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基于“血实宜决之”理论运用网络药理学讨论丹参-海风藤治疗紫癜性肾炎的作用机制
1
作者
李旭峰
白晓红
+1 位作者
修婵
杨姝荟
《中医临床研究》
2023年第33期111-118,共8页
目的:基于“血实宜决之”理论运用网络药理学讨论丹参-海风藤治疗紫癜性肾炎(Henoch-Schonlein Purpura Nephritis,HSPN)的作用机制。方法:“血实宜决之”出自《素问•阴阳应象大论篇》,是活血化瘀法的治疗总纲。基于“血实宜决之”理论...
目的:基于“血实宜决之”理论运用网络药理学讨论丹参-海风藤治疗紫癜性肾炎(Henoch-Schonlein Purpura Nephritis,HSPN)的作用机制。方法:“血实宜决之”出自《素问•阴阳应象大论篇》,是活血化瘀法的治疗总纲。基于“血实宜决之”理论,选取“丹参-海风藤”作为研究药物。使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取丹参-海风藤的活性成分和其对应的靶点。借助GeneCards数据库、DisGenet数据库获取HSPN的致病靶点。使用在线绘图工具微生信获得药物-疾病交集靶点,导入Cytoscape 3.9.1绘制“药物-主要活性成分-疾病-靶点”图。采用STRING数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)网络信息,并通过CytoNCA插件筛选出治疗HSPN的核心靶点。利用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,采用AutoDuck Vina对核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:本研究筛选丹参-海风藤治疗HSPN的靶点47个,对应2个药物(丹参、海风藤)、74个活性成分(其中丹参56个活性成分、海风藤18个活性成分)。筛选出核心靶点15个,包括基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproteinase,MMP)-9、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)、MYC基因、信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、半胱氨酸天冬氨酸酶(Caspase,CASP3)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(Peroxisome Proliferator Activated Receptor Gamma,PPARG)基因、前列素内环氧化物合成酶2(Prostaglandin-endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、雌激素受体(Estrogen Receptor 1,ESR1)、淀粉样β前体蛋白(Amyloid Beta Precursor Protein,APP)、MMP1、一氧化氮合成酶3(Nitric Oxide Synthase 3,NOS3)。GO富集分析得到基因信息共1119条。KEGG富集分析得到通路141条,主要包括晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Advanced Glycation End Product Receptor,RAGE)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-Akt信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1信号通路、IL-17信号通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、Relaxin信号通路、细胞凋亡通路(Apoptosis)等。分子对接的结果表明核心成分与核心靶点的分子对接结果均小于–5 kcal/mol,可以稳定结合。结论:“丹参-海风藤”可以基于“血实宜决之”理论通过多种成分、多个靶点、多条通路来治疗HSPN,主要涉及其抗炎、抗氧化、抗纤维化、调控细胞缺氧、促进细胞凋亡等方式。
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关键词
紫癜性肾炎
丹参-海风藤
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于“血实宜决之”理论运用网络药理学讨论丹参-海风藤治疗紫癜性肾炎的作用机制
1
作者
李旭峰
白晓红
修婵
杨姝荟
机构
辽宁中医药大学
辽宁中医药大学附属医院
出处
《中医临床研究》
2023年第33期111-118,共8页
文摘
目的:基于“血实宜决之”理论运用网络药理学讨论丹参-海风藤治疗紫癜性肾炎(Henoch-Schonlein Purpura Nephritis,HSPN)的作用机制。方法:“血实宜决之”出自《素问•阴阳应象大论篇》,是活血化瘀法的治疗总纲。基于“血实宜决之”理论,选取“丹参-海风藤”作为研究药物。使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取丹参-海风藤的活性成分和其对应的靶点。借助GeneCards数据库、DisGenet数据库获取HSPN的致病靶点。使用在线绘图工具微生信获得药物-疾病交集靶点,导入Cytoscape 3.9.1绘制“药物-主要活性成分-疾病-靶点”图。采用STRING数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)网络信息,并通过CytoNCA插件筛选出治疗HSPN的核心靶点。利用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,采用AutoDuck Vina对核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:本研究筛选丹参-海风藤治疗HSPN的靶点47个,对应2个药物(丹参、海风藤)、74个活性成分(其中丹参56个活性成分、海风藤18个活性成分)。筛选出核心靶点15个,包括基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproteinase,MMP)-9、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)、MYC基因、信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、半胱氨酸天冬氨酸酶(Caspase,CASP3)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(Peroxisome Proliferator Activated Receptor Gamma,PPARG)基因、前列素内环氧化物合成酶2(Prostaglandin-endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、雌激素受体(Estrogen Receptor 1,ESR1)、淀粉样β前体蛋白(Amyloid Beta Precursor Protein,APP)、MMP1、一氧化氮合成酶3(Nitric Oxide Synthase 3,NOS3)。GO富集分析得到基因信息共1119条。KEGG富集分析得到通路141条,主要包括晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Advanced Glycation End Product Receptor,RAGE)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-Akt信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1信号通路、IL-17信号通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、Relaxin信号通路、细胞凋亡通路(Apoptosis)等。分子对接的结果表明核心成分与核心靶点的分子对接结果均小于–5 kcal/mol,可以稳定结合。结论:“丹参-海风藤”可以基于“血实宜决之”理论通过多种成分、多个靶点、多条通路来治疗HSPN,主要涉及其抗炎、抗氧化、抗纤维化、调控细胞缺氧、促进细胞凋亡等方式。
关键词
紫癜性肾炎
丹参-海风藤
网络药理学
分子对接
Keywords
HSPN
danshen-haifengteng
Network pharmacology
Molecular docking
分类号
R256.5 [医药卫生—中医内科学]
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题名
作者
出处
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1
基于“血实宜决之”理论运用网络药理学讨论丹参-海风藤治疗紫癜性肾炎的作用机制
李旭峰
白晓红
修婵
杨姝荟
《中医临床研究》
2023
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