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分子对接、CRISPR/Cas9技术筛选并验证DNA ligase Ⅳ抑制剂
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作者 肖红卫 《湖北农业科学》 2021年第23期177-180,共4页
为了筛选靶向DNA连接酶Ⅳ的抑制剂以实现更有效的基因定点插入,采用分子对接技术筛选出与前期研究中靶向DNA连接酶Ⅳ的抑制剂SCR7作用类似的小分子化合物。筛选到与化合物库一致的nocodazole、Fisetin和Methylene blue 3个小分子化合物... 为了筛选靶向DNA连接酶Ⅳ的抑制剂以实现更有效的基因定点插入,采用分子对接技术筛选出与前期研究中靶向DNA连接酶Ⅳ的抑制剂SCR7作用类似的小分子化合物。筛选到与化合物库一致的nocodazole、Fisetin和Methylene blue 3个小分子化合物,通过用MSTN基因T11位点序列截断的Firefly Luciferase荧光素酶报告载体结合CRISPR/Cas9-gRNA-T11载体共转细胞,并结合不同的小分子化合物处理。结果表明,没有用小分子化合物处理时,萤火虫荧光素酶被截断的位置发生NHEJ修复,不能得到大量有活性的萤火虫荧光素酶;经过小分子化合物处理,抑制了细胞内的NHEJ,提高了HDR效率,能得到大量有活性的萤火虫荧光素酶。使用nocodazole、Methylene blue和Fisetin处理后的萤火虫荧光素酶检测结果65256.3、53713和77058.3分别是SCR7处理后的萤火虫荧光素酶检测结果41905.3的1.6、1.3和1.8倍,是没有SCR7处理后的萤火虫荧光素酶检测结果10120的6.4、5.3和7.6倍。证明所用的筛选策略正确,所筛选出的小分子化合物是具有DNA ligaseⅣ抑制活性的抑制剂,为后续研究奠定了基础。 展开更多
关键词 dna连接酶 抑制剂 荧火虫荧光素酶报告载体 CRISPR/Cas9 小分子化合物
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沉默Ku70促进PARP1、ligase3和XRCC1在DNA双链断裂染色质聚集 被引量:1
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作者 程巧 厉红元 +1 位作者 王小毅 任国胜 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第14期1497-1501,共5页
目的研究碱基切除修复途径(base excision repair,BER)关键因子PARP1、ligase3和XRCC1在Ku70缺失的条件下与DNA双链断裂(double-strand break,DSB)所在染色质的结合及抑制PARP1所产生的影响。方法采用可经药物诱导Ku70 shRNA的细胞株,... 目的研究碱基切除修复途径(base excision repair,BER)关键因子PARP1、ligase3和XRCC1在Ku70缺失的条件下与DNA双链断裂(double-strand break,DSB)所在染色质的结合及抑制PARP1所产生的影响。方法采用可经药物诱导Ku70 shRNA的细胞株,以高效的DNA双链断裂诱导剂刺孢霉素calicheamicin诱导DSB。分离不同组分蛋白联合稳定同位素标记定量差异蛋白组分析法鉴定Ku70下调后在损伤染色质聚集增多的蛋白,Western blot进行验证并检测PARP1抑制剂DIQ对其染色质聚集的影响。结果在药物Doxy作用下,Ku70明显下调,其余蛋白的表达不受影响。稳定同位素标记定量蛋白组学方法鉴定出PARP1、ligase3和XRCC1在Ku70下调后在损伤染色质聚集增多。Western blot进行了验证并显示PARP1、ligase3和XRCC1在损伤染色质的聚集随DSB程度增加而增加。施加PARP1抑制剂DIQ,随着DIQ浓度的上升,ligase3在损伤染色质的聚集逐渐减少。结论沉默Ku70后,PARP1、ligase3和XRCC1在DSB染色质聚集增加,这种聚集与DSB程度变化一致,并且ligase3的染色质聚集具有一定程度的PARP1依赖性。 展开更多
关键词 dna双链断裂 KU70 PARP1 ligase3 XRCC1
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Flexibility in the order of action and in the enzymology of the nuclease, polymerases, and ligase of vertebrate non-homologous DNA end joining: relevance to cancer, aging, and the immune system 被引量:5
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作者 Michael R Lieber Haihui Lu +1 位作者 Jiafeng Gu Klaus Schwarz 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2008年第1期125-133,共9页
Nonhomologous DNA end joining (NHEJ) is the primary pathway for repair of double-strand DNA breaks in human cells and in multicellular eukaryotes. The causes of double-strand breaks often fragment the DNA at the sit... Nonhomologous DNA end joining (NHEJ) is the primary pathway for repair of double-strand DNA breaks in human cells and in multicellular eukaryotes. The causes of double-strand breaks often fragment the DNA at the site of damage, resulting in the loss of information there. NHEJ does not restore the lost information and may resect additional nucleotides during the repair process. The ability to repair a wide range of overhang and damage configurations reflects the flexibility of the nuclease, polymerases, and ligase of NHEJ. The flexibility of the individual components also explains the large number of ways in which NHEJ can repair any given pair of DNA ends. The loss of information locally at sites of NHEJ repair may contribute to cancer and aging, but the action by NHEJ ensures that entire segments of chromosomes are not lost. 展开更多
关键词 nonhomologous dna end joining (NHEJ) Ku dna-PKcs Artemis Cernunnos/XLE ligase XRCC4 polymerase μ polymerase λ
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Ovarian cancer and DNA repair: DNA ligase IV as a potential key 被引量:2
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作者 Joana Assis Deolinda Pereira Rui Medeiros 《World Journal of Clinical Oncology》 CAS 2013年第1期14-24,共11页
Ovarian cancer(OC)is the sixth most common cancer and the seventh cause of death from cancer in women.The etiology and the ovarian carcinogenesis still need clarification although ovulation may be determinant due to i... Ovarian cancer(OC)is the sixth most common cancer and the seventh cause of death from cancer in women.The etiology and the ovarian carcinogenesis still need clarification although ovulation may be determinant due to its carcinogenic role in ovarian surface epithelium.The link between ovarian carcinogenesis and DNA repair is well established and it became clear that alterations in DNA damage response may affect the risk to develop OC.Polymorphisms are variations in the DNA sequence that exist in normal individuals of a population and are capable to change,among other mechanisms,the balance between DNA damage and cellular response.Consequently,genetic variability of the host has a great role in the development,progression and consequent prognosis of the oncologic patient as well as in treatment response.Standard treatment for OC patients is based on cytoreductive surgery,followed by chemotherapy with a platinum agent and a taxane.Although 80%of the patients respond to the first-line therapy,the development of resistance is common although the mechanisms underlying therapy failure remain mostly unknown.Because of their role in oncology,enzymes involved in the DNA repair pathways,like DNA Ligase IV(LIG4),became attractive study targets.It has been reported that variations in LIG4 activity can lead to a hyper-sensitivity to DNA damage,deregulation of repair and apoptosis mechanisms,affecting the susceptibility to cancer development and therapy response.To overcome resistance mechanisms,several investigations have been made and the strategy to target crucial molecular pathways,such as DNA repair,became one of the important areas in clinical oncology.This review aims to elucidate the link between DNA repair and OC,namely which concerns the role of LIG4 enzyme,and how genetic polymorphisms in LIG4 gene can modulate the activity of the enzyme and affect the ovarian carcinogenesis and treatment response.Moreover,we try to understand how LIG4 inhibition can be a potential contributor for the development of new cancer treatment strategies. 展开更多
关键词 OVARIAN Cancer dna Repair dna ligase IV POLYMORPHISMS SUSCEPTIBILITY Treatment response
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Ligase Ⅳ基因突变对小鼠生长及成体神经系统发育的影响
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作者 邱月 汪光明 徐俊 《同济大学学报(医学版)》 CAS 2018年第6期40-45,共6页
目的研究Ligase Ⅳ对小鼠生长及成体神经系统发育的影响。方法记录野生型(WT)和突变型Ligase Ⅳ^(Y288C)纯合子(MU)小鼠的生存情况,绘制小鼠生存曲线;记录小鼠不同生长时期的体质量和脑质量,监测小鼠个体发育和脑发育差异;用Sox2和Nesti... 目的研究Ligase Ⅳ对小鼠生长及成体神经系统发育的影响。方法记录野生型(WT)和突变型Ligase Ⅳ^(Y288C)纯合子(MU)小鼠的生存情况,绘制小鼠生存曲线;记录小鼠不同生长时期的体质量和脑质量,监测小鼠个体发育和脑发育差异;用Sox2和Nestin免疫染色来检测小鼠侧脑室下区(subventricular zone,SVZ)神经干细胞(neural stem cells,NSCs)的数量;用Ki67和Nestin免疫染色来检测小鼠SVZ的NSCs增殖情况;原代分离培养小鼠SVZ的NSCs,用克隆形成实验检测细胞的生长状况。结果 MU小鼠的平均寿命明显低于WT小鼠(P<0. 000 1);MU小鼠的体质量和脑质量在生长的各个时期均明显小于WT小鼠(P<0. 000 1); MU小鼠大脑SVZ的NSCs数量及增殖细胞数均比WT少(P<0. 011 3); MU小鼠NSCs的克隆形成能力低于WT小鼠(P<0. 001)。结论 Ligase Ⅳ突变在小鼠生长及成体神经系统发育的过程中起重要作用。 展开更多
关键词 ligase 基因突变 神经干细胞 侧脑室下区
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Radiation Effect of T_4DNA Ligase Induced by 80 MeV/u ^(12)C^(6+) Ions
6
作者 Wang Xiao, Li Wenjian, Gao Qingxiang, Feng Yan and Zhou Libing 《IMP & HIRFL Annual Report》 2001年第1期73-73,共1页
Cancer therapy with heavy ion bearns has now been progressed by America,Japan,Germany and some other countries.It becomes the most advanced and efficacious new cancer radiotherapy owing its high LET and RBE,low OER,es... Cancer therapy with heavy ion bearns has now been progressed by America,Japan,Germany and some other countries.It becomes the most advanced and efficacious new cancer radiotherapy owing its high LET and RBE,low OER,especialy forming Bragg peak at the end of the tracks of the charged particles.DNA 展开更多
关键词 dna IONS BRAGG RADIOTHERAPY ligase CHARGED repair spectrometer POLYACRYLAMIDE irradiated
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耐氟喹诺酮类药物鸡毒支原体DNA回旋酶及拓扑异构酶Ⅳ的突变特征 被引量:4
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作者 魏飞龙 周云雷 +1 位作者 沈祥广 蒋红霞 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第9期43-47,共5页
采用二倍稀释法测定临床分离的4株鸡毒支原体对常用抗菌药物的敏感性,PCR方法和基因测序法对鸡毒支原体DNA回旋酶编码基因gyrA、gyrB及拓扑异构酶Ⅳ编码基因parC和parE耐药决定区进行分析。敏感性测定结果表明,4株分离鸡毒支原体对泰乐... 采用二倍稀释法测定临床分离的4株鸡毒支原体对常用抗菌药物的敏感性,PCR方法和基因测序法对鸡毒支原体DNA回旋酶编码基因gyrA、gyrB及拓扑异构酶Ⅳ编码基因parC和parE耐药决定区进行分析。敏感性测定结果表明,4株分离鸡毒支原体对泰乐菌素、泰妙林、沃尼妙林和替米考星有很高的敏感性,对四环素和红霉素中度敏感,对林可霉素、氟苯尼考和氟喹诺酮类药物呈现不同程度的耐药性。4株耐氟喹诺酮类药物鸡毒支原体均在GyrA和ParC的喹诺酮类耐药决定区(QRDR)发生氨基酸的改变,GyrA的氨基酸取代模式有两种,分别为Ser81→Gly和Ser83→Ile,ParC仅在80位发生氨基酸取代(Ser80→Leu),GyrB和ParE均未发生氨基酸改变。 展开更多
关键词 鸡毒支原体 最低抑菌浓度 dna回旋酶 拓扑异构酶
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Ag(Ⅰ)、Au(Ⅲ)、Pt(Ⅳ)离子与DNA相互作用的光谱研究 被引量:3
8
作者 王树玲 于俊生 邹燕辉 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第7期665-670,共6页
本文用中药小檗碱作为探针分子,在0.01mol·L-1醋酸-醋酸钠缓冲体系中,用荧光和紫外-可见吸收光谱研究了贵金属离子Ag?、Au?、Pt?与DNA的相互作用。在三种贵金属离子中,Au?、Pt?离子对小檗碱-DNA体系均具有明显的荧光猝灭作用,而Ag... 本文用中药小檗碱作为探针分子,在0.01mol·L-1醋酸-醋酸钠缓冲体系中,用荧光和紫外-可见吸收光谱研究了贵金属离子Ag?、Au?、Pt?与DNA的相互作用。在三种贵金属离子中,Au?、Pt?离子对小檗碱-DNA体系均具有明显的荧光猝灭作用,而Ag?离子对该体系有强烈的荧光敏化作用。分别求出了三种贵金属离子与DNA的结合常数。三种贵金属离子与DNA结合能力的强弱顺序依次为:Au?>Ag?>Pt?。探讨了三种贵金属离子与DNA的作用机理及导致结合力不同的原因。 展开更多
关键词 Ag(Ⅰ) Au(Ⅲ) Pt() dna
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小分子化合物靶向DNA连接酶Ⅳ提高CRISPR/Cas9基因编辑效率的研究进展 被引量:1
9
作者 肖红卫 毕延震 《湖北农业科学》 2020年第22期13-19,共7页
基因编辑工具能够在DNA链上制造特定位点双链断裂(Double-strand breaks,DSB)。细胞内具有修复DSB的2种不同途径,即同源重组(HDR)和非同源末端连接(NHEJ)。NHEJ与HDR之间相互竞争,互为替代DNA修复途径。DNA连接酶Ⅳ参与NHEJ途径并发挥... 基因编辑工具能够在DNA链上制造特定位点双链断裂(Double-strand breaks,DSB)。细胞内具有修复DSB的2种不同途径,即同源重组(HDR)和非同源末端连接(NHEJ)。NHEJ与HDR之间相互竞争,互为替代DNA修复途径。DNA连接酶Ⅳ参与NHEJ途径并发挥重要作用。DNA连接酶Ⅳ抑制剂可以抑制DNA修复通路中NHEJ的效率,同时可以提高HDR的效率。为了优选小分子化合物实现更有效的基因定点插入,综述了SCR7、NU7026、白藜芦醇、L755507这4种不同的小分子化合物在CRISPR/Cas9基因编辑效率上的研究,归纳了这4种小分子化合物在其中发挥的作用,并用生物信息学软件模拟所用小分子化合物与DNA连接酶Ⅳ的对接。在此基础上,对这4种小分子化合物提高基因编辑效率的研究前景进行了展望。 展开更多
关键词 双链断裂 同源重组 非同源末端连接 dna连接酶 小分子化合物
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蛋氨酸席夫碱氧钒(Ⅳ)配合物的合成及其与DNA相互作用 被引量:2
10
作者 曹亚萍 易芩兰 +3 位作者 刘洪梅 李海霞 左建丽 袁泽利 《遵义医学院学报》 2015年第6期584-590,共7页
目的开发具有新生物活性的非铂系前药并探寻其与DNA作用模式。方法采用一锅法合成L-蛋氨酸缩芳香醛席夫碱和1,10-邻菲罗啉氧钒(Ⅳ)[VO(csal-L-meth)(phen)]配合物Ⅰ,利用高分辨质谱、FT-IR谱及摩尔电导对其进行结构表征,并通过X射线单... 目的开发具有新生物活性的非铂系前药并探寻其与DNA作用模式。方法采用一锅法合成L-蛋氨酸缩芳香醛席夫碱和1,10-邻菲罗啉氧钒(Ⅳ)[VO(csal-L-meth)(phen)]配合物Ⅰ,利用高分辨质谱、FT-IR谱及摩尔电导对其进行结构表征,并通过X射线单晶衍射测定其晶体结构。采用紫外(UV)及荧光光谱方法研究配合物Ⅰ与鲱鱼精DNA的作用机制。结果高分辨质谱和红外光谱及晶体测试结果证实目标配合物Ⅰ为预期结构。目标配合物Ⅰ的晶体结构属于正交晶系(Orthorhombic),P2_1/c空间群,晶胞参数为a=13.615(7)A,b=9.615(5)A,c=18.63(1)A,α=γ=90.00°,β=94.963(7)°,V=2430.7(2)A^3,Dc=1.457g/cm^3,μ=0.640mm^(-1),Z=4,F(000)=1 092.0,R_1=0.103 4,wR_2=0.271 4[Ⅰ>2σ(Ⅰ)],Gof=1.085。并以钒原子为中心形成了六配位变形的八面体构型。目标配合物与DNA作用研究表明:其能与DNA发生作用。结论设计合成的新配合物I与DNA之间为典型的嵌插作用模式,这为了解其与DNA作用提供了理论依据和实验基础。 展开更多
关键词 蛋氨酸 席夫碱 氧钒()配合物 晶体结构 dna
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苏丹Ⅳ与DNA在含金属离子环境中相互作用的研究
11
作者 付彩霞 荣先国 高宗华 《安徽化工》 CAS 2019年第3期48-50,共3页
用荧光和紫外光谱法研究了苏丹Ⅳ与DNA在含金属离子环境中的相互作用.结果表明:DNA及金属离子均导致苏丹Ⅳ的内源荧光猝灭,猝灭机制均为静态猝灭.运用Scatchard方程对实验数据进行处理分析,求得在有无金属离子存在下苏丹Ⅳ与DNA相互作... 用荧光和紫外光谱法研究了苏丹Ⅳ与DNA在含金属离子环境中的相互作用.结果表明:DNA及金属离子均导致苏丹Ⅳ的内源荧光猝灭,猝灭机制均为静态猝灭.运用Scatchard方程对实验数据进行处理分析,求得在有无金属离子存在下苏丹Ⅳ与DNA相互作用的结合常数和结合位点数.讨论了金属离子对苏丹Ⅳ与DNA相互作用的影响. 展开更多
关键词 苏丹 鲱鱼精dna 金属离子 光谱法 影响
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荧光光谱法研究苏丹Ⅳ与鲱鱼精DNA的相互作用 被引量:2
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作者 付银环 付彩霞 《化学与生物工程》 CAS 2015年第4期44-47,共4页
在pH值为7.4的Tris-HCl缓冲溶液中,采用荧光光谱法研究了苏丹Ⅳ与鲱鱼精DNA的相互作用。通过单、双链DNA作用的比较实验、KI荧光猝灭实验,分析了苏丹Ⅳ与鲱鱼精DNA的相互作用模式。结果表明:苏丹Ⅳ通过沟槽结合模式与鲱鱼精DNA发生作用... 在pH值为7.4的Tris-HCl缓冲溶液中,采用荧光光谱法研究了苏丹Ⅳ与鲱鱼精DNA的相互作用。通过单、双链DNA作用的比较实验、KI荧光猝灭实验,分析了苏丹Ⅳ与鲱鱼精DNA的相互作用模式。结果表明:苏丹Ⅳ通过沟槽结合模式与鲱鱼精DNA发生作用;鲱鱼精DNA能猝灭苏丹Ⅳ的内源性荧光,其机理属于静态猝灭。通过Scatchard方程求得不同温度下的结合常数和结合位点数,热力学参数数据表明,苏丹Ⅳ与鲱鱼精DNA之间的主要作用力为氢键和范德华力。 展开更多
关键词 苏丹 鲱鱼精dna 相互作用 荧光光谱
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Role of E3 ubiquitin ligases in lung cancer 被引量:5
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作者 Barbara C Snoek Leonie HAM de Wilt +1 位作者 Gerrit Jansen Godefridus J Peters 《World Journal of Clinical Oncology》 CAS 2013年第3期58-69,共12页
E3 ubiquitin ligases are a large family of proteins that catalyze the ubiquitination of many protein substrates for targeted degradation by the 26S proteasome.Therefore,E3 ubiquitin ligases play an essential role in a... E3 ubiquitin ligases are a large family of proteins that catalyze the ubiquitination of many protein substrates for targeted degradation by the 26S proteasome.Therefore,E3 ubiquitin ligases play an essential role in a variety of biological processes including cell cycle regulation,proliferation and apoptosis.E3 ubiquitin ligases are often found overexpressed in human cancers,including lung cancer,and their deregulation has been shown to contribute to cancer development.However,the lack of specific inhibitors in clinical trials is a major issue in targeting E3 ubiquitin ligases with currently only one E3 ubiquitin ligase inhibitor being tested in the clinical setting.In this review,we focus on E3 ubiquitin ligases that have been found deregulated in lung cancer.Furthermore,we discuss the processes in which they are involved and evaluate them as potential anti-cancer targets.By better understanding the mechanisms by which E3 ubiquitin ligases regulate biological processes and their exact role in carcinogenesis,we can improve the development of specific E3 ubiquitin ligase inhibitors and pave the way for novel treatment strategies for cancer patients. 展开更多
关键词 E3 UBIQUITIN ligaseS Lung cancer Ubiquitinproteasome system PROTEASOME inhibitors BORTEZOMIB Apoptosis Gene regulation dna repair
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Se(Ⅳ)对酒石酸长春质碱与DNA相互作用影响的研究
14
作者 姜芳茹 黄媛 +1 位作者 刘佳荣 刘炜 《海南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2014年第3期274-276,共3页
利用荧光光谱法、紫外光谱法和粘度法研究了Se(Ⅳ)对酒石酸长春质碱与DNA相互作用的影响.研究结果表明Se(Ⅳ)的加入使酒石酸长春质碱与DNA的主要作用力由氢键或范德华力转变为静电作用力,作用模式由沟槽结合转变为静电结合.由结合常数... 利用荧光光谱法、紫外光谱法和粘度法研究了Se(Ⅳ)对酒石酸长春质碱与DNA相互作用的影响.研究结果表明Se(Ⅳ)的加入使酒石酸长春质碱与DNA的主要作用力由氢键或范德华力转变为静电作用力,作用模式由沟槽结合转变为静电结合.由结合常数的改变及紫外光谱实验结果判断Se(Ⅳ)对酒石酸长春质碱与DNA的结合起抑制作用. 展开更多
关键词 酒石酸长春质碱 Se() dna 相互作用
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DNA免疫吸附联合双冲击治疗在Ⅳ型重症狼疮肾炎的临床观察 被引量:1
15
作者 张秋玲 《医学信息》 2010年第19期3672-3673,共2页
目的观察DNA特异性免疫吸附联合双冲击治疗在Ⅳ型重型狼疮性肾炎的临床疗效。方法对2008~2010年我院住院的病理类型为Ⅳ型的重型狼疮性肾炎(LN)的6例患者采用DNA特异性免疫吸附联合大量激素、环磷酰胺冲击治疗。结果 6例患者临床症... 目的观察DNA特异性免疫吸附联合双冲击治疗在Ⅳ型重型狼疮性肾炎的临床疗效。方法对2008~2010年我院住院的病理类型为Ⅳ型的重型狼疮性肾炎(LN)的6例患者采用DNA特异性免疫吸附联合大量激素、环磷酰胺冲击治疗。结果 6例患者临床症状、体征均明显好转,抗核抗体、抗-DNA抗体均明显下降或转阴,脱离透析,尿量、肾功能恢复正常,尿蛋白转阴。结论 DNA特异性免疫吸附联合激素、免疫抑制剂双冲击治疗Ⅳ型重型狼疮性肾炎疗效明显,能迅速缓解病情,縮短住院时间。 展开更多
关键词 dna特异性免疫吸附 双冲击治疗 型重型狼疮性肾炎
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植物RNA聚合酶Ⅳ调控DNA甲基化和发育的研究进展
16
作者 许梦萱 周明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期567-580,共14页
DNA甲基化是一类稳定可遗传的表观遗传修饰,在调控基因表达、沉默转座子和维持基因组稳定性等方面发挥重要作用。植物中,DNA从头甲基化通过RNA指导的DNA甲基化(RNA-directedDNAmethylation,RdDM)途径建立。植物特有的DNA依赖的RNA聚合酶... DNA甲基化是一类稳定可遗传的表观遗传修饰,在调控基因表达、沉默转座子和维持基因组稳定性等方面发挥重要作用。植物中,DNA从头甲基化通过RNA指导的DNA甲基化(RNA-directedDNAmethylation,RdDM)途径建立。植物特有的DNA依赖的RNA聚合酶Ⅳ(DNA-dependent RNA polymerase Ⅳ, Pol Ⅳ)是RdDM途径核心蛋白,转录产生非编码RNA,通过RdDM途径引导从头建立DNA甲基化,进而调控植物基因表达和生长发育。Pol Ⅳ行使功能受多个蛋白调控:组蛋白阅读器SHH1 (SAWADEE homeodomain homolog 1)识别H3K9甲基化引导Pol Ⅳ到基因组特定位点;染色质重塑因子CLSY (CLASSY)蛋白家族协助Pol Ⅳ识别靶位点;RNA依赖的RNA聚合酶2 (RNA-dependent RNA polymerase 2, RDR2)将Pol Ⅳ转录产生的单链RNA转换成双链RNA。本文总结了Pol Ⅳ及其调控蛋白调控植物DNA甲基化和发育的研究进展,以期为DNA甲基化研究和农作物育种提供参考。 展开更多
关键词 dna甲基化 RdDM途径 RNA聚合酶 表观基因组 发育
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Ligase4缺失对芹菜素抑制TK6细胞增殖作用的影响
17
作者 赵梓潞 向翠方 +1 位作者 冯晓雨 卿勇 《广西医科大学学报》 CAS 2020年第3期384-387,共4页
目的:研究非同源末端连接修复基因Ligase4缺失对芹菜素(APG)抑制TK6细胞增殖作用的影响。方法:采用CCK8方法检测APG和阳性药依托泊苷(ETP)对TK6细胞增殖的影响;采用流式细胞术检测APG对TK6细胞周期和凋亡的影响;利用免疫荧光实验分析AP... 目的:研究非同源末端连接修复基因Ligase4缺失对芹菜素(APG)抑制TK6细胞增殖作用的影响。方法:采用CCK8方法检测APG和阳性药依托泊苷(ETP)对TK6细胞增殖的影响;采用流式细胞术检测APG对TK6细胞周期和凋亡的影响;利用免疫荧光实验分析APG对野生型(WT)和DNA损伤修复缺陷的Ligase4-/-细胞的DNA损伤作用。结果:APG对TK6细胞的增殖抑制作用呈现剂量依赖性;APG能将TK6细胞阻滞在G2/M期并诱导TK6细胞凋亡;经80μmol·L^-1APG处理细胞后,Ligase4-/-型细胞的γ-H2AX foci相对于WT细胞明显增加,在6 h达到峰值(P<0. 05)。结论:APG能抑制TK6细胞的增殖,并且对非同源末端连接修复基因Ligase4缺失的细胞造成的DNA损伤更严重且抑制细胞增殖作用更强。 展开更多
关键词 芹菜素 dna损伤 免疫荧光 ligase4 非同源末端连接 TK6细胞
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非同源末端连接中DNA连接酶Ⅳ抑制剂研究进展
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作者 贺越 王秀梅 《陕西医学杂志》 CAS 2023年第3期358-360,F0003,共4页
DNA连接酶Ⅳ(LIG4)主要通过非同源末端连接(NHEJ)参与V(D)J重组和DNA双键断裂(DSB)修复,具有独特调控作用和广泛应用前景。研究发现,LIG4抑制剂在NHEJ中可作为增敏剂,与放化疗联合治疗肿瘤时具有较好的抗癌效果。此外,LIG4抑制剂还可作... DNA连接酶Ⅳ(LIG4)主要通过非同源末端连接(NHEJ)参与V(D)J重组和DNA双键断裂(DSB)修复,具有独特调控作用和广泛应用前景。研究发现,LIG4抑制剂在NHEJ中可作为增敏剂,与放化疗联合治疗肿瘤时具有较好的抗癌效果。此外,LIG4抑制剂还可作为一种有效的生化抑制剂介导CRISPR/Cas9基因编辑,有提高基因编辑效率的作用。近年来,许多研究基于此机制不断进行大规模药物筛选以发现新型抗癌药物,来为肿瘤治疗提供一种新思路。现对目前已报道的LIG4抑制剂及其衍生物的各种形式进行综述,并重点介绍目前应用较广的SCR7。 展开更多
关键词 dna连接酶抑制剂 非同源末端连接 dna双键断裂 dna修复 同源重组 肿瘤治疗
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人型支原体拓扑异构酶Ⅳ氨基酸变异与喹诺酮耐药关系的研究 被引量:7
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作者 于静波 王璐 +1 位作者 张明磊 孟冬娅 《国际检验医学杂志》 CAS 2011年第16期1792-1793,1796,共3页
目的研究人型支原体(Mh)对喹诺酮类药物的耐药机制。方法以泌尿生殖道分泌物中分离的10株Mh为实验对象,采用PCR测序法对其拓扑异构酶Ⅳ基因序列进行分析,推算其氨基酸残基,并与标准菌株ATCC23114及野生株(PG21)基因进行序列比对,分析Mh... 目的研究人型支原体(Mh)对喹诺酮类药物的耐药机制。方法以泌尿生殖道分泌物中分离的10株Mh为实验对象,采用PCR测序法对其拓扑异构酶Ⅳ基因序列进行分析,推算其氨基酸残基,并与标准菌株ATCC23114及野生株(PG21)基因进行序列比对,分析Mh拓扑异构酶Ⅳ保守区编码的氨基酸残基变异与对喹诺酮类药物耐药的关系。结果与野生株相比,对氧氟沙星和左氧氟沙星耐药的8株Mh分离株中,对于parC基因所编码的氨基酸序列,6株Mh检出K(Lys赖氨酸)134→R(Arg精氨酸)单一变异,1株Mh检出80位S(Ser丝氨酸)→I(Ile异亮氨酸)变异,1株Mh同时检出上述两种变异;对于parE基因所编码的氨基酸序列,其中1株Mh检出D(Asp天冬氨酸)426→N(Asn天冬酰胺)变异,1株Mh检出R447→K变异。对氧氟沙星和左氧氟沙星敏感的Mh菌株及标准菌株均未发现parC基因和parE基因所编码的氨基酸残基变异。结论 Mh临床分离株对氧氟沙星和左氧氟沙星耐药可能与parC基因所编码的K134→R氨基酸残基变异有关。 展开更多
关键词 支原体 人型 dna拓扑异构酶 喹诺酮类 抗药性
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基于分子信标实时监测大肠杆菌DNA连接酶催化的DNA连接过程 被引量:5
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作者 刘凌凤 唐志文 +6 位作者 王柯敏 谭蔚泓 李军 郭秋平 孟祥贤 黄杉生 李杜 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2003年第10期1761-1764,共4页
报道了一种对 DNA连接过程进行实时监测的方法 ,利用分子信标核酸探针作为 DNA连接反应的模板和检测探针 ,实时监测了 E.coli DNA连接酶催化的 DNA连接反应 ,克服了传统的凝胶电泳技术操作复杂、周期长及无法实时监测 DNA连接过程的缺... 报道了一种对 DNA连接过程进行实时监测的方法 ,利用分子信标核酸探针作为 DNA连接反应的模板和检测探针 ,实时监测了 E.coli DNA连接酶催化的 DNA连接反应 ,克服了传统的凝胶电泳技术操作复杂、周期长及无法实时监测 DNA连接过程的缺点 ,为核酸连接过程的实时监测和连接酶催化机理的研究提供了更为丰富的信息 .在此基础上 ,发展了一种快速、准确测定 E.coli DNA连接酶的方法 ,线性响应范围为 4.0× 1 0 -6~ 2 .0× 1 0 -4U /μL,检测下限为 4.0× 1 0 -6U/μL. 展开更多
关键词 分子信标 实时监测 大肠杆菌 dna 连接酶 催化 核酸连接
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