性低于30%的细胞毒性,且未观察到Gluc高表达,表明5种MS/PBAT多组分迁移物在活化条件下均未产生遗传毒性。微量波动Ames试验结果表明,在活化和非活化条件下,MS/PBAT的5种多组分迁移物3.05和12.20 g·L^(-1)作用于TA98和TA1002种菌株,致突变阳性孔的数量均不超过溶剂对照组的2倍,即均未产生致突变作用;作用于CHL细胞后的细胞染色体畸变率亦均无显著变化。结论初步建立了基于GADD45α基因的遗传毒性高通量筛选方法BSHC,提示可用于食品接触材料多组分迁移物的体外遗传毒性评价,但仍需进一步探索其最低有效浓度,并应用更多种类混合物进行进一步验证。 展开更多
关键词 食品接触材料 多组分迁移物 人生长阻滞和dna损伤诱导45α基因 遗传毒性评价
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西镇牛微卫星DNA与生长发育性状的关联性分析 被引量:4
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作者 王斌 昝林森 +3 位作者 杜宝民 余横伟 刘红 陈兴平 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2017年第3期7-16,共10页
【目的】分析12个微卫星DNA与西镇牛长发育性状的关联性,为西镇牛品种资源保护和开发利用提供理论依据。【方法】测定西镇牛的体高、体长、胸围、管围、腰角宽和体质量。利用12对微卫星引物,采用PCR扩增和非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳技术,... 【目的】分析12个微卫星DNA与西镇牛长发育性状的关联性,为西镇牛品种资源保护和开发利用提供理论依据。【方法】测定西镇牛的体高、体长、胸围、管围、腰角宽和体质量。利用12对微卫星引物,采用PCR扩增和非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳技术,对48头西镇牛母牛进行了遗传多样性检测,并统计分析各位点各种基因型群体与体尺性状之间的效应关系。【结果】12个微卫星位点各基因型与西镇牛生长发育性状具有关联性。IDVGA2、BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILSTS005、BM1824位点与体高,BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILSTS005、ETH10、DAVG44位点与体长,IDVGA2、DVGA55、HEL9、ILST093、IDVGA27、BM1824位点与胸围,IDVGA2、ETH225、DAVG44位点与管围,BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、BM1905、ILSTS005、ILST093、ETH10位点与腰角宽,IDVGA2、BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILST093、BM1824位点与体质量具有显著或极显著的效应关系。【结论】筛选出了对西镇牛生长发育性状具有正效应的等位基因45个,具有负效应的等位基因40个,可用于指导西镇牛育种实践。 展开更多
关键词 西镇牛 微卫星dna 体尺性状
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砷化物对HL-60细胞生长及基因组DNA甲基化的影响 被引量:7
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作者 卢光明 崔旭 +4 位作者 黄福南 赵军平 戚其平 姚孝远 丛涛 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期161-163,共3页
目的 研究 Na As O2 和 Na3As O4对 HL- 6 0细胞生长及基因组 DNA甲基化的影响。方法 采用细胞培养和限制性内切酶解分析技术观察分析细胞生长及细胞基因组 DNA甲基化水平。结果  1两种无机砷化物对 HL- 6 0细胞生长具有抑制作用 ,... 目的 研究 Na As O2 和 Na3As O4对 HL- 6 0细胞生长及基因组 DNA甲基化的影响。方法 采用细胞培养和限制性内切酶解分析技术观察分析细胞生长及细胞基因组 DNA甲基化水平。结果  1两种无机砷化物对 HL- 6 0细胞生长具有抑制作用 ,特别是高浓度 Na As O2 (2、10 μmol/ L)和 Na3As O4(10 0、30 0 μmol/ L)可明显地抑制 HL- 6 0细胞的生长 (P <0 .0 1)。2随着砷化物浓度的增加 ,Msp 酶解基因组 DNA片段的分子量变化不大 ,但 Hpa 酶解片段的分子量逐渐变大。结论 提示基因组 DNA中 CCGG核苷酸内侧 C的甲基化总的水平有上升趋势。 展开更多
关键词 砷化物 细胞生长 脱氧核糖核酸甲基化 dna 毒性 HL-60细胞 致癌物
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日粮蛋氨酸和赖氨酸水平对肉鸡生长性能及肌肉和肝脏组织DNA甲基化含量的影响 被引量:4
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作者 宗凯 刘国庆 +3 位作者 曹树青 钱晓勇 张黎利 汪洋 《粮食与饲料工业》 CAS 北大核心 2010年第2期33-37,共5页
研究日粮中添加不同氨基酸水平对肉鸡生长性能和不同日龄阶段肉鸡各组织中DNA甲基化含量的影响。结果表明:①日粮中添加不同赖氨酸和蛋氨酸水平,显著影响了肉仔鸡的生长和屠宰性能;②肉鸡肌肉和肝脏组织DNA甲基化含量随日龄增加均成降... 研究日粮中添加不同氨基酸水平对肉鸡生长性能和不同日龄阶段肉鸡各组织中DNA甲基化含量的影响。结果表明:①日粮中添加不同赖氨酸和蛋氨酸水平,显著影响了肉仔鸡的生长和屠宰性能;②肉鸡肌肉和肝脏组织DNA甲基化含量随日龄增加均成降低趋势;55日龄肉鸡肌肉和肝脏组织中,蛋氨酸过量组DNA甲基化含量均大于蛋氨酸缺乏组,且两两差异显著;③肉鸡肌肉甲基化含量与55日龄肉鸡总活体重、胴体重成显著正相关,与屠宰率、半净膛率和全净膛率成负相关;肉鸡肝脏甲基化含量与55日龄肉鸡总活体重、半净膛重、全净膛重成显著正相关,与屠宰率和半净膛率成负相关。 展开更多
关键词 蛋氨酸 赖氨酸 甲基化 生长性能 肉鸡
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胶质母细胞瘤FGFR3-TACC3融合基因介导丙酮酸激酶M2入核促进DNA损伤修复基础研究 被引量:1
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作者 任修德 李涛 +3 位作者 范吉康 王希森 贾晓丹 杨学军 《中国现代神经疾病杂志》 CAS 北大核心 2023年第8期745-757,共13页
目的探讨胶质母细胞瘤FGFR3-TACC3(F3-T3)融合基因介导丙酮酸激酶M2(PKM2)入核激活DNA损伤修复致替莫唑胺(TMZ)耐药的作用机制。方法慢病毒转染构建稳定表达F3-T3融合基因和空载体的胶质母细胞瘤细胞系U87MG和U251MG,构建稳定表达F3-T3... 目的探讨胶质母细胞瘤FGFR3-TACC3(F3-T3)融合基因介导丙酮酸激酶M2(PKM2)入核激活DNA损伤修复致替莫唑胺(TMZ)耐药的作用机制。方法慢病毒转染构建稳定表达F3-T3融合基因和空载体的胶质母细胞瘤细胞系U87MG和U251MG,构建稳定表达F3-T3融合基因的胶质母细胞瘤裸鼠模型,小动物活体成像系统观察荷瘤鼠肿瘤荧光信号强度;采用生物信息学分析基因芯片转录组数据分析F3-T3融合基因的生物学功能,并分析肿瘤基因组学图谱计划(TCGA)数据库中胶质瘤患者生存期与PKM2基因表达的关系;瞬时转染小干扰RNA(siRNA)敲低PKM2基因表达;CCK-8细胞增殖实验观察经梯度浓度替莫唑胺处理后、转染siRNA后、替莫唑胺联合PKM2抑制剂Compound 3k处理后U87MG和U251MG细胞增殖活性;提取核质蛋白并观察经替莫唑胺处理后总蛋白提取物、胞质提取物和胞核提取物PKM2蛋白表达情况;Western blotting法检测稳定表达F3-T3融合基因的U87MG和U251MG细胞PKM2蛋白相对表达量、磷酸化组蛋白H2AX(p-H2AX)相对表达量、siRNA敲低PKM2基因p-H2AX相对表达量。结果(1)CCK-8细胞增殖实验显示,经替莫唑胺640、320、160、80、40μmol/L处理后F3-T3转染组的U87MG细胞存活率均高于空载体转染组(P=0.000,0.000,0.000,0.004,0.010),经替莫唑胺640、320、160、80、40、20、5μmol/L处理后F3-T3转染组的U251MG细胞存活率亦均高于空载体转染组(P=0.000,0.000,0.000,0.000,0.002,0.001,0.002);然而,经替莫唑胺640、320、160、80、40、20、10、5和2.50μmol/L处理后si-PKM2-1009转染组的U87MG细胞存活率均低于F3-T3转染组(P=0.000,0.000,0.000,0.012,0.006,0.030,0.000,0.007,0.025),经替莫唑胺640、320、160、80、40、20、5μmol/L处理后si-PKM2-1377转染组U251MG细胞存活率亦低于F3-T3转染组(P=0.000,0.000,0.002,0.000,0.002,0.048,0.042);经替莫唑胺640、320、160、80、40、20μmol/L处理后TMZ+Compound 3k组U87MG细胞存活率低于TMZ组(P=0.000,0.000,0.000,0.000,0.001,0.002),经高浓度(640、320、160、80、40μmol/L)替莫唑胺处理后TMZ+Compound 3k组U251MG细胞存活率亦低于TMZ组(P=0.000,0.000,0.000,0.000,0.003),而经低浓度(10、5、2.50μmol/L)替莫唑胺处理后TMZ+Compound 3k组U251MG细胞存活率高于TMZ组(P=0.000,0.000,0.006)。(2)胶质母细胞瘤动物模型显示,荷瘤鼠存在替莫唑胺耐药。(3)生物信息学分析,F3-T3融合蛋白的生物学功能显著富集于DNA修复通路(P=0.000)。TCGA数据库中胶质瘤患者PKM2基因高表达组生存率和总生存期均低于低表达组(P<0.05)。(4)Western blotting法显示,经替莫唑胺处理48 h再更换培养基后24、36和48 h,F3-T3转染组U87MG(P=0.000,0.000,0.004)和U251MG(P=0.000,0.007,0.005)细胞p-H2AX蛋白相对表达量均低于空载体转染组;经替莫唑胺处理后F3-T3转染组U87MG和U251MG细胞均可见明显的PKM2入核,而空载体转染组细胞均未见这一现象;si-PKM2-1009和si-PKM2-1377分别敲低U87MG(P=0.000,0.001,0.006)和U251MG(P=0.000,0.000,0.000)细胞PKM2基因表达的效果最显著。结论F3-T3融合基因可促进PKM2入核,激活DNA损伤修复相关通路,进而介导胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药,不同细胞株对替莫唑胺的耐药浓度不一致,PKM2抑制剂可逆转这种耐药。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 受体 成纤维细胞生长因子 3型 基因融合 丙酮酸激酶 dna修复 替莫唑胺 抗药性 肿瘤 细胞增殖 免疫印迹法 肿瘤细胞 培养的 疾病模型 动物
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镧和铈对两种细菌生长的影响及胞内DNA的荧光光谱分析 被引量:11
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作者 柴瑞娟 王玉良 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1829-1833,共5页
为了研究镧,铈对细菌生长及核酸的影响,用光电比浊法测定了镧,铈和钙调蛋白抑制剂(氯丙嗪)存在时两种细菌的生长曲线,并用荧光光谱法研究了镧,铈对小牛胸腺DNA和细菌胞内DNA结构的影响。结果显示适当浓度(200mg.L-1)稀土元素可以促进细... 为了研究镧,铈对细菌生长及核酸的影响,用光电比浊法测定了镧,铈和钙调蛋白抑制剂(氯丙嗪)存在时两种细菌的生长曲线,并用荧光光谱法研究了镧,铈对小牛胸腺DNA和细菌胞内DNA结构的影响。结果显示适当浓度(200mg.L-1)稀土元素可以促进细菌的生长和繁殖,比对照提前进入对数期,扫描电镜观察也显示镧,铈可以促进枯草芽孢杆菌个体的生长,菌体体积比对照更大,但促进繁殖的作用会被氯丙嗪抑制,表明镧,铈促进细菌生长的机理可能与钙调蛋白的功能有关;荧光光谱分析显示镧,铈会使小牛胸腺DNA荧光增强,镧、铈浓度分别为5和10mg.L-1时荧光增强作用最大;但镧使细菌胞内DNA荧光猝灭,铈使其荧光增强,结论认为镧,铈对核酸的影响远比想象的要复杂。 展开更多
关键词 细菌 稀土元素 生长 核酸 荧光光谱分析
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铜、铅、锌对黄芪生长及其DNA损伤的影响 被引量:11
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作者 姜志艳 王建英 杨雪梅 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期205-209,共5页
【目的】探究重金属铜、铅、锌胁迫对药用植物黄芪植物种子萌发、生根、叶片叶绿素含量和DNA损伤的影响,为黄芪无公害栽培和药材基地环境评价提供理论依据。【方法】以内蒙特色药用植物黄芪为材料,设置不同浓度重金属(0~300mg/L)单一... 【目的】探究重金属铜、铅、锌胁迫对药用植物黄芪植物种子萌发、生根、叶片叶绿素含量和DNA损伤的影响,为黄芪无公害栽培和药材基地环境评价提供理论依据。【方法】以内蒙特色药用植物黄芪为材料,设置不同浓度重金属(0~300mg/L)单一和复合污染(Zn200/Cu200、Zn200/Pb200、Pb200/Cu200mg/L),观察黄芪生长状况及其叶片叶绿素含量的变化,并利用单细胞凝胶电泳技术检测黄芪DNA损伤情况。【结果】在0~100mg/L时,Cu2+、Pb2+、Zn2+单一胁迫可促进黄芪种子萌发,大于100mg/L时则抑制种子萌发。随着黄芪培养时间的延长和重金属离子处理浓度的升高,Pb2+处理的黄芪根生长受抑制逐渐增强,黄芪根长变短;Cu2+、Zn2+处理的黄芪根长呈先升高后降低的趋势,在不同时期内两者最长根长出现的处理浓度分别为60和100mg/L。3种重金属Cu2+、Pb2+、Zn2+单一处理后,黄芪总叶绿素含量呈先增后降的变化趋势,当Cu2+处理浓度高于100mg/L、Zn2+处理浓度高于200mg/L、Pb2+处理浓度高于60mg/L时,黄芪叶片叶绿素含量最高,随后不断降低。Cu/Zn、Zn/Pb复合胁迫,会降低彼此的毒害作用;Cu与Zn复合胁迫,对彼此毒害作用影响不大。随着重金属Zn2+、Pb2+、Zn2+浓度的增加,对黄芪DNA的伤害程度不断加大,Pb2+处理造成的损伤最大,Cu2+处理次之,Zn2+处理最小。【结论】一定含量的Pb2+、Cu2+、Zn2+对药用植物黄芪种子萌发、生根、叶绿素含量具有一定毒害作用,且随重金属浓度的增加,毒害程度加深。3种重金属离子的毒性大小排序为Pb2+>Cu2+>Zn2+。 展开更多
关键词 黄芪 重金属 生长状况 dna损伤 彗星测试
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植物DNA的甲基化及其生物学功能 被引量:3
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作者 孟凡荣 司志飞 刘昊英 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第36期11757-11757,11759,共2页
DNA甲基化是生物体内普遍存在的一种基因修饰现象,在生物体内发挥着重要的生物学功能。大量研究表明,DNA甲基化不仅可以遗传,而且存在特定的动态变化模式。综述了植物DNA甲基化的特点、模式以及它们与植物生长、发育和基因表达调控的关系。
关键词 植物 dna甲基化 生长发育
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DNA甲基化在植物生长发育中的作用 被引量:7
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作者 黑淑梅 慕明涛 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第21期6368-6369,共2页
DNA甲基化是植物体细胞基因组中一种常见的DNA共价修饰方式。在植物的正常生长发育中,DNA甲基化与外来基因的防御、内源基因表达的调节及转基因沉默等之间有着极大的关系。
关键词 植物 dna甲基化 生长发育 基因沉默
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日本沼虾体内RNA/DNA比值与其生长关系的研究 被引量:12
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作者 刘存歧 沈会涛 吴玲玲 《河北大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2006年第5期524-528,共5页
测定了白洋淀野生日本沼虾不同生长阶段的体长、体重以及肝胰腺和肌肉中RNA/DNA比值,通过回归分析拟合得到体重与体长、RNA/DNA比值与体长关系的数学方程.结果显示,体重与体长的关系可用幂方程(W=0.004 5L3.985 9,R2=0.98,P<0.01)来... 测定了白洋淀野生日本沼虾不同生长阶段的体长、体重以及肝胰腺和肌肉中RNA/DNA比值,通过回归分析拟合得到体重与体长、RNA/DNA比值与体长关系的数学方程.结果显示,体重与体长的关系可用幂方程(W=0.004 5L3.985 9,R2=0.98,P<0.01)来表示,而肝胰腺和肌肉中RNA/DNA比值与体长的关系则为指数式方程(RL=-0.225 3e0.74L,R2=0.968,P<0.01;RM=0.051 2e1.195 1L,R2=0.974,P<0.01),与体重关系为RL=1.592 4e0.821 5w(R2=0.969 9,P<0.01)和RM=1.198 9e1.330 5w(R2=0.981 3,P<0.01).RNA/DNA比值能较好指示日本沼虾的生长状况,为日本沼虾的生物学研究提供了重要的参考指标. 展开更多
关键词 日本沼虾 生长 RNA/dna比值
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铝、镉对小麦幼苗生长的影响及其DNA损伤效应研究 被引量:20
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作者 马引利 佘小平 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期729-735,共7页
本研究旨在探索Al3+、Cd2+对小麦幼苗生长的影响及其DNA损伤效应。结果表明:(1)所试浓度Al3+、 Cd2+不仅不同程度抑制2d龄和12d龄幼苗根系和地上部分的生长,而且表现明显的DNA损伤效应;(2)除Al3+ 对幼苗地上部分鲜重、干重的影响及Cd2+... 本研究旨在探索Al3+、Cd2+对小麦幼苗生长的影响及其DNA损伤效应。结果表明:(1)所试浓度Al3+、 Cd2+不仅不同程度抑制2d龄和12d龄幼苗根系和地上部分的生长,而且表现明显的DNA损伤效应;(2)除Al3+ 对幼苗地上部分鲜重、干重的影响及Cd2+对幼苗根系生长速率的影响外,其余生长指标显示2 d龄幼苗比12 d龄幼苗对Al3+、Cd2+更敏感,这与导致2d龄幼苗DNA损伤的Al3+、Cd2+浓度明显低于12 d龄幼苗的结果一致。研究结果表明,DNA损伤可能是Al3+、Cd2+抑制2d龄和12d龄小麦幼苗生长的重要原因之一。 展开更多
关键词 AL^3+ CD^2+ 小麦幼苗 生长 dna损伤
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玫瑰冠鸡微卫星DNA标记与生长性状相关性分析 被引量:3
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作者 李应生 廖和荣 +1 位作者 张成先 赵艳 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第17期5067-5068,共2页
选用5对微卫星标记对玫瑰冠鸡进行多态性扩增,计算出这些微卫星标记座位的等位基因频率、多态信息含量、群体杂合度;通过标记多态性与生长性状的最小二乘法分析和多重比较,进行了微卫星位点与各生长性状间的相关分析。结果表明,5对微卫... 选用5对微卫星标记对玫瑰冠鸡进行多态性扩增,计算出这些微卫星标记座位的等位基因频率、多态信息含量、群体杂合度;通过标记多态性与生长性状的最小二乘法分析和多重比较,进行了微卫星位点与各生长性状间的相关分析。结果表明,5对微卫星标记平均等位基因为5.6个,最高为7个,最低为4个。微卫星位点ADL176的基因型188-196、200-200分别对12周龄的巨型玫瑰冠鸡的体斜长和胸宽有显著影响(P<0.05)。 展开更多
关键词 玫瑰冠鸡 微卫星dna标记 生长性状 相关分析
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海水养殖与低盐养殖凡纳滨对虾生长性能、酶活及RNA/DNA比值的差异 被引量:24
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作者 梁萌青 王士稳 +1 位作者 王家林 常青 《海洋水产研究》 CSCD 北大核心 2008年第4期69-73,共5页
以初始体重为4.04±0.14 g的凡纳滨对虾为研究对象,分别在盐度1.5和30的水体中用同一种配合饲料喂养50d,探讨海水养殖和低盐养殖对凡纳滨对虾生长性能、碱性磷酸酶及酸性磷酸酶和RNA/DNA比值的影响。结果显示,海水养殖凡纳滨对虾的... 以初始体重为4.04±0.14 g的凡纳滨对虾为研究对象,分别在盐度1.5和30的水体中用同一种配合饲料喂养50d,探讨海水养殖和低盐养殖对凡纳滨对虾生长性能、碱性磷酸酶及酸性磷酸酶和RNA/DNA比值的影响。结果显示,海水养殖凡纳滨对虾的成活率、特殊增长率(SGR)高于低盐养殖对虾(P<0.05);海水养殖凡纳滨对虾的饲料系数(FCR)明显低于低盐养殖对虾(P<0.05);海水养殖凡纳滨对虾肝胰脏碱性磷酸酶和酸性磷酸酶活性均明显高于低盐养殖对虾(P<0.05);海水养殖凡纳滨对虾肌肉RNA/DNA比值明显高于低盐养殖凡纳滨对虾(P<0.05)。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 生长 盐度 RNA/dna
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