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基于DNA.NET的分布式测控系统集成框架的研究
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作者 李念强 《工业控制计算机》 2002年第2期7-9,共3页
本文介绍了.NETRemoting应用模型,以及基于Remoting的DNA.NET三层应用框架;同时还提出了分布式测试系统的计算模型。
关键词 NETRemoting应用模型 dna.net 系统集成框架 分布式测控系统
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新型超声快速处理活检标本保存不同年限对DNA质量的影响
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作者 石晨曦 朱卫东 +3 位作者 李三恩 李秀明 师逢 丁亚云 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第13期2655-2660,共6页
背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探... 背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探索最佳的标本存储时间。方法:收集40例乳腺穿刺小活检组织,采用超声技术制作石蜡标本,按照存储年限分为4组:<1年组、1-3年组、>3-5年组及>5年组,每组10例,对石蜡标本进行切片,每张切片厚3μm,切片10-15张,提取DNA后通过Nanophotometer N60超微量分光光度计和Qubit 4.0荧光计检测DNA的质量浓度,记录A_(260)/A_(280)比值判定DNA的纯度,利用全自动毛细管电泳核酸分析仪(Qsep 100)检测DNA片段完整性,以评估DNA片段的质量。结果与结论:4组样本A_(260)/A_(280)均值在1.8-2.0之间,达到纯度要求,无明显差异。4组样本的DNA质量浓度(Qubit浓度)均值分别为30.39,14.33,2.52,1.95 ng/μL;DNA的平均N/Q比值分别为6.48,14.18,24.56,29.86;DNA质量数均值分别为5.64,1.76,1.24,0.80;大片段占比均值分别为56.08%,17.72%,12.68%,7.90%。PCR检测内控基因Ct均值分别为15.32,17.09,18.39,21.24。与<1年组相比,其余3组DNA浓度显著降低,N/Q比值显著增加,DNA质量数和大片段占比均值显著降低,Ct值升高,差异有显著性意义(P<0.05)。实验结果表明,对于新型超声处理活检标本,应优先选择存储<1年的样本进行日常分子检测,储存3年内的样本可满足二代测序等检测要求,5年内样本仅可尝试进行PCR等检测,存储超过5年的样本不建议进行后续分子检测。 展开更多
关键词 超声处理 存储年限 DNA质量 片段完整性 降解程度 二代测序
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基于中医证候与精液质量相关参数构建精子DNA碎片预测模型与验证
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作者 周超 庾广聿 +4 位作者 阳绍华 高磊磊 金珍 蒋月园 李欢 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第13期2661-2668,共8页
背景:中医证候与精液质量相关参数相结合,共同预测精子DNA碎片指数(DNA fragmentation index,DFI)异常增高的发生并绘制列线图,能显著提高临床的实操性与应用效能,为临床全面评估精液质量,采取积极干预措施以改善临床结局及制定个体化... 背景:中医证候与精液质量相关参数相结合,共同预测精子DNA碎片指数(DNA fragmentation index,DFI)异常增高的发生并绘制列线图,能显著提高临床的实操性与应用效能,为临床全面评估精液质量,采取积极干预措施以改善临床结局及制定个体化医疗方案提供依据。目的:探讨基于中医证候与精液质量相关参数构建精子DNA碎片的预测模型与验证。方法:回顾性分析2019年7月至2021年7月在广西壮族自治区南溪山医院中医男科接受中医证候诊断及精子DNA碎片率检查的不育患者共420例,据《人类精液检查与处理实验室手册》(第6版),将其中137例精子DFI>30%患者纳入精子DFI异常增高组,将283例精子DFI≤30%作为对照组;首先采用单因素分析筛选精子DFI异常增高的影响因素,然后采用套索算法(LASSO)校正因子共线性问题并筛选出最佳匹配因子后,将其纳入多因素向前逐步Logistic回归找出其独立影响因素并绘制列线图,最后采用受试者工作曲线、校准曲线、临床决策曲线、临床影响曲线对该预测模型进行区分度与准确度及临床应用效能验证。结果与结论:①单因素分析结果显示,年龄、体质量指数、前向运动率、精子总活率、精子浓度、精子形态学、肾阳虚衰证、湿热下注证、肾精不足证为引发精子DFI异常增高的影响因子(P<0.05);②通过LASSO回归进一步筛选出的最佳匹配因素为年龄、体质量指数、精子总活率、精子浓度、精子形态学、肾阳虚衰证、湿热下注证、肾精不足证(P<0.05);③多因素向前逐步Logistic回归结果显示年龄、体质量指数、精子浓度、精子总活率、湿热下注证、肾阳虚衰证共6项为引发精子DFI异常增高的独立影响因素;④受试者工作曲线显示,模型组曲线下面积为0.760(0.713,0.806),验证组曲线下面积为0.745(0.714,0.776),说明该预测模型具有较好的区分度;⑤校准曲线平均绝对误差0.040,Hosmer-Lemeshow检验P>0.05,表明该模型预测发生精子DFI异常增高的概率与实际发生精子DFI异常增高的概率无显著统计学差异,证实该模型具有较好的准确度;⑥临床决策曲线与临床影响曲线显示,模型组与验证组分别在阈概率值为0.08-0.84与0.09-0.78时具有临床最大净获益,且在该阈概率范围内具有较好的临床应用效能;⑦结果表明,年龄、体质量指数、精子浓度、精子总活率、湿热下注证、肾阳虚衰证为引发精子DFI异常增高的独立影响因素,通过其构建的临床预测模型列线图具有较好的临床预测价值与临床应用效能,可为临床全面评估精液质量、预后与干预及个体化医疗服务提供依据。 展开更多
关键词 精子DNA碎片 精子DNA完整性 中医证候 精子DNA碎片指数 预测模型
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FTA-环介导等温扩增技术直接提取变异链球菌DNA的效果评价 被引量:1
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作者 王玥晖 尚进 +4 位作者 杨晨 符冬格 曹灿 张晓东 王敬夫 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第5期1043-1049,共7页
背景:变异链球菌是龋病的重要病原菌,及时检测变异链球菌水平对龋病的早发现、早治疗有重要意义。目的:建立并评价FTA-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术直接提取变异链球菌DNA的应用效果。方法:①制备... 背景:变异链球菌是龋病的重要病原菌,及时检测变异链球菌水平对龋病的早发现、早治疗有重要意义。目的:建立并评价FTA-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术直接提取变异链球菌DNA的应用效果。方法:①制备含有ATCC标准菌株变异链球菌的菌悬液,接种于脑心浸出液培养基,充分混匀后按10倍梯度稀释成7种浓度(4.2×10^(7),4.2×10^(6),4.2×10^(5),4.2×10^(4),4.2×10^(3),4.2×10^(2),4.2×10 CFU/mL),每个稀释级做2个平行对照,并增加无菌水作为空白对照;②分别采用FTA卡、常规煮沸法、试剂盒提取及裂解液提取4种方法直接提取菌株DNA,通过LAMP技术进行扩增,并进行特异性试验,比较4种提取方法的差异。结果与结论:①4种方法提取的DNA均满足LAMP扩增的要求;②特异性试验结果显示,只有变异链球菌才可特异扩增出靶基因;③裂解液提取法最低检测限为4.2×10^(3) CFU/mL,FTA卡提取法最低检测限为4.2×10^(4) CFU/mL,试剂盒提取法和常规煮沸法最低检测限分别为4.2×10^(6) CFU/mL和4.2×10^(7) CFU/mL;④4种提取方法其他方面的比较显示,试剂盒提取法的实验成本、步骤数和时间都是最高;其他3种方法步骤数一致,其中FTA卡所需仪器设备最少,常规煮沸法单次成本最低,裂解液提取法所需时间最少;FTA卡和裂解液提取法仅需少量菌即可提取成功,后者在时间方面优于FTA卡,但相较于FTA卡其单次成本高,所需设备多;⑤结果说明,该研究建立的FTA-LAMP技术具有操作简便、特异性强、灵敏度高、结果可视化等优势,有望为高效提取检测变异链球菌提供新途径。 展开更多
关键词 变异链球菌 环介导等温扩增 FTA卡 DNA 可视化
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表观遗传学变化及运动调控:改善骨骼肌衰老的机制
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作者 樊饶 孔健达 +3 位作者 李琳 翟腾 杨紫柔 朱磊 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第2期419-429,共11页
背景:骨骼肌衰老和多种表观遗传学变化密切相关,运动对这些表观遗传学变化具有一定调控作用,但尚不完全了解其具体机制。目的:回顾骨骼肌的表观遗传学机制以及运动如何通过这些表观遗传学机制来改善骨骼肌的衰老,并促进肌肉的适应性变化... 背景:骨骼肌衰老和多种表观遗传学变化密切相关,运动对这些表观遗传学变化具有一定调控作用,但尚不完全了解其具体机制。目的:回顾骨骼肌的表观遗传学机制以及运动如何通过这些表观遗传学机制来改善骨骼肌的衰老,并促进肌肉的适应性变化,旨在更全面地认识骨骼肌老化和疾病机制。方法:于2023-06-01/08-01检索自建库至2023年8月的Web of Science、PubMed、中国知网(CNKI)、万方和维普等数据库,中文检索词包括骨骼肌、肌肉、衰老、老年、老化、运动、体育锻炼、表观遗传、表观遗传学等;英文检索词包括skeletal muscle,muscle,aging,older adult,senescence,older adult,age,exercise,sports,physical activity,physical activity,epigenetic,epigenetics等。运用布尔逻辑运算符将检索词连接并进行检索,并制定了相应的策略。根据预定的纳入和排除标准,最终筛选出70篇符合条件的文献。结果与结论:①表观遗传学是指基因序列不发生改变的情况下,基因表达和功能受到调控的现象,其中骨骼肌的表观遗传学变化是一个重要的领域;②骨骼肌的表观遗传学机制在肌肉衰老过程中起着重要作用,主要涉及DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA的调控、染色质重塑、线粒体功能改变和衰老相关基因的表达改变等;③运动显著调控骨骼肌表观遗传学,包括运动促进骨骼肌DNA甲基化、骨骼肌组蛋白修饰、调控骨骼肌miRNA、调控骨骼肌长链非编码RNAs、调控肌肉因子(白细胞介素6的作用)、调控骨骼肌线粒体功能(过氧化物酶体增殖剂激活受体γ共激活因子1α的作用);④建议未来开展:长期、跨不同群体的运动干预研究;应用多组学技术,如蛋白组学和代谢组学;加强对单个细胞水平上表观遗传学变化;开展跨物种的比较研究以及人体临床试验将动物模型的发现转化到人类;研究运动与药理学干预相结合的策略评估两者的协同效果;开展骨骼肌和不同器官之间串扰交互作用的表观遗传学研究。 展开更多
关键词 骨骼肌 衰老 表观遗传学变化 运动调控 DNA甲基化 组蛋白修饰 线粒体功能
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基于非靶向代谢组学分析甲基化对副干酪乳酪杆菌发酵剂贮藏特性的影响
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作者 游明坤 张文羿 《食品科学》 EI CAS 北大核心 2025年第1期49-55,共7页
副干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)Zhang是一株具有调节免疫反应、抗氧化等益生特性的优良菌株。DNA甲基化是一种重要的表观遗传机制,在细菌的很多生理过程中发挥关键作用。为更好利用该菌株,本研究重点关注甲基化对L.parac... 副干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)Zhang是一株具有调节免疫反应、抗氧化等益生特性的优良菌株。DNA甲基化是一种重要的表观遗传机制,在细菌的很多生理过程中发挥关键作用。为更好利用该菌株,本研究重点关注甲基化对L.paracasei Zhang发酵剂贮藏特性的影响。利用L.paracasei Zhang及其DNA甲基化突变株ΔpglX制备发酵剂并在30℃条件下贮藏90 d。结果表明:与野生型相比,甲基化突变株在贮藏90 d后活菌数极显著提高(P<0.01);利用非靶向代谢组学方法分析贮藏90 d后野生型及其甲基化突变体的代谢物差异发现,与野生型相比,突变体的差异代谢物质有269种,在负离子模式下主要富集到核苷酸代谢、嘌呤代谢、嘧啶代谢、柠檬酸循环、乙醛酸盐和二羧酸盐代谢等多条代谢通路,在正离子模式下主要富集到生物素代谢等多条代谢通路。研究结果证实DNA甲基化可以通过生成和利用碳水化合物类、脂肪酸类物质等提高L.paracasei Zhang的贮藏特性。 展开更多
关键词 副干酪乳酪杆菌 DNA甲基化 贮藏特性 发酵剂 pglX 非靶向代谢组学
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基于活产建立体外受精-胚胎移植精子DNA碎片指数的参考阈值及子代短期安全性
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作者 周超 王淑娴 +2 位作者 于春梅 庾广聿 蒋月园 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第1期111-119,共9页
背景:精子DNA碎片指数与受精、胚胎发育潜能、胚胎植入、流产及子代安全性等存在显著的相关性。然而,其临床参考值受多种因素的影响,导致临床意义极其有限,该研究以活产为结局,通过倾向评分匹配校正其他混杂因素后,构建精子DNA碎片指数... 背景:精子DNA碎片指数与受精、胚胎发育潜能、胚胎植入、流产及子代安全性等存在显著的相关性。然而,其临床参考值受多种因素的影响,导致临床意义极其有限,该研究以活产为结局,通过倾向评分匹配校正其他混杂因素后,构建精子DNA碎片指数与活产的最佳临床截断值,并对其进行内外部验证,具有较好的预测价值及临床应用效能。目的:探讨基于活产建立体外受精-胚胎移植精子DNA碎片指数的参考阈值及子代短期安全性。方法:选取2019年5月至2021年5月于常州市妇幼保健院接受体外受精-胚胎移植患者1921例,以倾向匹配容差0.02为标准,1∶1进行倾向评分匹配,结果活产组与非活产组各成功匹配540例,以此建立模型组;通过选取同时期广西壮族自治区南溪山医院接受体外受精-胚胎移植患者135例作为外部验证组;采用受试者工作曲线探求精子DNA碎片指数对活产的临床最佳截断值,分别采用限制性立方样条曲线、标准曲线、临床决策曲线、临床影响曲线及内外部验证等方法,对该截断值的准确性及临床应用效能进行评估。结果与结论:(1)非活产组精子DNA碎片指数显著高于活产组且与活产存在显著的负相关性(r=-0.444,P<0.001);(2)受试者工作曲线结果显示,DNA碎片指数对活产的最佳截断值为24.33%,曲线下面积为0.775(0.746,0.804),特异度为72.60%,敏感度为78.90%,准确度为75.70%;(3)限制性立方样条曲线拟合Logistic回归结果显示,当精子DNA碎片指数大于24.57%时,临床非活产的风险呈趋势性增涨;(4)Logistic回归概率分析结果显示,精子DNA碎片指数为活产的危险因素[OR(95%CI)=0.916(0.904,0.928),P<0.001],且当精子DNA碎片指数大于27.78%时,临床活产发生的概率将小于50%,随着精子DNA碎片指数每增高1个单位,活产的概率下降8.4%;(5)内外部对该临床截断值的验证均显示,该截点具有一定的临床预测价值及准确性;(6)临床决策曲线与临床影响曲线显示,以该临床截断值建立的预测模型在阈概率为0.22-0.73时具有临床最大净获益值,且在该阈概率范围内损失与获益的比值始终小于1,证实该预测模型具有较好的临床应用效能;(7)精子DNA碎片指数与子代短期安全性分析结果显示,精子DNA碎片指数与出生儿早产、体质量、畸形、性别差异无显著性;(8)结果表明,精子DNA碎片指数对体外受精-胚胎移植活产的最佳临床截断值为24.33%,以此建立的临床预测模型具有较好的区分度、准确度与临床应用效能,精子DNA碎片指数对子代短期安全性影响并不显著,但仍需大样本及长期的追踪评估。 展开更多
关键词 精子DNA碎片指数 活产 体外受精-胚胎移植 子代安全性 最佳截断值
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Peripheral mitochondrial DNA as a neuroinflammatory biomarker for major depressive disorder
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作者 Jinmei Ye Cong Duan +5 位作者 Jiaxin Han Jinrong Chen Ning Sun Yuan Li Tifei Yuan Daihui Peng 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第6期1541-1554,共14页
In the pathogenesis of major depressive disorder, chronic stress-related neuroinflammation hinders favorable prognosis and antidepressant response. Mitochondrial DNA may be an inflammatory trigger, after its release f... In the pathogenesis of major depressive disorder, chronic stress-related neuroinflammation hinders favorable prognosis and antidepressant response. Mitochondrial DNA may be an inflammatory trigger, after its release from stress-induced dysfunctional central nervous system mitochondria into peripheral circulation. This evidence supports the potential use of peripheral mitochondrial DNA as a neuroinflammatory biomarker for the diagnosis and treatment of major depressive disorder. Herein, we critically review the neuroinflammation theory in major depressive disorder, providing compelling evidence that mitochondrial DNA release acts as a critical biological substrate, and that it constitutes the neuroinflammatory disease pathway. After its release, mitochondrial DNA can be carried in the exosomes and transported to extracellular spaces in the central nervous system and peripheral circulation. Detectable exosomes render encaged mitochondrial DNA relatively stable. This mitochondrial DNA in peripheral circulation can thus be directly detected in clinical practice. These characteristics illustrate the potential for mitochondrial DNA to serve as an innovative clinical biomarker and molecular treatment target for major depressive disorder. This review also highlights the future potential value of clinical applications combining mitochondrial DNA with a panel of other biomarkers, to improve diagnostic precision in major depressive disorder. 展开更多
关键词 BIOMARKER cytokine EXOSOMES INFLAMMASOME major depressive disorder MICROGLIA mitochondrial DNA mitochondrial dysfunction NEUROINFLAMMATION Toll-like receptor
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Epigenetic regulation of the inflammatory response in stroke
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作者 Jingyi Liang Fei Yang +1 位作者 Zixiao Li Qian Li 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第11期3045-3062,共18页
Stroke is classified as ischemic or hemorrhagic,and there are few effective treatments for either type.Immunologic mechanisms play a critical role in secondary brain injury following a stroke,which manifests as cytoki... Stroke is classified as ischemic or hemorrhagic,and there are few effective treatments for either type.Immunologic mechanisms play a critical role in secondary brain injury following a stroke,which manifests as cytokine release,blood–brain barrier disruption,neuronal cell death,and ultimately behavioral impairment.Suppressing the inflammatory response has been shown to mitigate this cascade of events in experimental stroke models.However,in clinical trials of anti-inflammatory agents,longterm immunosuppression has not demonstrated significant clinical benefits for patients.This may be attributable to the dichotomous roles of inflammation in both tissue injury and repair,as well as the complex pathophysiologic inflammatory processes in stroke.Inhibiting acute harmful inflammatory responses or inducing a phenotypic shift from a pro-inflammatory to an anti-inflammatory state at specific time points after a stroke are alternative and promising therapeutic strategies.Identifying agents that can modulate inflammation requires a detailed understanding of the inflammatory processes of stroke.Furthermore,epigenetic reprogramming plays a crucial role in modulating post-stroke inflammation and can potentially be exploited for stroke management.In this review,we summarize current findings on the epigenetic regulation of the inflammatory response in stroke,focusing on key signaling pathways including nuclear factor-kappa B,Janus kinase/signal transducer and activator of transcription,and mitogen-activated protein kinase as well as inflammasome activation.We also discuss promising molecular targets for stroke treatment.The evidence to date indicates that therapeutic targeting of the epigenetic regulation of inflammation can shift the balance from inflammation-induced tissue injury to repair following stroke,leading to improved post-stroke outcomes. 展开更多
关键词 DNA methylation histone modification intracerebral hemorrhage ischemic stroke NEUROINFLAMMATION NEUROPROTECTION non-coding RNA RNA methylation subarachnoid hemorrhage treatment
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Targeting epigenetic mechanisms in amyloid-β-mediated Alzheimer’s pathophysiology:unveiling therapeutic potential
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作者 Jennie Z.Li Nagendran Ramalingam Shaomin Li 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第1期54-66,共13页
Alzheimer’s disease is a prominent chronic neurodegenerative condition characterized by a gradual decline in memory leading to dementia.Growing evidence suggests that Alzheimer’s disease is associated with accumulat... Alzheimer’s disease is a prominent chronic neurodegenerative condition characterized by a gradual decline in memory leading to dementia.Growing evidence suggests that Alzheimer’s disease is associated with accumulating various amyloid-βoligomers in the brain,influenced by complex genetic and environmental factors.The memory and cognitive deficits observed during the prodromal and mild cognitive impairment phases of Alzheimer’s disease are believed to primarily result from synaptic dysfunction.Throughout life,environmental factors can lead to enduring changes in gene expression and the emergence of brain disorders.These changes,known as epigenetic modifications,also play a crucial role in regulating the formation of synapses and their adaptability in response to neuronal activity.In this context,we highlight recent advances in understanding the roles played by key components of the epigenetic machinery,specifically DNA methylation,histone modification,and microRNAs,in the development of Alzheimer’s disease,synaptic function,and activity-dependent synaptic plasticity.Moreover,we explore various strategies,including enriched environments,exposure to non-invasive brain stimulation,and the use of pharmacological agents,aimed at improving synaptic function and enhancing long-term potentiation,a process integral to epigenetic mechanisms.Lastly,we deliberate on the development of effective epigenetic agents and safe therapeutic approaches for managing Alzheimer’s disease.We suggest that addressing Alzheimer’s disease may require distinct tailored epigenetic drugs targeting different disease stages or pathways rather than relying on a single drug. 展开更多
关键词 Alzheimer’s disease DNA methylation enriched environments histone modification microRNAs non-invasive brain stimulation synaptic plasticity
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甲基化测序和转录组整合分析黄韧带肥厚的分子机制
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作者 何杨 唐步源 卢昌怀 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第5期1013-1020,共8页
背景:黄韧带肥厚是腰椎管狭窄症的最主要病因,是多个病理因素共同作用的结果,目前黄韧带肥厚的分子机制、作用通路尚不明确,缺乏有效的非手术治疗方案。目的:使用甲基化测序和转录组整合分析方法,研究黄韧带肥厚发生发展的分子机制。方... 背景:黄韧带肥厚是腰椎管狭窄症的最主要病因,是多个病理因素共同作用的结果,目前黄韧带肥厚的分子机制、作用通路尚不明确,缺乏有效的非手术治疗方案。目的:使用甲基化测序和转录组整合分析方法,研究黄韧带肥厚发生发展的分子机制。方法:收集5个正常黄韧带组织和5个肥厚黄韧带组织,采用甲基化测序记录异常甲基化位点和甲基化状态,采用转录组整合分析记录异常表达的基因,取二者交集中甲基化水平与表达水平负相关的基因。采用GO和KEGG富集分析研究差异基因表达的主要功能通路和分子功能。使用PPI互作分析筛选调控黄韧带肥厚的关键基因。结果与结论:对两组黄韧带行甲基化测序发现高甲基化位点37173个,低甲基化位点10583个,转录组整合分析发现异常表达基因720个,其中463个上调基因、257个下调基因。两者重叠基因383个,其中192个基因甲基化水平与表达水平负相关。GO功能通路分析结果显示分子功能富集到10个条目,细胞组分富集到15个条目,生物学途径富集到30个条目。KEGG通路富集分析结果显示,192个基因主要富集到PI3K-Akt信号通路、Rap1信号通路、Focal adhesion信号通路、信号通路等9条通路。PPI互作分析筛选出PPARG、EGFR、CNR1、TNF和COL11A25个基因可能是调控黄韧带肥厚的关键基因,主要通过调控组织纤维化、细胞增殖分化、炎症因子水平、胶原纤维表达水平等途径影响黄韧带肥厚的发生发展。 展开更多
关键词 黄韧带肥厚 甲基化测序 转录组整合分析 腰椎管狭窄症 DNA甲基化
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BIBR1532 inhibits proliferation and metastasis of esophageal squamous cancer cells by inducing telomere dysregulation
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作者 Qin Wang Qing-Rong Li +7 位作者 Lei Xu Zi-Chun Yuan Xiao Liu Mao-Ju Tang Man Luo Xiao-Wu Zhong Qiang Ma Xiao-Lan Guo 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2025年第1期214-225,共12页
BACKGROUND Esophageal squamous cell carcinoma(ESCC)is a malignant tumor with high morbidity and mortality,and easy to develop resistance to chemotherapeutic agents.Telomeres are DNA-protein complexes located at the te... BACKGROUND Esophageal squamous cell carcinoma(ESCC)is a malignant tumor with high morbidity and mortality,and easy to develop resistance to chemotherapeutic agents.Telomeres are DNA-protein complexes located at the termini of chro-mosomes in eukaryotic cells,which are unreplaceable in maintaining the stability and integrity of genome.Telomerase,an RNA-dependent DNA polymerase,play vital role in telomere length maintain,targeting telomerase is a promising therapeutic strategy for cancer.KYSE150 and KYSE410 cells were cultured and exposed to various concentrations of BIBR1532.Cell viability was assessed at 48 hours and 72 hours to determine the IC50 values.The effects of BIBR1532 on ESCC cell proliferation,migration,and cellular senescence were evaluated using the cell counting kit-8 assay,plate colony formation assay,scratch assay,transwell assay,andβ-galactosidase staining,respectively.Western blotting was performed to detect the expression of RESULTS The IC50 values for KYSE150 and KYSE410 cells after 48 hours of BIBR1532 exposure were 48.53μM and 39.59μM,respectively.These values decreased to 37.22μM and 22.71μM,respectively,following a longer exposure of 72 hours.BIBR1532 exhibited dose-dependent effects on KYSE150 and KYSE410 cells,including decreased hTERT expression,inhibition of proliferation and metastasis,and induction of cellular senescence.Mechanistically,BIBR1532 upregulated the expression of the DDR protein,γ-H2AX,and activated the ataxia telangiectasia and Rad3-related protein(ATR)/check point kinase 1(CHK-1)and ataxia-telangiectasia mutated gene(ATM)/CHK2 pathways.BIBR1532 downregulated the expression of telomere-binding proteins,including telomeric-repeat binding factor 1(TRF1),TRF2,protection of telomeres 1,and TIN2-interacting protein 1.In a nude mouse xenograft model,BIBR1532 significantly suppressed tumor growth,reduced hTERT expression,and increasedγ-H2AX protein levels.Hematoxylin and eosin staining of various organs,including the heart,liver,spleen,lungs,and kidneys,revealed no apparent adverse effects.CONCLUSION BIBR1532 exerts anti-cancer effects on ESCC by inducing DDR through the ATR/CHK1 and ATM/CHK2 pathways and downregulating the expression of telomere-binding proteins. 展开更多
关键词 Esophageal squamous cell carcinoma BIBR1532 Human telomerase reverse transcriptase DNA damage response Telomere-binding proteins
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针刺治疗支气管哮喘的表观遗传学机制研究进展
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作者 祁祺 魏华 李晨依 《中国中医药现代远程教育》 2025年第1期178-180,共3页
近10年,表观遗传调控作为一种新策略被引入到针刺治疗中,但针刺治疗支气管哮喘的表观遗传学机制尚不明确。文章于Web of Science数据库及知网数据库中搜集、总结大量有关针刺、支气管哮喘、表观遗传学的文献后,发现DNA甲基化、微小核糖... 近10年,表观遗传调控作为一种新策略被引入到针刺治疗中,但针刺治疗支气管哮喘的表观遗传学机制尚不明确。文章于Web of Science数据库及知网数据库中搜集、总结大量有关针刺、支气管哮喘、表观遗传学的文献后,发现DNA甲基化、微小核糖核苷酸(miRNAs)调节机制在支气管哮喘发病和针刺治疗中具有重要意义。文章探讨针刺治疗支气管哮喘的表观遗传学机制,同时揭露其研究中的空白和缺陷,为后续的机制研究和临床运用提供新启示。 展开更多
关键词 针刺疗法 支气管哮喘 表观遗传 DNA甲基化 MIRNA 综述
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耦合水文情势及鱼类繁殖的江垭水库生态调度需求研究 被引量:2
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作者 徐薇 魏秘 +3 位作者 曹俊 蔡露 高少波 朱迪 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期103-111,共9页
为了修复河流水文情势、维持河流生态系统健康,通过环境DNA采样、IHA水文指标变动分析和文献资料总结等方法,开展了江垭水库坝下水文情势及鱼类繁殖需求关系研究,提出了水库生态调度需求与建议。结果显示,2021年9月在溇水干支流综合调... 为了修复河流水文情势、维持河流生态系统健康,通过环境DNA采样、IHA水文指标变动分析和文献资料总结等方法,开展了江垭水库坝下水文情势及鱼类繁殖需求关系研究,提出了水库生态调度需求与建议。结果显示,2021年9月在溇水干支流综合调查获得鱼类55种,与20世纪90年代相比,流水性种类在干流江段显著减少了51.35%;按照生态调度优先等级评估原则,确定江垭水库生态调度的主要目标物种为产漂流性卵的银鲴(Xenocypris argentea)、银鮈(Squalidus argentatus)、贝氏䱗(Hemiculter bleekeri)和产粘沉性卵的鲤(Cyprinus carpio)、鲫(Carassius auratus);江垭建坝前后下游水文情势变化较大,发生高度改变且对鱼类洄游产卵及鱼卵发育有重要作用的水文指标包括年最大1日、3日平均流量指标、年出现高流量脉冲事件的次数和持续时间以及连续日流量上涨率。研究表明,以促进坝下不同产卵类型的鱼类繁殖为目标,生态调度需要一定的高流量脉冲次数和历时,还需要控制下游水位的日降幅,通过泄放合理的生态流量来维持下游鱼类的生物多样性。 展开更多
关键词 鱼类繁殖 环境DNA 水文情势 生态调度 江垭水库
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基于环境DNA技术的珠江中下游鱼类多样性初步研究 被引量:1
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作者 朱书礼 陈蔚涛 +4 位作者 武智 夏雨果 杨计平 李跃飞 李捷 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期120-129,共10页
通过环境DNA技术(Environmental DNA,eDNA)检测珠江中下游鱼类生物多样性,探索珠江中下鱼类多样性监测和保护的新途径。2023年2月在珠江中下游设置了桂平、藤县、封开、德庆、肇庆和九江共6个采样点,通过水样采集及过滤、eDNA提取、遗... 通过环境DNA技术(Environmental DNA,eDNA)检测珠江中下游鱼类生物多样性,探索珠江中下鱼类多样性监测和保护的新途径。2023年2月在珠江中下游设置了桂平、藤县、封开、德庆、肇庆和九江共6个采样点,通过水样采集及过滤、eDNA提取、遗传标记扩增及测序和数据库比对分析等流程检测鱼类多样性。结果表明,6个采样点共检测出30种鱼类,隶属于4目10科27属,其中土著鱼类26种,外来种4种。较已有传统调查数据新检出2种鱼类:美丽沙鳅(Botia pulchra)和齐氏罗非鱼(Oceochromis zillii)。鱼类优势种为子陵吻鰕虎鱼(Rhinogobius giurinus)、瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachellii)、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、尼罗罗非鱼(O.nilotica)、齐氏罗非鱼、南方波鱼(Rasbora steineri)和鲤(Cyprinus carpio)。根据Shannon指数和Simpson指数显示,eDNA检测九江和桂平站点的鱼类多样性最高,藤县的最低。作为一种新的检测方法,eDNA技术可用于快速检测珠江中下游鱼类的多样性及分布,在实际应用中可将eDNA技术与传统的监测方法相结合,以提供更全面的鱼类生物多样性数据信息。 展开更多
关键词 环境DNA(eDNA) 鱼类多样性 珠江中下游
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温和灸足三里穴对自然衰老大鼠肾组织p16 DNA甲基化的影响 被引量:1
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作者 刘文博 赵舒羽 +6 位作者 殷之光 杨秋红 崔云华 黄艳 焦丹丽 吴焕淦 赵琛 《上海针灸杂志》 CSCD 2024年第2期210-218,共9页
目的 观察温和灸足三里穴对自然衰老大鼠肾组织p16 DNA甲基化的调控作用及潜在机制。方法 将Sprague-Dawley(SD)大鼠随机分为12月龄组、24月龄组和艾灸组。24月龄组和艾灸组制备自然衰老模型。12月龄组和24月龄组大鼠不予治疗,待相应时... 目的 观察温和灸足三里穴对自然衰老大鼠肾组织p16 DNA甲基化的调控作用及潜在机制。方法 将Sprague-Dawley(SD)大鼠随机分为12月龄组、24月龄组和艾灸组。24月龄组和艾灸组制备自然衰老模型。12月龄组和24月龄组大鼠不予治疗,待相应时间取材;艾灸组采用温和灸足三里穴至24月龄取材。采用免疫荧光法观察3组大鼠肾组织衰老相关标志物β-半乳糖苷酶的表达。采用酶联免疫吸附法和免疫组织化学法检测3组大鼠肾组织衰老相关p16蛋白及甲基转移酶[甲基转移酶3a(DNA methyltransferase 3a,Dnmt3a)和甲基转移酶3b(DNA methyltransferase 3b,Dnmt3b)]蛋白的表达。采用定量反转录聚合酶连锁反应(quantitative real time-polymerase chain reaction,qRT-PCR)法检测3组大鼠肾组织端粒长度、肾组织衰老相关p16 mRNA及甲基转移酶(Dnmt3a和Dnmt3b) mRNA表达。采用重亚硫酸盐测序技术检测3组大鼠肾组织p16 DNA CpG岛甲基化程度。结果 与12月龄组比较,24月龄组大鼠肾组织β-半乳糖苷酶表达、端粒长度的损耗及衰老相关p16蛋白和mRNA表达水平升高(P<0.05),24月龄组大鼠肾组织Dnmt3a和Dnmt3b蛋白及mRNA表达水平降低(P<0.05)。与24月龄组比较,艾灸组大鼠肾组织β-半乳糖苷酶表达、端粒长度的损耗及肾组织衰老相关p16蛋白和mRNA表达显著降低(P<0.05),艾灸组大鼠肾组织Dnmt3a和Dnmt3b蛋白及mRNA表达显著升高(P<0.05)。结论温和灸可通过影响自然衰老大鼠肾组织衰老相关甲基转移酶的表达调控p16 DNA CpG岛整体甲基化水平,降低肾组织p16蛋白及mRNA在衰老机体肾组织的表达,延缓肾组织衰老进程。 展开更多
关键词 灸法 温和灸 艾条灸 衰老 DNA甲基化 大鼠
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HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-献血者血清学与分子生物学特征分析 被引量:1
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作者 景媛媛 范云 +3 位作者 郭燕 张文娟 段勇 冯娜 《中国输血杂志》 CAS 2024年第4期412-416,共5页
目的 了解西安地区无偿献血人群HBsAg ELISA检测结果与HBV DNA检测结果不一致的标本相关血清学标志物的分布情况。方法 收集2022年11月1日—2023年4月30日陕西省血液中心HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-(ELISA+/NAT-)标本共计71份,对其采用... 目的 了解西安地区无偿献血人群HBsAg ELISA检测结果与HBV DNA检测结果不一致的标本相关血清学标志物的分布情况。方法 收集2022年11月1日—2023年4月30日陕西省血液中心HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-(ELISA+/NAT-)标本共计71份,对其采用电化学发光法检测乙肝血清学标志物,同时复检巢式PCR扩增HBV S区和C区基因片段。结果 双ELISA+/NAT-标本(n=30)巢式PCR检测阳性率远高于单ELISA+/NAT-标本(n=41)(60%vs 24.40%,P<0.05)。前者献血者100%为初次献血者,血清抗-HBc阳性率100%,血清学模式以1、4、5此3项阳性(80%)为主;后者献血者中31.7%为重复献血者,血清抗-HBc阳性率仅为19.51%,血清学模式以单2项阳性(43.90%)和全阴(36.58%)为主。结论 单ELISA+结果存在较多假阳性,导致不必要的血液报废;而NAT-标本可能存在低水平的HBV DNA,产生漏检风险。建议针对单HBsAg ELISA+/NAT-献血者,采用多套系统多种方法追溯检测,提高献血者HBV筛查的准确度,减少不必要的血液浪费。 展开更多
关键词 乙型肝炎表面抗原 无偿献血者 巢式PCR HBV DNA
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中年男性精子DNA碎片率对体外受精-胚胎移植妊娠结局的影响 被引量:1
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作者 王平 王静 +1 位作者 陈先兵 陈曦 《解剖学报》 CAS CSCD 2024年第3期345-348,共4页
目的探讨中年男性精子DNA碎片率(DFI)与精液质量和体外受精-胚胎移植妊娠结局的关系。方法共收集180例接受常规体外受精-胚胎移植治疗且男性年龄>38岁的精液标本。根据DFI的阈值分成(<30%和≥30%)两组。主要测量指标包括:常规精... 目的探讨中年男性精子DNA碎片率(DFI)与精液质量和体外受精-胚胎移植妊娠结局的关系。方法共收集180例接受常规体外受精-胚胎移植治疗且男性年龄>38岁的精液标本。根据DFI的阈值分成(<30%和≥30%)两组。主要测量指标包括:常规精液参数、激素水平、DFI、受精率、优质胚胎率、临床妊娠率等。结果通过比较分析发现,DFI与男性卵泡刺激素(FSH)、精子活力、精子形态密切相关,且精子活力随着DFI水平的升高而下降(P<0.05);当DFI≥30%时,优质胚胎率下降(P<0.05),但两组的临床妊娠率差异无显著性(P>0.05)。结论DFI可以作为中年男性精液常规分析的重要参考指标,虽然DFI影响优质胚胎率,但与辅助生殖治疗的临床妊娠结局无关。 展开更多
关键词 精子DNA碎片率 精子活力 精子染色质扩散 形态学观察
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DNA无创产前检测及彩色多普勒超声检查在高危孕妇胎儿 染色体异常筛查中的应用价值 被引量:1
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作者 成艳 马雯 +2 位作者 权秋宁 于青 杜小云 《检验医学与临床》 CAS 2024年第2期217-220,共4页
目的探讨DNA无创产前检测(NIPT)及彩色多普勒超声(简称彩超)检查在高危孕妇胎儿染色体异常筛查中的应用价值。方法选取2020年1月至2022年12月于该院接受产前检查的5862例高危孕妇作为研究对象,均接受NIPT、彩超检查,以羊水穿刺结果或分... 目的探讨DNA无创产前检测(NIPT)及彩色多普勒超声(简称彩超)检查在高危孕妇胎儿染色体异常筛查中的应用价值。方法选取2020年1月至2022年12月于该院接受产前检查的5862例高危孕妇作为研究对象,均接受NIPT、彩超检查,以羊水穿刺结果或分娩结局作为诊断胎儿染色体异常的金标准,比较NIPT、彩超检查及二者联合检查对高危孕妇胎儿染色体异常的诊断效能。结果5862例高危孕妇中共检出167例胎儿染色体异常,检出率为2.85%。167例胎儿染色体异常中胎儿染色体数目异常161例,构成比为96.41%;胎儿染色体结构异常6例,构成比为3.59%。彩超检查共诊断出119例孕妇胎儿染色体异常,经一致性分析,彩超检查诊断胎儿染色体异常的灵敏度为0.713,特异度为0.884,准确率为87.96%,Kappa=0.215,P<0.05。NIPT共诊断出133例孕妇胎儿染色体异常,经一致性分析,NIPT诊断胎儿染色体异常的灵敏度为0.796,特异度为0.945,准确率为94.05%,Kappa=0.408,P<0.05。彩超检查联合NIPT共诊断出158例孕妇胎儿染色体异常,经一致性分析,二者联合检查诊断胎儿染色体异常的灵敏度为0.946,特异度为0.986,准确率为98.50%,Kappa=0.775,P<0.05。结论NIPT与彩超检查用于筛查高危孕妇胎儿染色体异常均具有一定价值,二者联合检查可获得更高的灵敏度、特异度和准确率,能有效降低漏诊及误诊风险。 展开更多
关键词 DNA无创产前检测 彩色多普勒超声检查 高危孕妇 胎儿染色体异常 应用价值
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血清中DNA聚合酶α在阿尔茨海默病中的表达和诊断价值分析 被引量:1
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作者 赵越 刘静 +2 位作者 张晓敏 崔雨婷 王培昌 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第1期1-5,共5页
目的探究血清中DNA聚合酶α(DNA polα)在阿尔茨海默病(AD)中的表达水平,分析其在AD中的诊断价值。方法选取2019年3月至2023年4月在首都医科大学宣武医院就诊的AD痴呆(DAT)期患者100例作为DAT组,轻度认知障碍(MCI)期患者43例作为MCI组;... 目的探究血清中DNA聚合酶α(DNA polα)在阿尔茨海默病(AD)中的表达水平,分析其在AD中的诊断价值。方法选取2019年3月至2023年4月在首都医科大学宣武医院就诊的AD痴呆(DAT)期患者100例作为DAT组,轻度认知障碍(MCI)期患者43例作为MCI组;同期,选取68例同年龄组别的健康者作为HC组。检测各组血清样本中DNA polα的表达水平,利用受试者工作特征(ROC)曲线分析DNA polα在AD中的诊断价值。结果DAT组血清DNA polα表达水平高于MCI组(P<0.05)和HC组(P<0.001),随着AD病程发展,DNA polα表达水平有递增趋势。DNA polα表达水平与简易智能精神状态检查量表(MMSE)和蒙特利尔认知评估量表(MoCA)评分均呈负相关(r=-0.1553、-0.2037,P<0.05)。DNA polα诊断DAT期的曲线下面积(AUC)为0.682,灵敏度为0.900,特异度为0.412;DNA polα诊断MCI期的AUC为0.546,灵敏度为0.977,特异度为0.250;DNA polα鉴别诊断MCI期和DAT期的AUC为0.664,灵敏度为0.780,特异度为0.535。结论DNA polα在DAT期AD患者中表达水平升高,且其表达水平与AD病程发展存在一定联系,推测DNA polα有可能是诊断AD潜在的血液生物标志物。 展开更多
关键词 DNA聚合酶α 阿尔茨海默病 生物标志物 诊断价值
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