胎儿DNA短片段富集分析法辨别无创产前检测中母体来源的假阳性病例分析

目的:比较胎儿DNA短片段富集分析法在无创产前检测(NIPT)中辨别母体来源的假阳性病例的临床应用价值。方法:选取13例母体染色体异常引起的NIPT假阳性标本和8例胎盘染色体异常引起的NIPT假阳性标本。用半导体基因测序技术测序后,分别用胎儿DNA全片段分析法(M方法)和DNA短片段富集分析法(L方法)分析测序数据,分别获得染色体Z值和相应的染色体位置-剂量分布曲线。结果:在母体来源的假阳性样本中,L方法与M方法比较阳性信号缩小,表现为Z值绝对值变小,在染色体位置-剂量分布曲线上更接近基线0。而胎盘来源样本阳性信号则相反。结论:在NIPT中,DNA短片段富集分析法能辨别母体来源的假阳性信号,且不增加额外实验成本,具有临床应用价值。

青蟹微卫星DNA的筛选及特征分析

利用磁珠富集法,结合生物素标记的(CA)16寡核苷酸探针从青蟹基因组MboI酶切片段中筛选微卫星DNA序列。将得到的片段与pGEM-T Easy载体连接后转化克隆构建微卫星富集文库。经PCR筛选检测,对89个阳性克隆进行测序,其中52个克隆中含有64个微卫星,完全型占87.50%,重复次数超过11次的占78.12%。根据所获微卫星的侧翼序列设计并合成了30对引物,通过优化PCR反应条件,并在35只青蟹个体中进行PCR扩增检测,最终获得了10对具有多态性的引物,为进一步开展青蟹遗传多样性分析、遗传图谱构建等研究提供了基础资料。

消减杂交基因克隆技术研究进展

基因克隆技术是研究生命过程分子机制的基础,消减杂交基因克隆技术的应用,使一些多基因遗传病相关致病基因的筛查和定位有所突破。本文综述近年消减杂交-基因克隆技术研究进展,包括差示反转录PCR、差异消减杂交、代表性差异分析、S1富集法、抑制性消减杂交、基因组错配扫描、比较基因组杂交及DNA微阵列杂交系统等。

miRNA-32启动子区域相互作用蛋白的分析

目的检测及分析与微RNA-32(miRNA-32)基因上游启动子区域相互作用的蛋白。方法采用DNA pulldown技术联合质谱鉴定的方法检测miRNA-32启动子区域相互作用的蛋白,并用生物信息学方法对这些蛋白进行GO富集及KEGG通路分析。结果在大肠癌HCT-116细胞中总共鉴定到191个与miRNA-32启动子区域特异性结合的蛋白。GO功能富集分析显示,这些蛋白涉及多种生物学功能,包括参与核酸代谢、基因转录、细胞周期、细胞生长和再生等过程。KEGG通路分析表明这些蛋白参与多条信号通路,包括间隙连接、细胞周期信号通路、MAPK信号通路等。结论与miRNA-32启动子区域有相互作用的蛋白具有多种生物学功能及参与多条信号通路。