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荷斯坦奶牛DPP6和PRKN基因的生物信息学及表达规律分析
1
作者
李瑞瑞
虎红红
+2 位作者
冯雪
杨文飞
马云
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期210-222,共13页
【目的】旨在探究前期GWAS筛选出的与荷斯坦奶牛产奶相关的二肽基肽酶样6(Dipeptidyl Peptidase⁃like 6,DPP6)和E3泛素连接酶基因(Parkin gene,PRKN)的生物学性质及表达特性,为后续验证DPP6和PRKN基因对于荷斯坦奶牛相关调控机制研究提...
【目的】旨在探究前期GWAS筛选出的与荷斯坦奶牛产奶相关的二肽基肽酶样6(Dipeptidyl Peptidase⁃like 6,DPP6)和E3泛素连接酶基因(Parkin gene,PRKN)的生物学性质及表达特性,为后续验证DPP6和PRKN基因对于荷斯坦奶牛相关调控机制研究提供基础。【方法】利用ProtParam、Phyre2、NetPhos 3.1等软件分析DPP6和PRKN的理化性质与蛋白结构,并采用实时荧光定量PCR(Real⁃Time quantitative PCR,RT⁃qPCR)检测DPP6和PRKN基因在荷斯坦奶牛的心脏、脾脏、肝脏、肺脏、肾脏、乳腺、子宫、卵巢、瘤胃、黄体10个组织中的表达规律;通过脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)诱导乳腺上皮细胞(bMECs),初步检测DPP6和PRKN基因在炎症反应中的表达模式。【结果】DPP6蛋白编码863个氨基酸,与山羊的亲缘关系最近;PRKN蛋白编码488个氨基酸,其中甘氨酸含量最多,其序列与马鹿的相似性最高,保守型较强。本研究推测2个物种的DPP6和PRKN蛋白可能具有相似的生物学功能,并且2个蛋白均属于不稳定亲水性蛋白。DPP6和PRKN基因在组织中普遍表达。其中,DPP6基因在乳腺、肺脏、脾脏以及肾脏组织中的表达量显著高于其他组织,而PRKN基因在乳腺、肾脏、瘤胃组织中显著高表达。此外,相比于空白对照组,DPP6与PRKN基因均能够在LPS诱导的bMECs中极显著表达(DPP6基因极显著下调,PRKN基因极显著上调)。【结论】DPP6与PRKN基因可能在调控荷斯坦奶牛乳房炎症过程中发挥潜在作用,为后期荷斯坦奶牛DPP6与PRKN两个基因在奶牛bMECs炎症反应相关调控机制研究提供理论依据。
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关键词
dpp6
PRKN
乳房炎症
荷斯坦奶牛
表达规律
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职称材料
腺病毒介导的DPP6过表达载体的构建及其在大鼠心肌细胞内表达的鉴定
2
作者
王娜
华乐
+5 位作者
杨甫
王珏
王志华
王琼
董梅
王川
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期453-457,共5页
目的:构建腺病毒介导的DPP6过表达载体并验证其在大鼠心肌细胞内的表达.方法:应用PCR技术扩增目的基因DPP6,经酶切、连接等反应将目的基因插入穿梭载体p Shuttle-CMV中,进而转化至含有Ad Easy质粒的大肠杆菌中,进行重组;所产生的腺病毒...
目的:构建腺病毒介导的DPP6过表达载体并验证其在大鼠心肌细胞内的表达.方法:应用PCR技术扩增目的基因DPP6,经酶切、连接等反应将目的基因插入穿梭载体p Shuttle-CMV中,进而转化至含有Ad Easy质粒的大肠杆菌中,进行重组;所产生的腺病毒载体转染在HEK-293细胞中,进行腺病毒的包装、分泌和扩增,所得病毒感染大鼠心肌细胞,进行荧光及实时定量PCR(q PCR)鉴定.结果:DPP6过表达腺病毒载体构建成功,经HEK293细胞包装、扩增后,所得病毒可成功感染初生大鼠心肌细胞,观测到腺病毒携带的绿色荧光蛋白表达,q PCR检测DPP6 mRNA表达明显升高.结论:成功构建了腺病毒介导的DPP6过表达载体,并在大鼠心肌细胞内成功表达,为进一步研究DPP6在心肌细胞内的功能奠定了基础.
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关键词
dpp6
基因
腺病毒载体
绿色荧光蛋白
心肌细胞
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职称材料
SMAD6在Aβ诱导的神经毒性病变中的表达变化
被引量:
1
3
作者
张莹洁
安娜
《中国神经免疫学和神经病学杂志》
CAS
2017年第3期183-187,共5页
目的探讨母抗Dpp小同源物6(small mothers against decapentaplegic homolog 6,SMAD6)在β淀粉样蛋白(amyloidβ,Aβ)诱导的神经毒性病变中的表达变化。方法取孕15~17d的SD大鼠的胎鼠,进行海马神经元原代培养,经不同浓度(10、15、20μmo...
目的探讨母抗Dpp小同源物6(small mothers against decapentaplegic homolog 6,SMAD6)在β淀粉样蛋白(amyloidβ,Aβ)诱导的神经毒性病变中的表达变化。方法取孕15~17d的SD大鼠的胎鼠,进行海马神经元原代培养,经不同浓度(10、15、20μmol/L)Aβ25-35毒性片段处理后,通过定量PCR技术检测SMAD6mRNA表达水平。取2月龄SD雄性大鼠12只,随机分为Aβ注射组和空白对照组,每组6只。采用双侧基底前脑注射Aβ1-40建立大鼠痴呆模型,通过免疫组化及免疫印迹检测基底前脑及海马区SMAD6蛋白表达水平。结果不同浓度Aβ25-35处理组海马神经元内SMAD6mRNA表达均较对照组减少(F=602.1,P<0.01)。免疫组化结果显示,与对照组比较,Aβ1-40注射组大鼠基底前脑区SMAD6蛋白表达减少(68103±1520比96036±1804;t=20.51,P<0.01),而海马区其表达增多(96441±1852比55039±1528;t=29.87,P<0.01);免疫印迹结果显示,与对照组比较,Aβ1-40注射组大鼠基底前脑区SMAD6蛋白表达减少(0.1042±0.0067比1.000±0.0986;t=15.69,P<0.01),而海马区其表达增多(12.5525±2.6803比1.000±0.0135;t=7.465,P<0.01)。结论 Aβ可直接下调神经元内SMAD6mRNA转录及表达,不同脑区内SMAD6蛋白表达可能受负反馈调节机制影响。
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关键词
阿尔茨海默病
母抗Dpp小同源物6
骨形态发生蛋白质
β淀粉蛋白
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职称材料
题名
荷斯坦奶牛DPP6和PRKN基因的生物信息学及表达规律分析
1
作者
李瑞瑞
虎红红
冯雪
杨文飞
马云
机构
宁夏大学动物科技学院/宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室
宁夏新澳农牧有限公司
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期210-222,共13页
基金
国家现代农业产业体系(CARS36)
宁夏回族自治区重点研发项目(2021BEF01001、2021NXZD1、2022BBF02017)。
文摘
【目的】旨在探究前期GWAS筛选出的与荷斯坦奶牛产奶相关的二肽基肽酶样6(Dipeptidyl Peptidase⁃like 6,DPP6)和E3泛素连接酶基因(Parkin gene,PRKN)的生物学性质及表达特性,为后续验证DPP6和PRKN基因对于荷斯坦奶牛相关调控机制研究提供基础。【方法】利用ProtParam、Phyre2、NetPhos 3.1等软件分析DPP6和PRKN的理化性质与蛋白结构,并采用实时荧光定量PCR(Real⁃Time quantitative PCR,RT⁃qPCR)检测DPP6和PRKN基因在荷斯坦奶牛的心脏、脾脏、肝脏、肺脏、肾脏、乳腺、子宫、卵巢、瘤胃、黄体10个组织中的表达规律;通过脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)诱导乳腺上皮细胞(bMECs),初步检测DPP6和PRKN基因在炎症反应中的表达模式。【结果】DPP6蛋白编码863个氨基酸,与山羊的亲缘关系最近;PRKN蛋白编码488个氨基酸,其中甘氨酸含量最多,其序列与马鹿的相似性最高,保守型较强。本研究推测2个物种的DPP6和PRKN蛋白可能具有相似的生物学功能,并且2个蛋白均属于不稳定亲水性蛋白。DPP6和PRKN基因在组织中普遍表达。其中,DPP6基因在乳腺、肺脏、脾脏以及肾脏组织中的表达量显著高于其他组织,而PRKN基因在乳腺、肾脏、瘤胃组织中显著高表达。此外,相比于空白对照组,DPP6与PRKN基因均能够在LPS诱导的bMECs中极显著表达(DPP6基因极显著下调,PRKN基因极显著上调)。【结论】DPP6与PRKN基因可能在调控荷斯坦奶牛乳房炎症过程中发挥潜在作用,为后期荷斯坦奶牛DPP6与PRKN两个基因在奶牛bMECs炎症反应相关调控机制研究提供理论依据。
关键词
dpp6
PRKN
乳房炎症
荷斯坦奶牛
表达规律
Keywords
dpp6
PRKN
Mammary inflammation
Holstein
Expression pattern
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
腺病毒介导的DPP6过表达载体的构建及其在大鼠心肌细胞内表达的鉴定
2
作者
王娜
华乐
杨甫
王珏
王志华
王琼
董梅
王川
机构
河北医科大学药理学教研室
河北医科大学临床医学系
河北科技大学校医院
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期453-457,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31171097)
河北省自然科学基金项目(C2014206419)
+1 种基金
教育部留学回国人员科研启动基金项目(2013-693)
河北省高等学校科学技术研究项目重点项目(ZD2015007)和自筹项目(Z2015005)
文摘
目的:构建腺病毒介导的DPP6过表达载体并验证其在大鼠心肌细胞内的表达.方法:应用PCR技术扩增目的基因DPP6,经酶切、连接等反应将目的基因插入穿梭载体p Shuttle-CMV中,进而转化至含有Ad Easy质粒的大肠杆菌中,进行重组;所产生的腺病毒载体转染在HEK-293细胞中,进行腺病毒的包装、分泌和扩增,所得病毒感染大鼠心肌细胞,进行荧光及实时定量PCR(q PCR)鉴定.结果:DPP6过表达腺病毒载体构建成功,经HEK293细胞包装、扩增后,所得病毒可成功感染初生大鼠心肌细胞,观测到腺病毒携带的绿色荧光蛋白表达,q PCR检测DPP6 mRNA表达明显升高.结论:成功构建了腺病毒介导的DPP6过表达载体,并在大鼠心肌细胞内成功表达,为进一步研究DPP6在心肌细胞内的功能奠定了基础.
关键词
dpp6
基因
腺病毒载体
绿色荧光蛋白
心肌细胞
Keywords
dpp6
gene
adenovirus vector
real-time PCR
GFP
cardiomyocytes
分类号
R33 [医药卫生—人体生理学]
R34 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
SMAD6在Aβ诱导的神经毒性病变中的表达变化
被引量:
1
3
作者
张莹洁
安娜
机构
首都医科大学附属北京安定医院
上海交通大学医学附属精神卫生中心老年科
出处
《中国神经免疫学和神经病学杂志》
CAS
2017年第3期183-187,共5页
文摘
目的探讨母抗Dpp小同源物6(small mothers against decapentaplegic homolog 6,SMAD6)在β淀粉样蛋白(amyloidβ,Aβ)诱导的神经毒性病变中的表达变化。方法取孕15~17d的SD大鼠的胎鼠,进行海马神经元原代培养,经不同浓度(10、15、20μmol/L)Aβ25-35毒性片段处理后,通过定量PCR技术检测SMAD6mRNA表达水平。取2月龄SD雄性大鼠12只,随机分为Aβ注射组和空白对照组,每组6只。采用双侧基底前脑注射Aβ1-40建立大鼠痴呆模型,通过免疫组化及免疫印迹检测基底前脑及海马区SMAD6蛋白表达水平。结果不同浓度Aβ25-35处理组海马神经元内SMAD6mRNA表达均较对照组减少(F=602.1,P<0.01)。免疫组化结果显示,与对照组比较,Aβ1-40注射组大鼠基底前脑区SMAD6蛋白表达减少(68103±1520比96036±1804;t=20.51,P<0.01),而海马区其表达增多(96441±1852比55039±1528;t=29.87,P<0.01);免疫印迹结果显示,与对照组比较,Aβ1-40注射组大鼠基底前脑区SMAD6蛋白表达减少(0.1042±0.0067比1.000±0.0986;t=15.69,P<0.01),而海马区其表达增多(12.5525±2.6803比1.000±0.0135;t=7.465,P<0.01)。结论 Aβ可直接下调神经元内SMAD6mRNA转录及表达,不同脑区内SMAD6蛋白表达可能受负反馈调节机制影响。
关键词
阿尔茨海默病
母抗Dpp小同源物6
骨形态发生蛋白质
β淀粉蛋白
Keywords
Alzheimer’s disease
small mothers against decapentaplegic homolog 6
bone morphogenetic proteins
amyloid beta protein
分类号
R749.1 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
荷斯坦奶牛DPP6和PRKN基因的生物信息学及表达规律分析
李瑞瑞
虎红红
冯雪
杨文飞
马云
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
腺病毒介导的DPP6过表达载体的构建及其在大鼠心肌细胞内表达的鉴定
王娜
华乐
杨甫
王珏
王志华
王琼
董梅
王川
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
下载PDF
职称材料
3
SMAD6在Aβ诱导的神经毒性病变中的表达变化
张莹洁
安娜
《中国神经免疫学和神经病学杂志》
CAS
2017
1
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职称材料
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