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基于DNA条形码ITS对西藏不同地理居群红景天的鉴定研究
1
作者
刘青
钟迎春
+5 位作者
顿珠
王化东
郑雷
尕藏卓玛
索朗次仁
白玛次旦
《西部中医药》
2024年第9期42-45,共4页
目的:对大花红景天和长鞭红景天进行2种DNA条形码的碱基序列分析,并构建系统进化树,为大花红景天的真伪鉴定提供参考。方法:提取3份样品基因组DNA,对内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)片段进行PCR扩增,双向测序,获得其序...
目的:对大花红景天和长鞭红景天进行2种DNA条形码的碱基序列分析,并构建系统进化树,为大花红景天的真伪鉴定提供参考。方法:提取3份样品基因组DNA,对内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)片段进行PCR扩增,双向测序,获得其序列信息;运用MEGA7.0对所有样品的ITS序列及GenBank共21条进行比对、计算种内种间遗传距离,构建Neighbor-Joining(NJ)系统进化树。结果:编号为A1~A14的大花红景天聚为一支,编号为K1~K7的长鞭红景天聚为一支;同时发现ITS序列信息变化与地域和环境明显相关。结论:将ITS序列作为DNA条形码能准确、快速地鉴别大花红景天,可为其种质资源鉴定及物种鉴别提供依据。
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关键词
大花红景天
长鞭红景天
DNA条形码
ITS
鉴定
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题名
基于DNA条形码ITS对西藏不同地理居群红景天的鉴定研究
1
作者
刘青
钟迎春
顿珠
王化东
郑雷
尕藏卓玛
索朗次仁
白玛次旦
机构
四川中医药高等专科学校
西藏藏医药大学
出处
《西部中医药》
2024年第9期42-45,共4页
基金
中央引导地方项目(XZ202102YD0027C)
四川中医药高等专科学校首批科研创新团队项目(自然科学类)(TD-2022-8)。
文摘
目的:对大花红景天和长鞭红景天进行2种DNA条形码的碱基序列分析,并构建系统进化树,为大花红景天的真伪鉴定提供参考。方法:提取3份样品基因组DNA,对内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)片段进行PCR扩增,双向测序,获得其序列信息;运用MEGA7.0对所有样品的ITS序列及GenBank共21条进行比对、计算种内种间遗传距离,构建Neighbor-Joining(NJ)系统进化树。结果:编号为A1~A14的大花红景天聚为一支,编号为K1~K7的长鞭红景天聚为一支;同时发现ITS序列信息变化与地域和环境明显相关。结论:将ITS序列作为DNA条形码能准确、快速地鉴别大花红景天,可为其种质资源鉴定及物种鉴别提供依据。
关键词
大花红景天
长鞭红景天
DNA条形码
ITS
鉴定
Keywords
dahua hongjingtian
Changbian
hongjingtian
DNA bar code
ITS
identification
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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作者
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1
基于DNA条形码ITS对西藏不同地理居群红景天的鉴定研究
刘青
钟迎春
顿珠
王化东
郑雷
尕藏卓玛
索朗次仁
白玛次旦
《西部中医药》
2024
0
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