水溞基因组P450基因家族的分析

利用水溞基因组mRNA和氨基酸数据库对P450基因进行搜索和分析,结果显示:在水溞基因组中发现71个P450基因,它们分别属于15个P450家族和17个亚家族,是一个典型的多基因家族。以氨基酸相似度大于60%为标准对水溞P450基因进行分组,则71个P450基因中,16个为孤儿基因,不能被归入任何一组;其余55个可归入12个组,其中8个组,包含47条序列适合于正选择和基因转换分析。结果表明:有3个组,含22个基因显著受到正选择压力作用,其中的2个组,含18个基因有正选择概率大于95%的氨基酸位点228E或277T,228E和277T分别位于底物识别位点SRS2和SRS5;有5个组,包含19个基因显示显著的基因转换事件;既显著受到正选择压力作用,又参与基因转换的基因共12个;相反,检测出既没有受到显著的正选择压力作用,又没有基因转换的基因18个。可见,发生基因转换的基因与受到显著正选择的基因有高度的相关性:发生过基因转换的基因中63.2%都受到显著的正选择压力作用,同时,受正选择压力作用的基因中有54.5%发生了基因转换。此外,鉴定出20个不同的基序,其中有5条基序在90%以上的基因中出现。