盐胁迫下转DcCIPK24拟南芥的转录组比较分析

【目的】探究铁皮石斛(Dendrobium catenatum Lindl.)DcCIPK24的下游响应基因,为研究DcCIPK24提高耐盐性的分子调控途径提供指导。【方法】利用Illumina NovaSeq 6000测序平台对200 mmol/L NaCl处理和对照组的转DcCIPK24拟南芥、野生型拟南芥进行测序,分析差异表达基因的富集通路,并对通路中的差异基因进行荧光定量PCR验证。【结果】盐胁迫下,从2个转基因拟南芥株系与野生型拟南芥的比较组合中共鉴定出96个差异表达基因;GO注释分析发现96个差异基因主要被富集在分子功能相关通路;KEGG富集分析发现差异基因主要被注释在氨基糖和核苷酸糖代谢、植物MAPK信号通路和甘油酯代谢通路中,选取上调表达的差异基因AtGPAT5、AtSIRK、AtMEE25、AtUGE5和下调表达基因AtAMT1-2、AtATTI3、AtCYP71A25、AtLHCB4.3进行实时荧光定量PCR验证,结果表明盐胁迫下8个差异基因表达趋势与转录组数据基本一致。【结论】盐胁迫下,DcCIPK24主要通过氨基糖和核苷酸糖代谢途径、植物MAPK信号途径和甘油酯代谢通路响应耐盐。