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B*48与B*1568难以应用SSP方法确定低分辨分型的分析
1
作者
缪扣荣
潘芹芹
+5 位作者
薛敏
樊甦
王晓艳
赵星
潘猛
汪承亚
《中国输血杂志》
CAS
CSCD
2007年第5期372-375,共4页
目的分析SSP方法难以确定B* 48与B* 1568低分辨分型的原因。方法应用基因克隆和DNA测序技术对受检标本HLA-B基因第1-3外显子(Exon1-3)作核苷酸序列分析,通过序列比对寻找SSP分型困难的原因。结果该标本HLA-B基因Exon1序列与B*4801Exon1...
目的分析SSP方法难以确定B* 48与B* 1568低分辨分型的原因。方法应用基因克隆和DNA测序技术对受检标本HLA-B基因第1-3外显子(Exon1-3)作核苷酸序列分析,通过序列比对寻找SSP分型困难的原因。结果该标本HLA-B基因Exon1序列与B*4801Exon1序列完全相同,与已公布的B* 15Exon1序列相比,第5位碱基由G→T,第11位碱基由C→T,第44、45位碱基由GA→CG。Exon3序列则与B* 1568完全相同,按WHOHLA命名该标本为B* 1568。结论部分PCR-SSP引物序列涉及Exon1区域,但有些等位基因在此区域的序列并未公布,因此可能出现分型困难。分析SSP分型中引物发生的疑难问题,有助于提高HLA分型水平。
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关键词
等位基因
HLA-
PCR—SSP
分型
低分辨
dna
测序
dna亚克隆
下载PDF
职称材料
题名
B*48与B*1568难以应用SSP方法确定低分辨分型的分析
1
作者
缪扣荣
潘芹芹
薛敏
樊甦
王晓艳
赵星
潘猛
汪承亚
机构
南京医科大学第一附属医院HLA实验室
出处
《中国输血杂志》
CAS
CSCD
2007年第5期372-375,共4页
文摘
目的分析SSP方法难以确定B* 48与B* 1568低分辨分型的原因。方法应用基因克隆和DNA测序技术对受检标本HLA-B基因第1-3外显子(Exon1-3)作核苷酸序列分析,通过序列比对寻找SSP分型困难的原因。结果该标本HLA-B基因Exon1序列与B*4801Exon1序列完全相同,与已公布的B* 15Exon1序列相比,第5位碱基由G→T,第11位碱基由C→T,第44、45位碱基由GA→CG。Exon3序列则与B* 1568完全相同,按WHOHLA命名该标本为B* 1568。结论部分PCR-SSP引物序列涉及Exon1区域,但有些等位基因在此区域的序列并未公布,因此可能出现分型困难。分析SSP分型中引物发生的疑难问题,有助于提高HLA分型水平。
关键词
等位基因
HLA-
PCR—SSP
分型
低分辨
dna
测序
dna亚克隆
Keywords
Allele
HLA, Sequence based typing (SBT), Sub-cloning
分类号
R457.11 [医药卫生—治疗学]
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
B*48与B*1568难以应用SSP方法确定低分辨分型的分析
缪扣荣
潘芹芹
薛敏
樊甦
王晓艳
赵星
潘猛
汪承亚
《中国输血杂志》
CAS
CSCD
2007
0
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