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人类白细胞抗原HLA—DPA1和HLA—DPB1基因高通量测序分型的研究 被引量:11
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作者 喻琼 王大明 邓志辉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期323-327,共5页
目的建立可靠的人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)基因HLA—DPA1和HLA—DPB1同步测序分型方法,研究南方汉族人群HLA-DPA1和HLA—DPB1基因的多态性。方法根据HLA-DPA1和HLA-DPB1等位基因的全长序列,分别采用位点特异性引... 目的建立可靠的人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)基因HLA—DPA1和HLA—DPB1同步测序分型方法,研究南方汉族人群HLA-DPA1和HLA—DPB1基因的多态性。方法根据HLA-DPA1和HLA-DPB1等位基因的全长序列,分别采用位点特异性引物扩增HLA-DPA1和HLA-DPB1目的基因片段,涵盖完整的第2外显子。PCR产物经磁珠纯化,用自行设计的测序引物及优化的测序反应体系对HLA—DPA1和HLA—DPB1第2外显子进行双向测序。纯化的测序反应产物经ABI3730测序仪测序,用Assign3.5SBT软件分析结果。结果PCR扩增获得了清晰的HLA—DPA1和HLA-DPB1基因目的片段,对HLA~DPA1和HLA—DPB1基因的第2外显子进行的双向测序结果中,序列无背景信号和杂峰。在176名南方汉族健康无关个体中,共检出了4种HLA—DPA1等位基因,其频率分布依次为:DPA1*02:02(0.589)〉DPA1*01:03(0.284)〉DPA1*02:01(0.096)〉DPA1*04:01(0.031)。HLA-DPB1检出了14种等位基因,其中频率大于5%的4种等位基因为:DPB1*05:01、DPB1*02:01、DPB1*04:01和DPB1*02:02,频率介于1%~5%的7种,其余3种等位基因的频率均为1%以下。HLA-DPB1测序分型的结果与用Atria AlleleSEQR商品化测序分型试剂盒检测的结果一致。结论建立了HLA-DPA1及HLA—DPB1测序分型的方法,在群体遗传学及疾病关联研究等领域具有广泛的实用价值。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 HLA—dpa1基因 HLA—DPB1基因 测序分型
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浙江汉族人群HLA—DPA1和-DPB1基因多态性分析 被引量:6
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作者 戴卫健 朱发明 +1 位作者 严力行 赵洪灿 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期217-220,共4页
目的检测浙江地区汉族人群HLA-DPA1和HLA—DPB1等位基因及单倍型频率。方法应用PCR-直接测序分型法对100名健康、无血缘关系的浙江汉族人外周血标本进行HLA—DPA1和HLADPB1等位基因分析。结果在100份标本中检出8个HLA-DPA1等位基因和19... 目的检测浙江地区汉族人群HLA-DPA1和HLA—DPB1等位基因及单倍型频率。方法应用PCR-直接测序分型法对100名健康、无血缘关系的浙江汉族人外周血标本进行HLA—DPA1和HLADPB1等位基因分析。结果在100份标本中检出8个HLA-DPA1等位基因和19个HLA—DPB1等位基因。HLA—DPA1等位基因频率较高的依次为DPA1*020202(47.0%)、DPA1*010301(38.5%)和DPA1*020101(10.5%)。HLA-DPB1等位基因中,频率较高的依次为DPB1*0501(39.5%)、DPB1*020102(13.5%)和DPB1*040101(13.0%)。连锁分析发现共有44个HLA-DPA1-DPB1单倍型,单倍型频率最高为DPA1*020202-DPB1*0501(29.5%)。结论浙江地区汉族人群HLA~DPA1和~DPB1基因座等位基因具有丰富的多态性,2个基因座呈现连锁不平衡。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原dpa1 人类白细胞抗原DPB1 遗传多态性 基因频率 单倍型
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HLA-A、-B、-C、-DRBl和-DQB1等位基因全相合的无关供一受者对的HLA-DPA1和-DPB1基因匹配性研究
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作者 甄建新 邹红岩 +4 位作者 金士正 高素青 王大明 何柳媚 邓志辉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期697-700,共4页
目的研究HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因全相合的无关供-受者对HLA-DPA1和-DPB1基因的匹配性。方法对76对HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因10/10相合的无关供-受者样本进行HLA~DPA1和-DPB1基因测序分型,从等位基因水平统... 目的研究HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因全相合的无关供-受者对HLA-DPA1和-DPB1基因的匹配性。方法对76对HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因10/10相合的无关供-受者样本进行HLA~DPA1和-DPB1基因测序分型,从等位基因水平统计和分析HLA-DPA1和-DP通信作者:邓志辉,Emai1:zhihui-deng@sina.cn基因匹配的比例和特点。结果单个HI。A-DPA1、-DPB1基因高分辨水平完全相合的比例分别为17.1%、9.2%,完全相合的比例均较低。HI,A-DPA1等位基因半相合的比例占绝大多数(73.7%),完全不合的比例为9.2%;具有高度多态性的HLA-DPB1基因半相合的比例为57.9%,而完全不合的比例为32.9%。统计HLA-DPA1+-DPB1等位基因的匹配率,e/4相合的比例最高(51.4%),4/4相合的比例仅为5.6%,而0/4相合的比例为8.3%。结论HLA-A、-B、-C、~DRB1和-DQB1等位基因相合的无关供-受者对HLA-DPA1和-DPB1基因匹配率尚较低,HLA-DPA1和-DPB1基因匹配程度对无关供者造血干细胞移植的影响应引起临床的重视和探讨。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 无关供-受者对 HLA-dpa1 HLA-DPB1 测序分型 匹配程
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人类白细胞抗原-DPA1基因多态性与无胚胎妊娠的相关性
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作者 王振东 卢晓琳 +4 位作者 姚秀英 刘鑫丽 赵琳琳 王理 牛勃 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期161-165,共5页
目的探讨人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)-DPA1基因多态性与无胚胎妊娠的相关性。方法选取110例无胚胎妊娠病例,同时以150例非自然流产对象作为对照组(两组均为汉族),采集妊娠期外周血,通过高通量DNA技术分析HLA-DPA1基因... 目的探讨人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)-DPA1基因多态性与无胚胎妊娠的相关性。方法选取110例无胚胎妊娠病例,同时以150例非自然流产对象作为对照组(两组均为汉族),采集妊娠期外周血,通过高通量DNA技术分析HLA-DPA1基因的14个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),并通过统计学方法分析HLA-DPA1的SNP与无胚胎妊娠的相关性。同时将对照组与不同民族或种族人群基因型/等位基因频率进行比较。结果与对照组相比,有1个SNP位点rs1431403的纯合子分型(CC、TT)及纯合子突变组合(CC+TT)均显著增加了病例组无胚胎妊娠的风险(OR分别为2.93、4.15、3.58,95%CI分别为1.53~5.62、2.20~7.83、2.05~6.04,P分别为0.001、0.000、0.000),且rs1431403在不同民族或种族人群中具有不同的基因型/等位基因频率分布。结论 HLA-DPA1的基因多态位点rs1431403可能是中国汉族人群发生无胚胎妊娠的一个潜在危险因素。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 dpa1基因 单核苷酸多态性 无胚胎妊娠
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