利用SSR标记研究甘蓝型油菜叶绿体基因组DNA多态性

叶绿体基因组具有母性遗传、单倍性、高度的保守性和明显的种内差异等特点。研究不同品种叶绿体基因多样化程度,可为甘蓝型油菜的收集与引种及遗传改良提供指导。利用15对特异性叶绿体SSR标记对287份国内外甘蓝型油菜叶绿体基因组多样性进行了分析,结果显示,在15对叶绿体SSR特异引物中,5对引物扩增产生多态性条带合计19条,平均每对引物检测出3.8条多态性条带;287份材料共划分成14个单倍型,优势单倍型H01占比74.91%、H02占比13.59%、H03占比4.88%,其余11种单倍型(H04-H14)占比合计6.62%;H02为波里马、陕2A胞质类型,为中国特有单倍型;国外甘蓝型油菜中,俄罗斯与瑞典的单倍型较丰富,引进俄罗斯与瑞典的资源能更高效拓宽中国甘蓝型油菜的遗传多样性本底。本研究还获得2对引物(MF-4和ccmp2)得到特异条带,并为此建立了快速鉴定波里马、陕2A胞质类型的方法,为波里马与陕2A细胞质类型材料的鉴定与保护提供了方法。

PCR扩增近交系大鼠微卫星位点DNA多态性的研究

本实验选取大鼠 7条染色体上的微卫星位点合成了 10对引物 ,利用聚合酶链反应 (PCR)扩增技术对国内北京和哈尔滨等 4家单位提供的 6个品系 (SHR、SHRSP、LEW、RCS、WKY和F34 4)的 8个近交系大鼠群体进行了DNA多态性分析的研究。结果表明 :9个微卫星位点具有显著多态性 ;不同品系个体之间具有多态性 ;同一群体不同个体之间除SHR(哈 )的SMST位点和WKY(哈 )的AGT位点出现一定的差异外 ,其他均没有差异 ;不同地区同一品系的不同个体之间也存在一定的差异。该方法能有效地对近交系与杂交系、品系与品系、品系与亚系加以区分。因此 ,本实验为开展近交系大鼠遗传作图、基因定位和为实验动物的遗传背景监测提供可靠的信息 ,为大鼠遗传基因的研究提供了一个快捷简便、特异准确的方法。

不同致害性褐飞虱种群的DNA多态性研究

采用RAPD_PCR方法 ,对分别在水稻品种TN1、Mudgo和ASD7上纯化 82代的 3个不同致害性褐飞虱种群的基因组DNA多态性进行了分析。从 2 0 5个RAPD引物中筛选出了具种群特异性的引物 10个 ,结果表明 :尽管未达到统计意义上的显著差异 ,雌、雄两性试虫种群间的遗传多样性一般高于种群内 ,种群内的多样性则以未经抗性品种筛选的TN1种群最高。用相似性系数进行类平均距离法聚类 ,能将同一致害性种群的各个个体与其他致害种群分开 ,雌、雄虫均无一例外 ,表明不同致害性种群间存在明显的遗传分化 ;同时雌、雄两性试虫分别归为 2组 ,提示褐飞虱致害性遗传可能与性染色体连锁。不同致害性种群存在特有条带 。

铅胁迫对不同基因型谷子幼苗生理特性及基因组DNA多态性的影响

以4种基因型谷子为供试材料,采用盆栽土培法,研究了土壤重金属Pb2+胁迫对谷子幼苗基因组DNA多态性和可溶性糖、脯氨酸、丙二醛(MDA)含量的影响。结果表明:经50～400mg·kg-1Pb2+处理30d后,4种谷子幼苗体内可溶性糖含量随Pb2+浓度上升而逐渐降低,降幅为对照的31.45%～49.11%。脯氨酸含量则表现为低浓度(≤100mg·kg-1)的促进和高浓度(≥200mg·kg-1)的抑制效应,MDA含量均有增加且与对照差异显著。Pb2+胁迫下不同基因型谷子幼苗基因组DNA的RAPD图谱发生明显变化,表现为单条或多条RAPD谱带的缺失、增加及荧光强度的增强或减弱,表明Pb2+明显影响谷子幼苗细胞中基因组模板DNA的稳定性,DNA多态性变化与Pb2+浓度之间存在剂量-效应关系。不同基因型谷子对Pb2+胁迫的生理和遗传损伤响应存在差异。利用RAPD技术获得的DNA多态性变化可作为检测Pb2+遗传毒性效应的生物标记物。

用微卫星引物PCR分析棉蚜不同蚜型的DNA多态性

用微卫星引物PCR方法 ,对棉蚜Aphisgossypii干母、干雌、孤雌蚜 (有翅迁飞孤雌蚜和无翅孤雌蚜 )、性母、性雌蚜和雄蚜的DNA多态性进行分析。结果表明 :①棉蚜的有性蚜型和无性蚜型之间在遗传上有较大的差异 ;②性母与性雌蚜和雄蚜的遗传关系都十分接近 ,说明同一性母既产性雌蚜 ,也产雄蚜 ;③干母和干雌的遗传关系很近 ,但孤雌蚜已与二者有分化。

镉胁迫对蚕豆幼苗基因组DNA多态性的影响

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术检测镉（cd）胁迫对蚕豆幼苗根尖DNA多态性的影响。结果表明，不同浓度（2．5、5和15mg·L^-1）镉处理7d后，蚕豆幼苗根伸长及根系中可溶性蛋白质含量均受到了抑制。选用12条寡核苷酸引物（10bp）对蚕豆幼苗根尖细胞中基因组DNA进行RAPD扩增，其中有6个引物产生特异性PCR产物。对照组蚕豆幼苗根尖基因组DNA的RAPD图谱中可分辨出86条RAPD谱带，其分子量为200—2520bp。处理组与对照组RAPD图谱之间存在明显差异，且与镉浓度之间存在剂量-效应关系。这些结果表明，镉影响蚕豆幼苗根尖细胞中基因组模板的稳定性，故利用RAPD技术获得的DNA多态性变化可作为检测镉黄传毒性效应的生物标记物。

桑树栽培种的随机扩增DNA多态性（RAPD）研究

通过２０个随机引物的扩增结果，显示出分属于４个栽培种的２０个材料的ＲＡＰＤ多态性，表明各种、品种间遗传分化上的差异：计算了２０个材料的遗传相似系数和遗传距离，建立了它们的ＵＰ－ＧＭＡ系统树：结果表明小官桑与鲁桑系有较近的亲缘关系，广东桑有较复杂的遗传背景。进一步探讨了桑树栽培种及种内各品种之间的亲缘关系。

RAPD条件优化及天麻基因组DNA多态性分析

建立了RAPD扩增条件快速优化程序与方法,并应用于天麻基因组DNA扩增条件的优化及多态性的测定;获得了天麻基因组DNA的RAPD扩增优化条件和DNA指纹图谱;分析了模板DNA、引物、dNTP、TaqDNA聚合酶等的浓度和退火温度对RAPD扩增的影响.结果表明:天麻基因组DNA用引物S1扩增的片段具有更明显的多态性,这种指纹图谱更适合于天麻遗传分化研究;而用引物S12扩增的DNA指纹图谱具有更大的相似性,这种指纹图谱更适合于天麻真伪鉴别.该方法使RAPD扩增条件优化过程实现了程序化和数量化,是获得RAPD优化条件的简便快速、经济实用方法.应用该方法进行RAPD扩增,可获得图谱清晰、稳定可靠的实验结果.

长期住院老年患者铜绿假单胞菌随机扩增DNA多态性分型研究

目的 了解长期住院老年患者肺部感染铜绿假单胞菌 (PA)的分子流行病学特征 ,为临床防治提供依据。方法 建立 PA随机扩增 DNA多态性 (RAPD)指纹图基因分型方法 ,对与流行病学相关或不相关 34株菌株的基因分型。结果 采用同一反应体系 ,30株临床分离株和 2株不相关株产生稳定 RAPD特异带型 ,分型率为 94 .12 % ,长期住院的同一患者不同时期或不同患者同一时期 PA的 RAPD谱型存在差异。结论 RAPD指纹图基因技术分型率高 ,分辨率强 ,简便快捷 ,可在分子水平上对老年人长期住院感染 PA提供病原学及流行病学的研究方法。

中国柞蚕DNA多态性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA(RAPD)标记技术对 4个代表性的柞蚕品种河 41、四青、青黄 1号、杏黄和 3个家蚕品种大造、C10 8、75 32的 2 8个个体进行了DNA多态性分析。结果表明 :柞蚕具有极为丰富的DNA多态性 ;不同品种的个体间 (种内 )的多态性为 80 7%,而同一品种个体间的多态性也达到 45 8%～ 49 4 %;同一品种个体间的遗传距离为 0 133～ 0 2 38,远大于家蚕的 0 0 0 8～ 0 0 81;不同品种个体间的遗传距离为 0 2 15～ 0 382 ,与家蚕相似。柞蚕的DNA多态性有 6 0 %来源于品种内的个体间 ,而来源于品种间的部分只占 40 %。UPGMA聚类时 ,柞蚕的各个体均能按品种聚在一起。

桃蚜不同蚜型DNA多态性的RAPD研究

采用RAPD方法 ,对全周期桃蚜的有翅产雌性母蚜、无翅性母蚜、雄蚜、卵、干母、干雌、有翅迁移蚜等蚜型的DNA遗传多态性进行了分析。结果表明 :卵的DNA多态性最大 ,性蚜次之 ,孤雌生殖蚜最小 ;卵与其它蚜型之间在遗传上具最大差异 ,其中与孤雌生殖蚜的差异大于与性蚜的 ;干母、干雌和迁移蚜之间的遗传关系最近。

玉米丝黑穗病菌DNA多态性的初步研究

从169个随机引物中筛选出了9个单引物和3个双引物,利用这些引物对玉米丝黑穗病菌进行了RAPD遗传多态性分析。聚类分析结果将24个菌株划分为3个致病类型:菌株03-12、03-13、03-01、03-02、03-03、03-11、03-04、03-16、03-07、03-08和03-14聚为一类;03-18、03-20、03-17、03-26、03-29、03-27、03-23、03-25、03-28聚为一类;03-21、03-22、03-15和03-10聚为一类。表明玉米丝黑穗病菌菌株间存在一定的遗传多态性和遗传分化,分化与菌株地域来源关系不大。

利用RAPD分子标记对我国杂交水稻主要恢复系的DNA多态性研究

用 2 5 8个 RAPD引物分析了我国杂交水稻 3 5个主要恢复系 ,其中 4 2个引物具有多态性 ,从中筛选出13个 RAPD引物 ,可检测出重演性较好的多态性片段 93条 ,能够有效地区分所有供试的恢复系材料 ,聚类分析显示 :在 GS=0 .5 7附近 ,可将 3 5个恢复系材料聚为 4类 ,大部分材料的遗传相似系数在 0 .80以上 .表明我国杂交水稻恢复系资源比较丰富 ,但其遗传差异较小 ,遗传背景比较单一 ,从而在很大程度上限制了我国水稻杂种优势的利用 .

中国3种不同生物型烟粉虱的种群DNA多态性研究(英文)

利用基因组DNA的多态性研究了中国3种不同生物型烟粉虱的种群分化.烟粉虱种群分别采自北京、扬州和广州的不同寄主上,烟粉虱生物型包括B型、本地型(NaC)和一种新的生物型(CV型).对3种生物型烟粉虱的RAPD-PCR结果进行遗传距离聚类分析,结果显示烟粉虱中国本地型和CV型的种群关系比较近缘,二者与B型种群的亲缘关系较远.3个烟粉虱生物型的种群分化属于种内分化,据此推测CV型烟粉虱可能起源于中国或其临近地区.

武汉东湖浮游生物群落DNA多态性与富营养化

对武汉东湖不同程度富营养化湖区 ,即站 、站 与站 浮游生物进行了群落级 DNA多态性的 DNA指纹研究 ,并就其拓扑结构与富营养化特征参数之间关系进行了分析。实验结果如下 :(1)各站点总氮、总磷及叶绿素 a分别为 1.14 6～ 2 .2 35mg/ L、0 .0 13～ 0 .2 10 mg/ L 和 4 0 .2 5～ 10 9.2 2 μg/ L;(2 )所筛选的 5个随机引物共获得 2 9个扩增位点 ,其中多态位点占75 .9% ,各引物扩增谱带数在 2～ 6间。站 的扩增条带数最多、谱带多态率最高 (6 9.6 % )、特有带最多 ;(3)特定浮游生物类群的特异性 PCR扩增谱带为 1～ 6条不等 ,站间差别甚小。聚类及综合分析表明 :DNA指纹拓扑结构与浮游生物及特定浮游生物类群的物种多样性丰度相吻合 ,并与富营养化主要指示参数存在明显相关 ,即在一定范围内浮游生物群落 DNA多态性与富营养化程度呈反方向发展 ,而原生动物则表现出同向性发展趋势。因此 ,群落级 DNA指纹分析不仅能为生态学研究洞开一片新颖的视窗 。

中、韩两国主要茶树品种基因组DNA多态性比较研究

利用RAPD技术结合类平均法聚类分析研究了中国、韩国和日本茶树品种资源共 4 6个样品的基因组DNA多态性。结果表明 ,19个有效随机引物对 4 6个样品共扩增出 2 0 0条RAPD带 ,平均每个引物 10 5条带 ,每个品种 4 4条带。在得到的 2 0 0条谱带中 ,多态性带达到 84 3 %。中国和韩国茶树品种DNA多态性分别为 86 2 %和 78 2 %。 4 6个品种之间的遗传距离为 0 2 79～ 0 65 4。聚类分析结果表明 ,4 6个供试品种可分成 4个类群 ;

枇杷栽培种的随机扩增DNA多态性(RAPD)研究

运用RAPD(RandomAmplifiedPolymorphicDNA)分析技术 ,对江苏省常绿果树研究中心 16个枇杷(E .japonicThunbLindl)品种的基因组DNA进行了分析 ,从 5 0个随机引物中筛选出 19个引物 ,可从各个品种的基因组DNA扩增出谱带 ,总数为 2 33个 ,其中多态性DNA片段 176个 ,公共性DNA片段 5 7个 ,表明这些枇杷品种间存在着丰富的遗传多样性。根据DNA片段的电泳结果 ,计算出品种间遗传相似系数及遗传距离 ,应用UPG MA方法建立了品种遗传关系的系统树 ,将 16个品种分成 5类。从随机引物中筛选出 2个随机引物能从各个品种的基因组DNA扩增出DNA片段 ,在 16个枇杷品种中 2个引物扩增出 19个DNA片段 ,其中 3个为公共 ,16个为多态性或单态性DNA片段。这些结果可为枇杷品种鉴定、分类、亲缘关系确立及品种选育中杂交组合亲本选配提供一定的依据。

中国野桑蚕DNA多态性研究初报

用RAPD技术对浙江省、陕西省和重庆地区的野桑蚕及家蚕品种C1 0 8和大造进行了DNA多态分析。结果发现 :中国野桑蚕具有极为丰富的遗传多样性 ,就DNA多态性而言 ,不仅地区之间有很大的差异 ,同一地区不同个体之间的DNA多态性差异也类似家蚕品种之间的差异 ;同时 ,野桑蚕也与家蚕有较大的相似性 ,其共有的DNA带数高达 1 3 6%,相似系数也在 0 6以上 。

莲藕品种DNA多态性的初步研究

利用RAPD技术对12个莲藕品种进行了DNA多态性分析。从85个随机引物中筛选出12个引物扩增基因组DNA,共获得128条带,其中106条为多态性标记,每个引物平均提供10.7个标记信息。由UP-MGA方法得到的聚类分析结果表明了12个品种间的亲缘关系,聚类结果与它们的系谱关系比较吻合。

利用SADF法进行家蚕基因组DNA多态性分析

从家蚕品种Ｃ１０８和大造后部丝腺提取的基因组ＤＮＡ，用ＰｓｔⅠ酶解后与自己设计的人工接头相连，并用与人工接头序列相匹配的选择性引物进行选择性ＰＣＲ扩增（ｓｅｌｅｃｔｉｖｅａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）．扩增产物经琼脂糖电泳检测显示，用ＳＡＤＦ法在两品种中能检测到稳定的ＤＮＡ多态性片段．