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Flexibility in the order of action and in the enzymology of the nuclease, polymerases, and ligase of vertebrate non-homologous DNA end joining: relevance to cancer, aging, and the immune system 被引量:5
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作者 Michael R Lieber Haihui Lu +1 位作者 Jiafeng Gu Klaus Schwarz 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2008年第1期125-133,共9页
Nonhomologous DNA end joining (NHEJ) is the primary pathway for repair of double-strand DNA breaks in human cells and in multicellular eukaryotes. The causes of double-strand breaks often fragment the DNA at the sit... Nonhomologous DNA end joining (NHEJ) is the primary pathway for repair of double-strand DNA breaks in human cells and in multicellular eukaryotes. The causes of double-strand breaks often fragment the DNA at the site of damage, resulting in the loss of information there. NHEJ does not restore the lost information and may resect additional nucleotides during the repair process. The ability to repair a wide range of overhang and damage configurations reflects the flexibility of the nuclease, polymerases, and ligase of NHEJ. The flexibility of the individual components also explains the large number of ways in which NHEJ can repair any given pair of DNA ends. The loss of information locally at sites of NHEJ repair may contribute to cancer and aging, but the action by NHEJ ensures that entire segments of chromosomes are not lost. 展开更多
关键词 nonhomologous dna end joining (NHEJ) Ku dna-PKcs Artemis Cernunnos/XLE ligase XRCC4 polymerase μ polymerase λ
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小分子化合物靶向DNA连接酶Ⅳ提高CRISPR/Cas9基因编辑效率的研究进展 被引量:1
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作者 肖红卫 毕延震 《湖北农业科学》 2020年第22期13-19,共7页
基因编辑工具能够在DNA链上制造特定位点双链断裂(Double-strand breaks,DSB)。细胞内具有修复DSB的2种不同途径,即同源重组(HDR)和非同源末端连接(NHEJ)。NHEJ与HDR之间相互竞争,互为替代DNA修复途径。DNA连接酶Ⅳ参与NHEJ途径并发挥... 基因编辑工具能够在DNA链上制造特定位点双链断裂(Double-strand breaks,DSB)。细胞内具有修复DSB的2种不同途径,即同源重组(HDR)和非同源末端连接(NHEJ)。NHEJ与HDR之间相互竞争,互为替代DNA修复途径。DNA连接酶Ⅳ参与NHEJ途径并发挥重要作用。DNA连接酶Ⅳ抑制剂可以抑制DNA修复通路中NHEJ的效率,同时可以提高HDR的效率。为了优选小分子化合物实现更有效的基因定点插入,综述了SCR7、NU7026、白藜芦醇、L755507这4种不同的小分子化合物在CRISPR/Cas9基因编辑效率上的研究,归纳了这4种小分子化合物在其中发挥的作用,并用生物信息学软件模拟所用小分子化合物与DNA连接酶Ⅳ的对接。在此基础上,对这4种小分子化合物提高基因编辑效率的研究前景进行了展望。 展开更多
关键词 双链断裂 同源重组 非同源末端连接 dna连接酶 小分子化合物
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人肿瘤细胞系Ligase Ⅳ基因突变与放射敏感性的关系研究 被引量:1
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作者 王顺 陆雪官 +2 位作者 张纬建 胡超苏 冯炎 《中华放射肿瘤学杂志》 CSCD 北大核心 2002年第2期126-129,共4页
目的 研究人肿瘤细胞DNA LigaseⅣ基因突变与放射敏感性的关系。方法 常规集落形成方法测定人鼻咽鳞癌 (CNE)、肺腺癌 (SPC A1)和乳腺腺癌 (MCF 7)细胞系不同剂量照射后的细胞存活分数 ,采用聚合酶链式反应和克隆技术测定 3种细胞参与... 目的 研究人肿瘤细胞DNA LigaseⅣ基因突变与放射敏感性的关系。方法 常规集落形成方法测定人鼻咽鳞癌 (CNE)、肺腺癌 (SPC A1)和乳腺腺癌 (MCF 7)细胞系不同剂量照射后的细胞存活分数 ,采用聚合酶链式反应和克隆技术测定 3种细胞参与DNA损伤修复的DNAligaseⅣ基因序列 ,分析它们的同源性变化和突变对基因产物亲疏水性的影响。结果  3种细胞存活参数比较存在较大差异 ,CNE细胞较SPC A1和MCF 7细胞显示出较高的放射敏感性。CNE、SPC A1和MCF 7细胞LigaseⅣ基因同源性分别为 99.95 %、99.99%和 99.98% ,包括碱基转换和颠换突变。部分突变碱基导致氨基酸替代并影响基因产物的亲疏水结构。CNE细胞LigaseⅣp的 313aaHis→Arg、5 38aaGly→Arg、5 79aaLys→Arg和 5 85aaAsn→Ser替代与CNE细胞放射敏感性高于SPC A1和MCF 7细胞有关。结论 LigaseⅣp在非同源性末端连接 (NHEJ)途径中起关键和最终连接作用 ,该基因突变影响肿瘤细胞的双链断裂损伤修复能力和放射敏感性。 展开更多
关键词 人肿瘤细胞 ligase 基因突变 放射敏感性
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SUCLG1基因突变相关的新生儿致死性酸中毒1例并文献复习
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作者 潘翩翩 吴玫瑰 +1 位作者 陈俊操 魏谋 《中华生物医学工程杂志》 CAS 2023年第5期503-510,共8页
目的探讨SUCLG1基因突变所致新生儿脑肌病型线粒体DNA耗竭综合征9型(MDS)的临床特点,为其早期诊断提供依据。方法对广州市妇女儿童医疗中心新生儿科收治的1例新生儿脑肌病型MDS 9型患儿的临床表现、生化结果、辅助检查、尸体病理及基因... 目的探讨SUCLG1基因突变所致新生儿脑肌病型线粒体DNA耗竭综合征9型(MDS)的临床特点,为其早期诊断提供依据。方法对广州市妇女儿童医疗中心新生儿科收治的1例新生儿脑肌病型MDS 9型患儿的临床表现、生化结果、辅助检查、尸体病理及基因报告进行回顾性分析,并以"线粒体DNA耗竭综合征""SUCLG1基因""甲基丙二酸尿症""甲基丙二酸""SUCLG1"等为关键词,分别对中国知网、万方、Pubmed、ClinVar自建库至2023年5月收录的文献进行检索,其中仅13篇文章报道20例新生儿期发病的SUCLG1基因突变导致的MDS,本文总结新生儿脑肌病型MDS 9型的临床特点。结果本例患儿为足月小样儿,女,生后0.5 h起病,主要表现为呼吸窘迫、难以纠正的代谢性酸中毒、高乳酸血症、低氧血症、尿甲基丙二酸和血氨轻度升高,予以禁食、呼吸循环支持、纠酸等治疗效果欠佳,生后5 d死亡。尸体病理见脑干蛛网膜下腔出血及血肿形成、动脉导管未闭、卵圆孔未闭、左肺动脉狭窄、右心室和左心室室壁增厚。外观及四肢未见畸形。血酰基肉碱提示C0含量极低,C3较正常高值升高3.7倍。尿液GC-MS见少量甲基丙二酸,全外显基因检测出SUCLG1基因c.901G>A(p.Gly301Arg)和c.315-316dup(p.Glu106GlyfsTer63)复合变异,确诊脑肌病型MDS 9型。共检索13篇文献20例新生儿期发病的脑肌病型MDS 9型患者,包括本例共21例,临床特征主要为新生儿期出现不明原因的肌张力减低、喂养困难,伴有甲基丙二酸轻度升高,95%有高乳酸血症,80%有呼吸窘迫,累及呼吸、循环系统者更易出现致死性乳酸酸中毒,全外显子基因测序示SUCLG1基因突变。治疗以支持为主,预后差,死亡率高。结论新生儿期不明原因的肌张力减低、喂养困难、乳酸酸中毒、甲基丙二酸轻度升高应警惕新生儿脑肌病型MDS 9型,累及呼吸、循环系统者更易出现新生儿致死性酸中毒,基因测序可帮助诊断。 展开更多
关键词 线粒体dna耗竭综合征 SUCLG1基因 婴儿 新生 酸中毒 基因突变 琥珀酰CoA连接酶类
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