DNA微阵列图象信息的自动提取

微阵列图象分析是分子生物学中DNA微阵列杂交实验数据测定过程的一个重要部分。其目的是将微阵列图象中大量象素灰度信息简化为微阵列靶点的信号值。该文介绍了一种对DNA微阵列图象信息进行自动提取的方法,使用此方法完全不需要人为操作,可避免操作者主观性对实验的影响,提高数据提取的效率和可重复性。其关键步骤包括:图象滤波,图象灰度信息提取,微阵列间距确定,靶点定位和靶点信号值计算。实验结果表明使用此算法提取DNA微阵列图象信息具有重复性好、效率高和分析准确的特点。

一种基于聚类和统计分析DNA基因芯片图像处理算法

DNA基因芯片可以同时监控成千上万个基因的表达信息。图像分析是基因芯片试验中一个重要的环节,直接影响到其后续的处理、分析和研究,比如鉴别预测具有不同表达信息的基因功能。基因芯片图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及信息抽取。该文主要研究分割和信息抽取问题。首先基于K-Means聚类技术提出了一种新的分割方法;其次基于统计分析文章建议了一种新的背景和前景分割校正方法用于更准确的信息抽取。新方法的优点是对于基因芯片中spot图像没有任何形状限制。实际图像分析结果与目前最流行的基因芯片图像分析软件GenePix对比研究表明该文算法是精确有效的。

DNA微阵列的数字图像处理

从微阵列图像中提取基因表达和识别基因,并进一步测定基因的功能是DNA微阵列研究的主要目标。而微阵列图像处理通过定位和提取每个cDNA靶点上探针的信号强度,并通过计算平均灰度值和分析强度比率等为生物学家进行更高层的基因分析提供必要条件。本文介绍采用红绿双色荧光标记杂交实验进行微阵列图像处理几个关键步骤:微阵列靶区的分割、背景强度的提取、靶点检测、靶点灰度提取、靶点表达程度分析。