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Death-associated protein kinase 1 is associated with cognitive dysfunction in major depressive disorder
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作者 Xiao-Hui Li Hong-Can Zhu +5 位作者 Xue-Min Cui Wang Wang Lin Yang Li-Bo Wang Neng-Wei Hu Dong-Xiao Duan 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2023年第8期1795-1801,共7页
We previously showed that death-associated protein kinase 1(DAPK1)expression is increased in hippocampal tissue in a mouse model of major depressive disorde and is related to cognitive dysfunction in Alzheimer's d... We previously showed that death-associated protein kinase 1(DAPK1)expression is increased in hippocampal tissue in a mouse model of major depressive disorde and is related to cognitive dysfunction in Alzheimer's disease.In addition,depression is a risk factor for developing Alzheimer's disease,as well as an early clinical manifestation of Alzheimer's disease.Meanwhile,cognitive dysfunction is a distinctive feature of major depressive disorder.Therefore,DAPK1 may be related to cognitive dysfunction in major depressive disorder.In this study,we established a mouse model of major depressive disorder by housing mice individually and exposing them to chronic,mild,unpredictable stressors.We found that DAPK1 and tau protein levels were increased in the hippocampal CA3 area,and tau was hyperphosphorylated at Thr231,Ser262,and Ser396 in these mice.Furthermore,DAPK1 shifted from axonal expression to overexpression on the cell membrane.Exercise and treatment with the antidepressant drug citalopram decreased DAPK1 expression and tau protein phosphorylation in hippocampal tissue and improved both depressive symptoms and cognitive dysfunction.These results indicate that DAPK1 may be a potential reason and therapeutic target of cognitive dysfunction in major depressive disorder. 展开更多
关键词 Alzheimer's disease antidepressant drug behavioral tests cognitive dysfunction death-associated protein kinase 1 EXERCISE HIPPOCAMPUS major depressive disorder PHOSPHORYLATION tau protein
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AAV mediated carboxyl terminus of Hsp70 interacting protein overexpression mitigates the cognitive and pathological phenotypes of APP/PS1 mice
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作者 Zhengwei Hu Jing Yang +7 位作者 Shuo Zhang Mengjie Li Chunyan Zuo Chengyuan Mao Zhongxian Zhang Mibo Tang Changhe Shi Yuming Xu 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第1期253-264,共12页
The E3 ubiquitin ligase,carboxyl terminus of heat shock protein 70(Hsp70)interacting protein(CHIP),also functions as a co-chaperone and plays a crucial role in the protein quality control system.In this study,we aimed... The E3 ubiquitin ligase,carboxyl terminus of heat shock protein 70(Hsp70)interacting protein(CHIP),also functions as a co-chaperone and plays a crucial role in the protein quality control system.In this study,we aimed to investigate the neuroprotective effect of overexpressed CHIP on Alzheimer’s disease.We used an adeno-associated virus vector that can cross the blood-brain barrier to mediate CHIP overexpression in APP/PS1 mouse brain.CHIP overexpression significantly ameliorated the performance of APP/PS1 mice in the Morris water maze and nest building tests,reduced amyloid-βplaques,and decreased the expression of both amyloid-βand phosphorylated tau.CHIP also alleviated the concentration of microglia and astrocytes around plaques.In APP/PS1 mice of a younger age,CHIP overexpression promoted an increase in ADAM10 expression and inhibitedβ-site APP cleaving enzyme 1,insulin degrading enzyme,and neprilysin expression.Levels of HSP70 and HSP40,which have functional relevance to CHIP,were also increased.Single nuclei transcriptome sequencing in the hippocampus of CHIP overexpressed mice showed that the lysosomal pathway and oligodendrocyte-related biological processes were up-regulated,which may also reflect a potential mechanism for the neuroprotective effect of CHIP.Our research shows that CHIP effectively reduces the behavior and pathological manifestations of APP/PS1 mice.Indeed,overexpression of CHIP could be a beneficial approach for the treatment of Alzheimer’s disease. 展开更多
关键词 adeno-associated virus Alzheimer’s disease APP/PS1 mice carboxyl terminus of Hsp70 interacting protein gene therapy
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Assessment of pathogenicity and functional characterization of APPL1 gene mutations in diabetic patients
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作者 Ping Shi Yang Tian +7 位作者 Feng Xu Lu-Na Liu Wan-Hong Wu Ying-Zhou Shi An-Qi Dai Hang-Yu Fang Kun-Xia Li Chao Xu 《World Journal of Diabetes》 SCIE 2024年第2期275-286,共12页
BACKGROUND Adaptor protein,phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1(APPL1)plays a crucial role in regulating insulin signaling and glucose metabolism.Mutations in the APPL1 gene have been associ... BACKGROUND Adaptor protein,phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1(APPL1)plays a crucial role in regulating insulin signaling and glucose metabolism.Mutations in the APPL1 gene have been associated with the development of maturity-onset diabetes of the young type 14(MODY14).Currently,only two mutations[c.1655T>A(p.Leu552*)and c.281G>A p.(Asp94Asn)]have been identified in association with this disease.Given the limited understanding of MODY14,it is imperative to identify additional cases and carry out comprehensive research on MODY14 and APPL1 mutations.AIM To assess the pathogenicity of APPL1 gene mutations in diabetic patients and to characterize the functional role of the APPL1 domain.METHODS Patients exhibiting clinical signs and a medical history suggestive of MODY were screened for the study.Whole exome sequencing was performed on the patients as well as their family members.The pathogenicity of the identified APPL1 variants was predicted on the basis of bioinformatics analysis.In addition,the pathogenicity of the novel APPL1 variant was preliminarily evaluated through in vitro functional experiments.Finally,the impact of these variants on APPL1 protein expression and the insulin pathway were assessed,and the potential mechanism underlying the interaction between the APPL1 protein and the insulin receptor was further explored.RESULTS A total of five novel mutations were identified,including four missense mutations(Asp632Tyr,Arg633His,Arg532Gln,and Ile642Met)and one intronic mutation(1153-16A>T).Pathogenicity prediction analysis revealed that the Arg532Gln was pathogenic across all predictions.The Asp632Tyr and Arg633His variants also had pathogenicity based on MutationTaster.In addition,multiple alignment of amino acid sequences showed that the Arg532Gln,Asp632Tyr,and Arg633His variants were conserved across different species.Moreover,in in vitro functional experiments,both the c.1894G>T(at Asp632Tyr)and c.1595G>A(at Arg532Gln)mutations were found to downregulate the expression of APPL1 on both protein and mRNA levels,indicating their pathogenic nature.Therefore,based on the patient’s clinical and family history,combined with the results from bioinformatics analysis and functional experiment,the c.1894G>T(at Asp632Tyr)and c.1595G>A(at Arg532Gln)mutations were classified as pathogenic mutations.Importantly,all these mutations were located within the phosphotyrosinebinding domain of APPL1,which plays a critical role in the insulin sensitization effect.CONCLUSION This study provided new insights into the pathogenicity of APPL1 gene mutations in diabetes and revealed a potential target for the diagnosis and treatment of the disease. 展开更多
关键词 Adaptor protein phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1 Maturity-onset diabetes of the young Bioinformatics analysis gene mutation DOMAIN
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抑制lncRNA TUG1下调核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1炎症小体在延缓阿尔茨海默病进展的作用
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作者 马婷婷 陈建红 +1 位作者 刘爱翠 李海宁 《解剖学报》 CAS CSCD 2024年第1期32-42,共11页
目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早... 目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早老素1(PS1)转基因小鼠(30只)。APP/PS1转基因小鼠随机分为模型(model)组,模型+敲低lncRNA TUG1组[model+lncRNA TUG1短发夹RNA(shRNA)组]和model+shRNA非靶标(NT)组,每组10只。分别采集12周龄第1天(3月龄)和32周龄第1天(8月龄)小鼠外周血和脑皮质组织,并分离皮质中的原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞,每个时间点每组5只小鼠。Real-time PCR分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和巨噬细胞移动抑制因子(MIF)mRNA的水平,以及原代星形胶质细胞中补体蛋白C1r和C1s mRNA的水平。ELISA法测定其外周血浆中MIF含量。对3月龄和8月龄小鼠脑皮质原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞共培养。CCK-8法测定上述2种细胞的增殖能力。Western blotting分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织中MIF、白细胞介素1β前体(pro-IL-1β)、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1及NLRP3蛋白的表达水平。采用免疫荧光染色法测定8月龄各分组小鼠脑皮质组织中β淀粉样蛋白(Aβ)表达。结果3月龄和8月龄时,与WT组小鼠相比,model组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF相对表达水平显著上调,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF的相对表达水平显著降低,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力降低(P<0.05)。与WT组相比,model组小鼠外周血浆中MIF含量显著升高;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1以及NLRP3的蛋白表达水平显著升高;Aβ免疫荧光强度明显增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠外周血浆中MIF含量显著降低;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)和NLRP1的蛋白表达水平显著降低,Aβ免疫荧光强度明显降低(P<0.05),而NLRP3蛋白质的表达水平无明显变化(P>0.05)。与model组相比,model+shRNA NT组小鼠上述所有检测指标差异均无显著性(P>0.05)。结论APP/PS1转基因小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF因子表达上调与脑皮质内NLRP1炎症小体激活成正相关,敲低lncRNA TUG1可缓解阿尔茨海默病的进展。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 长链非编码RNA 牛磺酸上调基因1 巨噬细胞移动抑制因子 核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1 免疫印迹法 小鼠
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BAP1在肝细胞肝癌中的表达及其与预后的关系
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作者 王珺平 陈可和 王志强 《海南医学》 CAS 2024年第1期24-28,共5页
目的探讨BRCA1相关蛋白1(BAP1)在肝细胞肝癌(LIHC)中的表达变化及其与预后的关系。方法从UALCA获得癌症基因组图谱(TCGA)中LIHC的BAP1 m RNA表达水平及临床数据并进行数据分组和处理。采用R3.2.2软件进行分析。比较BAP1在癌组织与正常... 目的探讨BRCA1相关蛋白1(BAP1)在肝细胞肝癌(LIHC)中的表达变化及其与预后的关系。方法从UALCA获得癌症基因组图谱(TCGA)中LIHC的BAP1 m RNA表达水平及临床数据并进行数据分组和处理。采用R3.2.2软件进行分析。比较BAP1在癌组织与正常组织中的表达差异,并分析LIHC患者各亚组临床指标的BAP1表达水平与正常组织的差异。采用寿命表法计算生存率,采用Kaplan-Meier法比较BAP1高表达组和中低表达组患者的生存率,并绘制患者的生存曲线。结果LIHC组织中BAP1 mRNA表达中位数为37.748 TPM,明显高于正常组织中的18.444 TPM,差异有显著统计学意义(P<0.01);患者的性别、年龄、种族、体质量、组织学类型、组织学分级、淋巴结、TNM分期Ⅰ~Ⅲ期、TP53突变的各组癌组织中BAP1表达水平与正常组织表达水平比较差异均有统计学意义(P<0.05),而Ⅳ期组癌组织中BAP1表达水平与正常组织表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05);患者的中位生存时间为27.18个月,1年、2年、3年、4年、5年生存率分别为0.57%、0.31%、0.20%、0.13%、0.08%;BAP1 m RNA高表达的整体生存率较BAP1mRNA中低表达者短,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论BAP1 m RNA在LIHC中呈高表达,高表达组生存率较低,提示预后不良。 展开更多
关键词 肝细胞肝癌 BRCA1相关蛋白1 基因表达 预后 相关性
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ERCC1、K-ras、TP-73在替雷利珠单抗联合TP化疗方案治疗非小细胞肺癌中的评估价值
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作者 王亚飞 张振军 +1 位作者 宋长亮 杨琼 《标记免疫分析与临床》 CAS 2024年第3期496-501,共6页
目的研究探讨核苷酸切除修复交叉互补基因1(ERCC1)、Kirsten-Rous肉瘤病毒蛋白(K-ras)、肿瘤蛋白P73(TP73)在替雷利珠单抗结合紫杉醇+顺铂(TP)化疗方案治疗NSCLC中的评估价值。方法选取2020年1月至2021年12月本院收治的126例NSCLC肺癌... 目的研究探讨核苷酸切除修复交叉互补基因1(ERCC1)、Kirsten-Rous肉瘤病毒蛋白(K-ras)、肿瘤蛋白P73(TP73)在替雷利珠单抗结合紫杉醇+顺铂(TP)化疗方案治疗NSCLC中的评估价值。方法选取2020年1月至2021年12月本院收治的126例NSCLC肺癌患者为研究对象,按随机抽签法分为对照组、观察组,各63例。对照组以TP化疗方案治疗,观察组增加替雷利珠单抗治疗。评估组间临床疗效、肿瘤标记蛋白、免疫指标、生存周期、不良反应。结果观察组患者的客观缓解率为69.84%(44/63)高于对照组患者为52.38%(33/63),观察组疾病控制率为82.54%(52/63),高于对照组患者为66.67%(42/63)(P<0.05)。化疗1周期、化疗3周期、化疗6周期时,观察组ERCC1、K-ras、TP-73水平均低于对照组(P<0.05)。治疗后观察组免疫功能补体C3、补体C4、CD40细胞低于对照组,NK细胞高于对照组(P<0.05)。观察组患者的TTP、PFS、总生存期均高于对照组(P<0.05)。观察组不良反应发生率为19.05%(12/63),对照组为12.70%(8/63),组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论替雷利珠单抗联合TP化疗方案治疗肺癌有良好的治疗效果,能够改善患者免疫功能,延长患者生存周期,治疗安全性较好,且ERCC1、K-ras、TP-73水平变化可反映替雷利珠单抗联合TP化疗方案在肺癌治疗中的效果,在综合疗效评估中有较高的应用价值。 展开更多
关键词 替雷利珠单抗 紫杉醇 顺铂 核苷酸切除修复交叉互补基因1 基因Kirsten-Rous肉瘤病毒蛋白 肿瘤蛋白P73 非小细胞肺癌
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PD-1抑制剂联合一线化疗方案对晚期驱动基因阴性肺腺癌的效果及安全性分析
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作者 陈艳妮 张建红 +3 位作者 李健 李瑶 逯震芳 陈亮 《河北医药》 CAS 2024年第8期1184-1187,共4页
目的探讨程序性细胞死亡蛋白-1(PD-1)抑制剂联合一线化疗方案治疗晚期驱动基因阴性肺腺癌的效果及安全性。方法回顾性收集2019年1月至2021年12月收治的60例晚期驱动基因阴性的肺腺癌患者病历资料,依据治疗方式不同分组,将30例接受培美... 目的探讨程序性细胞死亡蛋白-1(PD-1)抑制剂联合一线化疗方案治疗晚期驱动基因阴性肺腺癌的效果及安全性。方法回顾性收集2019年1月至2021年12月收治的60例晚期驱动基因阴性的肺腺癌患者病历资料,依据治疗方式不同分组,将30例接受培美曲塞、顺铂联合PD-1抑制剂(信迪利单抗)治疗的病历资料纳入观察组另30例接受培美曲塞联合顺铂治疗的病历资料纳入对照组。对比2组患者治疗前、治疗30 d时2组临床疗效[客观缓解率(ORR)、疾病控制率(DCR)]、免疫功能[CD_(4)^(+)、CD_(8)^(+)、CD_(4)^(+)/CD_(8)^(+)]、肿瘤标志物[癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)]、不良反应[恶心、粒细胞减少、肝功能异常、甲状腺功能异常、肺炎、皮疹、血小板降低]。结果观察组ORR显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);2组DCR比较差异无统计学意义(P>0.05);治疗后,观察组CD_(4)^(+)、CD_(4)^(+)/CD_(8)^(+)水平高于治疗前,且高于对照组(P<0.05);治疗后,2组CYFRA21-1、CEA水平均下降,且观察组低于对照组(P<0.05)。观察组甲状腺功能异常、肺炎、皮疹等发生例数显著多于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论PD-1抑制剂联合化疗一线治疗可有效改善晚期驱动基因阴性肺腺癌患者免疫功能,并降低肿瘤标志物水平,疗效确切。 展开更多
关键词 肺腺癌 驱动基因阴性 PD-1抑制剂 化疗 免疫功能
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蛋白激酶全抑制分析揭示KG-1细胞增殖的分子机制
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作者 段毓 徐凝馨 +6 位作者 曹琼 杨恺 王金娟 刘思瑾 贾峰峰 刘建兵 李莉 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期621-628,共8页
目的:通过分析KG-1细胞对各种蛋白激酶抑制剂的反应,探讨其增殖的分子机制。方法:采用CCK-8法、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western-blot检测各种蛋白激酶抑制剂对KG-1细胞增殖、相关基因mRNA表达水平以及FGFR1下游信号通路蛋白磷酸化... 目的:通过分析KG-1细胞对各种蛋白激酶抑制剂的反应,探讨其增殖的分子机制。方法:采用CCK-8法、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western-blot检测各种蛋白激酶抑制剂对KG-1细胞增殖、相关基因mRNA表达水平以及FGFR1下游信号通路蛋白磷酸化水平的影响。结果:NVP-BGJ398和PD173074有效抑制KG-1细胞的增殖,表明FGFR及其下游信号通路在KG-1细胞增殖过程中具有关键作用。使用FGFR抑制剂处理后,p-FGFR1和p-STAT5水平显著下降(P<0.001),p-Akt水平稍有下降(P<0.05),并未影响p-ERK水平(P>0.05)。结论:FGFR1OP2-FGFR1主要作用于下游STAT5信号通路,以促进细胞增殖。蛋白激酶全抑制分析是一种可靠而直接的方法,可用于确定癌细胞增殖的分子机制。 展开更多
关键词 KG-1细胞 蛋白激酶抑制剂 FGFR1OP2-FGFR1融合基因 STAT5
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ATF6调控生殖相关基因HSPA1L表达的分子机制
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作者 汪媛媛 朱席琳 +1 位作者 伍晓盼 刘英 《基础医学与临床》 2024年第1期37-42,共6页
目的探究内质网应激活化转录因子6(ATF6)对生殖相关基因热休克蛋白A1样蛋白(HSPA1L)表达的影响并初步阐明其调控分子机制。方法在人胚肾细胞系HEK-293T中转染ATF6过表达质粒,RT-qPCR和Western blot验证过表达效率;利用雄性ATF6敲除小鼠... 目的探究内质网应激活化转录因子6(ATF6)对生殖相关基因热休克蛋白A1样蛋白(HSPA1L)表达的影响并初步阐明其调控分子机制。方法在人胚肾细胞系HEK-293T中转染ATF6过表达质粒,RT-qPCR和Western blot验证过表达效率;利用雄性ATF6敲除小鼠睾丸组织转录物组测序信息,筛选ATF6下游5个生殖相关基因;双荧光素酶报告基因实验选择启动子活性较高的下游基因并检测过表达ATF6对其启动子活性的影响;通过gene-regulation预测ATF6和下游基因启动子可能的结合位点;RT-qPCR和Western blot检测在HEK-293T细胞中过表达ATF6对于下游基因表达的影响;利用凝胶迁移实验(EMSA)确定ATF6与下游基因启动子是否结合。结果转染后HEK-293T细胞中ATF6的mRNA(P<0.001)和蛋白(P<0.05)表达水平明显升高。转录物组测序及双荧光素酶报告基因实验筛选出ATF6下游的生殖相关基因HSPA1L。ATF6能够促进HSPA1L的截短启动子活性(P<0.001)。过表达ATF6后,HSPA1L的表达量明显升高(P<0.001)。差异均有统计学意义。ATF6蛋白能与HSPA1L的启动子DNA序列aagtcgtcac相结合。结论内质网应激的关键分子ATF6通过结合生殖相关基因HSPA1L的启动子调控后者表达水平,这将为预防或治疗与内质网应激(ERS)有关的男性不育的深入研究奠定基础。 展开更多
关键词 活化转录因子6 热休克蛋白A1样蛋白 男性生殖 基因调控
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藏红花素通过跨膜受体蛋白/发状分裂相关增强子1信号通路对缺氧诱导的视网膜神经节细胞凋亡的影响
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作者 王玉风 付珂 王洪亮 《安徽医药》 CAS 2024年第1期193-197,I0005,共6页
目的探讨藏红花素对缺氧诱导的视网膜神经节细胞凋亡的作用及其可能机制。方法于2021年1月至2022年1月采用不同浓度藏红花素处理视网膜神经节细胞RGC-5,四甲基噻唑蓝(MTT)法检测细胞存活情况并筛选合适浓度。培养RGC-5细胞并用氯化钴(Co... 目的探讨藏红花素对缺氧诱导的视网膜神经节细胞凋亡的作用及其可能机制。方法于2021年1月至2022年1月采用不同浓度藏红花素处理视网膜神经节细胞RGC-5,四甲基噻唑蓝(MTT)法检测细胞存活情况并筛选合适浓度。培养RGC-5细胞并用氯化钴(CoCl_(2))处理建立缺氧模型,分为缺氧组、藏红花素组、阳性对照(抗坏血酸)组和藏红花素+跨膜受体蛋白信号通路抑制剂(DAPT)组,另设对照组。Cell counting kit-8法检测细胞存活情况;采用流式细胞术检测细胞凋亡率;钙荧光探针(Flou-4)实验检测各组细胞钙离子水平;实时定量PCR法检测跨膜受体蛋白(Notch1)、发状分裂相关增强子1(Hes-1)mRNA表达情况;蛋白质印迹法检测凋亡蛋白B细胞淋巴瘤因子2(Bcl-2)、Bcl-2相关蛋白(Bax)、钙依赖性蛋白酶家族1(Cal⁃pain1)蛋白表达情况。结果藏红花素组细胞活力0.83±0.08高于缺氧组0.45±0.04,细胞凋亡率(17.92±1.21)%低于缺氧组(51.82±5.36)%,钙离子水平0.27±0.04低于缺氧组0.76±0.05,差异有统计学意义(P<0.05);藏红花素+DAPT组细胞活力0.50±0.06低于藏红花素组0.83±0.08,细胞凋亡率(36.50±3.50)%高于藏红花素组(17.92±1.21)%,钙离子水平0.65±0.05高于藏红花素组0.27±0.04,差异有统计学意义(P<0.05)。与缺氧组比较,藏红花素组Bcl-2蛋白表达水平升高,Notch1、Hes-1mRNA表达、Bax和Calpain1蛋白表达水平降低(P<0.05)。与藏红花素组比较,藏红花素+DAPT组Bcl-2蛋白表达水平降低,Notch1、Hes-1mRNA表达、Bax和Calpain1蛋白表达水平升高(P<0.05)。结论藏红花素对体外培养的缺氧RGC-5细胞凋亡有一定的抑制作用,可能是通过抑制钙离子内流,阻滞Notch1/Hes-1通路,提高细胞内抑凋亡蛋白Bcl-2表达水平发挥作用。 展开更多
关键词 番红花 细胞低氧 基因 BCL-2 藏红花素 视网膜神经节细胞 细胞凋亡 跨膜受体蛋白Notch1 发状分裂相关增强子1 大鼠 Sprague-Dawley
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草鱼TAB2与TAK1蛋白互作鉴定及其对两种抗菌肽基因表达的影响
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作者 杨文飞 郭佳静 +1 位作者 赵文平 李槿年 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期131-140,共10页
为了探究草鱼TAB2(Ci TAB2)与Ci TAK1能否互作及其对2种草鱼抗菌肽基因(Cihepcidin与Ciβ-defensin1)表达的影响,实验首先采用实时荧光定量PCR(qPCR)方法分析拟态弧菌感染后Citab2和Citak1在草鱼免疫相关组织中的时空表达模式。然后利... 为了探究草鱼TAB2(Ci TAB2)与Ci TAK1能否互作及其对2种草鱼抗菌肽基因(Cihepcidin与Ciβ-defensin1)表达的影响,实验首先采用实时荧光定量PCR(qPCR)方法分析拟态弧菌感染后Citab2和Citak1在草鱼免疫相关组织中的时空表达模式。然后利用荧光共定位、免疫共沉淀及Western blot技术鉴定Ci TAB2与Ci TAK1在细胞内共定位及相互作用情况。最后将过表达质粒pEGFP-N1-Citak1与pEGFP-N1-Citab2共同转染草鱼肾细胞(CIK细胞),检测Cihepcidin与Ciβ-defensin1的相对mRNA表达水平。结果显示,拟态弧菌感染能够显著改变Citab2和Citak1的相对表达水平,前者于感染后不同时间在各检测组织中表现出不同的时空表达模式,而后者均呈现先上调后下调的表达模式;荧光显微镜下观察到Ci TAB2与Ci TAK1共定位于转染后的HEK293T和CIK细胞的胞质中,且在HEK293T细胞内能够形成Ci TAB2-Ci TAK1蛋白复合物;共同过表达Ci TAB2与Ci TAK1后,CIK细胞内Cihepcidin与Ciβ-defensin1的相对mRNA表达水平在各检测时间点均显著上调。结果表明,Ci TAB2与Ci TAK1存在互作关系且二者互作能够促进上述两种抗菌肽的转录表达。本研究从蛋白互作调控抗菌肽表达的角度为防治鱼类弧菌病提供了新策略。 展开更多
关键词 草鱼 转化生长因子-β激活激酶1(TAK1) TAK1结合蛋白2(TAB2) 蛋白互作 抗菌肽基因表达
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组蛋白H2A去泛素化酶BAP1对恶性胶质瘤细胞发生发展的作用及临床应用价值研究
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作者 李玉芳 林志烽 +5 位作者 项瑛 戚菲 韩飞舟 钱忠立 王涛 陈旭 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第2期7-11,33,共6页
目的探索乳腺癌/卵巢癌易感基因1相关蛋白1(breast/ovarian cancer susceptibility gene 1 associated protein 1,BAP1)对人源恶性胶质瘤发生、发展的作用与BAP1作为恶性胶质瘤临床诊断标志物的可行性。方法基于基因表达综合数据库(gene... 目的探索乳腺癌/卵巢癌易感基因1相关蛋白1(breast/ovarian cancer susceptibility gene 1 associated protein 1,BAP1)对人源恶性胶质瘤发生、发展的作用与BAP1作为恶性胶质瘤临床诊断标志物的可行性。方法基于基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)的子数据集GSE4290,GSE90598,分析BAP1在正常组织及胶质瘤组织中的差异性表达情况;受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析BAP1对恶性胶质瘤的早期诊断价值;选取自主收集的非配对28例恶性胶质瘤患者的原发灶组织、5例颅脑外伤患者内减压术切除的非瘤脑组织,采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测BAP1的表达水平;利用靶向BAP1的特异性小干扰RNAs(small interfering RNAs,siRNAs)瞬时转染U251细胞系,进一步检测其干涉效率;基于流式细胞仪分析BAP1下调的U251细胞系,其细胞周期、凋亡的变化情况。结果生物信息学结果显示,BAP1在恶性胶质瘤组织中的表达水平均低于正常脑组织(GSE4290:1209±18.49 vs 1476±53.90;GSE90598:5.19±0.10 vs 5.65±0.21),差异具有统计学意义(t=5.115,2.267,均P<0.05)。ROC曲线显示,BAP1可高效区分恶性胶质瘤组织与正常脑组织(GSE4290:AUC=0.78;GSE90598:AUC=0.75,均P<0.05)。临床标本结果显示,BAP1在恶性胶质瘤原发灶组织中的表达水平显著低于非瘤脑组织(0.27±0.04 vs 1.06±0.07),差异具有统计学意义(t=10.22,P<0.001)。在U251细胞系中下调BAP1的表达,其细胞周期中S期细胞比例明显增多,由17.59%分别增至27.21%(siBAP1-1)和25.79%(siBAP1-2),差异具有统计学意义(t=6.576,6.642,均P<0.01),而细胞凋亡水平则有所下降,由10.17%分别降至2.70%(siBAP-1)和3.00%(siBAP-2),差异具有统计学意义(t=10.31,9.428,均P<0.01)。结论组蛋白H2A去泛素化酶BAP1能够通过抑制恶性胶质瘤细胞周期快速进展并促进其凋亡,进而发挥肿瘤抑癌基因的功能,可作为潜在的恶性胶质瘤临床诊断标志物。 展开更多
关键词 恶性胶质瘤 乳腺癌/卵巢癌易感基因1相关蛋白1 细胞周期 细胞凋亡 抑癌基因
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猴痘病毒B.1谱系遗传分支、毒力基因及蛋白功能
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作者 林思宇 陈芳 +1 位作者 罗语思 张科 《热带病与寄生虫学》 CAS 2024年第1期1-6,53,共7页
2022年以来,猴痘疫情在全球暴发和流行。相较以往的猴痘病毒,2022年流行的猴痘毒株传播能力和宿主适应性等明显增强,猴痘B.1谱系毒株已成为全球猴痘疫情流行的主要毒株。为此,本文对猴痘病毒B.1谱系遗传分支、毒力基因及蛋白功能进行综... 2022年以来,猴痘疫情在全球暴发和流行。相较以往的猴痘病毒,2022年流行的猴痘毒株传播能力和宿主适应性等明显增强,猴痘B.1谱系毒株已成为全球猴痘疫情流行的主要毒株。为此,本文对猴痘病毒B.1谱系遗传分支、毒力基因及蛋白功能进行综述,并就部分基因产物的蛋白功能进行了注释,以期为猴痘疫情的科学防控提供参考。 展开更多
关键词 猴痘病毒 B.1谱系毒株 遗传分支 毒力基因 蛋白功能
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遗传性卵巢癌中乳腺癌抑制蛋白1/2和错配修复蛋白MutS同源物2基因突变的意义研究
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作者 廖莹 宋晓霞 刘行 《当代医学》 2024年第5期151-154,共4页
目的研究遗传性卵巢癌中乳腺癌抑制蛋白1/2(BRCA1/2)和错配修复蛋白MutS同源物2(MSH2)基因突变意义。方法选取2019年6月至2023年6月于新余市人民医院就诊的13例家族遗传性卵巢癌患者及家系中5名Ⅰ代健康亲属、20名Ⅱ/Ⅲ代健康亲属作为... 目的研究遗传性卵巢癌中乳腺癌抑制蛋白1/2(BRCA1/2)和错配修复蛋白MutS同源物2(MSH2)基因突变意义。方法选取2019年6月至2023年6月于新余市人民医院就诊的13例家族遗传性卵巢癌患者及家系中5名Ⅰ代健康亲属、20名Ⅱ/Ⅲ代健康亲属作为研究对象。采集所有研究对象空腹静脉血5 ml,分离提取DNA行聚合酶链式反应扩增后直接测序比对,研究遗传性卵巢癌家族中有意义的错义突变基因。结果13例家族遗传性卵巢癌患者临床分期以Ⅲ期、组织分级以低-中分化、有淋巴结肿转移为主。13例患者基因测序显示,BRCA1基因发现突变6处中,无意义突变3处,新发现突变3处。新发现3处突变中3780A>G、5069A>G造成氨基酸变化,3326A>T突变造成Arg突变成终止密码子,共同存在突变为3326A>T。BRCA2基因测序检测出突变6处,无意义突变5处,其中共同存在突变为1342A>C。MSH2基因测序发现无意义突变2处。健康家系中,携带BRCA1基因3326A>T突变3例(12.00%),携带BRCA2基因1342A>C突变12例(48.00%),其余女性测序结果正常。结论BRCA1基因杂合突变3326A>T和BRCA2基因杂合突变1342A>C是遗传性卵巢癌家族发病的致病基因,可为临床早发现、早诊断、早治疗提供指导。 展开更多
关键词 遗传性 卵巢癌 乳腺癌抑制蛋白1/2 错配修复基因 基因突变
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SPP1、DEC1、C1QTNF6蛋白与口腔鳞状细胞癌患者临床病理指标及预后的关系
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作者 付勇青 徐三会 +1 位作者 赵岩 王丽丽 《癌变.畸变.突变》 CAS 2024年第2期107-111,117,共6页
目的:探讨口腔鳞状细胞癌患者血清重组人分泌型磷蛋白1(SPP1)、软骨分化的表达基因1(DEC1)和补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白6(C1QTNF6)的表达水平与其临床病理指标及预后的关系。方法:免疫组织化学染色法和电化学发光免疫分析法检测88例... 目的:探讨口腔鳞状细胞癌患者血清重组人分泌型磷蛋白1(SPP1)、软骨分化的表达基因1(DEC1)和补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白6(C1QTNF6)的表达水平与其临床病理指标及预后的关系。方法:免疫组织化学染色法和电化学发光免疫分析法检测88例口腔鳞状细胞癌患者癌组织和血清中SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白的表达水平;Pearson相关性分析和Kaplan-Meier生存分析法分析患者血清SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白表达水平与其临床病理指标的相关性和对患者预后的影响。多因素Cox回归法分析影响口腔鳞状细胞癌患者预后的危险因素。结果:免疫组织化学染色结果显示口腔鳞状细胞癌患者癌组织中SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白的阳性表达率较癌旁组织分别增加了1.94、2.98和2.35倍(P<0.05或P<0.01);电化学发光免疫分析法结果显示口腔鳞状细胞癌患者血清SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白表达水平较正常人分别上调了8.61、6.20和4.03倍(P<0.05或P<0.01);Pearson相关性分析结果显示患者血清SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白表达水平与患者发生多灶嗜神经侵犯、肿瘤浸润程度、淋巴结转移、较高的TNM分期呈正相关(P<0.05);Kaplan-Meier生存分析结果显示,血清SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白高表达水平的口腔鳞状细胞癌患者总生存率低;多因素Cox回归分析结果表明多灶嗜神经侵犯、肿瘤高浸润度、淋巴结转移和高的TNM分期是影响预后的危险因素(P<0.05)。结论:口腔鳞状细胞癌患者癌组织和血清中SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白表达水平升高,且与患者发生多灶嗜神经侵犯、肿瘤浸润和淋巴结转移、较高的TNM分期呈正相关,而与患者预后呈负相关。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 重组人分泌型磷蛋白1 软骨分化的表达基因1 补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白6 预后
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长链非编码RNA尿路上皮癌相关1基因与脓毒症患者炎症因子严重程度及预后的关系
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作者 张树柳 陈玉刚 +2 位作者 刘瑞瑞 杜超 崔云亮 《中国急救医学》 CAS CSCD 2024年第4期292-297,共6页
目的探索长链非编码RNA尿路上皮癌相关1(lncRNA UCA1)基因与脓毒症患者炎症因子、严重程度及28天死亡关系。方法收集2022年1月至2023年12月期间中国人民解放军联勤保障部队第九六○医院收治的174例脓毒症患者临床资料。按照与脓毒症患... 目的探索长链非编码RNA尿路上皮癌相关1(lncRNA UCA1)基因与脓毒症患者炎症因子、严重程度及28天死亡关系。方法收集2022年1月至2023年12月期间中国人民解放军联勤保障部队第九六○医院收治的174例脓毒症患者临床资料。按照与脓毒症患者性别相同,年龄相差1岁之内1∶1配对收集同期健康体检者作为对照组。通过实时荧光定量(RT-qPCR)法检测外周血单核细胞中lncRNA UCA1水平。酶联免疫吸附(ELISA)法检测血清中肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-6、IL-17、细胞间黏附分子1(ICAM1)和血管细胞黏附分子1(VCAM1)水平。使用COX风险比例回归模型分析影响脓毒症患者28天病死率相关危险因素。绘制受试者工作特征(ROC)曲线,评估独立危险因素预测脓毒症患者28天死亡的效能。结果与对照组比较,脓毒症患者lncRNA UCA1水平更高(Z=76.235,P<0.001)。脓毒症患者lncRNA UCA1与TNF-α(r=0.384)、IL-6(r=0.308)、IL-17(r=0.472)、ICAM1(r=0.361)和VCAM1(r=0.492)水平、APACHEⅡ(r=0.393)和SOFA评分(r=0.427)均呈正相关(P均<0.001),而对照组中lncRNA UCA1与上述参数均无相关性(P均>0.05)。LncRNA UCA1水平升高(HR=2.186,P=0.007)、年龄增加(HR=1.245,P=0.011)、真菌感染(HR=19.259,P=0.010),C-反应蛋白(CRP)升高(HR=1.334,P=0.036)及APACHEⅡ评分增加(HR=1.245,P=0.017)是脓毒症患者28天死亡的独立危险因素。ROC曲线分析可见lncRNA UCA1(AUC=0.757)、APACHEⅡ评分(AUC=0.865)、CRP(AUC=0.731)及年龄(AUC=0.616)均可预测脓毒症患者28天死亡情况。结论脓毒症患者lncRNA UCA1水平升高,IncRNA UCA1与多种促炎细胞因子、疾病严重程度和不良预后相关。 展开更多
关键词 脓毒症 长链非编码RNA(lncRNA) 尿路上皮癌相关1(UCA1)基因 炎性因子 预后 真菌感染 C-反应蛋白 年龄
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胃窦癌组织中LAG-3 FGL1 MHC-Ⅱ的表达与预后的关系
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作者 戚颖 黄子祺 +2 位作者 别鸿宇 颜次慧 任秀宝 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期64-69,共6页
目的:探索新型免疫检查点淋巴细胞激活基因3(lymphocyte-activation gene 3,LAG-3)、纤维蛋白原样蛋白1(fibrinogenlike protein 1,FGL1)、主要组织相容性复合体Ⅱ类分子(major histocompatibility complex classⅡ,MHC-Ⅱ)在胃窦癌(gas... 目的:探索新型免疫检查点淋巴细胞激活基因3(lymphocyte-activation gene 3,LAG-3)、纤维蛋白原样蛋白1(fibrinogenlike protein 1,FGL1)、主要组织相容性复合体Ⅱ类分子(major histocompatibility complex classⅡ,MHC-Ⅱ)在胃窦癌(gastric antral cancer,GAC)中的表达情况与预后的相关性。方法:收集2012年1月至2014年12月于天津医科大学肿瘤医院诊断为GAC的67例患者病理标本,分别进行石蜡切片制作,采用免疫组织化学法检测LAG-3、FGL1、MHC-Ⅱ三个指标的表达情况,并用统计学方法分析组间差异。采用Kaplan-Meier法评估LAG-3、FGL1、MHC-Ⅱ的表达水平与GAC患者预后之间的关系并绘制生存曲线。结果:GAC患者中,肿瘤大小<4 cm的患者和无淋巴结转移的患者LAG-3免疫细胞阳性率更高(P<0.05);女性患者MHC-Ⅱ免疫细胞阳性率更高(P<0.05)。免疫细胞中LAG-3、MHC-Ⅱ高表达的患者总生存期(overall survival,OS)较好(P<0.05);肿瘤细胞中MHC-Ⅱ高表达的患者OS、无病生存期(disease-free survival,DFS)较差(P<0.05);而FGL1在免疫细胞和肿瘤细胞中的表达与OS、DFS无显著相关性(P>0.05)。结论:GAC患者LAG-3、MHC-Ⅱ在不同区域的表达量存在差异,GAC患者LAG-3及其配体在免疫细胞的表达对预后产生积极影响,提示免疫细胞中LAG-3/MHC-Ⅱ可以作为GAC患者预后标志物,为临床个体化免疫治疗提供新的依据。 展开更多
关键词 胃窦癌 淋巴细胞激活基因3 纤维蛋白原样蛋白1 主要组织相容性复合体Ⅱ类分子 生存 预后
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长链非编码RNA CASC15对肝细胞癌增殖、侵袭和迁移的影响及作用机制
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作者 吴东洋 蔡青山 +4 位作者 刘东 左刚刚 李树栋 刘立友 郑建兴 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2024年第1期18-29,共12页
目的探究长链非编码RNA(lncRNA)癌症易感性基因15(Cancer susceptibility candidate 15,CASC15)在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)中的分子调控机制。方法通过生物信息学方法预测目的基因表达,并分析目的基因表达与患者生存时... 目的探究长链非编码RNA(lncRNA)癌症易感性基因15(Cancer susceptibility candidate 15,CASC15)在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)中的分子调控机制。方法通过生物信息学方法预测目的基因表达,并分析目的基因表达与患者生存时间的关系;收集临床HCC患者肝癌组织和癌旁组织;CCK-8、Transwell和流式细胞术实验检测HCC细胞SMMC7721和Huh-7的增殖、侵袭、迁移以及凋亡;双荧光素酶实验检测miR-144-3p与CASC15和富含亮氨酸的重复序列蛋白1(Leucine rich repeat containing protein 1,LRRC1)的靶向关系;qRT-PCR和Western blot检测mRNA和蛋白表达情况;免疫荧光实验用于蛋白定位研究;回复实验验证CASC15/miR-144-3p/LRRC1对HCC进展的影响。体内实验验证CASC15对HCC进展的影响。结果TCGA数据库与qRT-PCR检测显示HCC组织和细胞中CASC15高表达、miR-144-3p低表达、LRRC1高表达(P<0.05)。增殖、侵袭、迁移的细胞功能实验结果表明在肿瘤发展中CASC15和LRRC1起到促进作用,miR-144-3p则是抑制作用,与凋亡实验结果一致(P<0.05)。细胞功能实验表明CASC15抑制miR-144-3p功能,miR-144-3p抑制LRRC1,CASC15与miR-144-3p结合,并导致LRRC1上调。回复实验结果表明CASC15通过抑制miR-144-3p促进LRRC1的表达从而促进HCC细胞增殖、侵袭和迁移并抑制细胞凋亡。结论CASC15可能通过调节miR-144-3p/LRRC1轴,从而促进HCC进展。 展开更多
关键词 癌症易感性基因15 miR-144-3p 富含亮氨酸的重复序列蛋白1 肝癌细胞 细胞生物学功能
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EGFR和Notch1在女性甲状腺乳头状癌组织中的表达及临床意义
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作者 李念 杨晓红 《中国社区医师》 2024年第1期9-11,共3页
目的:探讨表皮生长因子受体(EGFR)和神经源性基因Notch同源蛋白1(Notch1)在女性甲状腺乳头状癌组织中的表达及临床意义。方法:选取2019年1月—2020年1月于孝感市中心医院行手术治疗的90例女性甲状腺乳头状癌患者作为研究对象,收集其病... 目的:探讨表皮生长因子受体(EGFR)和神经源性基因Notch同源蛋白1(Notch1)在女性甲状腺乳头状癌组织中的表达及临床意义。方法:选取2019年1月—2020年1月于孝感市中心医院行手术治疗的90例女性甲状腺乳头状癌患者作为研究对象,收集其病理标本与癌旁正常甲状腺组织,采用免疫组化法检测标本中EGFR及Notch1的表达水平。比较EGFR和Notch1在甲状腺乳头状癌、癌旁正常组织中的阳性表达率,分析EGFR、Notch1表达与甲状腺乳头状癌临床病理特征,EGFR与Notch1在女性甲状腺乳头状癌组织表达的相关性。结果:EGFR和Notch1在甲状腺乳头状癌组织中的阳性表达率高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。不同年龄段甲状腺乳头状癌患者EGFR阳性表达率比较,差异无统计学意义(P>0.05);发生淋巴结转移的患者EGFR阳性表达率高于无淋巴结转移患者,差异有统计学意义(P=0.001)。不同年龄段甲状腺乳头状癌患者Notch1阳性表达率比较,差异无统计学意义(P>0.05);发生淋巴结转移的患者Notch1阳性表达率高于无淋巴结转移患者,差异有统计学意义(P=0.002)。EGFR、Notch1在女性甲状腺乳头状癌中的表达水平呈正相关(r=0.329,P=0.002)。结论:甲状腺癌组织中EGFR和Notch1呈高表达,EGFR和Notch1可能与肿瘤淋巴结转移有关,且EGFR和Notch1可能存在协同作用。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 表皮生长因子受体 神经源性基因Notch同源蛋白1 淋巴结转移
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Analysis of the autophagy gene expression profile of pancreatic cancer based on autophagy-related protein microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3 被引量:11
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作者 Yan-Hui Yang Yu-Xiang Zhang +3 位作者 Yang Gui Jiang-Bo Liu Jun-Jun Sun Hua Fan 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2019年第17期2086-2098,共13页
BACKGROUND Pancreatic cancer is a highly invasive malignant tumor. Expression levels of the autophagy-related protein microtubule-associated protein 1 A/1 B-light chain 3(LC3) and perineural invasion(PNI) are closely ... BACKGROUND Pancreatic cancer is a highly invasive malignant tumor. Expression levels of the autophagy-related protein microtubule-associated protein 1 A/1 B-light chain 3(LC3) and perineural invasion(PNI) are closely related to its occurrence and development. Our previous results showed that the high expression of LC3 was positively correlated with PNI in the patients with pancreatic cancer. In this study, we further searched for differential genes involved in autophagy of pancreatic cancer by gene expression profiling and analyzed their biological functions in pancreatic cancer, which provides a theoretical basis for elucidating the pathophysiological mechanism of autophagy in pancreatic cancer and PNI.AIM To identify differentially expressed genes involved in pancreatic cancer autophagy and explore the pathogenesis at the molecular level.METHODS Two sets of gene expression profiles of pancreatic cancer/normal tissue(GSE16515 and GSE15471) were collected from the Gene Expression Omnibus.Significance analysis of microarrays algorithm was used to screen differentially expressed genes related to pancreatic cancer. Gene Ontology(GO) analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG) pathway analysis were used to analyze the functional enrichment of the differentially expressed genes. Protein interaction data containing only differentially expressed genes was downloaded from String database and screened. Module mining was carried out by Cytoscape software and ClusterOne plug-in. The interaction relationship between the modules was analyzed and the pivot nodes between the functional modules were determined according to the information of the functional modules and the data of reliable protein interaction network.RESULTS Based on the above two data sets of pancreatic tissue total gene expression, 6098 and 12928 differentially expressed genes were obtained by analysis of genes with higher phenotypic correlation. After extracting the intersection of the two differential gene sets, 4870 genes were determined. GO analysis showed that 14 significant functional items including negative regulation of protein ubiquitination were closely related to autophagy. A total of 986 differentially expressed genes were enriched in these functional items. After eliminating the autophagy related genes of human cancer cells which had been defined, 347 differentially expressed genes were obtained. KEGG pathway analysis showed that the pathways hsa04144 and hsa04020 were related to autophagy. In addition,65 clustering modules were screened after the protein interaction network was constructed based on String database, and module 32 contains the LC3 gene,which interacts with multiple autophagy-related genes. Moreover, ubiquitin C acts as a pivot node in functional modules to connect multiple modules related to pancreatic cancer and autophagy.CONCLUSION Three hundred and forty-seven genes associated with autophagy in human pancreatic cancer were concentrated, and a key gene ubiquitin C which is closely related to the occurrence of PNI was determined, suggesting that LC3 may influence the PNI and prognosis of pancreatic cancer through ubiquitin C. 展开更多
关键词 Pancreatic cancer Autophagy-related protein microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3 Perineural invasion gene Ontology ANALYSIS Kyoto ENCYCLOPEDIA of genes and Genomes pathway ANALYSIS Ubiquitin C
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