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HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-献血者血清学与分子生物学特征分析 被引量:1
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作者 景媛媛 范云 +3 位作者 郭燕 张文娟 段勇 冯娜 《中国输血杂志》 CAS 2024年第4期412-416,共5页
目的 了解西安地区无偿献血人群HBsAg ELISA检测结果与HBV DNA检测结果不一致的标本相关血清学标志物的分布情况。方法 收集2022年11月1日—2023年4月30日陕西省血液中心HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-(ELISA+/NAT-)标本共计71份,对其采用... 目的 了解西安地区无偿献血人群HBsAg ELISA检测结果与HBV DNA检测结果不一致的标本相关血清学标志物的分布情况。方法 收集2022年11月1日—2023年4月30日陕西省血液中心HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-(ELISA+/NAT-)标本共计71份,对其采用电化学发光法检测乙肝血清学标志物,同时复检巢式PCR扩增HBV S区和C区基因片段。结果 双ELISA+/NAT-标本(n=30)巢式PCR检测阳性率远高于单ELISA+/NAT-标本(n=41)(60%vs 24.40%,P<0.05)。前者献血者100%为初次献血者,血清抗-HBc阳性率100%,血清学模式以1、4、5此3项阳性(80%)为主;后者献血者中31.7%为重复献血者,血清抗-HBc阳性率仅为19.51%,血清学模式以单2项阳性(43.90%)和全阴(36.58%)为主。结论 单ELISA+结果存在较多假阳性,导致不必要的血液报废;而NAT-标本可能存在低水平的HBV DNA,产生漏检风险。建议针对单HBsAg ELISA+/NAT-献血者,采用多套系统多种方法追溯检测,提高献血者HBV筛查的准确度,减少不必要的血液浪费。 展开更多
关键词 乙型肝炎表面抗原 无偿献血者 巢式PCR HBV dna
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HBV C基因型有关的HBsAg阴性HBV DNA阳性患者S区突变对HBsAg的影响
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作者 刘辉 刘新 娄金丽 《标记免疫分析与临床》 CAS 2024年第4期727-731,747,共6页
目的通过构建HBV C基因型突变质粒研究HBsAg阴性HBV DNA阳性患者HBV S区突变对HBsAg水平的影响。方法收集2022年8月至2023年4月首都医科大学附属北京佑安医院107例HBsAg-/HBV DNA+患者血液样本,对成功提取扩增的HBV DNA S区进行测序,通... 目的通过构建HBV C基因型突变质粒研究HBsAg阴性HBV DNA阳性患者HBV S区突变对HBsAg水平的影响。方法收集2022年8月至2023年4月首都医科大学附属北京佑安医院107例HBsAg-/HBV DNA+患者血液样本,对成功提取扩增的HBV DNA S区进行测序,通过构建HBV C基因型突变质粒对HBV S区突变位点进行细胞功能验证,探讨OBI可能发生的分子机制。结果对成功提取扩增的68例患者进行测序,发现HBV S区存在大量突变,包括免疫逃逸突变(如sG145R、sK122R、sS114T、sT131P等)和跨膜结构域(transmembrane domain,TMD)突变(如sT5A、sG10D、sF20S等)。通过构建HBV C基因型突变质粒,进行细胞转染和细胞免疫荧光实验发现sG145R突变会明显降低HBsAg的表达,但是sK122R、sI26N、sQ29N、sR169H、sS114T、sT131P这6个突变位点并未影响细胞内外HBsAg的表达。结论通过测序发现HBsAg-/HBV DNA+患者HBV S区存在大量突变位点,通过构建sG145R、sK122R、sI26N、sQ29N、sS114T和ST131P等突变质粒发现sG145R突变会明显降低细胞内外HBsAg的表达,但是sK122R、sI26N、sQ29N、sR169H、sS114T、sT131P并未明显降低细胞内外HBsAg的表达。 展开更多
关键词 隐匿性乙型病毒感染(OBI) 乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg) 乙型肝炎病毒载量(HBV dna) 突变
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转录因子MYB转录调控MTFR2通过DNA损伤修复促进胃癌细胞化疗耐药性
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作者 李春兴 迪力旦·纳斯尔 +1 位作者 托合提阿吉·巴拉提 阿不都外力·吾守尔 《遵义医科大学学报》 2024年第9期857-867,共11页
目的探究v-myb禽成髓细胞病病毒癌基因同源物(MYB)转录调控线粒体裂变调节因子2(MTFR2)对胃癌(GC)细胞顺铂(DDP)耐药性的影响及分子作用机制。方法TCGA数据库分析GC中差异mRNA并预测上游调控分子,qRT-PCR检测MTFR2和MYB的表达,双荧光素... 目的探究v-myb禽成髓细胞病病毒癌基因同源物(MYB)转录调控线粒体裂变调节因子2(MTFR2)对胃癌(GC)细胞顺铂(DDP)耐药性的影响及分子作用机制。方法TCGA数据库分析GC中差异mRNA并预测上游调控分子,qRT-PCR检测MTFR2和MYB的表达,双荧光素酶和染色质免疫共沉淀(ChIP)实验验证MTFR2和MYB的调控关系,细胞计数盒8(CCK-8)检测细胞活力并计算IC_(50)值,流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡,彗星实验检测DNA损伤,蛋白质免疫印迹法检测DNA损伤相关蛋白(γ-H2AX、ATM、p-ATM)的表达。结果MTFR2在GC组织和细胞中显著高表达,敲低MTFR2能够降低细胞增殖,阻滞S期,诱导细胞凋亡,促进DNA损伤和DDP敏感性。生信预测MTFR2存在上游转录因子MYB,MYB在GC组织和细胞中的表达显著上调,双荧光素酶和ChIP验证了MTFR2启动子区域与MYB的结合关系。回复实验发现进一步过表达MTFR2能够逆转敲低MYB对GC细胞增殖和DDP耐药性的抑制作用。结论MYB上调MTFR2的表达通过DNA损伤途径促进GC细胞增殖和DDP耐药,表明靶向MYB/MTFR2调控轴可能是克服GC DDP耐药性的潜在途径。 展开更多
关键词 V-myb禽成髓细胞瘤病毒癌基因同源物 线粒体裂变调节因子2 dna损伤修复 胃癌 顺铂耐药
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无锡地区HBsAg-/HBV DNA+献血人群HBcrAg检出特点分析
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作者 王嫣 金建怀 +2 位作者 许友山 郝庆钦 夏卫 《中国输血杂志》 2024年第1期32-36,共5页
目的分析新型血清标志物乙型肝炎核心相关抗原(HBcrAg)在无锡地区HBsAg-/HBV DNA+献血人群中的检出特点。方法通过电话追踪随访了37名既往HBsAg-/HBV DNA+献血者并获得其血清,采用电化学发光法和实时荧光定量PCR核酸筛检出22例HBsAg-/HB... 目的分析新型血清标志物乙型肝炎核心相关抗原(HBcrAg)在无锡地区HBsAg-/HBV DNA+献血人群中的检出特点。方法通过电话追踪随访了37名既往HBsAg-/HBV DNA+献血者并获得其血清,采用电化学发光法和实时荧光定量PCR核酸筛检出22例HBsAg-/HBV DNA+献血者血清作为OBI组进行HBcrAg酶联免疫吸附法检测。挑选出20名经2遍酶免和1遍核酸筛检的健康献血者的血清作为健康对照组,20例经无锡第五人民医院临床诊断为慢性乙型肝炎患者血清作为实验的CHB组,分别进行HBcrAg酶联免疫吸附法检测;并对OBI组进行HBcrAg与HBeAb、HBcAb、ALT、HBV DNA的相关性分析。结果37份献血者标本经化学发光法检测HBsAg和核酸筛查,检出22份HBsAg-/HBV DNA+标本即OBI组,检出率59.46%。OBI组与健康对照组、CHB组血清的HBcrAg表达含量分别是(0.92±0.13)ng/mL、(0.47±0.09)ng/mL、(1.14±0.23)ng/mL(P<0.05),OBI组与CHB组的HBcrAg表达均高于健康对照组(P<0.05)。OBI组的HBcrAg与HBeAb、HBcAb、ALT、HBV DNA指标均无相关性(P>0.05)。结论OBI组与CHB组的HBcrAg表达均高于健康对照组,其血清HBcrAg在一定程度上与HBeAb、HBcAb、ALT、HBV DNA无相关性,HBcrAg在筛查HBsAg-/HBV DNA+献血者中具有较好的应用前景。 展开更多
关键词 乙型肝炎核心相关抗原 HBsAg-/HBV dna+ 献血者 共价闭合环状dna
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小鼠血液中年龄相关的DNA甲基化微单倍型的筛选与验证
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作者 田艺博 吴雨静 +2 位作者 肖君华 周宇荀 李凯 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期592-599,共8页
目的DNA甲基化微单倍型是指极短范围内多个甲基化位点的组合,其单倍型具有丰富的多样性。筛选和验证小鼠血液中年龄相关的DNA甲基化微单倍型。方法首先,构建基于小鼠参考基因组的DNA甲基化微单倍型理论数据集。其次,利用网络数据库中小... 目的DNA甲基化微单倍型是指极短范围内多个甲基化位点的组合,其单倍型具有丰富的多样性。筛选和验证小鼠血液中年龄相关的DNA甲基化微单倍型。方法首先,构建基于小鼠参考基因组的DNA甲基化微单倍型理论数据集。其次,利用网络数据库中小鼠血液DNA甲基化高通量测序信息,采用Spearman秩相关分析方法筛选年龄相关的DNA甲基化微单倍型。最后,以验证数据集交叉验证。结果小鼠基因组中50 bp范围内的DNA甲基化微单倍型位点数量共计6787142个,由个位数的CpG位点所组成的DNA甲基化微单倍型占比98.64%。在58个小鼠血液样本中共筛选出5835个年龄相关的DNA甲基化微单倍型(Spearman秩相关检验,|rho|>0.5,P<0.01),在DNA甲基化微单倍型中占0.086%。最后,在95例独立的样本中对具有高相关性的前100个年龄相关的DNA甲基化微单倍型进行验证,最终得到44个位点。结论本研究筛选出的年龄相关的DNA甲基化微单倍型可以为后续小鼠血液表观年龄预测及衰老研究提供借鉴。 展开更多
关键词 血液 dna甲基化微单倍型 Spearman秩相关系数 年龄 筛选
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HBV-DNA病毒载量在不同HBV感染产妇产后血清、唾液、乳汁中的变化及与肝功能的相关性研究
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作者 程苗 袁果 +2 位作者 郭宾 郑艳冰 张静 《临床医学工程》 2024年第2期203-204,共2页
目的 观察不同HBV感染产妇的HBV-DNA病毒载量及其与肝功能的相关性。方法 102例HBV产妇根据HBV血清标志物分为三组,比较各组的HBV-DNA载量以及ALT、 AST水平,分析HBV-DNA载量与肝功能的相关性。结果 产妇血清、唾液、乳汁中的HBV-DNA载... 目的 观察不同HBV感染产妇的HBV-DNA病毒载量及其与肝功能的相关性。方法 102例HBV产妇根据HBV血清标志物分为三组,比较各组的HBV-DNA载量以及ALT、 AST水平,分析HBV-DNA载量与肝功能的相关性。结果 产妇血清、唾液、乳汁中的HBV-DNA载量,以及血清中ALT、 AST水平由高到低依次为A组、 B组、 C组(P <0.05)。不同HBV感染产妇的血清、唾液、乳汁HBV-DNA载量与ALT、 AST水平均呈正相关(P <0.05)。结论 随着HBV感染程度的加深,产妇血清、唾液、乳汁中的HBV-DNA病毒载量呈上升趋势,产后血清、唾液及乳汁中HBV-DNA病毒载量均与肝功能密切相关。 展开更多
关键词 HBV-dna 病毒载量 血清 唾液 乳汁 肝功能
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化学发光法与乙肝病毒DNA荧光定量在乙肝检测中的应用价值
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作者 陶淼 喻艳 王彦 《黔南民族医专学报》 2024年第2期132-135,共4页
目的:明确化学发光法(CLIA)、乙肝病毒DNA荧光定量技术在乙肝检测中的价值。方法:选取285例乙肝患者和280例肝硬化患者为检测对象,分别对样本进行CLIA、乙肝病毒DNA荧光定量分析,统计相关检测数据。结果:乙肝组HBsAg、HBsAb、HBeAg、HB... 目的:明确化学发光法(CLIA)、乙肝病毒DNA荧光定量技术在乙肝检测中的价值。方法:选取285例乙肝患者和280例肝硬化患者为检测对象,分别对样本进行CLIA、乙肝病毒DNA荧光定量分析,统计相关检测数据。结果:乙肝组HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb、HBcAb水平均明显低于肝硬化组(P<0.05),HBV-DNA水平明显高于肝硬化组,随着HBV-DNA水平上升,乙肝患者的肝功能指标均有不同程度提高(P<0.05)。经Pearson相关性分析,HBV-DNA和HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb、HBcAb均为负相关(t=-0.876、-0.956、-0.974、-0.922、-0.981)。结论:CILA、乙肝病毒DNA荧光定量检测技术在乙肝检测中都有一定价值,两者之间为负相关,可为乙肝诊断、预后评估提供参考信息。 展开更多
关键词 乙肝 病毒dna 荧光定量 化学发光法 肝功能
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外周血基因组DNA提取试剂盒的改良
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作者 陶莹 廖长秀 +1 位作者 覃宇馨 何南轩 《广州化工》 CAS 2024年第2期140-142,共3页
对现有DNA提取试剂盒进行改良,减少DNA提取成本,寻找经济、稳定的提取方法。将96份血液标本分为A、B两组,各48份,组内按外周血体积分为250μL、500μL、750μL三组。A组(试剂盒法)采用杭州倍沃医学科技公司的血液基因组小量提取试剂盒(... 对现有DNA提取试剂盒进行改良,减少DNA提取成本,寻找经济、稳定的提取方法。将96份血液标本分为A、B两组,各48份,组内按外周血体积分为250μL、500μL、750μL三组。A组(试剂盒法)采用杭州倍沃医学科技公司的血液基因组小量提取试剂盒(离心柱型),B组(改良法)使用3%明胶吸附白细胞代替试剂盒法中分离白细胞的步骤,其余步骤同试剂盒法。采用紫外分光光度计、凝胶电泳、荧光定量PCR比较两种提取方法不同体积外周血DNA提取效果。与试剂盒法相比,改良法250μL DNA提取得率稍低,差异无统计学意义(P>0.05);改良法500μL、750μL DNA提取得率及500μL的OD_(260)/OD_(280)值均显著高于试剂盒法(P<0.01),差异具有统计学意义。琼脂糖凝胶电泳发现两种方法提取的DNA条带均完整,无拖尾现象,定量PCR扩增后两者产物融解曲线均为单峰,Ct值差异无统计学意义。本实验中改良全血DNA提取法在提取大量血体积DNA时具有优势,是一种经济、稳定、高效的DNA提取方法。 展开更多
关键词 外周血 基因组dna 提取 改良
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外周血异型淋巴细胞比例联合EB病毒DNA载量在小儿传染性单核细胞增多症诊断中的应用
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作者 沈肖明 《实用检验医师杂志》 2024年第1期11-14,共4页
目的研究外周血异型淋巴细胞比例(ALY)联合EB病毒DNA载量(EBV-DNA)在小儿传染性单核细胞增多症(IM)诊断中的应用。方法选择2020年3月—2022年3月龙岩人民医院收治的62例IM患儿作为IM组,另外选择同期在龙岩人民医院进行健康体检的62例健... 目的研究外周血异型淋巴细胞比例(ALY)联合EB病毒DNA载量(EBV-DNA)在小儿传染性单核细胞增多症(IM)诊断中的应用。方法选择2020年3月—2022年3月龙岩人民医院收治的62例IM患儿作为IM组,另外选择同期在龙岩人民医院进行健康体检的62例健康儿童作为健康对照组。采用显微镜检测两组患儿外周血ALY、淋巴细胞计数(LYM)、淋巴细胞比例(LYM%);采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测两组EBV-DNA;采用Pearson相关系数分析LYM、LYM%、外周血ALY与EBV-DNA的相关性;绘制受试者工作特征曲线(ROC曲线)并计算ROC曲线下面积(AUC),考察外周血ALY联合EBV-DNA检测对IM的诊断价值。结果IM组患儿的外周血ALY、LYM、LYM%以及EBV-DNA水平均明显高于健康对照组〔外周血ALY:(25.62±8.31)%比(18.01±4.62)%;LYM(×10~7/mL):8.35±2.61比5.54±0.34;LYM%:(50.35±10.36)%比(37.69±6.31)%;EBV-DNA(拷贝/mL):7.85±2.64比5.31±1.10;均P<0.05〕。Pearson相关性分析结果显示,IM组患儿的LYM、LYM%、外周血ALY与EBV-DNA均呈正相关(r值分别为0.424、0.490、0.632,P值分别为0.016、0.010、0.008)。外周血ALY诊断小儿IM的AUC为0.773,95%可信区间(95%CI)为0.680~0.866,敏感度为48.00%,特异度为72.00%;EBV-DNA诊断小儿IM的AUC为0.810,95%CI为0.718~0.902,敏感度为60.00%,特异度为96.00%;外周血ALY与EBV-DNA联合检测诊断小儿IM的AUC最高,为0.904,95%CI为0.843~0.964,敏感度为90.00%,特异度为92.00%。结论IM患儿外周血ALY和EBV-DNA均显著增高,二者联合检测能够辅助诊断IM。 展开更多
关键词 外周血异型淋巴细胞比例 小儿传染性单核细胞增多症 EB病毒dna载量
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Genomic DNA Isolation by Phenol/Chloroform Extracting Method from Sheep Blood Clot 被引量:6
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作者 曹果清 莫清珊 陈凤仙 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第5期76-78,共3页
[ Objective] The aim was to establish the method of extracting genomic DNA from sheep blood clot on the basis of the improvement of method for extracting genomic DNA from tissues. [Method]The genomic DNA with complete... [ Objective] The aim was to establish the method of extracting genomic DNA from sheep blood clot on the basis of the improvement of method for extracting genomic DNA from tissues. [Method]The genomic DNA with complete primary structure and high purity was obtained from the sheep blood clot after the steps of cutting the sheep blood clot with ophthalmic scissors, cell lysis with tissue DNA extracts and digested by proteinase K, extracting with phenol/chloroform and precipitating with ethanol were performed. [ Result] The concentration of the extracted DNA was 159.90 ±0.70 ng/μl and the ratio of the A260/A280 was 1.80 +0.01. The sheep microsatellite locus of BM203 was amplified by using the extracted DNA from the sheep blood clot as template of PCR, and the PCR result was perfect. [Conclusion]This method is simple and feasible, the quantity and quality of the extracted DNA can satisfy the demands for the subsequent researches. It is worth to extending and using for reference. 展开更多
关键词 Sheep blood clot Phenol/chloroform extracting method dna extraction
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DNA Damage Response in Resting and Proliferating Peripheral Blood Lymphocytes Treated by Camptothecin or X-ray 被引量:2
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作者 田铭 冯永东 +6 位作者 闵江 龚万军 肖薇 李小兰 陶德定 胡俊波 龚建平 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2011年第2期147-153,共7页
DNA damage response (DDR) in different cell cycle status of human peripheral blood lymphocytes (PBLs) and the role of H2AX in DDR were investigated. The PBLs were stimulated into cell cycle with phytohemagglutinin... DNA damage response (DDR) in different cell cycle status of human peripheral blood lymphocytes (PBLs) and the role of H2AX in DDR were investigated. The PBLs were stimulated into cell cycle with phytohemagglutinin (PHA). The apoptotic ratio and the phosphorylation H2AX (S139) were flow cytometrically measured in resting and proliferating PBLs after treatment with camptothecin (CPT) or X-ray. The expressions of γH2AX, Bcl-2, caspase-3 and caspase-9 were detected by Western blotting. DDR in 293T cells was detected after H2AX was silenced by RNAi method. Our results showed that DNA double strand breaks (DSBs) were both induced in quiescent and proliferating PBLs after CPT or X-ray treatment. The phosphorylation of H2AX and apoptosis were more sensitive in proliferating PBLs compared with quiescent lymphocytes (P0.05). The expression levels of anti-apoptotic proteins Bcl-2 were reduced and cleaved caspase-3 and caspase-9 were increased. No significant changes were observed in CPT-induced apoptosis in 293T cells between H2AX knocking down group and controls. It was concluded that proliferating PBLs were more vulnerable to DNA damage compared to non-stimulated lymphocytes and had higher apoptosis rates. γH2AX may only serve as a marker of DNA damage but exert no effect on apoptosis regulation. 展开更多
关键词 dna double strand breaks PHYTOHEMAGGLUTININ peripheral blood lymphocytes γH2AX dna damage response
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结直肠癌患者血浆Septin9 DNA甲基化联合FOBT检测的临床应用价值 被引量:4
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作者 李娜 惠凌云 +2 位作者 冯艾 张琳 王亚文 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第6期1085-1090,共6页
目的:探讨血浆Septin9 DNA甲基化及粪便隐血试验(FOBT)在结直肠癌(CRC)诊断中的应用价值。方法:回顾性收集2017年6月至2022年1月我院收治并经病理检查确诊的101例结直肠良性腺瘤患者、209例结直肠癌患者分别作为良性腺瘤组和结直肠癌组... 目的:探讨血浆Septin9 DNA甲基化及粪便隐血试验(FOBT)在结直肠癌(CRC)诊断中的应用价值。方法:回顾性收集2017年6月至2022年1月我院收治并经病理检查确诊的101例结直肠良性腺瘤患者、209例结直肠癌患者分别作为良性腺瘤组和结直肠癌组,选取同期在我院进行体检的98例健康人群作为正常对照组,比较三组一般资料及血浆Septin9 DNA甲基化及FOBT阳性情况,比较不同病理特征、不同临床分期结直肠癌患者血浆Septin9 DNA甲基化、FOBT阳性情况,采用受试者工作曲线(ROC)评估血浆Septin9 DNA甲基化、FOBT单项及联合检测对结直肠癌的诊断价值。结果:三组血浆Septin9 DNA甲基化、FOBT阳性率比较,结直肠癌组高于良性腺瘤组及正常对照组,良性腺瘤组高于正常对照组(P<0.05);肿瘤低分化、淋巴结转移、脉管/神经侵犯的结直肠癌患者血浆Septin9 DNA甲基化和FOBT阳性率高于肿瘤高分化、中分化及未发生淋巴结转移、未发生脉管/神经侵犯的结直肠癌患者(P<0.05);随着结直肠癌TNM临床分期升高,血浆Septin9 DNA甲基化及FOBT阳性率升高,差异具有统计学意义(P<0.05);血浆Septin9 DNA甲基化和FOBT联合诊断结直肠癌的敏感度、曲线下面积(AUC)(87.08%、0.885)均高于两者单独诊断(59.33%、0.744和52.63%、0.643,P<0.05);血浆Septin9 DNA甲基化诊断结直肠癌的特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为89.45%、85.52%和67.68%;FOBT分别为76.38%、70.06%和60.56%,两者联合诊断分别为89.95%、90.10%和86.89%。联合诊断优于单项诊断。结论:随着结直肠病变恶性程度的增加,血浆Septin9 DNA甲基化和FOBT阳性率升高,血浆Septin9 DNA甲基化、FOBT联合检测对结直肠癌具有较高的诊断价值,可作为结直肠癌的实验室诊断指标。 展开更多
关键词 结直肠癌 良性腺瘤 粪便隐血试验 Septin9 dna甲基化
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房水与角膜样本对疱疹病毒阳性角膜移植后不同层次病毒DNA检测效率比较
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作者 臧云晓 彭荣梅 +2 位作者 肖格格 何林辉 洪晶 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期992-997,共6页
目的研究疱疹病毒DNA在疱疹病毒阳性角膜移植患者不同角膜层次中的分布,比较角膜和房水样本在该人群中的病毒DNA检测效率。方法采用诊断试验研究方法,通过临床病历系统收集2015年5月至2021年8月于北京大学第三医院眼科中心行角膜移植且... 目的研究疱疹病毒DNA在疱疹病毒阳性角膜移植患者不同角膜层次中的分布,比较角膜和房水样本在该人群中的病毒DNA检测效率。方法采用诊断试验研究方法,通过临床病历系统收集2015年5月至2021年8月于北京大学第三医院眼科中心行角膜移植且术中角膜和/或房水疱疹病毒DNA阳性患者。分析疱疹病毒DNA阳性患者的一般资料和分布层次。计算疱疹病毒在角膜和房水中的检出率,通过受试者工作特征曲线分析角膜和房水病毒DNA检测灵敏度,记录曲线下面积(AUC)和95%置信区间(CI)。结果角膜移植术中疱疹病毒DNA阳性患者共166例166眼,其中巨细胞病毒(CMV)75眼(占45.2%),单纯疱疹病毒1型(HSV-1)34眼(占20.5%),水痘-带状疱疹病毒(VZV)30眼(占18.1%),EB病毒(EBV)27眼(占16.3%)。CMV和VZV DNA在角膜内皮层分布者分别为47眼(占62.7%)和26眼(占86.7%),明显多于基质层的28眼(占37.3%)和4眼(占13.3%),差异均有统计学意义(χ^(2)=4.813、16.133,均P<0.05)。HSV-1和EBV DNA在角膜内皮层分布者分别为8眼(占23.5%)和5眼(占18.5%),分别少于基质层的26眼(占76.5%)和22眼(占81.5%),差异均有统计学意义(χ^(2)=9.529、10.704,均P<0.001)。疱疹病毒DNA阳性样本的检测灵敏度结果显示,角膜样本的病毒PCR检测总体灵敏度为71.6%,高于房水的54.1%,其中,CMV和VZV DNA阳性的角膜样本检测灵敏度分别为64.3%(AUC=0.821,95%CI:0.705~0.938)和35.7%(AUC=0.679,95%CI:0.475~0.882),分别低于房水样本的71.4%(AUC=0.875,95%CI:0.750~0.964)和85.7%(AUC=0.929,95%CI:0.816~1.000)。HSV-1和EBV DNA阳性的角膜样本检测灵敏度分别为100%(AUC=1.000,95%CI:1.000~1.000)和92.3%(AUC=0.962,95%CI:0.875~1.000),明显高于房水样本的27.8%(AUC=0.639,95%CI:0.455~0.823)和23.1%(AUC=0.615,95%CI:0.395~0.835)。结论在疱疹病毒DNA阳性的角膜移植患者中,CMV DNA的检出率最高,CMV和VZV DNA多在角膜内皮层被检出,HSV-1和EBV DNA多在角膜基质层被检出。相较房水样本,角膜组织病毒DNA的检测灵敏度更高。 展开更多
关键词 角膜移植 疱疹病毒 dna 角膜 房水 分布层次 病毒dna检测 样本
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野生大雁新发单链环状DNA病毒基因组鉴定和分析
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作者 姚雨欣 杨世兴 +2 位作者 沈权 王晓春 张文 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2023年第6期101-107,共7页
野鸟作为多种致病性病毒的天然宿主,可通过迁徙活动广泛传播病毒,给人类和其他动物的生命安全带来了严峻挑战。本研究中,我们从青海湿地公园的野生大雁泄殖腔拭子中鉴定出13个新型CRESS-DNA病毒全基因组。此外,基于Rep蛋白的系统发育分... 野鸟作为多种致病性病毒的天然宿主,可通过迁徙活动广泛传播病毒,给人类和其他动物的生命安全带来了严峻挑战。本研究中,我们从青海湿地公园的野生大雁泄殖腔拭子中鉴定出13个新型CRESS-DNA病毒全基因组。此外,基于Rep蛋白的系统发育分析表明,这13株新型CRESS-DNA病毒被划分为CRESS-DNA病毒家族的两个不同进化枝,其中1株隶属于未分类的CRESS-DNA病毒簇的分支,而其余12株则全部归类为类双生病毒科(Genomoviridae)。本研究在野生大雁体内发现13个新型CRESS-DNA病毒,将有助于我们对于CRESS-DNA病毒的多样性以及进化起源的研究。 展开更多
关键词 CRESS-dna病毒 环状dna病毒 病毒宏基因组学 野生大雁
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HBV-DNA检测及血液细胞分析在肝炎性肝硬化治疗效果评价中应用 被引量:1
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作者 王华 牛琰 +1 位作者 赵瑞敏 宋予娟 《罕少疾病杂志》 2023年第8期53-54,共2页
目的探讨与分析HBV-DNA检测及血液细胞分析在肝炎性肝硬化治疗效果评价中应用价值,以促进早期预测患者的预后。方法2019年2月到2022年1月选择在本院诊治的肝炎性肝硬化患者137例作为研究对象,所有患者都给予恩替卡韦治疗,在治疗前进行HB... 目的探讨与分析HBV-DNA检测及血液细胞分析在肝炎性肝硬化治疗效果评价中应用价值,以促进早期预测患者的预后。方法2019年2月到2022年1月选择在本院诊治的肝炎性肝硬化患者137例作为研究对象,所有患者都给予恩替卡韦治疗,在治疗前进行HBV-DNA检测及血液细胞分析,观察患者的预后并进行相关性分析。结果所有患者治疗观察3个月,有效患者数为107例,治疗有效率为78.1%。有效患者的性别、年龄、体重指数、病程、肝功能分级、血压等与无效患者对比无明显差异(P>0.05)。有效组的红细胞、血小板、白细胞、血红蛋白等血液细胞分析指标都明显高于无效组(P<0.05)。有效组的HBV-DNA载量明显少于无效组(P<0.05),血清TBi L、DBi L、ALP、GGT含量明显低于无效组(P<0.05)。在137例患者中,Spearsman分析显示红细胞、血小板、白细胞、血红蛋白、HBV-DNA载量都与患者预后有效呈现相关性(P<0.05)。结论恩替卡韦治疗乙肝肝硬化患者的疗效有待提高,HBV-DNA检测及血液细胞分析在肝炎性肝硬化治疗中的应用能有效评估患者预后情况。 展开更多
关键词 恩替卡韦 乙肝肝硬化 HBV-dna 血液细胞分析 肝炎性肝硬化
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Anti HBc titres and HBV DNA in Indian blood donors
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《中国输血杂志》 CAS CSCD 2001年第S1期332-,共1页
关键词 HBC HBV Anti HBc titres and HBV dna in Indian blood donors dna
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Mitochondria DNA 4977 bp Common Deletion in Peripheral Whole Blood from Healthy Donors
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作者 WANG Ping LIU Yu Long +4 位作者 HAN Lin ZHAO Feng Ling GUO Fei WANG Xi Ai LV Yu Min 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2013年第12期990-993,共4页
To investigate the distribution of mitochondria ONA 4 977 bp deletion, a common deletion (CD), in normal populations of Chinese, human peripheral blood samples from sixty healthy donors were collected, and levels of... To investigate the distribution of mitochondria ONA 4 977 bp deletion, a common deletion (CD), in normal populations of Chinese, human peripheral blood samples from sixty healthy donors were collected, and levels of the CD in genomic DNA from the samples were detected using real-time PCR. The results showed that the CD was found in 27 health donors, with its positive rate being 45% (27/60). The CD ratio was between 0 and 0.000308%, and not affected by age and gender in sixty healthy donors. Our studies indicate that the CD ratio is low, and do not show the age-dependent accumulation and any gender difference in peripheral whole blood from the normal Chinese population. 展开更多
关键词 dna Mitochondria dna 4977 bp Common Deletion in Peripheral Whole blood from Healthy Donors
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肝组织HBV DNA定量检查的临床意义 被引量:11
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作者 张光曙 卓海龙 +3 位作者 徐传镇 丁明权 于建国 甘天福 《实用医药杂志》 2002年第2期81-83,共3页
目的 由于对HBV感染的认识正在不断深入,抗病毒治疗急待寻找判定效果的可靠方法,HBV DNA检测,特别是血液和肝组织定量检测显得极为重要。方法 在HBV感染者作肝活检时随机留取小粒肝组织,同时采血作HBV DNA定量检... 目的 由于对HBV感染的认识正在不断深入,抗病毒治疗急待寻找判定效果的可靠方法,HBV DNA检测,特别是血液和肝组织定量检测显得极为重要。方法 在HBV感染者作肝活检时随机留取小粒肝组织,同时采血作HBV DNA定量检查。结果 急慢性HBV感染病例均示肝组织内HBV DNA检查明显高于血内检出率,同时肝组织HBV含量明显高于血液内含量。结论 肝组织检测HBV DNA可以明显提高HBV感染诊断率,血内HBV DNA阴转时不能说明肝组织内亦已阴转,血内HBV DNA阴转不宜随即停止治疗。 展开更多
关键词 HBV dna定量检测 肝组织 HBV dna含量 HBV dna阴性率 HBV dna阴转 HBV感染 抗病毒治疗 乙型肝炎
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抗凝血离心沉淀红细胞中残留基因组DNA的质量分析
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作者 张鑫 肖宇 +2 位作者 钱开宇 夏彩霞 朱源 《转化医学杂志》 2023年第2期80-85,共6页
目的探究抗凝血离心后红细胞样本中基因组DNA(gDNA)的质量及不同处理方式对gDNA产量的影响。方法血液样本均来自于武汉大学中南医院生物样本库,采用试剂盒分离柱纯化的方式提取冻存4年及未冻存的抗凝血红细胞样本中gDNA,使用Nanodrop On... 目的探究抗凝血离心后红细胞样本中基因组DNA(gDNA)的质量及不同处理方式对gDNA产量的影响。方法血液样本均来自于武汉大学中南医院生物样本库,采用试剂盒分离柱纯化的方式提取冻存4年及未冻存的抗凝血红细胞样本中gDNA,使用Nanodrop One超微量分光光度计、Qubit 4荧光计和Agilent 4200 TapeStation生物分析仪分别对gDNA样本进行检测,从浓度、纯度、完整性进行样本质量评估。结果从冻存4年的红细胞样本中可提取得到纯度和完整性较高的gDNA,50例250μL冻存4年红细胞样本的gDNA产量中位数为8.80μg,A260/A280比值为1.92±0.08,A260/A230比值为2.23±1.37。与不做处理的未冻存红细胞样本比较,利用红细胞裂解液处理未冻存红细胞样本留取白细胞提取gDNA会使产量降低(P<0.01),而gDNA纯度没有明显差异。未冻存与冻存4年的红细胞样本gDNA产量比较差异无统计学意义(P>0.05)。未冻存白膜层样本gDNA产量明显高于未冻存红细胞样本(P<0.01)。结论抗凝血离心后去除血浆和白膜层的剩余红细胞样本中,仍有少量白细胞残留,选择合适的方法可提取得到纯度较高的gDNA,生物样本库存储红细胞样本能使血液样本得到更充分利用。 展开更多
关键词 血液样本 红细胞 基因组dna dna提取 分光光度法 电泳法 生物样本库 质量控制
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DNA条形码技术在食用血制品掺杂成分鉴别中的应用
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作者 励炯 吴琼 +2 位作者 江海 扈明洁 徐新怡 《食品与机械》 CSCD 北大核心 2023年第5期43-48,138,共7页
目的:建立一种可食用血制品中7种动物源成分(包括猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅、兔)掺杂鉴别的分析方法。方法:血制品经DNA提取纯化及PCR扩增后,将克隆测序结果提交至7种血制品的DNA条形码本地数据库进行序列比对。对血制品的预处理方式、DN... 目的:建立一种可食用血制品中7种动物源成分(包括猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅、兔)掺杂鉴别的分析方法。方法:血制品经DNA提取纯化及PCR扩增后,将克隆测序结果提交至7种血制品的DNA条形码本地数据库进行序列比对。对血制品的预处理方式、DNA提取方式以及PCR扩增条件进行选择和优化,并建立常见血制品掺杂模型,研究模型的最低掺杂检出率。结果:7种可食用血制品的DNA扩增效率为100%,各种掺杂模型中的最低掺杂检出率为5%;利用该法对25批次市售可食用血制品进行掺杂鉴定,发现有21批次存在掺有其他动物源成分的情况。结论:该方法简单、可靠,可作为日常可食用血制品质量监督的检测方法。 展开更多
关键词 dna条形码 可食用血制品 COI 掺杂
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