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基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩新方法
1
作者
熊文萍
孙季丰
《科学技术与工程》
北大核心
2012年第29期7505-7509,7514,共6页
将DNA序列分成64个碱基一组的短序列。根据每个小段落不同的碱基排列特点,通过对每段中重复频率最高的三碱基组合片段采用特定码书编码,提出了基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩方法,以达到对DNA数据压缩的目的。实验表明,本算法在...
将DNA序列分成64个碱基一组的短序列。根据每个小段落不同的碱基排列特点,通过对每段中重复频率最高的三碱基组合片段采用特定码书编码,提出了基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩方法,以达到对DNA数据压缩的目的。实验表明,本算法在大部分常用基准测试序列中达到了比较好的压缩性能。
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关键词
dna
序列
统计分析
码书
分段编码
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职称材料
题名
基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩新方法
1
作者
熊文萍
孙季丰
机构
华南理工大学电子与信息学院
出处
《科学技术与工程》
北大核心
2012年第29期7505-7509,7514,共6页
文摘
将DNA序列分成64个碱基一组的短序列。根据每个小段落不同的碱基排列特点,通过对每段中重复频率最高的三碱基组合片段采用特定码书编码,提出了基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩方法,以达到对DNA数据压缩的目的。实验表明,本算法在大部分常用基准测试序列中达到了比较好的压缩性能。
关键词
dna
序列
统计分析
码书
分段编码
Keywords
dna sequences statistical analysis codebook segmented encoding
分类号
Q523.8 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
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1
基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩新方法
熊文萍
孙季丰
《科学技术与工程》
北大核心
2012
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