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内蒙古锡林浩特地区嗜盐古菌多样性的研究 被引量:23
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作者 潘海莲 周成 +2 位作者 王红蕾 薛燕芬 马延和 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期1-6,共6页
从内蒙古锡林浩特地区3个不同的盐湖中共分离到165株古菌,通过ARDRA分析后得到不同的类群,从各个类群中随机选取1—2个代表菌株进行16S rDNA序列测定和系统发育的分析。结果表明分离的菌株分布在Halorubrum,Natronococcus,Natronoru... 从内蒙古锡林浩特地区3个不同的盐湖中共分离到165株古菌,通过ARDRA分析后得到不同的类群,从各个类群中随机选取1—2个代表菌株进行16S rDNA序列测定和系统发育的分析。结果表明分离的菌株分布在Halorubrum,Natronococcus,Natronorubrum,Haloterrigena,Halorhabdus,Halobiforma,Haloarcula,Haloferax8个属和另外两个分支中,表现了锡林浩特地区嗜盐古菌的多样性。部分菌株的16S rDNA序列同源性低于97%,可能是潜在的新属或新种,代表了该地区嗜盐古菌的独特类型。 展开更多
关键词 盐湖 嗜盐古菌 ARDRA 16S RDNA
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新疆两盐湖可培养嗜盐古菌多样性研究 被引量:32
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作者 崔恒林 杨勇 +2 位作者 迪丽拜尔.托乎提 周培瑾 刘双江 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期171-176,共6页
从新疆地区艾比盐湖和艾丁盐湖卤水及泥土样品中分离到86株嗜盐古菌。16S rRNA基因序列分析结果表明,分离自艾比湖的嗜盐古菌分别属于Haloarcula、Halobacterium、Halorubrum、Haloterrigena、Natrinema和Natronorubrum6个属的11个分类... 从新疆地区艾比盐湖和艾丁盐湖卤水及泥土样品中分离到86株嗜盐古菌。16S rRNA基因序列分析结果表明,分离自艾比湖的嗜盐古菌分别属于Haloarcula、Halobacterium、Halorubrum、Haloterrigena、Natrinema和Natronorubrum6个属的11个分类单元,而分离自艾丁湖的嗜盐古菌分别属于Haloarcula、Halobiforma、Halorubrum、Haloterrigena、Natrialba、Natrinema6个属的8个分类单元,这一结果表明艾比湖可培养嗜盐古菌生物多样性稍高于艾丁湖。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明代表菌株ABH15应为Natronorubrum属的中性嗜盐古菌新种,代表菌株ABH07、ABH12、ABH17、ABH19、ABH51和AD30可能是Halobacterium、Halorubrum、Haloterrigena、Haloarcula的新成员。 展开更多
关键词 嗜盐古菌 生物多样性 艾比盐湖 艾丁盐湖
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新疆阿牙克库木湖可培养嗜盐古菌的种群结构 被引量:11
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作者 许学伟 吴敏 +1 位作者 吴月红 张会斌 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期3119-3123,共5页
从新疆南部的阿牙克库木湖采集了19个水样和15个土样,分离培养嗜盐微生物。采用PCR方法获取其中62株嗜盐古菌16S rRNA基因序列。序列分析结果表明,分离到的菌株分属6个属,占已报道嗜盐古菌属总数的27%,其中以Halorubrum和Natrinema属的... 从新疆南部的阿牙克库木湖采集了19个水样和15个土样,分离培养嗜盐微生物。采用PCR方法获取其中62株嗜盐古菌16S rRNA基因序列。序列分析结果表明,分离到的菌株分属6个属,占已报道嗜盐古菌属总数的27%,其中以Halorubrum和Natrinema属的菌株为优势菌株。通过Shannon多样性指数分析发现,阿牙克库木湖冬春两季嗜盐古菌多样性差异不明显。研究还发现4个嗜盐古菌新物种,表明阿牙克库木湖蕴藏着具有地域特点的嗜盐古菌资源。 展开更多
关键词 阿牙克库木湖 嗜盐古菌 多样性
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嗜盐古生菌AJ6的分离及系统发育分析 被引量:6
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作者 徐晓红 吴敏 +2 位作者 曹轶 吴月红 张婷 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期83-88,共6页
从新疆阿尔金山国家自然保护区阿牙克库木湖分离纯化得到嗜盐古生菌AJ6,革兰氏染色呈阴性、杆状、少数球形、菌体大小为0.2~0.6μm×1.6~4.2μm,最适NaCl和Mg2+质量浓度分别为15%和0.6%,在pH为6.0~7.0条件下生长良好.在此基础上... 从新疆阿尔金山国家自然保护区阿牙克库木湖分离纯化得到嗜盐古生菌AJ6,革兰氏染色呈阴性、杆状、少数球形、菌体大小为0.2~0.6μm×1.6~4.2μm,最适NaCl和Mg2+质量浓度分别为15%和0.6%,在pH为6.0~7.0条件下生长良好.在此基础上,进一步通过PCR方法扩增了菌株AJ6的16SrRNA基因(16SrDNA),测定了该基因的核苷酸序列,并利用"Clustalw"软件和"PHYLIP"软件包分析16SrDNA序列,对其进行同源性比较和系统发育学分析,建立了嗜盐古细菌的系统发育树.结果表明菌株AJ6与Nnm.pallidum、Nnm.pellirubrum和Nnm.versiforme分在同一类群中,16SrDNA序列同源性分别为97.47%,96.44%和98.12%,菌株AJ6是Natrinema属中的一个新成员,命名为Natrinemaaltuensis.菌株AJ6的16SrDNA序列已登陆到GenBank,其序列号为AY277584. 展开更多
关键词 新疆阿尔金山盐湖地区 嗜盐古生菌 16S RDNA 系统发育
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新疆艾比湖和伊吾湖可培养嗜盐古菌多样性 被引量:21
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作者 许学伟 吴敏 +1 位作者 迪丽拜尔.托乎提 古丽巴哈尔.阿巴拜克利 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期359-362,共4页
新疆地区盐湖密布,蕴藏着丰富的微生物资源。为保护和利用微生物物种与基因资源,作者从新疆准噶尔盆地的艾比湖和天山山间盆地的伊吾湖分离纯化嗜盐微生物。采用PCR方法扩增其中65株嗜盐古菌16SrRNA基因序列。序列分析表明,分离的嗜盐... 新疆地区盐湖密布,蕴藏着丰富的微生物资源。为保护和利用微生物物种与基因资源,作者从新疆准噶尔盆地的艾比湖和天山山间盆地的伊吾湖分离纯化嗜盐微生物。采用PCR方法扩增其中65株嗜盐古菌16SrRNA基因序列。序列分析表明,分离的嗜盐古菌分属6个属,艾比湖以Haloterrigena和Natrinema属的菌株为主,伊吾湖由Haloarcula和Halorubrum两个属的菌株构成。通过多样性指数、丰富度指数、均匀度指数和物种相对多度模型对分离的菌株进行多样性分析和比较,结果表明,盐湖嗜盐古菌的多样性指数、丰富度指数和均匀度指数具有一定相关性,艾比湖可培养嗜盐古菌的多样性高于伊吾湖。研究发现了一些新的物种资源,表明新疆盐湖中孕育的特色微生物资源亟待保护与利用。 展开更多
关键词 盐湖 嗜盐古菌 16S RRNA基因 多样性
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巴里坤湖和玛纳斯湖嗜盐菌的分离及功能酶的筛选 被引量:15
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作者 顾晓颖 李冠 吴敏 《生物技术》 CAS CSCD 2007年第3期26-30,共5页
目的:了解新疆巴里坤湖与马纳斯湖中嗜盐菌及功能酶的多样性。方法:从两湖中采集水样进行菌种分离,采用PCR方法扩增出其16S rRNA基因(16S rDNA),并测定了基因的序列。对分离菌株进行了蛋白酶、淀粉酶、酯酶、脂肪酶、以及纤维素酶的筛... 目的:了解新疆巴里坤湖与马纳斯湖中嗜盐菌及功能酶的多样性。方法:从两湖中采集水样进行菌种分离,采用PCR方法扩增出其16S rRNA基因(16S rDNA),并测定了基因的序列。对分离菌株进行了蛋白酶、淀粉酶、酯酶、脂肪酶、以及纤维素酶的筛选。结果:从两湖水样共分离得到51株嗜盐菌。基于16SrDNA序列的同源性比较和系统发育学分析,发现从两湖分离获得的中度嗜盐菌分别属于Planococcaceae、Bacillacea、Staphylococcus、Halomonadaceae、Salicolaceae以及Pseudomonadacaeae 6个属。分离得到的极端嗜盐古菌属于Halobacteriaceae属。功能酶筛选结果表明产蛋白酶的嗜盐菌共有15株,产酯酶的共有23株,产淀粉酶的共有8株,未获得产脂肪酶和纤维素酶的嗜盐菌。结论:新疆巴里坤湖和马纳斯湖中有丰富的嗜盐微生物资源及酶资源,有重要的研究意义和应用前景。 展开更多
关键词 盐湖 中度嗜盐菌 嗜盐古菌 生物多样性 极端水解酶
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柴达敏盐湖产胞外蛋白酶嗜盐古菌的筛选及其酶学性质 被引量:3
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作者 侯靖 许文梅 崔恒林 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期91-96,共6页
从分离自内蒙古柴达敏盐湖的嗜盐古菌中筛选高产胞外蛋白酶菌株,并对所产蛋白酶的酶学性质进行初步研究。结果表明,2株高产胞外蛋白酶嗜盐古菌CDM10和CDM12为新的分类单元。CDM10胞外蛋白酶最适反应条件为70~75℃,pH 8.0~9.0和1.5 mol/L... 从分离自内蒙古柴达敏盐湖的嗜盐古菌中筛选高产胞外蛋白酶菌株,并对所产蛋白酶的酶学性质进行初步研究。结果表明,2株高产胞外蛋白酶嗜盐古菌CDM10和CDM12为新的分类单元。CDM10胞外蛋白酶最适反应条件为70~75℃,pH 8.0~9.0和1.5 mol/L NaCl。CDM12胞外蛋白酶最适反应条件为60~75℃,pH7.0~9.0和1.5~2.5 mol/L NaCl。它们具有良好的热稳定性和盐度容忍性。抑制剂实验表明CDM10和CDM12的胞外蛋白酶是丝氨酸蛋白酶,半胱氨酸和金属离子对于蛋白酶活性的发挥具有重要的作用。 展开更多
关键词 胞外蛋白酶 嗜盐古菌 酶学性质 盐湖
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新疆艾比湖细菌视蛋白基因资源研究
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作者 徐晓红 张心齐 +1 位作者 迪丽拜尔.托乎提 吴敏 《浙江大学学报(工学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1636-1640,共5页
针对新疆艾比湖这一特定生境中的嗜盐古菌的细菌视蛋白(bacterio-opsin,bop)基因资源进行了研究.通过PCR方法扩增并测定了11株菌株的编码细菌视蛋白螺旋C至螺旋G片段的基因序列.根据该片段基因序列进行的系统发育分析表明,艾比湖获得的... 针对新疆艾比湖这一特定生境中的嗜盐古菌的细菌视蛋白(bacterio-opsin,bop)基因资源进行了研究.通过PCR方法扩增并测定了11株菌株的编码细菌视蛋白螺旋C至螺旋G片段的基因序列.根据该片段基因序列进行的系统发育分析表明,艾比湖获得的bop基因大部分聚类到同一个类群,具有明显的地域特征.将翻译出的氨基酸序列与已报道的相应片段进行对比表明,从艾比湖菌株获得的序列与其他菌株来源的序列间存在明显差异.这些天然的突变体,尤其是菌株AB9、AB27、AB47,都是研究细菌视紫红质(bacteriorhodopsin,BR)蛋白结构和功能的良好材料,而细菌视紫红质是人工视网膜和光子开关等的良好生物材料. 展开更多
关键词 艾比湖 细菌视蛋白基因 嗜盐古菌 细菌视紫红质
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柴达木盆地达布逊盐湖微生物多样性研究 被引量:24
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作者 赵婉雨 杨渐 +5 位作者 董海良 吴耿 王尚 孙永娟 赖忠平 蒋宏忱 《地球与环境》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期398-405,共8页
本研究采用高通量测序与传统培养技术相结合的方式研究达布逊湖微生物的多样性。结果显示,达布逊盐湖中的细菌多样性与丰度远高于古菌。高通量测序所得的16SrRNA基因序列分别归属广古菌门(Euryarchaeota),放线菌门(Actinobacteria),拟... 本研究采用高通量测序与传统培养技术相结合的方式研究达布逊湖微生物的多样性。结果显示,达布逊盐湖中的细菌多样性与丰度远高于古菌。高通量测序所得的16SrRNA基因序列分别归属广古菌门(Euryarchaeota),放线菌门(Actinobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),变形菌门(Proteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia)。广古菌门序列占原核微生物(细菌与古菌之和)的5.5%,以嗜盐的盐杆菌科(Halobacteriaceae)为主,而属于放线菌门、拟杆菌门、变形菌门和疣微菌门的细菌序列分别占原核微生物的53.0%、25.8%、14.1%和1.6%。定量PCR结果显示,达布逊盐湖水体中的细菌和古菌16S rRNA基因丰度分别为3.27×107和4.35×104拷贝/毫升。培养分离获得的纯细菌菌株分别属于假单胞菌属(Pseudomonas)和芽孢杆菌属(Bacillus)。古菌菌株则分别属于盐杆菌科的盐盒菌属(Haloarcula)、盐红菌属(Halorubrum)和盐棍菌属(Halorhabdus)。本研究为青藏高原盐湖微生物资源的开发和利用提供了有利的数据支持。 展开更多
关键词 达布逊盐湖 嗜盐微生物 古菌 细菌 多样性
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新疆伊吾湖嗜盐菌bop基因多样性 被引量:1
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作者 古丽巴哈尔.阿巴拜克利 吴敏 +1 位作者 吴月红 邵娇芳 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期80-84,共5页
为了研究新疆中部地区伊吾湖嗜盐微生物和细菌视蛋白基因(bop)资源,分离纯化了95株嗜盐和耐盐菌.并从中挑选了10株红色的菌株,采用PCR和TA克隆的方法,扩增出bop基因螺旋C到螺旋G的核心序列,测定了基因的核苷酸序列.基于bop基因序列的同... 为了研究新疆中部地区伊吾湖嗜盐微生物和细菌视蛋白基因(bop)资源,分离纯化了95株嗜盐和耐盐菌.并从中挑选了10株红色的菌株,采用PCR和TA克隆的方法,扩增出bop基因螺旋C到螺旋G的核心序列,测定了基因的核苷酸序列.基于bop基因序列的同源性比较和系统发育学分析,发现9个序列分布在同一分支下,表明伊吾湖嗜盐菌bop基因具有一定的多样性和明显的自身地域性. 展开更多
关键词 伊吾湖 嗜盐菌 细菌视蛋白基因 多样性
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Isolation and Phylogenetic Analysis of Halophilic Archaeon AJ6
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作者 Xu Xiaohong Wu Min +2 位作者 Cao Yi Wu Yuehong Zhang Ting 《Frontiers in Biology》 CSCD 2006年第1期29-34,共6页
Halophilic archaeon AJ6 was isolated and purified from the Altun Mountain National Nature Reserve of the Xinjiang Uygur Autonomous Region.Strain AJ6 is a Gram-negative rod whose size is 0.2–0.6 by 1.6–4.2μm,wherein... Halophilic archaeon AJ6 was isolated and purified from the Altun Mountain National Nature Reserve of the Xinjiang Uygur Autonomous Region.Strain AJ6 is a Gram-negative rod whose size is 0.2–0.6 by 1.6–4.2μm,wherein a few cells are globular.The optimum salt concentration for its growth is 20%NaCl and 0.6%Mg^(2+),and the optimum pH is 6.0–7.0.Morphological,physiological,and biochemical characteristics of strain AJ6 were observed.The 16S rRNA encoding gene(16S rDNA)sequence of strain AJ6 was amplified by PCR,and its nucleotide sequence was determined subsequently.“Clustalw”and“PHYLIP”software bags were used to analyze the 16S rDNA sequence;the homology was compared,and then the phylogenetic tree was established.The results indicate that strain AJ6 is a novel species of the genus Natrinema.The GenBank accession number of the 16S rDNA sequences of strain AJ6 is AY277584. 展开更多
关键词 extremely halophilic archaea salt lake Altun Mountain National Nature Reserve 16S rDNA gene PHYLOGENY
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