烧伤感染病原菌的DNA微阵列检测研究

目的观察DNA微阵列检测烧伤感染病原菌的灵敏度和特异度。方法分别采用DNA微阵列法和常规培养分离鉴定法对不同含菌量的菌液进行检测,比较二者鉴定病原菌的灵敏度;采用微阵列法检测经常规方法鉴定明确的烧伤感染病原菌62株,观察二者的阳性符合率和阴性符合率;采用上述两种方法检测103份烧伤创面分泌物标本,观察其符合率。结果与常规方法相比,DNA微阵列检测烧伤创面细菌具有快捷、高通量的优势,鉴定单一菌株的灵敏度比常规方法高10-100倍,鉴定已知菌株与常规方法的阳性符合率和阴性符合率均为100%;在检测103份烧伤创面分泌物时,DNA微阵列除鉴定出常规方法鉴定出的所有菌株外,还检出了一些常规方法未检出的菌株。结论与常规方法相比,DNA微阵列检测烧伤感染常见病原菌的符合率和灵敏度均达到较高水平,具有良好的临床应用前景。

PROGRESS IN DNA CHIP TECHNOLOGY

DNA chip technology employs light- directed in situ oligonucleotide synthesis and/or DNA microarray printing device to produce arrays of large number of probes in the tiny surface of silicon substrates, which makes it possible that the gene detection be conducted efficiently with high speed and sensitivity. The DNA chip may take important part in genome research, gene diagnoses and so on.

褪黑素在辐射诱导的小鼠放射性肠损伤作用中的全基因体表达图谱分析

目的探讨褪黑素在小鼠放射性肠损伤作用中的全基因体表达图谱变化。方法对C57BL/6J雄性小鼠按10 mg/kg体重进行腹腔注射褪黑素,1次/d,连续5 d,然后,对小鼠腹部进行14 Gyγ射线照射。照射后3 d收集小鼠小肠组织,进行DNA微阵列检测,对小肠组织差异基因进行基因本体论(GO)注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果与对照组相比,照射前给药组小鼠差异基因中上调基因584个,下调基因538个。照射组和照射前给药组小鼠取交集的差异基因中,照射前给药组特有的上调基因324个,下调基因246个。这些差异基因的GO注释分析显示,照射前给药组排名前15的显著富集的生物过程主要包括自噬体组装(GO:0000045)、自噬体组织(GO:1905037)和急性炎症反应调节(GO:0002673)。其中,ATG12、ATG16L2和AMBRA1基因参与自噬体组装和自噬体组织,C3、CPN1、CD55、CFP、CNR1、C1QA、C2和CREB3L3基因参与急性炎症反应调节。这些差异基因参与的KEGG通路分析显示,照射前给药组排名前15的显著富集的通路主要包括O-聚糖生物合成(hsa00512)、鞘糖脂生物合成(hsa00603)、细胞外基质-受体互作(hsa04512)和不饱和脂肪酸生物合成(hsa01040)。qRT-PCR验证显示,照射前给药组参与自噬生物过程中的ATG12和ATG16L2基因的表达量较照射组显著增加(t=2.40、4.35,P<0.05)。结论与自噬和急性炎症反应相关生物过程中的差异基因,以及参与不饱和脂肪酸生物合成的通路,可能参与褪黑素在辐射诱导的放射性肠损伤中的作用。