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Expression of O<sup>6</sup>-Methylguanine-DNA Methyltransferase Examined by Alkyl-Transfer Assays, Methylation-Specific PCR and Western Blots in Tumors and Matched Normal Tissue 被引量:1
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作者 Kimiko Ishiguro Krishnamurthy Shyam +4 位作者 Philip G. Penketh Raymond P. Baumann Alan C. Sartorelli Thomas J. Rutherford Elena S. Ratner 《Journal of Cancer Therapy》 2013年第4期919-931,共13页
The tumor selectivity of alkylating agents that produce guanine O6-chloroethyl (laromustine and carmustine) and O6-methyl (temozolomide) lesions depends upon O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) activity bein... The tumor selectivity of alkylating agents that produce guanine O6-chloroethyl (laromustine and carmustine) and O6-methyl (temozolomide) lesions depends upon O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) activity being lower in tumor than in host tissue. Despite the established role of MGMT as a tumor resistance factor, consensus on how to assess MGMT expression in clinical samples is unsettled. The aim of this study is to examine the relationship between the values derived from distinctive MGMT measurements in 13, 12, 6 and 2 pairs of human tumors and matched normal adjacent tissue from the colon, kidney, lung and liver, respectively, and in human cell lines. The MGMT measurements included 1) alkyl-transfer assays using [benzene-3H]O6-benzylguanine as a substrate to assess functional MGMT activity, 2) methylation-specific PCR (MSP) to probe MGMT gene promoter CpG methylations as a measure of gene silencing, and 3) western immunoblots to analyze the MGMT protein. In human cell lines, a strict negative correlation existed between MGMT activity and the extent of promoter methylation. In tissue specimens, by contrast, the correlation between these two variables was low. Moreover, alkyl-transfer assays identified 3 pairs of tumors and normal tissue with tumor-selective reduction in MGMT activity in the absence of promoter methylation. Cell line MGMT migrated as a single band in western analyses, whereas tissue MGMT was heterogeneous around its molecular size and at much higher molecular masses, indicative of multi-layered post-translational modifications. Malignancy is occasionally associated with a mobility shift in MGMT. Contrary to the prevalent expectation that MGMT expression is governed at the level of gene silencing, these data suggest that other mechanisms that can lead to tumorselective reduction in MGMT activity exist in human tissue. 展开更多
关键词 O6-methylguanine-dna methylTRANSFERASE (MGMT O6-Alkylguanine-dna Alkyltransferase AGT) [Benzene-3H]O6-Benzylguanine methylation-specific pcr (msp) Laromustine (Onrigin Cloretazine VNP40101M 101M) TEMOZOLOMIDE
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玉米MuDR转座子DNA甲基化的MSP检测(英文)
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作者 钱叶雄 江海洋 +1 位作者 程备久 朱苏文 《激光生物学报》 CAS CSCD 2009年第6期834-839,共6页
DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,广泛存在于高等动植物中,并在维持基因组稳定性、调节基因表达等方面起着重要作用,因此建立快速有效地DNA甲基化检测技术至关重要。本文以两种不同MuDR活性的玉米转座子材料为研究对象,探讨了甲基... DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,广泛存在于高等动植物中,并在维持基因组稳定性、调节基因表达等方面起着重要作用,因此建立快速有效地DNA甲基化检测技术至关重要。本文以两种不同MuDR活性的玉米转座子材料为研究对象,探讨了甲基化特异性PCR(MSP)在检测DNA甲基化的有效性。结果表明:MSP技术可快速有效地检测MuDR转座子的末端反向重复(TIRs)序列内的CpG岛DNA甲基化的变化,灵敏度高,特异性强,可作为植物已知基因DNA甲基化检测的一种新方法。同时利用MSP研究发现,玉米MuDR转座子的活性随其TIRs序列内的CpG岛DNA甲基化的变化而改变,DNA甲基化是调控玉米MuDR转座活性的重要分子机制之一。 展开更多
关键词 Mutator转座子 dna甲基化 甲基化特异性pcr(msp)
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DNA修复基因MGMT启动子区过甲基化与脑胶质瘤 被引量:5
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作者 高薇 王之敏 +1 位作者 周岱 朱凤清 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期26-28,共3页
目的在许多肿瘤中发现启动子区过甲基化而导致O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)的转录失活,本研究拟从胶质瘤患者肿瘤组织和其对应血清中MGMT基因启动子过甲基化是否有一致性对MGMT基因启动子甲基化进行研究。方法采用甲基化特异性PCR... 目的在许多肿瘤中发现启动子区过甲基化而导致O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)的转录失活,本研究拟从胶质瘤患者肿瘤组织和其对应血清中MGMT基因启动子过甲基化是否有一致性对MGMT基因启动子甲基化进行研究。方法采用甲基化特异性PCR法(MSP)进行MGMT基因启动子区甲基化水平的检测。结果27例胶质瘤组织中有14例(51.9%)MGMT甲基化扩增阳性,13例(48.1%)为MGMT去甲基化扩增阳性。相应的血清中有13例(48.1%)MGMT甲基化扩增阳性,14例(51.9%)MGMT去甲基化扩增阳性(P<0.05)。结论胶质瘤患者肿瘤组织和其对应的血清中MGMT基因启动子甲基化状态具有显著相关性。测定血清中MGMT基因启动子区的甲基化状态能反应胶质瘤组织中MGMT基因启动子区甲基化状态。MSP是检测MGMT基因启动子区甲基化灵敏和可靠的方法,可以指导临床脑胶质瘤的个体化化疗方案的设计。 展开更多
关键词 胶质瘤 MGMT基因 甲基化 甲基化特异pcr检测
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胶质瘤组织中DNA修复基因MGMT启动子区过甲基化研究 被引量:1
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作者 王之敏 高薇 +4 位作者 朱凤清 许期年 左剑玲 王秀云 周岱 《中国神经肿瘤杂志》 2005年第4期248-251,共4页
背景与目的:O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNAmethyltransferase,MGMT)是肿瘤细胞产生亚硝脲药物抗药性的分子基础。启动子区过甲基化而导致MGMT基因的转录失活,影响MGMT蛋白表达。本研究探索了胶质瘤组织中MGMT基因... 背景与目的:O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNAmethyltransferase,MGMT)是肿瘤细胞产生亚硝脲药物抗药性的分子基础。启动子区过甲基化而导致MGMT基因的转录失活,影响MGMT蛋白表达。本研究探索了胶质瘤组织中MGMT基因启动子区过甲基化状态及其与MGMT蛋白表达的关系。方法:采用甲基化特异性聚合酶链反应分析胶质瘤组织中MGMT基因启动子区过甲基化状态,同时采用免疫组织化学法分析胶质瘤组织中MGMT蛋白表达情况。结果:在27例胶质瘤患者的肿瘤组织标本中,18例MGMT蛋白表达呈阳性的胶质瘤组织中7例MGMT基因启动子甲基化,阳性率为38.9%;9例MGMT蛋白表达呈阴性的胶质瘤组织中7例MGMT基因启动子甲基化,阳性率为77.8%(P<0.05)。结论:MGMT基因启动子区的甲基化状态与MGMT蛋白的表达相关。MGMT基因启动子过甲基化,MGMT蛋白表达较低;MGMT基因启动子去甲基化,MGMT蛋白表达较高。 展开更多
关键词 胶质瘤 MGMT基因 O^6-甲基鸟嘌呤-dna 甲基转移酶 甲基化 甲基化特异的pcr 免疫组织化学
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一种改良的亚硫酸氢盐修饰微量DNA的甲基化分析方法
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作者 冯苏妹 杨磊 +1 位作者 吕嘉春 纪卫东 《中国医学创新》 CAS 2008年第32期9-11,共3页
目的建立一种改良的亚硫酸氢盐修饰微量DNA的甲基化分析方法。方法应用低熔点琼脂糖包埋不同含量的DNA,进行亚硫酸氢盐修饰,通过MGMT基因甲基化与非甲基化特异PCR的扩增,与传统的亚硫酸氢盐修饰法进行分析比较。结果改良法对于低至15.62... 目的建立一种改良的亚硫酸氢盐修饰微量DNA的甲基化分析方法。方法应用低熔点琼脂糖包埋不同含量的DNA,进行亚硫酸氢盐修饰,通过MGMT基因甲基化与非甲基化特异PCR的扩增,与传统的亚硫酸氢盐修饰法进行分析比较。结果改良法对于低至15.625ng的DNA修饰均可获得MGMT基因甲基化扩增产物,而传统法对于62.5ng及其以下的DNA修饰难以获得MGMT基因甲基化扩增产物。结论改良的亚硫酸氢盐修饰方法可有效提高甲基化特异PCR的灵敏度,该方法为微量DNA的甲基化分析提供了一种较理想的研究手段。 展开更多
关键词 亚硫酸氢盐修饰 微量dna 甲基化特异pcr(msp)
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实时荧光定量检测人血浆中RASSF1A基因启动子甲基化 被引量:4
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作者 高丽 潘世扬 +8 位作者 束永前 谢而付 陈进步 赵文君 穆原 张丽霞 陈丹 黄珮珺 张寄南 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期194-196,共3页
目的建立检测人血浆DNA中RASSF1A基因甲基化的方法。方法以肺癌细胞株NCI-H460作为RASSF1A基因启动子区甲基化阳性样本,传统酚/氯仿法提取细胞DNA,经紫外分光光度计定量后以10倍稀释的浓度梯度依次投入到200μl健康人血浆中,制备得到模... 目的建立检测人血浆DNA中RASSF1A基因甲基化的方法。方法以肺癌细胞株NCI-H460作为RASSF1A基因启动子区甲基化阳性样本,传统酚/氯仿法提取细胞DNA,经紫外分光光度计定量后以10倍稀释的浓度梯度依次投入到200μl健康人血浆中,制备得到模拟肺癌患者血浆。用磁珠法从模拟血浆样本和15例早期肺癌患者血浆中提取总DNA。对血浆DNA模板进行亚硫酸氢盐化学修饰,并以TaqMan技术的实时荧光定量甲基化特异性PCR(MSP)进行检测。以模拟血浆样品作为标准品,用外标准曲线法对肺癌患者血浆中的甲基化RASSF1A进行定量。结果实时荧光定量MSP对模拟肺癌患者血浆的检测最低限为150拷贝(甲基化的肿瘤DNA)/ml(血浆)。15例肺癌患者5例RASSF1A甲基化阳性(33.3%)。5例肺癌患者血浆中甲基化的RASSF1A基因的浓度分别为2.56×103,8.20×104,1.45×104,3.31×104和4.24×104拷贝/ml。结论实时荧光定量MSP法检测肺癌患者血浆DNA中RASSF1A基因甲基化,灵敏度高,特异性强。 展开更多
关键词 RASSF1A 甲基化 实时荧光定量 甲基化特异性聚合酶链反应 肺癌 血浆dna
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胃癌中ABCG2的表达及其甲基化探讨 被引量:1
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作者 周林艳 齐秋锋 万美珍 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1298-1301,共4页
目的观察胃癌中三磷酸腺苷结合转运蛋白G超家族成员2(ATP binding cassette transpoter G2,ABCG2)基因的表达及其启动子区CpG岛甲基化水平,探讨其在胃癌发生、发展中的作用。方法采用实时荧光定量RT-PCR法检测6株胃癌细胞株和76例胃癌... 目的观察胃癌中三磷酸腺苷结合转运蛋白G超家族成员2(ATP binding cassette transpoter G2,ABCG2)基因的表达及其启动子区CpG岛甲基化水平,探讨其在胃癌发生、发展中的作用。方法采用实时荧光定量RT-PCR法检测6株胃癌细胞株和76例胃癌组织标本及其对应的癌旁组织中ABCG2 mRNA表达,应用免疫组化SP法检测ABCG2蛋白表达。应用甲基化特异性PCR(MSP)法检测ABCG2基因启动子区的甲基化状态。结果 (1)实时荧光定量RT-PCR结果显示ABCG2在低分化胃癌细胞系HGC-27、MKN-45中呈高表达,而在高分化胃癌细胞系AGS及低分化胃癌细胞系MGC-803中呈低表达。胃癌组织中ABCG2 mRNA的表达下调,与患者性别、年龄、浸润深度、肿瘤大小、淋巴结转移无明显相关,但与胃癌分化程度相关。(2)免疫组化结果显示胃癌组织中ABCG2阳性率为41%,癌旁组织中ABCG2阳性率为35%,两组间差异无统计学意义。有淋巴结转移与无淋巴结转移的胃癌组织中ABCG2阳性率分别为54.5%、21.8%,差异有统计学意义。低分化腺癌与高+中分化腺癌组织中ABCG2阳性率分别为62.5%、16.7%,差异有统计学意义。(3)甲基化结果显示仅在胃癌细胞系MGC-803检测到ABCG2基因甲基化,胃癌组织中未检测到甲基化。结论 ABCG2的表达与胃癌的分化程度及侵袭能力有关,其甲基化不参与胃癌的发生、发展。 展开更多
关键词 胃肿瘤 ABCG2 dna甲基化 甲基化特异性pcr 实时荧光定量RT—pcr
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灯盏花自交不亲和SRK基因编码区甲基化分析
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作者 张薇 孟衡玲 +3 位作者 孟珍贵 梁泉 魏翔 杨生超 《西部林业科学》 CAS 2016年第6期8-13,24,共7页
为研究灯盏花自交不亲和基因SRK(Eb SRK)的DNA甲基化变异,本文利用甲基化敏感限制性内切酶-PCR法,对Eb SRK基因中包含CCGG位点的部分编码区进行甲基化分析,同时,利用RT-PCR检测Eb SRK基因在灯盏花不同组织中的表达情况。实验结果显示,Eb... 为研究灯盏花自交不亲和基因SRK(Eb SRK)的DNA甲基化变异,本文利用甲基化敏感限制性内切酶-PCR法,对Eb SRK基因中包含CCGG位点的部分编码区进行甲基化分析,同时,利用RT-PCR检测Eb SRK基因在灯盏花不同组织中的表达情况。实验结果显示,Eb SRK基因中的两个CCGG位点不存在甲基化,而Eb SRK基因在不同组织该基因的表达量有显著的差异性。这说明对Eb SRK等位基因的抑制不是由于Eb SRK基因中CCGG位点甲基化引起,而存在其他的调控机理。 展开更多
关键词 灯盏花 SRK基因 dna甲基化 MS-RE-pcr mspⅠ/HpaⅡ RT-pcr
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非小细胞肺癌中ASC基因启动子甲基化的意义 被引量:4
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作者 张志学 张林 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期674-677,共4页
目的:探讨非小细胞肺癌(NSCLC)中ASC基因启动子甲基化与患者临床特征之间的关系以及去甲基化试剂对肺癌细胞系中ASC基因甲基化状态的逆转。方法:应用甲基化特异性PCR(MSP)检测48例NSCLC患者肿瘤组织和3株肺癌细胞系中ASC基因的甲基化状... 目的:探讨非小细胞肺癌(NSCLC)中ASC基因启动子甲基化与患者临床特征之间的关系以及去甲基化试剂对肺癌细胞系中ASC基因甲基化状态的逆转。方法:应用甲基化特异性PCR(MSP)检测48例NSCLC患者肿瘤组织和3株肺癌细胞系中ASC基因的甲基化状态,RT-PCR检测去甲基化试剂诱导肺癌细胞系中甲基化ASC基因的重新表达。结果:NSCLC肿瘤组织和相对应的正常肺组中ASC基因启动子甲基化的发生率分别为49.7%和8.3%,二者之间有显著性差异(P<0.01)。重度吸烟患者的肿瘤组织中ASC基因启动子甲基化的发生率明显增高(P<0.05),早期的NSCLC(T1)中ASC基因启动子甲基化也有相对较高的发生率(P<0.05)。去甲基化试剂5-氮-2′-脱氧胞苷(5-aza-2′-deoxycytidine)可使甲基化的ASC基因启动子发生逆转而获得重新表达。结论:ASC基因启动子的甲基化可能与吸烟引起的非小细胞肺癌有关,并可能是非小细胞肺癌发展过程中的一个早期事件,甲基化的ASC基因可以成为NSCLC治疗的靶点。 展开更多
关键词 肺癌 ASC基因 dna甲基化 甲基化特异性pcr RT-pcr
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尿液中多基因启动子甲基化联合检测诊断膀胱癌的研究 被引量:1
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作者 王晨青 高杨 +6 位作者 寇博 石琦 杜冲 徐珊 王新阳 贺大林 郭鹏 《现代泌尿外科杂志》 CAS 2014年第9期610-614,共5页
目的探索一种更加有效的通过尿液细胞中多基因甲基化分析诊断膀胱癌的方法。方法应用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测37例膀胱癌患者和31例非膀胱癌对照患者尿液中P14、RASSF1A、SLIT2、RASAL1基因启动子区的甲基化状态。结果尿液细胞中通... 目的探索一种更加有效的通过尿液细胞中多基因甲基化分析诊断膀胱癌的方法。方法应用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测37例膀胱癌患者和31例非膀胱癌对照患者尿液中P14、RASSF1A、SLIT2、RASAL1基因启动子区的甲基化状态。结果尿液细胞中通过P14、RASSF1A、SLIT2、RASAL1基因启动子区的甲基化状态检测膀胱癌的敏感性分别为75.7%、75.7%、62.2%、37.8%,与此相对它们的特异性为77.4%、90.3%、90.3%、93.5%。当4个基因中只有一个出现甲基化就诊断为膀胱癌时的敏感性为89.2%。结论膀胱癌患者尿液中多基因甲基化联合分析可能是一种高效的诊断膀胱癌的方法。 展开更多
关键词 膀胱肿瘤 dna甲基化
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Ephb4启动子区域甲基化与肺腺癌的关系 被引量:1
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作者 王晓臣 张洪涛 +4 位作者 刘泽毅 雷哲 刘仍允 赵军 狄洪震 《中国血液流变学杂志》 CAS 2009年第1期10-12,共3页
目的研究肺腺癌患者外周血中Ephb4启动子区域甲基化状态,发现Ephb4甲基化与肺腺癌之间的关系。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)方法检测肺腺癌样本、及对照正常人血样本中Ephb4基因启动子区甲基化表型状态。结果证明Ephb4基因启动子区... 目的研究肺腺癌患者外周血中Ephb4启动子区域甲基化状态,发现Ephb4甲基化与肺腺癌之间的关系。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)方法检测肺腺癌样本、及对照正常人血样本中Ephb4基因启动子区甲基化表型状态。结果证明Ephb4基因启动子区域在肺腺癌血样本中呈现高甲基化状态23.8%,正常人血样本中为O%。结论Ephb4基因启动子区域呈现高甲基化状态,表明Ephb4基因可能是肺腺癌的发生的早期事件,在肺腺癌的发生发展过程中起重要作用。 展开更多
关键词 肺腺癌 Ephb4基因 甲基化 特异性甲基pcr(msp)
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