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Kir2ds4基因RNAi慢病毒载体的构建与鉴定 被引量:5
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作者 窦立萍 达万明 +7 位作者 王畅 康慧媛 赵瑜 孙敬芬 靳海杰 王全顺 高春记 于力 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2008年第3期663-666,共4页
本研究旨在构建kir2ds4基因RNAi慢病毒载体。针对已经筛选确定的kir2ds4基因RNAi有效靶序列,合成靶序列的OligoDNA,退火形成双链DNA,与经HpaI和XhoI酶切后的pSicoR-GFP载体[含U6启动子和绿色荧光蛋白(GFP)]连接产生LV-shkir2ds4慢病毒载... 本研究旨在构建kir2ds4基因RNAi慢病毒载体。针对已经筛选确定的kir2ds4基因RNAi有效靶序列,合成靶序列的OligoDNA,退火形成双链DNA,与经HpaI和XhoI酶切后的pSicoR-GFP载体[含U6启动子和绿色荧光蛋白(GFP)]连接产生LV-shkir2ds4慢病毒载体,应用PCR筛选阳性克隆并进行测序鉴定。用LV-shkir2ds4,包装系统质粒共转染包装细胞293T细胞,产生慢病毒颗粒,以293T细胞GFP蛋白的表达水平测定病毒滴度。结果表明,PCR和测序结果证实成功地构建了kir2ds4shRNA的慢病毒载体LV-shkir2ds4。293T细胞测定病毒滴度为6×108TU/ml。结论:成功地构建了人kir2ds4基因RNAi慢病毒载体。 展开更多
关键词 rna干扰kir2ds4基因 慢病毒载体
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白桦环阿齐醇合成酶(CAS)基因与达玛烯二醇合成酶(DS)基因的双基因RNA干扰载体构建 被引量:3
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作者 梁甜 马泓思 +2 位作者 尹静 詹亚光 张梦岩 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期355-362,共8页
环阿齐醇合成酶(Cycloartenol synthase,CAS)和达玛烯二醇合成酶(Dammarenediol synthase,DS)为白桦三萜合成过程分支途径关键酶基因,对CAS和DS基因的抑制或沉默将有利于三萜前体-2,3氧化角鲨烯向目标产物白桦脂醇和齐墩果酸合成。利用... 环阿齐醇合成酶(Cycloartenol synthase,CAS)和达玛烯二醇合成酶(Dammarenediol synthase,DS)为白桦三萜合成过程分支途径关键酶基因,对CAS和DS基因的抑制或沉默将有利于三萜前体-2,3氧化角鲨烯向目标产物白桦脂醇和齐墩果酸合成。利用同源序列PCR方法及pRNAi-GG新型载体,进行DS单基因RNAi及DS与CAS双基因RNAi载体的构建。结果显示,分别克隆获得CAS和DS c DNA序列长度为300和509 bp,Blast同源序列比对与已知日本白桦BPX1和OSCBPD相似度为100%和92%。依据基因RNAi引物设计及pRNAi-GG使用原则,分别将CAS、DS的正向片段和反向片段有序地连接到pRNAi-GG载体PDK内含子两侧,并转化大肠杆菌Trans1-T1中,经PCR及克隆测序验证,获得白桦DS单基因和CAS、DS双基因干扰载体,并通过三亲杂交方法分别获得含有两个RNAi载体的工程农杆菌菌株。该研究为进一步通过基因工程手段阻断白桦三萜分支途径及促进前体物质向目标产物白桦酯醇和齐墩果酸方向合成奠定了基础。 展开更多
关键词 白桦 三萜 rna干扰载体 环阿齐醇合成酶(CAS) 达玛烯二醇合成酶(ds)
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Primer/Probe Optimization of RTq-PCR for Identification of Double-stranded (ds) RNA in Rhizoctonia solani
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作者 Mary S. Chey Ashlee M. Long +1 位作者 Seema Bharathan Narayanaswamy Bharathan 《Journal of Life Sciences》 2015年第11期535-540,共6页
Rhizoctonia solani is a soil-borne pathogenic fungus with several distinct isolates that have been classified based on their anastomosis groups (AG's). Many isolates of these fungi contain double-stranded viral RNA... Rhizoctonia solani is a soil-borne pathogenic fungus with several distinct isolates that have been classified based on their anastomosis groups (AG's). Many isolates of these fungi contain double-stranded viral RNA (dsRNA) that are cytoplasmic and viral in origin. Research in our laboratory has studied the epidemiology and molecular biology of viral RNA in R. solani, making it a useful biological model in the development of protocols for the rapid identification of biological agents. In the present study the dsRNA from the isolate EGR-4 which is characteristically large at 3.301 Kb was purified. Attempts to clone middle (M)-size dsRNA fragments from R, solani have been very difficult primarily due to artifacts that co-purify including large (L)-size dsRNA in the fungus. Various MgC12 concentrations were tested to optimize full length dsRNA PCR product. Magnesium is required for DNA polymerase, and EGR-4 requires a specific concentration; thus, several MgC1z concentrations were tested. The dsRNA was analyzed by gel electrophoresis. The gel-purified, nuclease-treated dsRNA was reverse transcribed into cDNA and ligated into the p-jet cloning vector and transformed using E. coli. All such clones were sequenced and forward and reverse primers were generated using BLAST sequence via Biosearch Technology. The plasmids were purified from transformed cultures and amplified using real-time PCR (RTqPCR) with the primers (reverse CCACCGGAAGAGGGAAATCC, forward AGCGCTGACCTTGCTATCGA ATC) and probe (5' Fam-AGTGCCGATCAGCCCTCCACCG-BHQ 1 3'). The ideal primer/probe concentration was determined through optimization by comparing the lowest threshold concentration (Ct) values using the plasmid cDNA as a template. 展开更多
关键词 Life science Rhizoctoniasolani double-stranded ds rna cryptic mycoviruses phylogenetic analysis q-PCR.
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RNA农药的研究现状和发展前景 被引量:6
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作者 关梅 晁子健 +1 位作者 闫硕 沈杰 《现代农药》 CAS 2023年第2期11-18,共8页
RNA农药被誉为第三次农药革命,在植物病虫害治理方面展现出巨大潜力。近年来,植物基因工程和基因干扰(RNAi)技术在RNA农药的研发中起到了关键作用。RNA农药的研发策略主要分为4种:寄主诱导的基因沉默策略(HIGS);病毒等微生物诱导的基因... RNA农药被誉为第三次农药革命,在植物病虫害治理方面展现出巨大潜力。近年来,植物基因工程和基因干扰(RNAi)技术在RNA农药的研发中起到了关键作用。RNA农药的研发策略主要分为4种:寄主诱导的基因沉默策略(HIGS);病毒等微生物诱导的基因沉默策略(VIGS);喷雾诱导的基因沉默策略(SIGS);纳米载体递送的基因沉默策略(NDGS)。目前,RNA农药领域的研究大多集中在基础理论,而开发及应用能力相对较弱。鉴于此,本文总结了以RNAi为核心的病虫害防治技术的研究现状,介绍了基于RNAi技术防治病虫害的应用实例,阐明了叶绿体转基因技术及纳米递送平台的优势,并对未来开发低成本、安全和高效的RNAi产品做出了展望,以期为RNA农药的研究及商业化生产提供参考。 展开更多
关键词 ds rna rnaI 病虫害 纳米载体 转基因
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实时荧光定量RT-PCR检测白血病细胞WT1 mRNA方法的建立 被引量:1
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作者 沈红强 汤永民 +4 位作者 杨世隆 宋华 石淑文 徐卫群 钱伯芹 《实用肿瘤杂志》 CAS 北大核心 2003年第5期371-374,共4页
目的 建立实时荧光定量 RT-PCR检测白血病细胞 WT1m RNA的方法。方法 在 PCR反应体系中加入了一条与靶基因序列互补的寡核苷酸双荧光标记探针 (5′端为荧光报告基团 ,3′端为荧光淬灭基团 ) ,建立实时荧光定量 RT-PCR检测白血病细胞 W... 目的 建立实时荧光定量 RT-PCR检测白血病细胞 WT1m RNA的方法。方法 在 PCR反应体系中加入了一条与靶基因序列互补的寡核苷酸双荧光标记探针 (5′端为荧光报告基团 ,3′端为荧光淬灭基团 ) ,建立实时荧光定量 RT-PCR检测白血病细胞 WT1m RNA的方法 ,并测试其特异性及敏感性。结果 所建立的实时荧光定量 RT-PCR检测 WT1m RNA的方法具有很好的准确性 ,检测 WT1m RNA的灵敏度达 10 - 4。方法的变异系数为1.93 % ,稳定性较好。循环阈值与 PCR体系中起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系 (斜率为 -3 .5,线性相关系数 r=0 .997) ,可对 WT1m RNA的表达进行准确定量分析。结论 实时荧光定量 RT-PCR检测白血病细胞WT1m RNA的方法具有很好的特异性和敏感性 ,且操作简便、安全。 展开更多
关键词 实时荧光定量RT-PCR 检测 白血病 癌基因 Wilms肿瘤基因 基因表达
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双链RNA检测对白血病临床价值的探讨
6
作者 韩安平 哈森 +2 位作者 王建秀 牛瑞兰 寇志芬 《白血病》 1997年第2期82-84,共3页
采用计算双链RNA(ds-RNA)过量值的方法,对白血病、营养性贫血、非血液病、健康人分组进行了观察比较,发现白血病组与非白血病组有显著性差异,且随着病情的缓解,细胞内ds-RNA的含量下降。提示:ds-RNA的监测... 采用计算双链RNA(ds-RNA)过量值的方法,对白血病、营养性贫血、非血液病、健康人分组进行了观察比较,发现白血病组与非白血病组有显著性差异,且随着病情的缓解,细胞内ds-RNA的含量下降。提示:ds-RNA的监测对白血病的诊断及复发的早期发现有一定的临床价值。 展开更多
关键词 双链rna 白血病 诊断
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CP基因3'端短片段介导的对马铃薯Y病毒的抗性 被引量:19
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作者 竺晓平 朱常香 +3 位作者 宋云枝 温孚江 刘红梅 李向东 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1153-1158,共6页
目的探明马铃薯Y病毒脉坏死株系(PVYN)CP基因3′端序列短片段的不同结构转基因诱导转基因植物产生RNA介导抗性的有效性。方法以PVYN的CP基因cDNA3′端202bp片段构建非翻译的正向重复和反向重复结构的植物表达载体转化烟草。结果攻毒试... 目的探明马铃薯Y病毒脉坏死株系(PVYN)CP基因3′端序列短片段的不同结构转基因诱导转基因植物产生RNA介导抗性的有效性。方法以PVYN的CP基因cDNA3′端202bp片段构建非翻译的正向重复和反向重复结构的植物表达载体转化烟草。结果攻毒试验表明前者没有一例转基因植株表现为抗病,而转化反向重复结构的转基因植株82.8%表现近似免疫的高度抗病型,Southern印迹杂交证明目的基因已整合到烟草基因组,Northern印迹杂交结果显示反向重复结构转基因植物的抗病性与RNA的表达量呈现负相关。结论抗病性是RNA介导的病毒抗性。3′端短片段诱导产生的转基因抗病株比例比5′端短片段诱导产生的高。 展开更多
关键词 马铃薯Y病毒 rna介导的病毒抗性 dsrna rna沉默
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家蚕质多角体病毒片段IV的全序列测定
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作者 林伟 杨文利 +4 位作者 徐安龙 梁玉尧 陈森雄 戴伟君 张景强 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期41-44,共4页
在随机引物建库的基础上 ,通过交叉设计引物及加单链DNA接头 ,应用RT PCR技术克隆了家蚕质多角体病毒dsRNA片段Ⅳ的全长cDNA ,并测定了它的全序列。该片段长 3,2 6 2bp ,含有一个完整的开放读码框 ,编码一个长 1 ,0 5 8氨基酸的成熟多... 在随机引物建库的基础上 ,通过交叉设计引物及加单链DNA接头 ,应用RT PCR技术克隆了家蚕质多角体病毒dsRNA片段Ⅳ的全长cDNA ,并测定了它的全序列。该片段长 3,2 6 2bp ,含有一个完整的开放读码框 ,编码一个长 1 ,0 5 8氨基酸的成熟多肽。序列分析表明 ,该片段与日本BmCPV片段Ⅳ的核苷酸序列同源性为 89% ,氨基酸序列同源性为 95 %。 展开更多
关键词 家蚕质多角体病毒 BmCPV 双链rna RT-PCR 序列测定
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RR基因沉默对WSSV病毒复制的影响
9
作者 陈朝阳 史鑫娜 +1 位作者 郑丽燕 吴文林 《泉州师范学院学报》 2014年第2期17-19,共3页
对虾白斑综合症病毒(WSSV)编码与核酸合成代谢相关的核糖核苷酸还原酶(Ribonucleotide Reductases,RR),与病毒DNA的复制有关.利用克隆技术将RR基因克隆到L4440载体,构建体内合成dsRNA的大肠杆菌HT115工程菌.诱导该工程菌合成了RR基因的... 对虾白斑综合症病毒(WSSV)编码与核酸合成代谢相关的核糖核苷酸还原酶(Ribonucleotide Reductases,RR),与病毒DNA的复制有关.利用克隆技术将RR基因克隆到L4440载体,构建体内合成dsRNA的大肠杆菌HT115工程菌.诱导该工程菌合成了RR基因的特异双链RNA(RR-dsRNA)和非特异双链RNA(gfp-dsRNA),分别与WSSV混合共注射凡纳滨对虾,在感染72h后用病毒检测试剂盒提取DNA模板用于荧光定量PCR分析,结果显示RR-dsRNA能有效抑制WSSV病毒粒子的增值. 展开更多
关键词 RR基因 双链rna WSSV
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Equally Knocking on the Door of Medical Breakthroughs: Safety and Efficacy of a New Anti-Cancer Drug Pamica (PICNH<sub>2</sub>Ca) for Late Stage Cancer Patients
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作者 Haixiang Lin Fang Liu 《Journal of Biosciences and Medicines》 2017年第2期49-54,共6页
The composition of Pamica (PICNH2Ca2) is dsRNA polyI:C, non-biotics amino compounds and CaCl2. It is the second generation noncytotoxic product of PICKCa (PIKA) adjuvant which was found effective in phase II clinical ... The composition of Pamica (PICNH2Ca2) is dsRNA polyI:C, non-biotics amino compounds and CaCl2. It is the second generation noncytotoxic product of PICKCa (PIKA) adjuvant which was found effective in phase II clinical trial for PICKCa rabies vaccine and phase I trial for PICKCa hepatitis B vaccine in Singapore. With their knowledge and consent, cancer patients, regardless of their tumor types or performance status (ECOG above 5 or ECOG > 20), who were unresponsive to standard treatment, were treated free of charge with Pamica by injection or nasal spray. The primary results indicated that Pamica had no side effect except for a few cases of local pain in the site of injection and appeared to markedly improve cancer patients’ appetite, physical strength, quality of life and extended patients’ life for months and counting. These preliminary findings underlined promise of this potentially life-saving drug. In the hope of cooperating with the proper authorities, companies, and hospitals to benefit patients at the earliest opportunity, we share our findings in this paper. 展开更多
关键词 CANCER IMMUNOTHERAPY ds rna TLR3 Terminal CANCER ADJUVANT PICKCa PIKA Pamica
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RNAi在植物寄生线虫中的研究及应用 被引量:5
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作者 解啸 成飞雪 +3 位作者 程菊娥 宋志强 刘勇 张德咏 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1087-1091,共5页
植物寄生线虫寄生于植物体内,引起植物病害,危害寄主植物,其危害仅次于真菌病害,每年都会对全世界主要农作物造成严重损失。由于传统的防治植物寄生线虫策略的诸多局限性,近年来,随着RNAi技术日趋成熟,越来越多的研究者开始着手于运用... 植物寄生线虫寄生于植物体内,引起植物病害,危害寄主植物,其危害仅次于真菌病害,每年都会对全世界主要农作物造成严重损失。由于传统的防治植物寄生线虫策略的诸多局限性,近年来,随着RNAi技术日趋成熟,越来越多的研究者开始着手于运用该项技术来防治植物寄生线虫。本文主要介绍了RNAi在对线虫生长繁殖,侵染及运动起作用的基因的功能的研究,对培育转抗线虫基因作物的中应用及参与互作的植物基因沉默在抑制线虫方面的应用及研究进展。 展开更多
关键词 植物寄生线虫 rnaI ds rna 基因功能 转基因 VIGS
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