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DNA typing of HLA by reverse PCRSSOP and clinical application
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《中国输血杂志》 CAS CSCD 2001年第S1期371-,共1页
关键词 dna typing of hla by reverse PCRSSOP and clinical application hla
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Screening of Species-specific DNA Probes for Identification of Fallopia multiflora
2
作者 Chuanjin ZHENG Nian CHEN 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2014年第1期22-25,30,共5页
To screen species-specific DNA probes for identification of Fallopia muhiflora, the genomic DNA (gDNA) suppression subtraction hybridization (SSH) between F. muhiflora and F. muhiflora var. ciliinervis was firstly... To screen species-specific DNA probes for identification of Fallopia muhiflora, the genomic DNA (gDNA) suppression subtraction hybridization (SSH) between F. muhiflora and F. muhiflora var. ciliinervis was firstly performed. The obtained differential gDNA fragments by SSH were then hybridized with gDNA ar- rays consisting of multiple whole genomes of several species (adulterants and/or closely related species of F. muhiflora) and four differential fragments were screened uniquely representing F. muhiflora, which could be used as F. muhiflora species-specific probes. The screened DNA probes were tested by reverse dot blot hybridization and the results demonstrated that these probes could be used reliably to identify F, muhiflora. The species-specific DNA probes obtained in this study exhibited broad application prospects in the preparation of gene chips for identifying Chinese traditional medicines and the authentication of germplasm re- sources and crude drugs of F. muhiflora. 展开更多
关键词 Fallopia muhiflora dna probe Species identification Reverse dot blot hybridization
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一种新型Al^(3+)荧光探针的合成及与DNA的相互作用
3
作者 孟德素 庞艳玲 +2 位作者 石广革 段升霞 刘玉玲 《现代化工》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期227-231,共5页
以2-羟基-1-萘甲醛、邻氨基苯甲醛为原料,设计合成了一种新型Schiff碱Al^(3+)荧光探针S,并通过1HNMR、^(13)CNMR、ESI-MS、IR对探针S进行结构表征。光谱实验结果表明,探针S在DMSO∶H_(2)O=4∶1(V/V)体系中,对Al^(3+)有良好的荧光和裸眼... 以2-羟基-1-萘甲醛、邻氨基苯甲醛为原料,设计合成了一种新型Schiff碱Al^(3+)荧光探针S,并通过1HNMR、^(13)CNMR、ESI-MS、IR对探针S进行结构表征。光谱实验结果表明,探针S在DMSO∶H_(2)O=4∶1(V/V)体系中,对Al^(3+)有良好的荧光和裸眼识别。Al^(3+)浓度在2.0~50μmol/L范围内,体系荧光强度呈现出良好的线性关系,检出限为0.033μmol/L,探针S与Al^(3+)形成1∶1的配合物。通过荧光光谱研究了荧光探针S-Al^(3+)配合物与DNA的相互作用,实验结果表明,探针S-Al^(3+)配合物对DNA的猝灭过程为动态猝灭,同时对不同温度下相互作用的结合点常数、结合位点数及热力学参数进行了计算,推断二者作用力的类型为疏水作用,作用方式为嵌插作用。 展开更多
关键词 SCHIFF碱 铝离子 邻氨基苯甲醛 dna 荧光探针
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DNA序列分析鉴定HLA-DRB1新等位基因DRB1 1449 被引量:7
4
作者 缪扣荣 潘芹芹 +7 位作者 薛敏 旭日 周小玉 费小明 赵星 徐安龙 汪承亚 KuKuruga D 《中国输血杂志》 CAS CSCD 2006年第2期100-103,共4页
目的鉴定HLADRB1位点新等位基因。方法应用基因克隆和DNA测序技术对1例受检样本HLADRB1基因第2外显子(Exon2)作核苷酸序列分析,与已知等位基因序列比对并作血清学分型。结果基因组DNA和DNA克隆的测序结果一致;DRB1Exon2的核苷酸序列与... 目的鉴定HLADRB1位点新等位基因。方法应用基因克隆和DNA测序技术对1例受检样本HLADRB1基因第2外显子(Exon2)作核苷酸序列分析,与已知等位基因序列比对并作血清学分型。结果基因组DNA和DNA克隆的测序结果一致;DRB1Exon2的核苷酸序列与已知等位基因序列均不相同,与同源性最高的HLADRB11432相比,存在4处碱基的改变;以Exon2的第1位碱基为记数起点,核苷酸71位C→>G,196位G→>A,244位T→>G和245位上G→>T,引起相应编码氨基酸28位上天门冬氨酸(Asp)→>谷氨酸(Glu),70位上精氨酸(Arg)→>谷氨酸盐(Gln),86位上缬氨酸(Val)→>氨基乙酸(Gly)。血清学分型结果表明新等位基因血清学特异性为DR14。结论被检标本HLADRB位点存在新等位基因,2005年2月WHOHLA命名委员会正式将其命名为HLADRB11449。 展开更多
关键词 新等位基因 DRB1^* 1449 hla dna 测序dna 亚克隆
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沈阳汉族人群HLA-DR、DQ、DP的DNA分型研究 被引量:18
5
作者 于桂兰 孙逸平 +5 位作者 徐林敏 高风云 李桂芹 郭玉红 邵惠心 沈晶晶 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1995年第3期142-145,共4页
使用PCR/SSO方法对94名沈阳汉族健康人群进行了HLA第Ⅱ类抗原等位基因的完全分型。共发现66种等位基因,基中DRB128种,DRB33种,DRB54种,DQA18种,DQB1I3种,DPB110种。分析了DR-... 使用PCR/SSO方法对94名沈阳汉族健康人群进行了HLA第Ⅱ类抗原等位基因的完全分型。共发现66种等位基因,基中DRB128种,DRB33种,DRB54种,DQA18种,DQB1I3种,DPB110种。分析了DR-DQ连锁的五位点单倍型,共发现38种,其中21种是在白人为主的人群中已发现过的。本研究提出了中国东北人群HLA第Ⅱ类抗原等位基因的遗传基本情况,可用于疾病研究的对照和其他中国人群资料的比较。 展开更多
关键词 白细胞 抗原 脱氧核糖核酸 等位基因 沈阳 汉族
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基因组DNA高通量提取技术及其在骨髓库捐献者样本HLA基因分型中的应用 被引量:3
6
作者 王大明 唐斯 +3 位作者 李桢 程曦 高素青 邓志辉 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2009年第5期1265-1268,共4页
本研究旨在建立从全血EDTA抗凝样本中高通量提取基因组DNA的有效方法,以常规应用于Luminexr SSO HLA流式磁珠基因分型。使用2ml深孔板和TECAN DNA全自动工作站,从288份骨髓捐献者样本中提取基因组DNA;提取的DNA样本用紫外分光光度仪测... 本研究旨在建立从全血EDTA抗凝样本中高通量提取基因组DNA的有效方法,以常规应用于Luminexr SSO HLA流式磁珠基因分型。使用2ml深孔板和TECAN DNA全自动工作站,从288份骨髓捐献者样本中提取基因组DNA;提取的DNA样本用紫外分光光度仪测定其浓度和纯度,并采用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性;DNA样本用Onelambdar SSOHLA-A、B和DRB1基因分型试剂盒进行PCR扩增、分子杂交和Luminex流式磁珠分析仪检测,统计分析每一DNA样本HLA-A、B和DRB1基因扩增产物经DNA探针分子杂交后的阳性磁珠和阴性磁珠的荧光信号强度。结果表明:从400μl全血中提取了基因组DNA,288份样本的DNA产量平均为3.217±0.715μg,A260/A280值平均为1.710±0.103,A260-A320/A280-A320值平均为1.761±0.151;用琼脂糖凝胶电泳法测得DNA的分子量均大于15kb;每一样本HLA-A、-B和-DRB1杂交后的阳性磁珠的荧光信号强度均>600RFU,而阴性磁珠的荧光信号强度<50RFU。结论:本方法适用于从大量全血样本中快速提取基因组DNA,所得的基因组DNA适用于高通量中华骨髓捐献者样本的HLA流式磁珠基因分型等下游的移植免疫学与分子生物学实验。 展开更多
关键词 基因组dna 基因组dna高通量提取 中华骨髓库 hla基因分型
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寡核苷酸DNA Microarray用于HLA DRB1基因分型的研究 被引量:17
7
作者 陈君男 李瑶 +5 位作者 李亚莉 秦红友 李荣宇 曹慧敏 谢毅 毛裕民 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第10期887-894,共8页
对寡核苷酸DNAMicroarray用于HLADRB1基因分型的技术进行研究。常规的酚 /氯仿法提取标准血样基因组DNA ,在DRB1的exon 2区域设计一对引物 ,经PCR扩增基因组相应区段并用Cy5 dCTP进行标记。设计寡核苷酸分型探针 ,将探针固定在APS PDC... 对寡核苷酸DNAMicroarray用于HLADRB1基因分型的技术进行研究。常规的酚 /氯仿法提取标准血样基因组DNA ,在DRB1的exon 2区域设计一对引物 ,经PCR扩增基因组相应区段并用Cy5 dCTP进行标记。设计寡核苷酸分型探针 ,将探针固定在APS PDC法制作的DNAMicroarray上 ,用标记的PCR产物与之杂交 ,扫描仪对杂交结果进行扫描 ,Imagene软件对杂交图象进行分析。共检测了 33例标准血样的HLADRB1基因型。检测结果证明研制的DNAMicroarray准确、灵敏。DNAMicroarray技术可以有效地检测DRB1等位基因 ,对比常规的PCR SSP和PCR SSO方法、分型基因芯片方法更为直观 。 展开更多
关键词 hla DRB1 等位基因 基因分型 寡核苷酸dna微阵列 PCR-SSP PCR-SSO 基因分型
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HLA组特异性PCR及DNA测序确认新基因HLA-A*110202 被引量:4
8
作者 邢培清 张伯伟 赵磊 《河南医学研究》 CAS 2006年第4期289-293,共5页
目的:用HLA组特异性PCR扩增,DNA测序方法确认新等位基因。方法:用SSO(序列特异性寡核苷酸探针)反向流式荧光微珠法对标本62011550进行常规HL-A、B、DRB1分型检测,A位点反应格局清晰而无法给出确切分型结果,对该基因扩增2、3外显子,以此... 目的:用HLA组特异性PCR扩增,DNA测序方法确认新等位基因。方法:用SSO(序列特异性寡核苷酸探针)反向流式荧光微珠法对标本62011550进行常规HL-A、B、DRB1分型检测,A位点反应格局清晰而无法给出确切分型结果,对该基因扩增2、3外显子,以此为模板采用组特异性引物区分杂合子,分别对杂合子2、3外显子测序,将测序结果与已知的基因序列进行比较。结果:测序得到A*1102v(1102的变异体)序列与已知序列比对发现,在第2对外显子215出现C>A,导致第75密码子GGA>AGA,未引起氨基酸改变(R>R),该序列为新的HLA序列,经向WHO HLA因子命名委员会申报确定为HLA-A 110202,注册号HWS.10003507-DQ3544411(www.ebi.ac.uk/imgt/hla)结论:DNA测序是HLA分型的最直接准确方法,常用于新基因的发现,用组特异性引物区分杂合子进而进行测序简便易行,避免了基因克隆操作。 展开更多
关键词 hla 组特异性 dna测序 新基因
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改良盐酸胍法提取脐血DNA用于HLA基因分型 被引量:1
9
作者 汤雪薇 廖灿 +2 位作者 李焱 谢杏梅 黄以宁 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2006年第2期363-365,共3页
为了比较经典的盐酸胍(Gu·HCl)抽提DNA法和改良盐酸胍抽提DNA法在提取脐血DNA的效果,探讨这两种方法在脐血组织相溶性抗原(HLA)基因分型中的应用,使用盐酸胍抽提DNA法和改良盐酸胍抽提DNA法提取72例脐血标本的DNA,并分别测定其DNA... 为了比较经典的盐酸胍(Gu·HCl)抽提DNA法和改良盐酸胍抽提DNA法在提取脐血DNA的效果,探讨这两种方法在脐血组织相溶性抗原(HLA)基因分型中的应用,使用盐酸胍抽提DNA法和改良盐酸胍抽提DNA法提取72例脐血标本的DNA,并分别测定其DNA的浓度和纯度,采用序列特异性引物聚合酶反应方法(PCR-SSP)比较这两种方法所提取的DNA。结果表明:两种方法提取脐血DNA均获成功;根据对DNA的质量监测发现,用改良盐酸胍抽提DNA在质量上较盐酸胍法好;用于HLA基因分型时,改良盐酸胍抽提DNA法可减少非特异性条带的出现。结论:改良盐酸胍抽提DNA法不但操作简便,成本下降,而且在最少血量中能提取出高纯度的DNA,减少非特异性条带的出现。该法完全可以满足脐血库的日常脐血样品DNA的提取以及脐血HLA基因分型的要求。 展开更多
关键词 dna提取 盐酸胍法 改良盐酸胍法 hla基因分型
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Taq DNA聚合酶导致HLA-DRB,DQ BDNA分型错误1例 被引量:3
10
作者 武大林 丁红 张泓 《中国输血杂志》 CAS CSCD 2001年第5期291-292,共2页
关键词 聚合酶 TAQ dna hla分型
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DNA测序用于HLA常规分型方法难以确定样本的检测 被引量:1
11
作者 张伯伟 程四国 +2 位作者 赵磊 杜娟 王艺芳 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期397-398,共2页
关键词 dna测序 hla分型 中华骨髓库
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DNA 序列分析鉴定HLA新等位基因B^*0740 被引量:2
12
作者 薛敏 潘芹芹 +8 位作者 缪扣荣 周小玉 周小平 赵星 樊甦 梁文飚 费小明 汪承亚 Kukuruga D 《中国输血杂志》 CAS CSCD 2005年第5期365-368,共4页
目的确认一个中国人群中的新HLA等位基因.方法应用单倍型特异性分离(haplotype-specific extraction,HSE)技术和DNA序列分析技术鉴定HLA-B*的新等位基因.结果被检标本HLA-B位点有一个等位基因的核苷酸序列与任何已知的HLA等位基因均不同... 目的确认一个中国人群中的新HLA等位基因.方法应用单倍型特异性分离(haplotype-specific extraction,HSE)技术和DNA序列分析技术鉴定HLA-B*的新等位基因.结果被检标本HLA-B位点有一个等位基因的核苷酸序列与任何已知的HLA等位基因均不同,与同源性最高的B*0705相比,在exon3区域中的605位碱基由A>T,引起编码178位的氨基酸由赖氨酸(K)变成甲硫氨酸(M).血清学分型表明新等位基因的免疫学表型仍为HLA-B7.家系分析提示,HLA- B*0740基因来源于其母亲.结论该等位基因序列为HLA-B位点的一个新等位基因,于2005年2月由WHO HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*0740. 展开更多
关键词 等位基因 hla hla-B*0740 单倍型特异性分离(HSE) PCR-SSP分型 序列分析
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HLA-A位点DNA分型及其法医学应用 被引量:1
13
作者 刘利民 贾静涛 +1 位作者 梁健 U.Gyllensten 《中国法医学杂志》 CSCD 1998年第4期205-209,共5页
应用聚合酶链反应0寡核苷酸探针(PCR-SSO)斑点杂交技术,对222名辽宁地区汉族人群无关个体进行HLA-A基因检测,研究中国辽宁地区汉族群体的HLA-A座位基因分布状况。共检出HLA-A等位基因24个,其中以等位基因HLA-A0201最为常见,... 应用聚合酶链反应0寡核苷酸探针(PCR-SSO)斑点杂交技术,对222名辽宁地区汉族人群无关个体进行HLA-A基因检测,研究中国辽宁地区汉族群体的HLA-A座位基因分布状况。共检出HLA-A等位基因24个,其中以等位基因HLA-A0201最为常见,频率为0.2635;依次是2402101和1101,等位基因频率分别为0.1847和0.1262.理论杂合度为87%,个人鉴别机率为92%,非父排除率为73.3%。在中国辽宁汉族中检出73种基因型,对观察值和期望值进行X2检验,符合Hardy-Weinberg平衡定律(x2=6.28,df=9,0.5<P<0.75)。家系分析结果表明按照孟德尔方式遗传。提出的中国辽宁汉族HLA-A等位基因的遗传基因情况,可用于法医学个人识别和亲子鉴定。人类学,HLA相关疾病,及器官移植研究。 展开更多
关键词 hla-A 基因分型 PCR 亲子鉴定
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HLA方法学进展及其DNA分型应用 被引量:2
14
作者 武大林 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2001年第6期469-473,共5页
人类白细胞抗原(HLA)方法学包括传统的HLA血清学分型和HLA-DNA分型,而HLA-DNA又可分为DNA-限 制性片段长度多态性分析、PCR-序列特异性寡核苷酸探针、PCR-序列特异性引物、PCR-单链构象多态性... 人类白细胞抗原(HLA)方法学包括传统的HLA血清学分型和HLA-DNA分型,而HLA-DNA又可分为DNA-限 制性片段长度多态性分析、PCR-序列特异性寡核苷酸探针、PCR-序列特异性引物、PCR-单链构象多态性及PCR-DNA 测序5种,并对血清学和DNA分型方法的可靠性进行了比较。HLA-DNA分型技术主要应用于移植配型、骨髓库和脐 血库的HLA分型及人类基因多态性、疾病关联、移植物植活指标的研究。 展开更多
关键词 hla抗原 血清学分型 dna 基因型
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DETECTION OF GENES FOR HEAT-STABLE ENTEROTOXIN IN ESCHERICHIA COLI BY BIOTINYLATED ST-DNA PROBES 被引量:2
15
作者 朱庆义 李连青 +2 位作者 林万明 周志江 刘纯杰 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 1994年第5期20-23,共4页
Reference strains of enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), non-enterotoxigenic Escherichia coli (non-ETEC), enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), enteroinvasive Escherichia coli (EIEC), and other enteropathogen... Reference strains of enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), non-enterotoxigenic Escherichia coli (non-ETEC), enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), enteroinvasive Escherichia coli (EIEC), and other enteropathogenic bacteria were used to prove the reliability of BIO-ST-DNA probe hybridization. In addition, 417 strains of E. coli isolated from children with diarrheal diseases in Shanxi Children's Hospital were examined for BIO-ST-DNA probe hybridization. In the test, BIO-ST-DNA hybridization was compared with suckling mouse assay in identifying ST-ETEC. The results obtained by both methods showed no significant difference. It was found that identification of ST-ETEC using hybridization is a simple, sensitive and more practical method. 展开更多
关键词 ST BIO ETEC CT DETECTION OF GENES FOR HEAT-STABLE ENTEROTOXIN IN ESCHERICHIA COLI BY BIOTINYLATED ST-dna probes dna
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DNA芯片技术与PCR-SSOP流式仪技术HLA检测结果比较 被引量:1
16
作者 赵磊 张伯伟 +2 位作者 马茹 杜娟 王艺芳 《医药论坛杂志》 2007年第3期41-42,共2页
目的比较DNA芯片技术与PCR-SSOP流式分析仪技术HLA检测结果。方法采用DNA芯片技术对已用PCR-SSOP流式分析仪技术检测并质检合格的15000份骨髓库标本中按2%随机抽检的样品300人份及PCR-SSOP流式分析仪技术中出现的基因型分不开标本424人... 目的比较DNA芯片技术与PCR-SSOP流式分析仪技术HLA检测结果。方法采用DNA芯片技术对已用PCR-SSOP流式分析仪技术检测并质检合格的15000份骨髓库标本中按2%随机抽检的样品300人份及PCR-SSOP流式分析仪技术中出现的基因型分不开标本424人份进行HLA分型检测。结果300份随机抽检样品DNA芯片技术复检结果完全正确,PCR-SSOP流式分析仪技术分不开的基因型DNA芯片技术全部检出了确切结果。结论DNA芯片技术具有更高的分辨率,可以满足HLA分型检测的质量要求。 展开更多
关键词 dna芯片 hla PCR—SSOP
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原发性胃癌患者HLA Ⅱ类抗原DNA多态性的初步研究
17
作者 陈诗书 于丽莉 +7 位作者 赵涵芳 孔良曼 林性玉 王亚新 张来仪 孙婕 何尧祥 薛建静 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 1990年第6期259-260,245,共3页
有关胃癌与宿主的关系,特别是与机体免疫系统中主要组织相容性复合物(MHC)多态性的关系,至今未见有报道。担负机体特异免疫功能的淋巴细胞在识别异己抗原和引起免疫反应的过程均需要MHC基因产物的参加。因此分析胃癌患者MHC基因的多态... 有关胃癌与宿主的关系,特别是与机体免疫系统中主要组织相容性复合物(MHC)多态性的关系,至今未见有报道。担负机体特异免疫功能的淋巴细胞在识别异己抗原和引起免疫反应的过程均需要MHC基因产物的参加。因此分析胃癌患者MHC基因的多态性是研究胃癌与宿主关系的一个重要内容,有助于了解胃癌的发病机制和分子流行病学。 展开更多
关键词 胃癌 hlaⅡ类抗原 dna 多态性
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DNA序列分析鉴定HLA新等位基因B~*580104
18
作者 刘嬿 季芸 +5 位作者 孙瑛 杨剑豪 唐晴钧 谢军华 毛臻 杜可明 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第S1期149-149,共1页
关键词 dna序列分析 hla 分型技术 同源性 先证者
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HLA区域微卫星DNA及其应用 被引量:3
19
作者 陈强 《国外医学(输血及血液学分册)》 1997年第5期264-269,共6页
近年来,HLA区域微卫星DNA日益受到科学工作者的重视,特别是HLA区域微卫星标记在群体遗传学以及骨髓移植中的基因相容性方面的应用前景更是引人注目。本文拟就HLA区域微卫星DNA的分子和遗传特征,可能的进化机制以及在HLA相关领域中的不... 近年来,HLA区域微卫星DNA日益受到科学工作者的重视,特别是HLA区域微卫星标记在群体遗传学以及骨髓移植中的基因相容性方面的应用前景更是引人注目。本文拟就HLA区域微卫星DNA的分子和遗传特征,可能的进化机制以及在HLA相关领域中的不同应用情况及应用前景作一综述。 展开更多
关键词 hla区域 微卫星dna hla单体型 骨髓移植
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旋转离心柱提取全血DNA在HLA基因分型中的应用
20
作者 黄少军 曾平凡 《国际检验医学杂志》 CAS 2007年第3期269-270,共2页
目的采用旋转离心柱提取人类基因组DNA,能更好的适用于临床肾移植特别是尸肾移植的HLA基因分型。方法18份EDTA-K。抗凝的2ml全血标本分别采用标准酚一氯仿法、快速盐析法和旋转离心柱法提取DNA,做HLA-DR基因分型。然后就所获DNA浓度... 目的采用旋转离心柱提取人类基因组DNA,能更好的适用于临床肾移植特别是尸肾移植的HLA基因分型。方法18份EDTA-K。抗凝的2ml全血标本分别采用标准酚一氯仿法、快速盐析法和旋转离心柱法提取DNA,做HLA-DR基因分型。然后就所获DNA浓度和纯度、操作时间、分型结果3个方面进行统计学分析。结果3种方法提取的DNA平均含量差异无统计学意义;采用旋转离心柱法和标准酚氯仿法提取的DNA纯度高于快速盐析法差异有统计学意义;整个操作时间旋转离心柱快于标准酚氯仿法和快速盐析法,差异有统计学意义;5份全血标本采用这3种方法获得的模板DNA基因分型结果完全相同,差异无统计学意义。结论采用旋转离心柱提取人类白细胞DNA,操作简单、快速,总耗时60~70min,分型方法稳定、可靠,无一例失败,能更好的适用于临床肾移植特别是尸肾移植的HLA基因分型。 展开更多
关键词 dna 基因组 hla抗原 基因
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