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悬钩子属DNA条形码通用序列的初步筛选
被引量:
4
1
作者
巫伟峰
沈玺龙
+4 位作者
陈哲
杨鼎元
李永霞
王瑶
张群英
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期301-307,共7页
为了建立悬钩子属(Rubus)植物的DNA条形码分子鉴定技术,筛选获得适用于悬钩子属植物的通用条形码序列。该研究基于GenBank数据对ITS、ITS2、matK、rbcL、trnH-psbA、trnL-trnF 6个DNA条形码序列进行了遗传变异、barcoding gap、建树等...
为了建立悬钩子属(Rubus)植物的DNA条形码分子鉴定技术,筛选获得适用于悬钩子属植物的通用条形码序列。该研究基于GenBank数据对ITS、ITS2、matK、rbcL、trnH-psbA、trnL-trnF 6个DNA条形码序列进行了遗传变异、barcoding gap、建树等评估分析。结果显示,trnH-psbA、matK、rbcL、rtnL-trnF的种内变异与种间变异差异较大,变异分辨率分别为97.32%、83.33%、79.07%、64.95%,存在较大的barcoding gap;NJ一致树分析显示,matK的单系性比例最高(67%),其次为trnH-psbA(64%),rtnL-trnF(43%),rbcL(30%)。结果表明,悬钩子属植物的matK与trnH-psbA序列种内变异与种间变异差异较大,能较好地区分不同物种,具有较大的鉴定潜力。建议将matK和trnH-psbA作为悬钩子属植物鉴定的核心条形码序列,rtnL-trnF、rbcL作为辅助条形码序列。
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关键词
悬钩子属
dna条形码筛选
物种鉴定
MATK
TRNH-PSBA
下载PDF
职称材料
中药DNA条形码分子鉴定技术的应用与展望
被引量:
38
2
作者
方强强
王燕
+1 位作者
彭春
唐玲
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第22期197-205,共9页
中药材品种广泛,存在多基原的情况,质量差异较大,使临床用药安全性和有效性难以得到保证。因传统中药鉴定方法的局限性,对准确鉴别多基原中药材带来了一定的挑战。为了保证中药临床用药安全有效可控,中药鉴定学已成为最重要的研究课题之...
中药材品种广泛,存在多基原的情况,质量差异较大,使临床用药安全性和有效性难以得到保证。因传统中药鉴定方法的局限性,对准确鉴别多基原中药材带来了一定的挑战。为了保证中药临床用药安全有效可控,中药鉴定学已成为最重要的研究课题之一,也是当前中医药事业急需解决的关键技术要求。DNA基因鉴别是从基因层面对中药材进行快速、准确的鉴定,包括DNA分子标记法、核酸探针杂交法和DNA条形码技术,其中DNA条形码技术应用最为广泛。DNA条形码是利用标准的DNA片段对物种进行鉴定的技术,2015年版《中国药典》收载了DNA条形码技术指导原则,建立了动物类采用细胞色素C氧化酶亚基I(COI)序列为主,转录间隔区间(ITS)2为辅;植物类采用ITS2/ITS为主,叶绿体psb A-trn H为辅的中药材鉴定体系。该技术的广泛应用为中药鉴别提供更高效快速的方法,并且有效地应用于多基原中药材的鉴别中,使中药品种混乱现象得到极大改观。文章首先对DNA条形码技术的原理、目的及意义、标准片段的选择进行介绍,着重阐述该技术在中药鉴定中的应用以及存在的局限性,并提出展望,以期为中药材的鉴定研究提供参考。
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关键词
dna
条形码
中药材
dna条形码筛选
线粒体基因
核基因
叶绿体基因
原文传递
题名
悬钩子属DNA条形码通用序列的初步筛选
被引量:
4
1
作者
巫伟峰
沈玺龙
陈哲
杨鼎元
李永霞
王瑶
张群英
机构
贵州省植物园
中国科学院庐山植物园
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期301-307,共7页
基金
贵州省科技厅黔科合成果项目([2019]4330号)。
文摘
为了建立悬钩子属(Rubus)植物的DNA条形码分子鉴定技术,筛选获得适用于悬钩子属植物的通用条形码序列。该研究基于GenBank数据对ITS、ITS2、matK、rbcL、trnH-psbA、trnL-trnF 6个DNA条形码序列进行了遗传变异、barcoding gap、建树等评估分析。结果显示,trnH-psbA、matK、rbcL、rtnL-trnF的种内变异与种间变异差异较大,变异分辨率分别为97.32%、83.33%、79.07%、64.95%,存在较大的barcoding gap;NJ一致树分析显示,matK的单系性比例最高(67%),其次为trnH-psbA(64%),rtnL-trnF(43%),rbcL(30%)。结果表明,悬钩子属植物的matK与trnH-psbA序列种内变异与种间变异差异较大,能较好地区分不同物种,具有较大的鉴定潜力。建议将matK和trnH-psbA作为悬钩子属植物鉴定的核心条形码序列,rtnL-trnF、rbcL作为辅助条形码序列。
关键词
悬钩子属
dna条形码筛选
物种鉴定
MATK
TRNH-PSBA
Keywords
Rubus
dna
barcodes selection
species identification
matK
trnH-psbA
分类号
S663.2 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
中药DNA条形码分子鉴定技术的应用与展望
被引量:
38
2
作者
方强强
王燕
彭春
唐玲
机构
大理大学药学与化学学院
出处
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第22期197-205,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81560695)
大理大学博士科研启动基金项目(KYBS201512)
大理大学第八批中青年学术带头人培养基金
文摘
中药材品种广泛,存在多基原的情况,质量差异较大,使临床用药安全性和有效性难以得到保证。因传统中药鉴定方法的局限性,对准确鉴别多基原中药材带来了一定的挑战。为了保证中药临床用药安全有效可控,中药鉴定学已成为最重要的研究课题之一,也是当前中医药事业急需解决的关键技术要求。DNA基因鉴别是从基因层面对中药材进行快速、准确的鉴定,包括DNA分子标记法、核酸探针杂交法和DNA条形码技术,其中DNA条形码技术应用最为广泛。DNA条形码是利用标准的DNA片段对物种进行鉴定的技术,2015年版《中国药典》收载了DNA条形码技术指导原则,建立了动物类采用细胞色素C氧化酶亚基I(COI)序列为主,转录间隔区间(ITS)2为辅;植物类采用ITS2/ITS为主,叶绿体psb A-trn H为辅的中药材鉴定体系。该技术的广泛应用为中药鉴别提供更高效快速的方法,并且有效地应用于多基原中药材的鉴别中,使中药品种混乱现象得到极大改观。文章首先对DNA条形码技术的原理、目的及意义、标准片段的选择进行介绍,着重阐述该技术在中药鉴定中的应用以及存在的局限性,并提出展望,以期为中药材的鉴定研究提供参考。
关键词
dna
条形码
中药材
dna条形码筛选
线粒体基因
核基因
叶绿体基因
Keywords
dna
barcoding
Chinese medicinal materials
dna
barcode screening
mitochondrialgene
nuclear gene
chloroplast gene
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
R927 [医药卫生—药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
悬钩子属DNA条形码通用序列的初步筛选
巫伟峰
沈玺龙
陈哲
杨鼎元
李永霞
王瑶
张群英
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
下载PDF
职称材料
2
中药DNA条形码分子鉴定技术的应用与展望
方强强
王燕
彭春
唐玲
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
38
原文传递
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