dRNA-seq原理及其在原核生物转录组学研究中的应用

第二代测序技术不仅推进了基因组学的研究,而且也广泛应用到转录组学的研究中。原核生物转录组学的研究方法主要有Tiling芯片和RNA-seq,后者因其较高的覆盖率和分辨率以及越来越低廉的成本而逐渐被更多的研究单位采用。根据对mRNA富集方法或rRNA去除方法的不同,目前RNA-seq方法主要有6种,其中dRNA-seq由于采用了5′单磷酸依赖的外切酶,可以特异性地降解加工过的转录本,从而使初始转录本得到富集,已被广泛应用到原核生物转录起始位点、小的调控RNA、启动子及操纵子等研究中。文章对dRNA-seq的原理、技术流程及其在原核生物转录组学研究中的应用进行了综述,并对这一研究方法在现阶段应用的优势和局限性进行了讨论,也进一步对该方法在未来的发展和应用进行了展望,期望为国内相关领域研究人员提供参考。

不同改性方式对控释碳源材料脱氮性能的影响

以玉米淀粉(S)为碳源,聚乙烯醇(P)为骨架载体,根据是否用硼酸(B)和硫酸钠(N)做改性处理,制备了GSP、GSP-N、GSP-B和GSP-BN 4种控释碳源材料,研究N、B和BN 3种改性方式对碳源材料脱氮性能的影响。在添加4种碳源的静态实验中,硝酸盐氮去除率均在96.1%以上。碳源材料的改性对硝酸盐氮的降解情况影响不明显,但对脱氮过程中TOC、亚硝酸盐氮、氨氮和TN浓度的变化有不同程度的影响。以TOC、亚硝酸盐氮、氨氮和TN为指标,N、BN和B 3种改性方式综合效益指数分别为5.62、4.6和1.92,硫酸钠(N)改性处理对提高控释碳源材料整体性能具有最佳效果。