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血清CYFRA21-1、CA125联合HPV DNA检测在宫颈癌早期筛查中的价值及病理特征研究 被引量:1
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作者 李彦英 黄平 +3 位作者 张玲 苏梦亚 李玲玲 张纪妍 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第4期700-703,708,共5页
目的分析血清细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)、糖类抗原125(CA125)联合HPV DNA检测在宫颈癌早期筛查中的价值及病理特征。方法选取2019年8月至2023年6月沧州市中心医院收治的宫颈癌患者152例为观察组,另选取同期在本院行体检且各项正常女... 目的分析血清细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)、糖类抗原125(CA125)联合HPV DNA检测在宫颈癌早期筛查中的价值及病理特征。方法选取2019年8月至2023年6月沧州市中心医院收治的宫颈癌患者152例为观察组,另选取同期在本院行体检且各项正常女性80名为对照组;对比两组血清CYFRA21-1、CA125水平以及HPV DNA检测结果;对比观察组不同手术病理结果及血清CYFRA21-1、CA125表达水平以及HPV DNA检测结果;以病理学检查为金标准,分析血清CYFRA21-1、CA125水平以及HPV DNA检测单独以及联合诊断宫颈癌的一致性;绘制ROC曲线,分析血清CYFRA21-1、CA125联合HPV DNA单独检测及联合检测宫颈癌的效能。结果152例患者中,鳞状细胞癌104例,腺癌患者48例;其中轻度不典型增生66例、中度不典型增生57例、重度不典型增生29例。观察组血清CYFRA21-1、CA125水平以及HPV DNA阳性率均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);血清CYFRA21-1、CA125水平:鳞状细胞癌<腺癌,轻度不典型增生<中度不典型增生<重度不典型增生,差异均有统计学意义(P<0.05)。观察组不同分期、不同肿瘤增生类型的HPV DNA阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05);血清CYFRA21-1、CA125水平、HPV DNA检测单独以及联合诊断宫颈癌与病理学检查结果的一致性Kappa值分别为0.677、0.731、0.756、0.902;CA125+CYFRA21-1+HPV DNA联合检测的AUC为0.894,高于CA125、CYFRA21-1、HPV DNA单独检测(P>0.05)。结论血清CYFRA21-1、CA125联合HPV DNA检测的诊断效能高于单一检测,提示三指标联合检测可显著提高宫颈癌早期筛查的诊断价值,可为制定临床治疗方案提供参考资料。 展开更多
关键词 CYFRA21-1 CA125 HPV dna检测 宫颈癌
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miR-214-5p通过DNMT1介导的AXIN2基因DNA甲基化修饰在皮肤基底细胞癌中的作用机制 被引量:1
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作者 熊斯颖 邵蕾 +2 位作者 杨艳 高爱莉 揭丽云 《新疆医科大学学报》 CAS 2024年第1期27-32,共6页
目的探讨皮肤基底细胞癌中轴抑制蛋白2(Axis inhibition protein 2,AXIN2)基因启动子甲基化对基因转录的影响及miR-214-5p通过靶向DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase1,DNMT1)对AXIN2甲基化率的调控机制。方法收集2022年1月-2023年6... 目的探讨皮肤基底细胞癌中轴抑制蛋白2(Axis inhibition protein 2,AXIN2)基因启动子甲基化对基因转录的影响及miR-214-5p通过靶向DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase1,DNMT1)对AXIN2甲基化率的调控机制。方法收集2022年1月-2023年6月在广州市皮肤病防治所就诊治疗的102例皮肤基底细胞癌(Cutaneous basal cell carcinoma,BCC)患者作为研究对象,提取癌组织和癌旁正常组织标本及基线资料。焦磷酸测序法检测AXIN2基因启动子区甲基化率。实时荧光定量PCR检测AXIN2、DNMT1基因mRNA和miR-214-5p的表达水平。将miR-214-5p模拟物(mimic)、抑制物(inhibitor)及其阴性对照(mimic NC和inhibitor NC)分别对基底细胞癌A431细胞进行转染,48 h后检测DNMT1基因mRNA表达水平和AXIN2基因甲基化率。结果BCC癌组织的AXIN2基因甲基化率显著高于癌旁正常组织(t=5.128,P<0.001),AXIN2基因mRNA相对表达水平显著低于癌旁正常组织(t=7.826,P<0.001),DNMT1基因mRNA表达水平显著高于癌旁正常组织(t=4.838,P<0.001),miR-214-5p表达水平显著低于癌旁正常组织(t=5.426,P<0.001)。BCC癌组织的AXIN2基因甲基化率与其mRNA表达水平呈负相关(r=-0.793,P<0.001),DNMT1基因mRNA水平与AXIN2基因甲基化率呈正相关(r=0.814,P<0.001),miR-214-5p表达水平与DNMT1基因mRNA水平呈负相关(r=-0.747,P<0.001)。双荧光素酶报告基因实验结果证实,DNMT1是miR-214-5p的靶基因。细胞转染后,与mimic NC、inhibitor和inhibitor NC比较,mimic的DNMT1基因mRNA水平、AXIN2基因甲基化率显著降低(P<0.001);而inhibitor的DNMT1基因mRNA水平和AXIN2基因甲基化率相较于其他三组明显上升(P<0.001)。结论miR-214-5p可通过调控下游靶蛋白DNMT1表达,影响AXIN2基因的DNA甲基化率,调控AXIN2基因的表达水平,参与皮肤基底细胞癌的发生机制。 展开更多
关键词 基底细胞癌 miR-214-5p dna甲基化转移酶1 轴抑制蛋白2 启动子区甲基化
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华裔科学家陈志坚发现感知DNA免疫监控的cGAS-STING信号通路——2024年拉斯克奖基础医学研究奖
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作者 周妍 吴巍 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第5期923-927,共5页
北京时间2024年9月19日,生物医学领域重要奖项拉斯克奖(The Lasker Award)揭晓,华人学者陈志坚博士(德克萨斯大学西南医学中心)因发现感知自身及外源DNA的环鸟嘌呤-腺嘌呤核苷酸合成酶[cyclic guanosine monophosphate(GMP)-adenosine m... 北京时间2024年9月19日,生物医学领域重要奖项拉斯克奖(The Lasker Award)揭晓,华人学者陈志坚博士(德克萨斯大学西南医学中心)因发现感知自身及外源DNA的环鸟嘌呤-腺嘌呤核苷酸合成酶[cyclic guanosine monophosphate(GMP)-adenosine monophosphate(AMP)synthase,cGAS],阐明了DNA如何刺激免疫和炎症反应的分子机制荣获基础医学研究奖。 展开更多
关键词 拉斯克奖 环鸟嘌呤-腺嘌呤核苷酸合成酶 环鸟苷酸-腺苷酸 免疫疗法 dna感受器
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精子DNA碎片对体外受精-胚胎移植妊娠结局及胚胎发育的影响
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作者 黄旋 王岑岑 +2 位作者 王慧 姚兵 陈莉 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2024年第8期722-729,共8页
目的:分析精子DNA碎片指数(DFI)对体外受精-新鲜胚胎移植(IVF-ET)助孕及活产结局的影响。方法:选取2015年6月至2020年12月因女方因素首次行IVF并进行新鲜胚胎移植的患者共947例,根据DFI分为低、中、高3组:DFI<15%、15≤DFI≤30%和30%... 目的:分析精子DNA碎片指数(DFI)对体外受精-新鲜胚胎移植(IVF-ET)助孕及活产结局的影响。方法:选取2015年6月至2020年12月因女方因素首次行IVF并进行新鲜胚胎移植的患者共947例,根据DFI分为低、中、高3组:DFI<15%、15≤DFI≤30%和30%<DFI,比较3组双方基础数据,女方包括年龄、体质量指数(BMI)、基础生殖激素、AMH等;男方包括年龄、BMI、精液参数;超促排卵参数;处理前和处理后IVF精液参数;促排卵结局、胚胎质量及妊娠结局。结果:不同DFI水平间相比,双方年龄在3组间均有显著性差异,15≤DFI≤30%和30%<DFI组双方年龄显著大于DFI<15%组;基础状态精液参数中前向运动精子百分率、非前向运动精子百分率、不活动精子百分率,以及IVF处理前精子总活率、前向运动精子百分率在3组间也均有显著差异(P<0.01);中和高DFI组中基础精子正常形态率、IVF处理前精子浓度、精子总数和处理后精子浓度均显著低于低DFI组;30%<DFI组无论是精液处理前还是精液处理后精子总数均显著低于其他两组(P<0.01)。此外,中和高DFI组受精率显著低于低DFI组,其他临床数据包括促排卵参数、胚胎质量、妊娠结局组间均无显著差异。结论:高DFI水平对精子活率产生显著影响,IVF精液处理后DFI水平与精子浓度、精子总数、受精率均呈显著负相关,对胚胎质量及妊娠结局无影响。 展开更多
关键词 体外受精-胚胎移植 精子dna碎片指数 精液参数 胚胎发育 妊娠结局
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组蛋白去乙酰化酶抑制剂CUDC-101对前列腺癌DU145细胞DNA损伤、迁移和上皮-间质转化的影响
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作者 那佈其 权春姬 +4 位作者 赵芳 杨凡 肖茹 金雪梅 李珍玲 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期400-410,共11页
目的:探讨泛素化组蛋白(H2AX)在前列腺癌(PCa)和癌旁良性前列腺组织中的表达及与其PCa患者临床病理参数之间的关系,阐明新型组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)CUDC-101对PCa的DNA损伤、迁移及上皮-间质转化(EMT)的影响。方法:肿瘤基因组谱(... 目的:探讨泛素化组蛋白(H2AX)在前列腺癌(PCa)和癌旁良性前列腺组织中的表达及与其PCa患者临床病理参数之间的关系,阐明新型组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)CUDC-101对PCa的DNA损伤、迁移及上皮-间质转化(EMT)的影响。方法:肿瘤基因组谱(TCGA)数据库和UALCAN数据库检索各种癌症组织中H2AX mRNA的表达情况及其在PCa与正常前列腺组织中的表达差异,分析其表达与PCa患者临床预后的关系;采用免疫组织化学染色法检测在PCa组织和癌旁良性前列腺组织中H2AX蛋白的表达情况,分析H2AX蛋白表达与PCa患者临床病理参数的关系;体外培养DU145细胞,分为对照组、5%FBS组、5%FBS+100μmol·L^(-1)CUDC-101组和5%FBS+200μmol·L^(-1)CUDC-101组,采用细胞划痕实验和Transwell小室实验检测CUDC-101处理前后PCa DU145细胞的细胞划痕面积及迁移细胞数;免疫荧光染色法检测CUDC-101处理后PCa DU145细胞中上皮细胞标志物E钙黏蛋白(E-cadherin)和磷酸化组蛋白γ-H2AX表达情况;Western blotting法检测CUDC-101处理后EMT相关蛋白、γ-H2AX和磷酸化蛋白激酶B(p-AKT)表达情况。结果:TCGA数据库和UALCAN数据库分析,H2AX mRNA在PCa组织中高表达,并且H2AX低表达组患者的无病生存期(DFS)明显高于H2AX mRNA高表达组(P<0.001);免疫组织化学染色,在PCa组织中H2AX蛋白强阳性表达率高于在癌旁良性前列腺组织(64.34%vs 14.29%),其过表达与PCa的T分期(P=0.001)和世界卫生组织/国际泌尿科病理学会(WHO/ISUP)预后分级分组(P=0.004)有关,但与PCa患者的年龄、Gleason评分、淋巴结转移、神经和脉管浸润无关(P>0.05);免疫荧光染色法检测,与对照组和EMT诱导组比较,CUDC-101处理组E-cadherin和γ-H2AX蛋白的荧光表达增强;细胞划痕实验和Transwell小室实验检测,与对照组比较,CUDC-101处理组DU145细胞愈合面积和迁移细胞数明显下调;Western blotting法检测,与EMT诱导组比较,CUDC-101处理组E-cadherin和γ-H2AX蛋白表达水平升高(P<0.05或P<0.01),波形蛋白(Vimentin)和p-AKT蛋白表达水平降低(P<0.05或P<0.01)。结论:H2AX蛋白过表达与PCa患者的不良预后密切关联。新型HDACi抑制剂CUDC-101可调控H2AX和AKT的磷酸化,抑制PCa细胞EMT过程。 展开更多
关键词 CUDC-101 泛素化组蛋白 前列腺肿瘤 上皮-间质转化 dna损伤
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miR-576-5p通过结合CADM2调节胃腺癌DNA损伤和放化疗敏感性
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作者 裴正浩 王耿泽 +3 位作者 夏西超 张虎 王钧 郝阳 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2024年第7期1673-1679,共7页
目的 探究miR-576-5p通过调控细胞黏附分子(CADM)2基因对胃腺癌DNA损伤和放化疗敏感性的影响。方法 GEO2R分析胃腺癌数据集(GSE26595、GSE6174)中表达上调的基因,GSEA分析miR-576-5p与细胞增殖和DNA损伤的关系。按照转染物的不同,分为... 目的 探究miR-576-5p通过调控细胞黏附分子(CADM)2基因对胃腺癌DNA损伤和放化疗敏感性的影响。方法 GEO2R分析胃腺癌数据集(GSE26595、GSE6174)中表达上调的基因,GSEA分析miR-576-5p与细胞增殖和DNA损伤的关系。按照转染物的不同,分为空白对照组(miR-NC)和miR-576-5p模拟物组(miR-576-5p),向miR-576-5p组的BGC-823、SGC-7901细胞中转染miR-576-5p模拟物组,miR-NC组细胞仅转染对应的对照片段。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测BGC-823、SGC-7901细胞中miR-576-5p的表达水平,细胞计数试剂盒(CCK8)检测细胞活力。将miR-576-5p过表达的BGC-823细胞皮下注射至裸鼠体内,成瘤后检测小鼠瘤重和体积,qRT-PCR检测肿瘤组织中miR-576-5p表达水平。以不同剂量的γ射线照射BGC-823、SGC-7901细胞,Western印迹检测γH2AX的蛋白表达。CCK8检测细胞对多柔比星化疗的敏感性。双荧光素酶活性实验验证miR-576-5p和CADM2的关系,qRT-PCR和Western印迹检测转染miR-576-5p模拟物的BGC-823、SGC-7901细胞中CADM2表达。向miR-576-5p高表达的BGC-823、SGC-7901细胞中转染CADM2过表达质粒,设为miR-576-5p+CADM2组,Western印迹检测CADM2的表达,CCK8检测细胞活力。结果 与miR-NC组相比,miR-576-5p组细胞活力显著增强(P<0.05)。体内实验结果表明,miR-576-5p过表达显著诱导了胃腺癌BGC-823细胞的肿瘤体内增殖,肿瘤体积和质量显著增加(P<0.05),miR-576-5p在miR-576-5p过表达的肿瘤组织中显著上调(P<0.05)。与miR-NC组相比,miR-576-5p组γH2AX蛋白表达显著下调,且呈照射剂量依赖性。同时剂量依赖性抑制胃腺癌细胞对多柔比星的化疗敏感性,抑制细胞活力(P<0.05)。与miR-NC组相比,miR-576-5p组荧光素酶活性被显著抑制(P<0.05),miR-576-5p过表达显著抑制了CADM2 mRNA和蛋白表达(P<0.05)。与miR-NC组相比,miR-576-5p组CADM2的表达显著下调,而与miR-576-5p组相比,miR-576-5p+CADM2组CADM2表达上调。与miR-NC组相比,miR-576-5p组细胞活性显著增强,而与miR-576-5p组相比,miR-576-5p+CADM2组细胞活性显著被抑制(P<0.05)。结论 miR-576-5p在胃腺癌中高表达,通过靶向抑制CADM2的表达促进胃腺癌细胞体内外增殖,抑制DNA损伤和降低对放化疗的敏感性。 展开更多
关键词 miR-576-5p 细胞黏附分子2 胃腺癌 dna损伤 化疗敏感性
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磷酸三苯酯和磷酸三(1,3-二氯-2-丙基)酯对小鼠精母细胞DNA损伤和细胞周期的影响
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作者 丰一兴 段鹤君 崔霞 《环境卫生学杂志》 2024年第3期226-232,246,F0003,共9页
目的 探讨不同剂量的磷酸三苯酯(TPhP)和磷酸三(1,3-二氯-2-丙基)酯(TDCPP)对小鼠精母细胞DNA损伤和细胞周期的影响。方法 选取小鼠精母细胞(GC-2)为细胞模型,经TPhP和TDCPP(0、3、10、30和50μmol/L)染毒48 h后,利用CCK-8方法检测GC-2... 目的 探讨不同剂量的磷酸三苯酯(TPhP)和磷酸三(1,3-二氯-2-丙基)酯(TDCPP)对小鼠精母细胞DNA损伤和细胞周期的影响。方法 选取小鼠精母细胞(GC-2)为细胞模型,经TPhP和TDCPP(0、3、10、30和50μmol/L)染毒48 h后,利用CCK-8方法检测GC-2的细胞存活率,采用高内涵分析系统检测TPhP和TDCPP对细胞核碎片化程度、磷酸化组蛋白(pH2AX)、DNA同源重组修复蛋白(Rad51)及细胞周期等参数的影响。实时荧光定量PCR法分析精母细胞生长发育关键调控基因,包括环腺苷酸应答元件结合蛋白(CREB-1)、抑制素-α (inhibin-α)、粘连蛋白2(nectin-2)和增殖标记蛋白(Ki67)mRNA的表达水平。结果 与对照组相比,30和50μmol/L TPhP和TDCPP均显著降低GC-2细胞存活率(P<0.05),并引起细胞核碎片化程度加剧(P<0.01)。DNA损伤标志物pH2AX在10、30和50μmol/L TPhP组及TDCPP组均显著升高(P<0.05),Rad51蛋白在30和50μmol/L TPhP组和10、30和50μmol/L TDCPP组均显著升高(P<0.01),表明较高浓度的TPhP和TDCPP可引起DNA损伤。细胞周期分析显示,TPhP主要将细胞阻滞在G0/G1期,而TDCPP主要将细胞阻滞在G0/G1期和G2/M期。荧光定量PCR结果可见,与对照组相比,TPhP(30和50μmol/L)和TDCPP(10、30和50μmol/L)抑制精母细胞生长发育关键基因(CREB-1、inhibin-α、nectin-2和Ki67)的表达(P<0.01)。结论 TPhP和TDCPP均可引起GC-2细胞DNA损伤和细胞周期阻滞,并最终影响精母细胞的生长发育。 展开更多
关键词 磷酸三苯酯 磷酸三(1 3-二氯-2-丙基)酯 GC-2细胞 dna损伤 细胞周期
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基于DNA链置换反应网络求解0-1背包问题 被引量:1
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作者 杨静 郑雅雯 +1 位作者 张彤彤 蒋天怿 《安徽理工大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第1期78-88,共11页
目的基于DNA链置换的化学反应网络可以作为一种有效的编程语言来解决各种数学问题,而0-1背包问题是一个经典的NP问题。为了求解0-1背包问题。方法提出利用DNA链置换反应网络,并利用Visual DSD设计仿真实验。结果通过加权、求和和阈值3... 目的基于DNA链置换的化学反应网络可以作为一种有效的编程语言来解决各种数学问题,而0-1背包问题是一个经典的NP问题。为了求解0-1背包问题。方法提出利用DNA链置换反应网络,并利用Visual DSD设计仿真实验。结果通过加权、求和和阈值3个反应模块进行求解,最后由输出的单链DNA来表达结果。由于浓度的检测存在一定误差,使用带有荧光分子的单链DNA输出表达操作结果。最后,使用DSD仿真软件得到变量转换模块相对应的链置换反应网络图、变量仿真图以及阈值比较图。模型表明,该算法能够有效降低0-1背包问题的复杂度,并且具有较高的求解精度和稳定性。结论所提出的模型进一步丰富了DNA计算,并拓宽了DNA链位移的计算宽度。 展开更多
关键词 dna链置换 0-1背包问题 NP问题 dna计算
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胞外囊泡DNA中5-羟甲基胞嘧啶分子标志物对突发性聋的疗效预判研究
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作者 李新建 时晰 +4 位作者 郭维维 林坚 陈航宇 陈伟 杨仕明 《中华耳科学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第2期221-226,共6页
目的 突发性聋(sudden sensorineural hearing loss, SSNHL)是一种急性感音神经性聋,部分患者治疗效果较差,目前无有效疗效预测指标。5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)是一种稳定的表观遗传标志,因其在不同身体状态下富集含量不同的特点可作为预测... 目的 突发性聋(sudden sensorineural hearing loss, SSNHL)是一种急性感音神经性聋,部分患者治疗效果较差,目前无有效疗效预测指标。5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)是一种稳定的表观遗传标志,因其在不同身体状态下富集含量不同的特点可作为预测疗效的生物标志物,本研究通过寻找5hmC标志物,探索其对SSNHL疗效进行预测的可能性。方法 选取2021年7月—2023年6月中国人民解放军总医院海南医院耳鼻咽喉头颈外科收治的SSNHL患者57例,其中男性26例、女性31例;根据治疗前后的听力结果将患者分为有效组27例和无效组30例。使用队列研究方法,寻找5hmC富集水平与SSNHL疗效之间的相关性。利用5hmC-Seal技术在患者治疗前的血浆胞外囊泡DNA中生成全基因组5hmC谱,比较两组不同治疗效果的5hmC谱,筛选出有价值的5hmC标志物,并进行相关功能和传导通路的初步探索。结果 共鉴定出11个5hmC标志物来预测治疗结果(曲线下面积为0.998),预测准确性较高。GO功能分析表明,调节GTPase活性、神经元投射发育、神经细胞发育等信号通路可能与内耳疾病的发病机制有关。结论 SSNHL治疗有效组和无效组的5hmC谱存在明显差异,胞外囊泡DNA来源的5hmC有可能作为有效的表观遗传生物标志物,用于SSNHL的微创疗效预测。 展开更多
关键词 突发性聋 dna去甲基化 5-羟甲基胞嘧啶 治疗预测
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基于活产建立体外受精-胚胎移植精子DNA碎片指数的参考阈值及子代短期安全性
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作者 周超 王淑娴 +2 位作者 于春梅 庾广聿 蒋月园 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第1期111-119,共9页
背景:精子DNA碎片指数与受精、胚胎发育潜能、胚胎植入、流产及子代安全性等存在显著的相关性。然而,其临床参考值受多种因素的影响,导致临床意义极其有限,该研究以活产为结局,通过倾向评分匹配校正其他混杂因素后,构建精子DNA碎片指数... 背景:精子DNA碎片指数与受精、胚胎发育潜能、胚胎植入、流产及子代安全性等存在显著的相关性。然而,其临床参考值受多种因素的影响,导致临床意义极其有限,该研究以活产为结局,通过倾向评分匹配校正其他混杂因素后,构建精子DNA碎片指数与活产的最佳临床截断值,并对其进行内外部验证,具有较好的预测价值及临床应用效能。目的:探讨基于活产建立体外受精-胚胎移植精子DNA碎片指数的参考阈值及子代短期安全性。方法:选取2019年5月至2021年5月于常州市妇幼保健院接受体外受精-胚胎移植患者1921例,以倾向匹配容差0.02为标准,1∶1进行倾向评分匹配,结果活产组与非活产组各成功匹配540例,以此建立模型组;通过选取同时期广西壮族自治区南溪山医院接受体外受精-胚胎移植患者135例作为外部验证组;采用受试者工作曲线探求精子DNA碎片指数对活产的临床最佳截断值,分别采用限制性立方样条曲线、标准曲线、临床决策曲线、临床影响曲线及内外部验证等方法,对该截断值的准确性及临床应用效能进行评估。结果与结论:(1)非活产组精子DNA碎片指数显著高于活产组且与活产存在显著的负相关性(r=-0.444,P<0.001);(2)受试者工作曲线结果显示,DNA碎片指数对活产的最佳截断值为24.33%,曲线下面积为0.775(0.746,0.804),特异度为72.60%,敏感度为78.90%,准确度为75.70%;(3)限制性立方样条曲线拟合Logistic回归结果显示,当精子DNA碎片指数大于24.57%时,临床非活产的风险呈趋势性增涨;(4)Logistic回归概率分析结果显示,精子DNA碎片指数为活产的危险因素[OR(95%CI)=0.916(0.904,0.928),P<0.001],且当精子DNA碎片指数大于27.78%时,临床活产发生的概率将小于50%,随着精子DNA碎片指数每增高1个单位,活产的概率下降8.4%;(5)内外部对该临床截断值的验证均显示,该截点具有一定的临床预测价值及准确性;(6)临床决策曲线与临床影响曲线显示,以该临床截断值建立的预测模型在阈概率为0.22-0.73时具有临床最大净获益值,且在该阈概率范围内损失与获益的比值始终小于1,证实该预测模型具有较好的临床应用效能;(7)精子DNA碎片指数与子代短期安全性分析结果显示,精子DNA碎片指数与出生儿早产、体质量、畸形、性别差异无显著性;(8)结果表明,精子DNA碎片指数对体外受精-胚胎移植活产的最佳临床截断值为24.33%,以此建立的临床预测模型具有较好的区分度、准确度与临床应用效能,精子DNA碎片指数对子代短期安全性影响并不显著,但仍需大样本及长期的追踪评估。 展开更多
关键词 精子dna碎片指数 活产 体外受精-胚胎移植 子代安全性 最佳截断值
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不育患者精子DNA碎片指数、血清25-羟化维生素D与精液常规参数的相关性分析 被引量:2
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作者 翟倩 张颖 +1 位作者 张建芳 田国华 《中国生育健康杂志》 2024年第3期237-241,共5页
目的 探讨男性不育患者精子DNA碎片指数(DFI)、血清25-羟化维生素D [25(OH)VD]总量与精液常规参数的相关性。方法 回顾性分析2021年11月至2022年7月在空军军医大学第一附属医院生殖医学中心就诊的627名男性不育患者的检查数据,采用计算... 目的 探讨男性不育患者精子DNA碎片指数(DFI)、血清25-羟化维生素D [25(OH)VD]总量与精液常规参数的相关性。方法 回顾性分析2021年11月至2022年7月在空军军医大学第一附属医院生殖医学中心就诊的627名男性不育患者的检查数据,采用计算机辅助精子分析系统分析精液常规参数,手工法检测正常形态精子百分率,流式细胞仪分析精子DFI,液相色谱-串联质谱检测系统检测血清25(OH)VD总量,采用SPSS 25.0数据分析软件分析精子DFI与精子总数、浓度、前向运动率(PR)、总活动率、正常形态精子百分率的相关性,以及血清25(OH)VD总量与精子总数、浓度、PR、总活动率、正常形态精子百分率、精子DFI的相关性。结果 精子DFI与精子总数、浓度呈负相关,但其相关系数绝对值均<0.1,临床价值较小(r=-0.082、-0.094,P均<0.05),与精子PR、总活动率、正常形态精子百分率呈负相关(r=-0.519、-0.534、-0.327,P均<0.001),差异均具有统计学意义;血清25(OH)VD总量与精子总数、浓度、PR、总活动率无相关性(r=-0.009、-0.020、0.059、0.054,P>0.05),与正常形态精子百分率呈正相关(r=0.147,P<0.001),与精子DFI呈负相关(r=-0.294,P<0.001),差异均具有统计学意义。结论 精子DFI与精子PR、总活动率、正常形态精子百分率呈明显负相关,可以在一定程度上反映精子质量,精子DFI检测与精液常规参数可以互为补充,为全面、客观评估男性生育力提供有效信息;血清25(OH)VD总量与正常形态精子百分率呈正相关,与精子DFI呈负相关,可作为评估男性生育力的参考指标。 展开更多
关键词 精子dna碎片指数 精子浓度 精子活力 精子形态 25-羟化维生素D
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DNA数据存储--机遇与挑战 被引量:1
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作者 史越 贾李佳 刘翟 《集成技术》 2024年第3期128-142,共15页
自人类进入信息时代以来,全球信息总量飞速膨胀,为数据存储行业带来极大挑战。当前的信息存储工具存在许多缺陷,如信息密度低、使用寿命短、环境污染等,而脱氧核糖核酸(DNA)作为天然的遗传信息载体,具有信息密度高、稳定性高、保存时间... 自人类进入信息时代以来,全球信息总量飞速膨胀,为数据存储行业带来极大挑战。当前的信息存储工具存在许多缺陷,如信息密度低、使用寿命短、环境污染等,而脱氧核糖核酸(DNA)作为天然的遗传信息载体,具有信息密度高、稳定性高、保存时间长、维护成本低等优点,可能成为信息存储领域的卓越选择。尽管DNA存储目前面临读写成本高、速度慢、错误率高等挑战,但在某些领域也有着独特的优势,如“冷”数据存储和军事加密存储等。目前,DNA存储的潜在发展方向主要包括在军事、航空航天等特殊场景下的应用,高容错的编解码方案,生物活体存储体系,脱离测序的信息读取方法,以及集成化的存储系统和统一行业标准等。希望在不久的将来,DNA存储能够实现规模化应用,迎来数据存储的新纪元。 展开更多
关键词 dna存储 合成生物学 生物技术-信息技术交叉 数字信息存储
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正常形态精子百分率联合精子DNA碎片指数对体外受精-胚胎移植结局的预测价值
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作者 李冷艳 楼丽君 林娜娜 《临床检验杂志》 CAS 2024年第2期132-135,共4页
目的探讨男性正常形态精子百分率联合精子DNA碎片化指数对体外受精-胚胎移植(IVF-ET)结局的影响。方法回顾性分析2020年6月至2023年2月在本中心行IVF-ET的641例患者的临床资料。根据正常形态精子百分率和精子DNA碎片化指数水平,分为A组... 目的探讨男性正常形态精子百分率联合精子DNA碎片化指数对体外受精-胚胎移植(IVF-ET)结局的影响。方法回顾性分析2020年6月至2023年2月在本中心行IVF-ET的641例患者的临床资料。根据正常形态精子百分率和精子DNA碎片化指数水平,分为A组(正常形态精子百分率<4%,精子DNA碎片化指数<25%,403例)、B组(正常形态精子百分率≥4%,精子DNA碎片化指数≥25%,9例)、C组(正常形态精子百分率≥4%,精子DNA碎片化指数<25%,125例)、D组(正常形态精子百分率<4%,精子DNA碎片化指数≥25%,104例)、A1组(正常形态精子百分率<1%,精子DNA碎片化指数<25%,106例)、D1组(正常形态精子百分率<1%,精子DNA碎片化指数≥25%,60例)。比较各组一般资料、精液参数、胚胎发育及妊娠结局指标。结果各组女方年龄、男方年龄差异无统计学意义(P>0.05)。A、B、C、D、A1、D1组的精子活动率、前向运动精子比率、精子总数、受精率指标差异有统计学意义(P<0.05),而可利用胚胎率、优胚率、临床妊娠率、早期流产率、活产率差异无统计学意义(P>0.05)。结论男性正常形态精子百分率降低和精子DNA碎片化指数升高与精子活动力和总数下降相关,影响IVF-ET受精率,但对临床妊娠结局无显著影响。联合检测正常形态精子百分率和精子DNA碎片化指数对预测IVF-ET妊娠结局的价值有限。 展开更多
关键词 精子形态 精子dna碎片指数 体外受精-胚胎移植 妊娠结局
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基于环境DNA宏条形码技术的克拉里昂-克利珀顿区鱼类多样性
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作者 何韦宜 黄浩 +3 位作者 王磊 欧丹云 张延续 李伟文 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期429-441,共13页
海洋鱼类长期遭受过度捕捞的影响,导致生物多样性丧失。在公海区域鱼类多样性研究常用传统的调查方法,该方法主要用于商业物种的调查。环境DNA(eDNA)已成功用于监测水生环境中的生物多样性,本研究通过eDNA宏条形码技术,监测采矿前东太... 海洋鱼类长期遭受过度捕捞的影响,导致生物多样性丧失。在公海区域鱼类多样性研究常用传统的调查方法,该方法主要用于商业物种的调查。环境DNA(eDNA)已成功用于监测水生环境中的生物多样性,本研究通过eDNA宏条形码技术,监测采矿前东太平洋克拉里昂-克利珀顿区(CC区)的鱼类多样性信息。通过使用两种鱼类通用引物(MiFish、COⅠ)获取CC区的鱼类多样性,共检测出140属、132种鱼类,随水深增加,物种检出率逐渐降低。其中,基于MiFish引物的eDNA宏条形码技术鉴定出2纲、35目、62科、88属、57种鱼类。基于COⅠ引物的共鉴定出2纲、29目、57科、72属、87种鱼类。基于COⅠ引物的检测出濒临灭绝物种有日本鳗鲡(Anguilla japonica)、美洲鳗鲡(Anguilla rostrata)、豹纹窄尾魟(Himantura uarnak)、褐背蝠鲼(Mobula tarapacana);极度濒危物种有欧洲鳗鲡(Anguilla anguilla);易危物种有大西洋蓝枪鱼(Makaira nigricans)、扁鲹(Pomatomus saltatrix);近危物种有大青鲨(Prionace glauca)。基于MiFish引物的检测出近危物种有大青鲨、龙头鱼(Harpadon nehereus)、尖头斜齿鲨(Scoliodon laticaudus),易危物种有褐点石斑(Epinephelus fuscoguttatus)。MiFish引物检测到的鱼类科、属数量高于COⅠ引物的检测结果,针对OTU序列的属及以上的分类具有高效的覆盖率和分辨率。研究结果表明,eDNA宏条形码技术可以有效鉴定鱼类物种,在海洋鱼类多样性监测中具有良好的应用前景。eDNA宏条形码技术作为一种非侵入性方法,监测到的鱼类多样性远高于深海生物诱捕观测器捕获的鱼类多样性,同时基于MiFish引物的eDNA宏条形码技术监测鱼类物种更具优势。 展开更多
关键词 海洋生物学 鱼类多样性 环境dna 克拉里昂-克利珀顿区 东太平洋
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胸水DNA倍体联合细胞角蛋白-19片段检测对良恶性肺部疾病的鉴别诊断意义
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作者 朱涛 王兆丰 《浙江医学》 CAS 2024年第18期1954-1958,I0004,共6页
目的探讨胸水DNA倍体联合细胞角蛋白-19片段(CYFRA-21-1)检测对良恶性肺部疾病的鉴别诊断意义。方法回顾性分析2021年5月1日至2023年12月1日浙江省荣军医院收治确诊为非小细胞肺癌伴胸水的患者78例作为病例组,同时纳入同期入院存在胸水... 目的探讨胸水DNA倍体联合细胞角蛋白-19片段(CYFRA-21-1)检测对良恶性肺部疾病的鉴别诊断意义。方法回顾性分析2021年5月1日至2023年12月1日浙江省荣军医院收治确诊为非小细胞肺癌伴胸水的患者78例作为病例组,同时纳入同期入院存在胸水的肺部良性疾病患者50例作为对照组。对所有患者的胸水及外周血标本进行DNA倍体及CYFRA-21-1阳性率的检测,并统计比较外周血及胸水标本中DNA倍体、CYFRA-21-1单一检测与联合检测的效能。结果病例组胸水、外周血的DNA倍体和CYFRA-21-1阳性率均明显高于对照组,差异均有统计学意义(均P<0.05);病例组胸水DNA倍体和CYFRA-21-1的阳性率均明显高于外周血,差异均有统计学意义(均P<0.05);胸水DNA倍体联合CYFRA-21-1鉴别良恶性肺部疾病的AUC为0.980,大于单一指标胸水DNA倍体的AUC 0.964和胸水CYFRA-21-1的AUC 0.900,差异均有统计学意义(均P<0.05);胸水DNA倍体联合CYFRA-21-1检测鉴别良恶性肺部疾病的灵敏度为1.00,特异度为0.96,准确度为0.98。结论肺癌患者胸水出现DNA异常增殖及CYFRA-21-1阳性率增高且远早于外周血标本,胸水DNA倍体及胸水CYFRA-21-1联合检测有助于提高良恶性肺部疾病的鉴别诊断效能,值得予以重视应用。 展开更多
关键词 肺癌 dna倍体 胸水 流式细胞术 细胞角蛋白-19片段
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显微镜下骨骼化精索静脉结扎术对精索静脉曲张患者精子DNA碎片率及血清IL-1β、HIF-1α水平的影响
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作者 刘国路 李乾 +3 位作者 王以金 刘鑫 王苏贵 张成波 《山东医药》 CAS 2024年第34期69-72,共4页
目的探讨显微镜下骨骼化精索静脉结扎术(MSV)对精索静脉曲张(VC)患者精子DNA碎片率(DFI)及血清白细胞介素-1β(IL-1β)、缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)水平的影响。方法选择120例VC患者,根据手术方式分为显微镜组和腹腔镜组,每组60例,术前... 目的探讨显微镜下骨骼化精索静脉结扎术(MSV)对精索静脉曲张(VC)患者精子DNA碎片率(DFI)及血清白细胞介素-1β(IL-1β)、缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)水平的影响。方法选择120例VC患者,根据手术方式分为显微镜组和腹腔镜组,每组60例,术前及术后采集精液标本2~5 mL,采用精子染色质结构分析法检测精子DNA碎片率(DFI),DFI值超出15%则为精子DNA碎片率高。采用改良巴氏染色法检测精子完整性,测算精液质量。于术前和术后采集患者空腹静脉血5 mL,ELISA法检测血清IL-1β、8-羟基脱氧鸟苷(8-OHdG)水平,速率散射比浊法检测HIF-1α水平,Western blotting法检测核因子NF-E2相关因子2(Nrf2)水平。以术后并发症作为近期预后进行统计,以术后1年复查卵泡雌激素(FSH)水平和术后1年配偶受孕率作为远期预后进行统计,其中FSH采用ELISA法检测。结果术前两组DFI值比较差异无统计学意义(P>0.05),术后两组DFI值均明显降低,显微镜组低于腹腔镜组(P<0.05);两组术前细胞因子水平比较差异无统计学意义(P>0.05),术后显微镜组IL-1β、HIF-1α、8-OHdG和Nrf2均低于腹腔镜组(P均<0.05);两组术前精子完整性、术后Ⅱ~Ⅳ类比较差异均无统计学意义(P均>0.05),术后显微镜组Ⅰ类高于腹腔镜组(P<0.05);两组术前精液质量参数及术后正常精子率比较差异无统计学意义(P均>0.05),术后显微镜精子浓度、精液量以及活动精子率显著高于腹腔镜组,不活动精子率低于腹腔镜组(P均<0.05);两组近期预后情况、术后1年受孕率比较差异无统计学意义(P均>0.05),显微镜组术后FSH水平高于腹腔镜组(P<0.05)。结论MSV术式可有效改善VC患者的精液质量,同时有利于提高精子完整性,改善患者远期预后,其机制可能与降低血清IL-1β、HIF-1α等生物标志物水平相关。 展开更多
关键词 精索静脉曲张 显微镜下骨骼化精索静脉结扎术 dna碎片率 白细胞介素- 缺氧诱导因子-
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肺炎支原体肺炎患儿外周血PCT、IL-6水平与MP抗体滴度、MP-DNA的相关性分析
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作者 鲍星星 艾奎 边俊梅 《成都医学院学报》 CAS 2024年第5期798-801,共4页
目的探究肺炎支原体肺炎(MPP)患儿外周血降钙素原(PCT)和白细胞介素-6(IL-6)水平与肺炎支原体(MP)抗体滴度、肺炎支原体DNA(MP-DNA)的相关性。方法选取2023年3月至2024年3月武汉市第三医院收治的97例MPP患儿为研究对象,根据病情严重程... 目的探究肺炎支原体肺炎(MPP)患儿外周血降钙素原(PCT)和白细胞介素-6(IL-6)水平与肺炎支原体(MP)抗体滴度、肺炎支原体DNA(MP-DNA)的相关性。方法选取2023年3月至2024年3月武汉市第三医院收治的97例MPP患儿为研究对象,根据病情严重程度将其分为轻症组(n=63)和重症组(n=34),根据血清MP抗体滴度不同分为1∶160亚组(n=19)、1∶320亚组(n=56)和≥1∶640亚组(n=22)。比较轻症组和重症组患儿临床肺部感染评分(CPIS)、外周血PCT和IL-6水平、血清MP抗体滴度及MP-DNA阳性率,分析外周血PCT和IL-6水平与血清MP抗体滴度、MP-DNA阳性率的相关性。结果重症组患儿CPIS评分、外周血PCT水平、IL-6水平和MP-DNA阳性率均高于轻症组(P<0.05);两组患儿血清MP抗体滴度分布比较,差异有统计学意义(P<0.05);不同血清MP抗体滴度亚组患儿外周血PCT、IL-6水平及MP-DNA阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05),外周血PCT、IL-6水平随血清MP抗体滴度增加而升高(P<0.05),血清MP抗体滴度1∶160亚组的MP-DNA阳性率低于MP抗体滴度1∶320亚组和≥1∶640亚组(P<0.05);Spearman分析结果显示,MPP患儿外周血PCT和IL-6水平、MPP重症、CPIS评分与血清MP抗体滴度、MP-DNA阳性结果均呈正相关(P<0.05)。结论MPP患儿外周血PCT和IL-6水平随病情严重程度而升高,与血清MP抗体滴度和MP-DNA阳性结果呈正相关,二者对MPP患儿病情评估具有一定参考价值。 展开更多
关键词 肺炎支原体肺炎 降钙素原 白细胞介素-6 肺炎支原体抗体滴度 肺炎支原体dna
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PSD-95基因DNA甲基化在睡眠剥夺相关疾病的作用研究进展
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作者 马江磊 张慧杰 王光明 《右江医学》 2024年第1期6-11,共6页
睡眠剥夺(SD)已成为世界各地普遍存在的问题,许多疾病的发生与睡眠不足有关。已经发现表观遗传机制与SD及相关疾病的发生发展密切相关,其中,DNA甲基化是最常见的表观遗传修饰,可影响基因表达。突触后密度蛋白-95(PSD-95)被认为是兴奋性... 睡眠剥夺(SD)已成为世界各地普遍存在的问题,许多疾病的发生与睡眠不足有关。已经发现表观遗传机制与SD及相关疾病的发生发展密切相关,其中,DNA甲基化是最常见的表观遗传修饰,可影响基因表达。突触后密度蛋白-95(PSD-95)被认为是兴奋性信号传递过程中重要的调节因子,SD后,PSD-95表达降低,表现出情绪改变和认知障碍等精神疾病症状。在慢性应激小鼠中,观察到血清素1A受体启动子区DNA甲基化水平增加,与抑郁症患者前额叶皮层PSD-95表达水平降低有关。然而,PSD-95基因的DNA甲基化水平与抑郁症表型无关。在精神分裂症患者中,SD的长度会加重疾病程度,且PSD-95基因DNA甲基化与精神分裂症有关。此外,结直肠癌的发病风险与SD或昼夜节律紊乱有关,而PSD-95基因DNA甲基化也可能成为治疗结直肠肿瘤的靶点。未来仍需要进一步深入探索PSD-95基因DNA甲基化在SD相关疾病中的作用及调节机制。 展开更多
关键词 睡眠剥夺 突触后密度蛋白-95 dna甲基化 表观遗传
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血浆游离胎儿DNA浓度联合血清妊娠相关血浆蛋白-A、β-人绒毛膜促性腺激素检测对孕妇不良妊娠结局的预测价值
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作者 劳力 梁娇 +2 位作者 蒙浣婷 艾文 杨仪心 《中国性科学》 2024年第3期91-95,共5页
目的探讨血浆游离胎儿DNA(cff-DNA)浓度联合血清妊娠相关血浆蛋白-A(PAPP-A)和β-人绒毛膜促性腺激素(β-hCG)检测对孕妇不良妊娠结局的预测价值。方法选取2022年8月至2023年2月佛山复星禅诚医院收治的进行产检、唐氏筛查和无创产前DNA... 目的探讨血浆游离胎儿DNA(cff-DNA)浓度联合血清妊娠相关血浆蛋白-A(PAPP-A)和β-人绒毛膜促性腺激素(β-hCG)检测对孕妇不良妊娠结局的预测价值。方法选取2022年8月至2023年2月佛山复星禅诚医院收治的进行产检、唐氏筛查和无创产前DNA检查(NIPT)的195例孕妇作为研究对象。将发生不良妊娠结局的孕妇设为研究组(n=36),无不良妊娠结局的孕妇设为对照组(n=159)。检测两组血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平;采用Spearman分析血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平与不良妊娠结局的相关性;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平对不良妊娠结局的预测价值。结果与对照组比较,研究组血浆cff-DNA浓度和血清PAPP-A水平显著更低,血清β-hCG水平显著更高,差异具有统计学意义(P<0.05);Spearman分析结果显示,血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平与妊娠期高血压、子痫前期、早产、死胎、新生儿窒息和胎儿生长受限不良妊娠结局具有显著相关性(P<0.05);ROC曲线结果显示,血浆cff-DNA浓度单独预测孕妇不良妊娠结局的曲线下面积为0.807,截断值为11.82%;血清PAPP-A单独预测孕妇不良妊娠结局的曲线下面积为0.804,截断值为0.41;血清β-hCG单独预测孕妇不良妊娠结局的曲线下面积为0.815,截断值为2.56;预测效能比较结果显示,血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平联合预测孕妇不良妊娠结局的特异度(97.48%)和准确度(96.41%)均显著高于三者单独预测(P<0.05),误诊率(2.52%)显著低于三者单独预测(P<0.05)。结论血浆cff-DNA浓度联合血清PAPP-A、β-hCG检测对孕妇不良妊娠结局具有较高的预测价值。 展开更多
关键词 血浆游离胎儿dna浓度 妊娠相关血浆蛋白-A Β-人绒毛膜促性腺激素 不良妊娠结局 预测价值
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Identification of Powdery Mildew Pathogen and Ribosomal DNA-ITS Sequence Analysis on Melon 被引量:2
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作者 Wang Xue-zheng Xu Bing-yin +3 位作者 Wang Ping Luan Fei-shi Ma Hong-yan Ma Ying-yuan 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2013年第4期10-18,F0003,共10页
Identification of powdery mildew pathogens on melon(Cucumis melo) is important for melon breeding and diseaseresistant germplasm selection. In this study, a powdery mildew pathogen that infected melon plants in Heil... Identification of powdery mildew pathogens on melon(Cucumis melo) is important for melon breeding and diseaseresistant germplasm selection. In this study, a powdery mildew pathogen that infected melon plants in Heilongjiang Province, China, was investigated in terms of host identification, morphological characteristics and phylogenetic relationships. The morphological characteristics of the pathogen were observed at five phases in the life cycle: germinating conidia, primary germ tube, hyphae, conidiophores, and colonization. The conidia were elliptical, colorless, catenulate, and the average length was 29.07 μm and average width was 17.82 μm. One ascus and eight ascospores were produced. DNA was extracted from 0.01 g conidiophores from a strain of powdery mildew pathogen that infected melon. ITS ribosomal DNA region(524 bp) was amplified with the universal ITS1 and ITS4 primers. The nucleotide sequence showed 100% similarity with ITS sequences for three Podosphaera fusca strains obtained from the GenBank database. The identity of the pathogen was confirmed as Sphaerotheca fuliginea. International standard differential hosts were used to identify S. fuliginea strain as 2F race. These results supported the notion that Podosphaera fusca was a synonym of S. fuliginea. 展开更多
关键词 PATHOGEN Sphaerotheca fuliginear dna-ITS morphological identification host identification
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