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CoMFA网格点的生成及选取对结果影响的研究
被引量:
2
1
作者
朱杰
张万年
+3 位作者
周有骏
季海涛
刘晓玲
朱驹
《中国药学杂志》
EI
CAS
CSCD
北大核心
1999年第6期417-420,共4页
目的:验证网格点位置及数目变化会对CoMFA结果产生较大影响的想法。方法:采用三种不同步长对常规CoMFA生成的region作系统的平移研究。结果:网格点位置变化对CoMFA结果产生极大的影响,超过任何其它可调因素;...
目的:验证网格点位置及数目变化会对CoMFA结果产生较大影响的想法。方法:采用三种不同步长对常规CoMFA生成的region作系统的平移研究。结果:网格点位置变化对CoMFA结果产生极大的影响,超过任何其它可调因素;而网格点数目的增多仅能减少格点平移对结果造成的波动,增加了计算时间却未必会提高结果。在合适的范围内增大σmin可在稳定结果的同时极大的提高PLS分析速度。结论:常规CoMFA操作存在分子力场的模拟具有随机性的缺陷,实际工作中应选取合适的σmin值对所研究的化合物进行CoMFA的格点系统平移操作,以获得更好且较为稳定的结果。
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关键词
3D-QSAR
COMFA
喜树碱
抗癌药
网格点
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职称材料
拟除虫菊酯类农药结构─急性毒性的三维定量构效关系研究
被引量:
3
2
作者
张子丰
董德建
+3 位作者
胡忠林
宋桂茹
刘兴泉
姜言训
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1999年第2期40-42,46,共4页
用比较分子力场分析(CoMFA)研究了拟除虫菊酯类农药的结构与急性毒性LD50(大鼠,口服)的关系,考察了网格结构和探针原子对结果的影响。得到模型的R2为0.99,标准偏差为0.08。说明,立体效应和静电作用场是描述...
用比较分子力场分析(CoMFA)研究了拟除虫菊酯类农药的结构与急性毒性LD50(大鼠,口服)的关系,考察了网格结构和探针原子对结果的影响。得到模型的R2为0.99,标准偏差为0.08。说明,立体效应和静电作用场是描述拟除虫菊酯类农药急性毒性和进行结构活性关系研究的重要结构参数,建立的三维定量构效关系模型可以对该类新化合物的LD50进行预测。
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关键词
三维
定量构效关系
拟除虫菊酯
农药
结构
毒性
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职称材料
选择性5-羟色胺再摄取抑制剂3-苯基-1-茚胺类似物的三维定量构效关系研究
被引量:
2
3
作者
卢律
邓萍
李勤耕
《中国药业》
CAS
2007年第5期9-11,共3页
目的建立可以提示高活性的选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRIs)3-苯基-1-茚胺类化合物分子结构信息的三维定量构效关系模型,研究结构与活性间的关系,为进一步提高药物的选择性、指导新化合物的设计提供理论依据。方法通过确定34个茚胺类...
目的建立可以提示高活性的选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRIs)3-苯基-1-茚胺类化合物分子结构信息的三维定量构效关系模型,研究结构与活性间的关系,为进一步提高药物的选择性、指导新化合物的设计提供理论依据。方法通过确定34个茚胺类化合物分子的药效构象,与模板分子进行分子叠加,利用比较分子力场分析方法(CoMFA),建立了一个选择性SSRIs的三维定量构效模型。结果该模型的交叉验证相关系数R2CV=0.660,非交叉验证相关系数R2=0.976,标准偏差SEE=0.196,F=181.916。用此模型预测了4个SSRIs的活性,结果与试验值相符。结论该模型解释了已有的构效关系,且有较高的预测能力,系数等势图映射的受体结合部位的性质对进一步提高该类药物活性的设计具有一定的指导意义。
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关键词
药物化学
三维定量构效关系
比较分子力场分析方法
选择性5-HT再摄取抑制剂
茚胺
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职称材料
题名
CoMFA网格点的生成及选取对结果影响的研究
被引量:
2
1
作者
朱杰
张万年
周有骏
季海涛
刘晓玲
朱驹
机构
上海第二军医大学药学院药化教研室
出处
《中国药学杂志》
EI
CAS
CSCD
北大核心
1999年第6期417-420,共4页
文摘
目的:验证网格点位置及数目变化会对CoMFA结果产生较大影响的想法。方法:采用三种不同步长对常规CoMFA生成的region作系统的平移研究。结果:网格点位置变化对CoMFA结果产生极大的影响,超过任何其它可调因素;而网格点数目的增多仅能减少格点平移对结果造成的波动,增加了计算时间却未必会提高结果。在合适的范围内增大σmin可在稳定结果的同时极大的提高PLS分析速度。结论:常规CoMFA操作存在分子力场的模拟具有随机性的缺陷,实际工作中应选取合适的σmin值对所研究的化合物进行CoMFA的格点系统平移操作,以获得更好且较为稳定的结果。
关键词
3D-QSAR
COMFA
喜树碱
抗癌药
网格点
Keywords
dqsar
,CoMFA,camptothecin,antineoplastic
分类号
R979.1 [医药卫生—药品]
R914 [医药卫生—药物化学]
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职称材料
题名
拟除虫菊酯类农药结构─急性毒性的三维定量构效关系研究
被引量:
3
2
作者
张子丰
董德建
胡忠林
宋桂茹
刘兴泉
姜言训
机构
黑龙江省农科院
吉林农业大学
山东省农资公司烟台分公司
出处
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1999年第2期40-42,46,共4页
文摘
用比较分子力场分析(CoMFA)研究了拟除虫菊酯类农药的结构与急性毒性LD50(大鼠,口服)的关系,考察了网格结构和探针原子对结果的影响。得到模型的R2为0.99,标准偏差为0.08。说明,立体效应和静电作用场是描述拟除虫菊酯类农药急性毒性和进行结构活性关系研究的重要结构参数,建立的三维定量构效关系模型可以对该类新化合物的LD50进行预测。
关键词
三维
定量构效关系
拟除虫菊酯
农药
结构
毒性
Keywords
dqsar
CoMFA
pyrethroid
分类号
TQ453.292 [化学工程—农药化工]
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职称材料
题名
选择性5-羟色胺再摄取抑制剂3-苯基-1-茚胺类似物的三维定量构效关系研究
被引量:
2
3
作者
卢律
邓萍
李勤耕
机构
重庆医科大学药学院
出处
《中国药业》
CAS
2007年第5期9-11,共3页
文摘
目的建立可以提示高活性的选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRIs)3-苯基-1-茚胺类化合物分子结构信息的三维定量构效关系模型,研究结构与活性间的关系,为进一步提高药物的选择性、指导新化合物的设计提供理论依据。方法通过确定34个茚胺类化合物分子的药效构象,与模板分子进行分子叠加,利用比较分子力场分析方法(CoMFA),建立了一个选择性SSRIs的三维定量构效模型。结果该模型的交叉验证相关系数R2CV=0.660,非交叉验证相关系数R2=0.976,标准偏差SEE=0.196,F=181.916。用此模型预测了4个SSRIs的活性,结果与试验值相符。结论该模型解释了已有的构效关系,且有较高的预测能力,系数等势图映射的受体结合部位的性质对进一步提高该类药物活性的设计具有一定的指导意义。
关键词
药物化学
三维定量构效关系
比较分子力场分析方法
选择性5-HT再摄取抑制剂
茚胺
Keywords
medicinal chemistry
3 -
dqsar
CoMFA
SSRIs
indan amines
分类号
R914.2 [医药卫生—药物化学]
R971.43 [医药卫生—药品]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CoMFA网格点的生成及选取对结果影响的研究
朱杰
张万年
周有骏
季海涛
刘晓玲
朱驹
《中国药学杂志》
EI
CAS
CSCD
北大核心
1999
2
下载PDF
职称材料
2
拟除虫菊酯类农药结构─急性毒性的三维定量构效关系研究
张子丰
董德建
胡忠林
宋桂茹
刘兴泉
姜言训
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1999
3
下载PDF
职称材料
3
选择性5-羟色胺再摄取抑制剂3-苯基-1-茚胺类似物的三维定量构效关系研究
卢律
邓萍
李勤耕
《中国药业》
CAS
2007
2
下载PDF
职称材料
已选择
0
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