Egfr基因启动子区的DNaseⅠ高敏感位点定位

目的用一种新方法研究表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因启动子区脱氧核糖核酸酶Ⅰ高敏感位点(DNaseⅠhypersensitive site,DHS),找出确切DNaseⅠ酶切位点,进而预测可能与DHS相结合的转录因子,探索egfr基因表达调控机制。方法本研究以宫颈癌细胞系HeLa(EGFR+)、乳腺癌细胞系MDA-MB-231(EGFR+)和阴性对照白血病细胞系K562(EGFR-)为模型,在用浓度为5kU/L、10kU/L DNaseⅠ消化细胞核中染色质后,采用连接介导PCR(ligation-mediatedPCR,LM-PCR)的方法,检测出egfr基因启动子区DHS,并进行测序。通过对测序结果进行分析,确定egfr基因启动子区DHS的具体位置。用生物信息学方法对所得DHS进行分析,预测与之结合的转录因子。结果对测序结果进行分析得到确切DNaseⅠ酶切位点。在egfr基因表达阳性的宫颈癌细胞系HeLa、乳腺癌细胞系MDA-MB-231中,DHS位于转录起始点上游300bp至500bp的启动子区内;而在egfr基因表达阴性的白血病细胞系K562中未发现DHS。运用生物信息学方法,用转录元件搜索软件(transcription element search software,TESS)对DHS进行分析,找到16个可能与egfr基因启动子区DHS序列相结合的转录因子。结论在egfr基因表达阳性的细胞系中,egfr基因启动子区存在DHS,可能是转录因子的结合区。这些实验结果为研究egfr基因启动子区空间构象、预测转录因子结合位点提供了部分实验依据。

染色质DNaseⅠ超敏感位点的定位及其转录调控功能的研究进展

DNaseⅠ超敏感位点(DNaseⅠhypersensitive sites,DHSs)是对DNaseⅠ高度敏感的活性染色质区域。全基因组DHSs的定位分析已成为准确识别染色质上基因转录调控元件的有效方法,有助于系统解析基因和基因组信息及转录调控的动态分子机制。文中就DHSs的分布、DHSs的高通量测序技术及DHSs的转录调控功能的相关性研究进展作一综述。

转录因子Gata3在Th2细胞分化过程中的作用

CD4^+辅助性T细胞根据其所分泌的细胞因子主要分为Th1、Th2、Th17和调节性T细胞(Treg)四个细胞亚群,它们对机体的免疫功能有着重要的调节作用。作为Th2细胞特异性的转录因子,Gata3能选择性地诱导幼稚性(na(?)ve)CD4^+T细胞朝着Th2方向分化,这一作用不仅体现在Gata3对IL-5和IL-13在转录水平上的调节,更表现在对CD4+T细胞染色质的重塑(chromatinremodeling)。Gata3除了在早期调控Th2细胞的分化,其对终末分化的Th2细胞的主要表型的维持也必不可少。本文主要就Gata3调节Th2细胞分化的作用和具体机制以及它自身在这一过程中所受到的调控做一综述。