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Proteomic analysis of the gene DR1709 mutant in Deinococcus radiodurans
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作者 TIAN Shuangqi QIN Guangyong LI Yongliang CHANG Shenghe 《Nuclear Science and Techniques》 SCIE CAS CSCD 2009年第6期331-334,共4页
DR1709 is a predicted Mn2+ transporter in Deinococcus radiodurans(D.radiodurans). The mensuration method to evaluate protein viability with two-dimensional electrophoresis in D.radiodurans and the mutants was establis... DR1709 is a predicted Mn2+ transporter in Deinococcus radiodurans(D.radiodurans). The mensuration method to evaluate protein viability with two-dimensional electrophoresis in D.radiodurans and the mutants was established in this study. The results showed that after DR1709 was disrupted, the expressions of DR1120 (acetokinase), DR1691 (heat shock protein), DR1485 (putative lipase), DR2095 (putative c-type cytochrome) and other three hypothetical proteins (DR0124, DR0047 and DR2474) were repressed. However the expression of DR1794 (putative nosX) was induced. Phenomena above suggested that the increased radiation-sensitivity of the mutant cells may be attributed to not only the protection of gene DR1709, but also the proteins' different expressions between the wild type and the mutant might also play important roles in protecting D.radiodurans from irradiation. Although DR2095 was a homologue of c-type cytochrome, it has no realitic functions. 展开更多
关键词 基因突变体 耐辐射球菌 蛋白质组 学分 细胞色素 热休克蛋白 双向电泳 测定方法
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耐辐射球菌DNA修复机制研究新进展 被引量:3
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作者 黄丽芬 陆辉明 +1 位作者 华孝挺 华跃进 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2007年第4期49-54,共6页
耐辐射球菌是迄今为止发现的最耐辐射的原核生物,是研究DNA损伤与修复的模式生物。根据国内外实验室和本实验在耐辐射球菌研究上取得的最新研究成果,本文从该细菌的结构特征、分子防御机制、重要修复基因、基因组学和蛋白质组学等方面... 耐辐射球菌是迄今为止发现的最耐辐射的原核生物,是研究DNA损伤与修复的模式生物。根据国内外实验室和本实验在耐辐射球菌研究上取得的最新研究成果,本文从该细菌的结构特征、分子防御机制、重要修复基因、基因组学和蛋白质组学等方面综述了耐辐射球菌在DNA修复机制方面取得的进展,探讨了未来揭示该细菌独特高效的DNA修复分子机理可能采取的途径。 展开更多
关键词 耐辐射球菌 DNA修复 蛋白质组学 基因组学
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耐辐射Belnapia菌株的分离和辐射后蛋白质组学分析 被引量:2
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作者 白明艳 宣慧娟 +3 位作者 李利 孙云峰 万平 杨志伟 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期169-176,共8页
从西藏土样中分离得到一株具有较强辐射抗性的革兰氏阴性菌株F-4,其16S rDNA序列与Belnapia属菌株具有很高的相似性。结合表型特点,初步将其鉴定为别尔纳普氏属(Belnapia)菌株。在UV和γ-射线辐照后,菌株F-4的D10分别为300J·m-2和4... 从西藏土样中分离得到一株具有较强辐射抗性的革兰氏阴性菌株F-4,其16S rDNA序列与Belnapia属菌株具有很高的相似性。结合表型特点,初步将其鉴定为别尔纳普氏属(Belnapia)菌株。在UV和γ-射线辐照后,菌株F-4的D10分别为300J·m-2和4000Gy,远高于辐射敏感的E.coli K12。为研究菌株F-4在蛋白质组水平对辐射的响应机制,将对数早期的F-4细胞置于1000Gyγ-射线辐照下,并在5h复苏培养后,对其可溶性蛋白进行了提取、双向电泳分析和MALDI-TOF/TOF质谱鉴定。结果表明,辐射后32个蛋白质的表达出现3倍以上的变化,其中24个蛋白质上调,8个蛋白质下调,涉及蛋白质折叠加工、能量代谢、氨基酸代谢、辅酶代谢和一些功能未知途径。本试验为研究细菌辐射抗性机制提供了一些启示。 展开更多
关键词 辐射抗性 别尔纳普氏菌 耐辐射奇异球菌 蛋白质组学分析
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Lon1蛋白酶参与耐辐射异常球菌高温胁迫及细胞分裂的功能研究 被引量:2
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作者 赵明明 唐殷 +6 位作者 郭磊周 韩佳慧 葛佳茗 孟勇 平淑珍 周正富 王劲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期149-158,共10页
Lon是一类广泛存在于生物体内的蛋白水解酶,其通过水解受损及无用蛋白,防止蛋白聚集造成的细胞伤害,在胞内氨基酸周转再利用中发挥重要作用。极端微生物耐辐射异常球菌(Deinococcus radiodurans R1)的超强非生物胁迫耐受性与其拥有功能... Lon是一类广泛存在于生物体内的蛋白水解酶,其通过水解受损及无用蛋白,防止蛋白聚集造成的细胞伤害,在胞内氨基酸周转再利用中发挥重要作用。极端微生物耐辐射异常球菌(Deinococcus radiodurans R1)的超强非生物胁迫耐受性与其拥有功能强大的胞内蛋白质稳态系统密切相关。而Lon作为蛋白水解系统的重要组成部分,在耐辐射异常球菌中的功能分析还未见具体报导。因此本研究以耐辐射异常球菌Lon1蛋白酶为研究对象,分析其逆境胁迫下的功能。结果显示lon1基因的转录受高温诱导,48℃高温胁迫蛋白组学分析显示,lon1的缺失使多个分子伴侣蛋白、参与膜功能和转运蛋白以及与DNA修复、转录调控、能量代谢等相关的蛋白表达量发生显著上调;lon1的缺失使5个参与细胞形态建成的蛋白表达量显著下调,电镜结果证实lon1缺失使细菌分裂异常,形成巨型细胞,细胞膜发生严重的损伤;非生物胁迫冲击实验发现,lon1的缺失使耐辐射异常球菌对0.2 mol/L NaCl以及48℃高温敏感。研究表明Lon1蛋白酶主要参与耐辐射异常球菌的细胞形态建成,并在适应高温等胁迫中发挥功能。 展开更多
关键词 耐辐射异常球菌 LON 非生物胁迫 蛋白质组
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基于差异蛋白质组学分析氧化应激下耐辐射奇球菌的抗氧化机制
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作者 王馥丽 魏琳洋 +4 位作者 甘巧玉 蒋辉 宋天宇 姚戈 万秀坤 《生命科学仪器》 2023年第3期54-63,共10页
耐辐射奇球菌具有极强的生命力,被吉尼斯世界记录收录并誉为是“世界上最顽强的细菌”,也作为模式生物用于抗性机制研究,电离辐射、强氧化剂等物理化学作用导致细胞产生大量具有高度细胞毒性作用的活性氧自由基,从而间接对生命体产生氧... 耐辐射奇球菌具有极强的生命力,被吉尼斯世界记录收录并誉为是“世界上最顽强的细菌”,也作为模式生物用于抗性机制研究,电离辐射、强氧化剂等物理化学作用导致细胞产生大量具有高度细胞毒性作用的活性氧自由基,从而间接对生命体产生氧化损伤,对ROS带来氧化损伤其也具有极强的抗氧化机制,对但其抗氧化机制的研究尚未完全。本研究将采用非标记定量蛋白质组学分析氧化应激下耐辐射奇球菌的抗氧化机制,基于非标记定量蛋白质组学分析,H2O2处理后的耐辐射奇球菌共检测到1853个蛋白,其中80个蛋白表达量与处理前相比具有显著差异,其中25个显著上调,55个显著下调。4h恢复培养后,耐辐射奇球菌组共检测到1853个蛋白,其中58个蛋白表达量发生显著变化,38个显著上调,20个显著下调。基于差异蛋白进行生物信息学分析并比较差异蛋白类型,我们发现H2O2氧化处理产生的差异蛋白主要富集在抵抗氧化应激胁迫等生物学过程;恢复培养4h产生的差异蛋白在恢复耐辐射奇球菌的正常生理代谢生物过程中显著富集。分析可知,在强氧化剂作用状态下,耐辐射奇球菌产生保护机制,翻译、核糖体结构相关蛋白上调以的合成更多抵御氧化损伤的蛋白,恢复培养后,重建恢复平衡相关蛋白的上调使得耐辐射奇球菌能够更快捷恢复正常生长状态。 展开更多
关键词 耐辐射奇球菌 氧化应激 抗氧化机制 蛋白质组学 非标记定量分析
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