CoMFA网格点的生成及选取对结果影响的研究

目的：验证网格点位置及数目变化会对ＣｏＭＦＡ结果产生较大影响的想法。方法：采用三种不同步长对常规ＣｏＭＦＡ生成的ｒｅｇｉｏｎ作系统的平移研究。结果：网格点位置变化对ＣｏＭＦＡ结果产生极大的影响，超过任何其它可调因素；而网格点数目的增多仅能减少格点平移对结果造成的波动，增加了计算时间却未必会提高结果。在合适的范围内增大σｍｉｎ可在稳定结果的同时极大的提高ＰＬＳ分析速度。结论：常规ＣｏＭＦＡ操作存在分子力场的模拟具有随机性的缺陷，实际工作中应选取合适的σｍｉｎ值对所研究的化合物进行ＣｏＭＦＡ的格点系统平移操作，以获得更好且较为稳定的结果。