After the recent publication in the Journal of Biophysical Chemistry entitled “Retracted HIV Study Provides New Information about the Status of the in Vitro Inhibition of DNA Replication by Back-bone Methylation”, i...After the recent publication in the Journal of Biophysical Chemistry entitled “Retracted HIV Study Provides New Information about the Status of the in Vitro Inhibition of DNA Replication by Back-bone Methylation”, it is of importance to review the results of Buck’s group on the synthesis and conformation analyses of phosphate-methylated RNAs in order to afford information on the absence of a further investigation with regard to this de facto acceptable approach. In fact these compounds belong to the very first group of RNAs with a modified neutral backbone by phosphatemethylation. In contrast to the corresponding phosphate-methylated DNAs with a frozen B-conformation, the phosphate-methylated RNAs show an A-conformation. The latter is a prerequisite for duplex formation with (complementary) (natural) RNA. A number of experiments support this fundamental statement. After the HIV study was retracted, the overall results concerning the phosphate-methylated RNAs were published without mentioning Buck’s initial proof of concept and his contributions. Generally, the (modified) dimer RNAs and DNAs possess a number of specific biophysical properties. A novel explanation is given for conflicting structural determinations.展开更多
目的探究社会性不同的拉布拉多犬认知能力是否存在差异。方法参照瑞典工作犬协会(the Swedish Working Dog Association)创建的犬气质评估测试(dog mentality assessment,DMA),使用DMA测试中的社会接触、游戏Ⅰ、距离游戏、扮鬼和游戏Ⅱ...目的探究社会性不同的拉布拉多犬认知能力是否存在差异。方法参照瑞典工作犬协会(the Swedish Working Dog Association)创建的犬气质评估测试(dog mentality assessment,DMA),使用DMA测试中的社会接触、游戏Ⅰ、距离游戏、扮鬼和游戏Ⅱ5个子测试中的12个行为变量来评估犬的社会性,根据评分标准对中国导盲犬大连培训基地提供的49只拉布拉多犬的社会性行为变量进行评分,使用聚类分析将其分为社会性高分组(n=15)和低分组(n=34)。根据Bray等的犬认知发展系列测试(dog cognitive development battery,DCDB)建立了新的犬认知能力测试体系,对犬的社会线索使用、无法解决任务、抑制控制、认知灵活、工作记忆和多步骤解决任务等不同领域的认知能力进行测试,记录犬在测试中的行为表现及持续时长,统计分析社会性不同的犬认知能力是否存在差异。结果社会性高分组与低分组的犬在无法解决任务、抑制控制测试和多步骤解决任务中的行为变量上存在显著差异。在无法解决任务中,社会性高分组的犬注视人时长显著高于社会性低分组的犬(P=0.008),注视人潜伏时长显著低于社会性低分组的犬(P=0.0001)。在抑制控制测试中,社会性高分组的犬选择正确率显著高于社会性低分组的犬(P=0.034),选择时长显著低于社会性低分组的犬(P=0.039)。在多步骤解决任务中,社会性高分组的犬完成木桩任务数量显著高于社会性低分组的犬(P=0.044);操作木桩时长占比显著低于社会性低分组的犬(P=0.05);完成骨头盘任务平均时长显著高于社会性低分组的犬(P=0.037);操作骨头盘时长占比显著低于社会性低分组的犬(P=0.038)。涉及可操作仪器的测试中,社会性高分组的犬注视人时长高于社会性低分组的犬,操作仪器时长低于低分组的犬,但经统计无显著差异(P>0.05)。结论社会性不同的犬的认知能力存在差异。社会性好的拉布拉多犬表现出更强的认知能力,它们在测试时抑制冲动的能力更强,完成多步骤解决任务的能力更强,在遇到无法解决任务时更倾向于转变策略向人寻求新线索而不是执着于操作仪器。展开更多
目的通过检测口腔癌皮下移植瘤小鼠小肠中代谢物和代谢通路的变化,分析过表达miR-181a-5p对皮下移植瘤小鼠小肠中代谢物和代谢物组的影响。方法实验分为3组,空白对照(Control)组、阴性对照(negative control,NC)组以及实验(over express...目的通过检测口腔癌皮下移植瘤小鼠小肠中代谢物和代谢通路的变化,分析过表达miR-181a-5p对皮下移植瘤小鼠小肠中代谢物和代谢物组的影响。方法实验分为3组,空白对照(Control)组、阴性对照(negative control,NC)组以及实验(over expression of miR-181a-5p,OE)组。将不同组别处理后的细胞混悬液,通过皮下注射到M-NSG重度免疫缺陷雌性小鼠右侧腹股沟中上部,构建成口腔癌皮下移植瘤小鼠模型。按时记录小鼠体重变化,对小鼠小肠组织进行HE染色,观察各组病理变化。采用超高效液相色谱-串联飞行时间质谱联用仪和串联Orbitrap质谱联用仪检测NC组、OE组和Control组小鼠小肠中的代谢物,使用XCMS预分析原始数据,质量评价样本数据,鉴定Control组与NC组、NC组与OE组的差异代谢物,进行KEGG富集分析获取差异代谢通路。结果Control组和NC组小肠组织中共鉴定出170种差异代谢物。代谢物富集的显著性信号通路包括胆碱代谢、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、γ-氨基丁酸(GABA)神经突触代谢、甘油磷脂代谢、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路代谢、癌症中心碳代谢以及烟酸和烟碱胺代谢通路。NC组和OE组相比,小鼠小肠中检测到VIP(variable importance in the projection)>2的差异代谢物有16种,显著性差异代谢物包括甘油磷酰胆碱、棕榈酸、3-羟基丁酰肉碱、β-羟丁酸等。代谢物富集到的显著性差异通路为胆碱代谢通路。结论口腔癌皮下移植瘤可引起小鼠小肠的代谢物发生变化,主要改变了小肠中与能量代谢相关的代谢物。过表达miR-181a-5p影响口腔癌皮下移植瘤小鼠小肠代谢物,代谢物富集通路为胆碱代谢通路。展开更多
文摘After the recent publication in the Journal of Biophysical Chemistry entitled “Retracted HIV Study Provides New Information about the Status of the in Vitro Inhibition of DNA Replication by Back-bone Methylation”, it is of importance to review the results of Buck’s group on the synthesis and conformation analyses of phosphate-methylated RNAs in order to afford information on the absence of a further investigation with regard to this de facto acceptable approach. In fact these compounds belong to the very first group of RNAs with a modified neutral backbone by phosphatemethylation. In contrast to the corresponding phosphate-methylated DNAs with a frozen B-conformation, the phosphate-methylated RNAs show an A-conformation. The latter is a prerequisite for duplex formation with (complementary) (natural) RNA. A number of experiments support this fundamental statement. After the HIV study was retracted, the overall results concerning the phosphate-methylated RNAs were published without mentioning Buck’s initial proof of concept and his contributions. Generally, the (modified) dimer RNAs and DNAs possess a number of specific biophysical properties. A novel explanation is given for conflicting structural determinations.
文摘目的探究社会性不同的拉布拉多犬认知能力是否存在差异。方法参照瑞典工作犬协会(the Swedish Working Dog Association)创建的犬气质评估测试(dog mentality assessment,DMA),使用DMA测试中的社会接触、游戏Ⅰ、距离游戏、扮鬼和游戏Ⅱ5个子测试中的12个行为变量来评估犬的社会性,根据评分标准对中国导盲犬大连培训基地提供的49只拉布拉多犬的社会性行为变量进行评分,使用聚类分析将其分为社会性高分组(n=15)和低分组(n=34)。根据Bray等的犬认知发展系列测试(dog cognitive development battery,DCDB)建立了新的犬认知能力测试体系,对犬的社会线索使用、无法解决任务、抑制控制、认知灵活、工作记忆和多步骤解决任务等不同领域的认知能力进行测试,记录犬在测试中的行为表现及持续时长,统计分析社会性不同的犬认知能力是否存在差异。结果社会性高分组与低分组的犬在无法解决任务、抑制控制测试和多步骤解决任务中的行为变量上存在显著差异。在无法解决任务中,社会性高分组的犬注视人时长显著高于社会性低分组的犬(P=0.008),注视人潜伏时长显著低于社会性低分组的犬(P=0.0001)。在抑制控制测试中,社会性高分组的犬选择正确率显著高于社会性低分组的犬(P=0.034),选择时长显著低于社会性低分组的犬(P=0.039)。在多步骤解决任务中,社会性高分组的犬完成木桩任务数量显著高于社会性低分组的犬(P=0.044);操作木桩时长占比显著低于社会性低分组的犬(P=0.05);完成骨头盘任务平均时长显著高于社会性低分组的犬(P=0.037);操作骨头盘时长占比显著低于社会性低分组的犬(P=0.038)。涉及可操作仪器的测试中,社会性高分组的犬注视人时长高于社会性低分组的犬,操作仪器时长低于低分组的犬,但经统计无显著差异(P>0.05)。结论社会性不同的犬的认知能力存在差异。社会性好的拉布拉多犬表现出更强的认知能力,它们在测试时抑制冲动的能力更强,完成多步骤解决任务的能力更强,在遇到无法解决任务时更倾向于转变策略向人寻求新线索而不是执着于操作仪器。
文摘目的通过检测口腔癌皮下移植瘤小鼠小肠中代谢物和代谢通路的变化,分析过表达miR-181a-5p对皮下移植瘤小鼠小肠中代谢物和代谢物组的影响。方法实验分为3组,空白对照(Control)组、阴性对照(negative control,NC)组以及实验(over expression of miR-181a-5p,OE)组。将不同组别处理后的细胞混悬液,通过皮下注射到M-NSG重度免疫缺陷雌性小鼠右侧腹股沟中上部,构建成口腔癌皮下移植瘤小鼠模型。按时记录小鼠体重变化,对小鼠小肠组织进行HE染色,观察各组病理变化。采用超高效液相色谱-串联飞行时间质谱联用仪和串联Orbitrap质谱联用仪检测NC组、OE组和Control组小鼠小肠中的代谢物,使用XCMS预分析原始数据,质量评价样本数据,鉴定Control组与NC组、NC组与OE组的差异代谢物,进行KEGG富集分析获取差异代谢通路。结果Control组和NC组小肠组织中共鉴定出170种差异代谢物。代谢物富集的显著性信号通路包括胆碱代谢、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、γ-氨基丁酸(GABA)神经突触代谢、甘油磷脂代谢、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路代谢、癌症中心碳代谢以及烟酸和烟碱胺代谢通路。NC组和OE组相比,小鼠小肠中检测到VIP(variable importance in the projection)>2的差异代谢物有16种,显著性差异代谢物包括甘油磷酰胆碱、棕榈酸、3-羟基丁酰肉碱、β-羟丁酸等。代谢物富集到的显著性差异通路为胆碱代谢通路。结论口腔癌皮下移植瘤可引起小鼠小肠的代谢物发生变化,主要改变了小肠中与能量代谢相关的代谢物。过表达miR-181a-5p影响口腔癌皮下移植瘤小鼠小肠代谢物,代谢物富集通路为胆碱代谢通路。
