期刊导航
期刊开放获取
河南省图书馆
退出
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式:
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
外源脱落酸处理的干旱胁迫下山桃叶片的转录组差异表达分析
被引量:
6
1
作者
刘晓
陈修德
+8 位作者
程宁
姜珊
张泽杰
王庆杰
高彦刚
肖伟
李玲
高东升
付喜玲
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2755-2766,共12页
以一年生实生山桃苗为试材,通过正常培养、干旱胁迫以及干旱胁迫下外施脱落酸(ABA)的山桃叶片进行高通量转录组测序分析,探究山桃响应干旱胁迫的分子机制,筛选响应ABA处理的功能基因。结果表明:试验共构建9个文库进行转录组测序。转录...
以一年生实生山桃苗为试材,通过正常培养、干旱胁迫以及干旱胁迫下外施脱落酸(ABA)的山桃叶片进行高通量转录组测序分析,探究山桃响应干旱胁迫的分子机制,筛选响应ABA处理的功能基因。结果表明:试验共构建9个文库进行转录组测序。转录组测序共获得67.14 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.81 Gb,Q30碱基百分比在91.71%及以上。与对照相比,干旱处理组差异表达基因显著上调596个,下调1 025个。与干旱处理组相比,干旱+ABA处理组差异表达基因显著上调394个,下调117个。GO富集分析表明:对照组、干旱处理组和干旱+ABA处理组在生物学途径中富集最多的类别都是代谢过程;在细胞组件和分子功能中, 3个不同处理组富集最多的基因类别均是细胞组分和催化活性相关的基因。KEGG富集分析表明:与对照相比,干旱处理组的样本有260个差异表达基因参与72条代谢途径;与干旱处理组相比,干旱+ABA处理组的样本有66个差异表达基因参与了38条代谢途径。经KEGG显著性富集分析,筛选到淀粉和蔗糖代谢、植物激素信号转导等相关基因。采用实时荧光定量PCR对筛选到的基因进行了表达检测,其趋势与转录组分析结果基本一致。
展开更多
关键词
山桃
高通量测序
干旱
脱落酸
原文传递
题名
外源脱落酸处理的干旱胁迫下山桃叶片的转录组差异表达分析
被引量:
6
1
作者
刘晓
陈修德
程宁
姜珊
张泽杰
王庆杰
高彦刚
肖伟
李玲
高东升
付喜玲
机构
作物生物学国家重点实验室
山东果蔬优质高效生产协同创新中心
山东农业大学园艺科学与工程学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2755-2766,共12页
基金
国家自然科学基金(31872041)
山东省现代农业产业技术体系果品创新团队项目栽培与土肥岗位(SDAIT-06-01)。
文摘
以一年生实生山桃苗为试材,通过正常培养、干旱胁迫以及干旱胁迫下外施脱落酸(ABA)的山桃叶片进行高通量转录组测序分析,探究山桃响应干旱胁迫的分子机制,筛选响应ABA处理的功能基因。结果表明:试验共构建9个文库进行转录组测序。转录组测序共获得67.14 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.81 Gb,Q30碱基百分比在91.71%及以上。与对照相比,干旱处理组差异表达基因显著上调596个,下调1 025个。与干旱处理组相比,干旱+ABA处理组差异表达基因显著上调394个,下调117个。GO富集分析表明:对照组、干旱处理组和干旱+ABA处理组在生物学途径中富集最多的类别都是代谢过程;在细胞组件和分子功能中, 3个不同处理组富集最多的基因类别均是细胞组分和催化活性相关的基因。KEGG富集分析表明:与对照相比,干旱处理组的样本有260个差异表达基因参与72条代谢途径;与干旱处理组相比,干旱+ABA处理组的样本有66个差异表达基因参与了38条代谢途径。经KEGG显著性富集分析,筛选到淀粉和蔗糖代谢、植物激素信号转导等相关基因。采用实时荧光定量PCR对筛选到的基因进行了表达检测,其趋势与转录组分析结果基本一致。
关键词
山桃
高通量测序
干旱
脱落酸
Keywords
david
peach
(
amygdalus
davidiana
)
high-through transcriptome sequencing
drought
abscisic acid
分类号
S662.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
外源脱落酸处理的干旱胁迫下山桃叶片的转录组差异表达分析
刘晓
陈修德
程宁
姜珊
张泽杰
王庆杰
高彦刚
肖伟
李玲
高东升
付喜玲
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
6
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部