局部放电定向超声阵列Dir-MUSIC测向算法仿真

超声波检测方法在电力设备绝缘状态检测定位中应用广泛。针对局部放电超声测向MUSIC算法存在的采样率要求高、计算复杂度大等不足,提出基于定向超声阵列信号强度信息的定向多重信号分类(directional multiple signal classification,Dir-MUSIC)算法。在阐述该算法理论模型和应用条件基础上,针对均匀圆盘超声阵列,仿真研究了不同增益方向图主瓣宽度、不同信噪比条件下Dir-MUSIC算法的测向精度。仿真结果表明8阵元阵列在-5 dB信噪比、方向图主瓣宽度为90°~120°时测向精度最高,均方根误差小于2°。最后基于研制的微型机电系统麦克风(microelectro-mechanical system,MEMS)定向超声阵列进行了测向试验,结果表明8阵元圆盘超声阵列测向均方根误差最小为2.76°,测向标准差最小为2.72°,验证了Dir-MUSIC算法的有效性与准确性。

厚朴Dirigent基因家族的挖掘与生物信息学分析

目的木脂素是药用植物厚朴中一类主要的活性物质,其合成与Dirigent(DIR)基因家族密切相关,然而厚朴中的DIR基因尚未被研究。研究旨在鉴定厚朴中的DIR基因,同时筛选出与木脂素合成相关的DIR基因。方法在获得厚朴全基因序列的基础上,利用生物信息学分析,采用本地BLAST将厚朴全基因序列与已知的模式植物拟南芥的25个DIR基因进行比对后,共筛选最终得到20个含有dirigent保守结构域的HoDIR基因,然后对这些基因进行包括蛋白质理化性质、亚细胞定位、蛋白二级结构、蛋白三级结构、保守结构域等在内的一系列生物信息学分析,并与拟南芥的25个DIR同源基因构建发育树并进行相关的分析。结果20个HoDIR基因只含有1个完整或非完整dirigent保守结构域,以及普遍存在于各HoDIR中的5种保守基序。相对分子量为18736.48 Da左右,理论等电点为5.05~10.27,碱性蛋白居多;除HoDIR4外均表现为稳定性蛋白;除HoDIR9外,均为疏水性蛋白。亚细胞定位主要位于叶绿体和细胞壁,少数位于细胞膜和细胞质。蛋白质二级结构中主要结构元件为延伸链和无规则卷曲;蛋白质三级结构大致相似,其中HoDIR6和HoDIR9与拟南芥中DIR-a亚族的AtDIR6结构极为相似。结论系统进化分析结果表明厚朴中的DIR基因分为3个亚族:DIR-a、DIR-b/d、DIR-e。其中HoDIR6和HoDIR9属于DIR-a,可能参与调控厚朴木脂素合成。对厚朴DIR基因家族的挖掘与鉴定,为厚朴木脂素的生物合成及其药效、品质的提高提供了一定的理论依据。

基于弧形阵列的局部放电Dir-MUSIC定位算法

局部放电是衡量电力设备绝缘状态的重要指标,局放检测需要解决局放源定位问题。多重信号分类(multiple signal classification,MUSIC)采用全向天线作为接收阵列,可实现多源信号的超分辨率空间谱估计,但要求高信号采样率,且在低信噪比情况下抗干扰能力不足。为此,提出基于弧形阵列的Dir(directional)-MUSIC算法,采用定向天线接收信号的强度信息,实现低信噪比下的局放源波达方向估计。设计了接收局放信号的Vivaldi天线阵列,并在不同信噪比下对算法的有效性进行仿真验证。结果表明:在低信噪比-10 dB来波方向5°下角度误差为0.14°,优于MUSIC算法;阵列在信噪比10 dB,测向范围[-80°,80°]内定位均方根误差小于1.5°。证明了基于弧形阵列的Dir-MUSIC算法有效提高了局放定位精度,且对噪声具有良好的鲁棒性,具有用于局放检测的潜力。

基于DIR-QPSO的弹丸落点定位声阵列优化布设方法

为了满足有限测点下声阵列定位精度提升的需求,提出了基于双种群量子粒子群(dual-group interaction quantum particle swarm optimization, DIR-QPSO)联合到达时差定位技术(time difference of arrival, TDOA)的单基站声阵列拓扑结构优化布设方法。首先,将声阵列中的声传感器作为粒子,利用Logistic混沌模型全局遍历性的优势初始化种群;其次,利用双种群之间信息共享优势,消除迭代过程中陷入局部最优点;再次,以TDOA模型构建适应度评价函数,得到声传感器最优布设位置;最后,通过仿真验证,得到优化后的声阵列拓扑结构。仿真结果表明,与传统六元正四棱锥阵列及QPSO优化后的阵列相比,方法将几何精度因子减小至1.351 8 m,克拉美罗下界减小至0.481 7 m,均方根误差减小至0.556 4 m。最后进行实验对比验证,实验结果表明,提出的单基站阵列具有更高的定位精度,极大提升了弹丸落点定位精度。

黄瓜DIR家族基因的全基因组鉴定及其表达分析

【目的】基于黄瓜基因组信息和转录组测序大数据,利用生物信息学手段,对黄瓜中DIR基因家族进行鉴定,并分析其在不同组织器官和胁迫响应过程中的表达模式,为后续深入研究黄瓜DIR基因的生物学功能奠定重要基础。【方法】基于已报道的DIR基因HMM模型文件,利用HMMER软件包的hmmsearch程序从黄瓜蛋白数据库中筛选出可能的DIR基因ID,并利用在线工具Pfam和SMART进行验证,最终确定黄瓜DIR家族基因。利用ExPASy、TBtools、GSDS、MEME、MEGA、MCScanX和Circos等工具分析黄瓜DIR基因家族成员的理化特征、染色体定位、基因结构、系统进化树和共线性。基于黄瓜在不同组织和胁迫响应下的转录组测序大数据,利用黄瓜V3版本基因组信息进行转录组分析,检索黄瓜DIR基因在不同转录组测序分析中的表达情况,利用TBtools软件绘制表达热图,分析黄瓜DIR基因在不同组织和胁迫响应过程中的表达模式。【结果】在黄瓜中鉴定到23个DIR家族基因,分布于7条染色体上,编码氨基酸个数在78—684,分子量8.70—73.82 kD;系统进化分析将黄瓜DIR基因家族划分为3个亚族,每个亚族中的基因结构和motif基本一致;共线性分析发现黄瓜中有12个DIR基因与拟南芥中的19个DIR基因存在27种线性关系,黄瓜中有12个DIR基因与水稻中的11个DIR基因存在19种线性关系,而黄瓜中另外8个DIR基因比较保守,既不与拟南芥中的DIR基因存在共线性,也不与水稻中的DIR基因存在共线性;组织特异性表达分析发现有些黄瓜DIR基因在根、茎、花、果实、叶片等所有组织器官中的表达量均较低或不表达,有些黄瓜DIR基因在所有组织器官中的表达量均较高,而有些黄瓜DIR基因只在特定组织中表达,但在其他组织中不表达或低表达,表明不同的黄瓜DIR基因具有组织特异性表达模式;黄瓜DIR家族基因在胁迫响应过程中的表达模式分析发现CsaV3_4G023490在黄瓜非生物胁迫和生物胁迫响应过程中均发生上调表达,表明该基因在黄瓜生长发育过程中发挥着重要作用。【结论】在黄瓜中共鉴定到23个DIR家族基因,分为3个亚族,每个亚族内的基因成员保守性高,不同亚族间的基因结构和蛋白保守结构域有所不同。黄瓜DIR基因在不同组织器官和胁迫响应下的表达模式具有差异性,协同调控了黄瓜的生长发育。

陆地棉Dirigent-like基因(GhDIR)的克隆与分析

Dirigent-like基因(DIR)编码蛋白质参与木质素的形成,与植物体的病菌防御有关。本研究以抑制差减杂交(SSH)技术获得DIR的EST为信息探针,对棉花EST数据库进行同源搜索和序列拼接,获得了全长为768 bp的DIR基因cDNA全长,将该基因命名为GhDIR。该基因序列的开放阅读框(ORF)位于70～594 bp,推测编码175个氨基酸残基的蛋白。用陆地棉基因组DNA和cDNA分别进行了PCR扩增验证,克隆测序结果表明,所得GhDIR序列与电子克隆序列完全一致,没有内含子。序列比对和系统进化分析表明,该基因与海岛棉的同源序列表现了最高的相似性,与其他双子叶植物同源序列的相似性次之,而与单子叶植物同源序列的相似性较远。实时定量PCR表达谱分析表明,该基因在陆地棉幼苗根部受黄萎病菌诱导表达。

小豆Dirigent基因家族鉴定及锈菌侵染对不同成员表达的影响

为明确Dirigent (DIR)基因在小豆抗锈病中的作用,采用生物信息学方法,对小豆DIR基因家族(VaDIRs)进行了全基因组鉴定,结果发现小豆中共有33个DIR基因,其中29个成员分别定位在8条染色体上,系统进化分析表明,VaDIRs包括DIR-a、DIR-b/d、DIR-e和DIR-f四个亚家族,对VaDIRs成员启动子区顺式作用元件的分析发现,VaDIRs启动子区均包含激素、病原体应答等元件。对小豆抗锈病品种接种后不同时间的转录组数据分析发现,差异表达基因中共有17个VaDIRs成员,其中6个于接种后24 h显著上调,2个于接种后24 h和48 h均高量表达。进一步应用qRT-PCR技术对上述8个基因在抗、感品种中应答锈菌侵染的表达分析表明,高抗品种中VaDIR14、VaDIR16和VaDIR33的表达量在锈菌侵染不同阶段均显著高于感病品种。上述结果表明,VaDIRs家族成员可作为正调节因子参与小豆对锈病的抗性。

DiR-PEG-PLGA荧光纳米囊的制备、表征及体外生物相容性评价

目的:制备并表征包载荧光染料1,1′-二十八烷基-3,3,3′,3′-四甲基吲哚三碳花青碘(Di R)的聚乙二醇-聚乳酸-羟基乙酸共聚物(Di R-PEG-PLGA)纳米囊,评价其体外生物相容性。方法:以聚乳酸-羟基乙酸共聚物(PLGA)、聚乙二醇(PEG)-PLGA共混物为载体,采用改良的超声乳化法制备Di R-PEG-PLGA纳米囊样品。对样品的粒径、Zeta电位、形貌、稳定性、体外荧光特性等进行检测;采用MTT试验评价样品对人源性HL7702肝细胞的体外细胞毒性,采用体外溶血试验考察其对健康Wistar大鼠血细胞的溶血作用。结果:所制备的Di R-PEG-PLGA纳米囊呈圆球形,具有明显核壳结构,平均粒径为(507.53±7.87)nm,粒径的多分散系数为0.306 1±0.001 5,Zeta电位为(-35.20±0.92)m V;4℃条件下保存6个月,稳定性较好;体外荧光信号强度(y)随Di R质量浓度(x)呈线性增加,线性方程为y=0.345 2x+0.433 4(R2=0.997 3)。所制纳米囊对HL7702细胞的毒性为0~1级(即无细胞毒性),对大鼠血细胞无体外溶血作用。结论:本研究成功制备了具有荧光特性的Di R-PEG-PLGA纳米囊;所制纳米囊体外生物相容性较好,有望成为一种安全的药物光学示踪载体。

柽柳dir基因的克隆及序列分析

在柽柳cDNA文库测序中获得了dir基因的全长cDNA序列,去除PolyA后,该基因全长为724bp,其中5′非翻译区26bp,3′非翻译区143bp,开放阅读框(ORF)长555bp,编码184个氨基酸.基因编码蛋白的分子量为19·69kD,理论等电点为6·96·疏水性分析表明,蛋白的前41个氨基酸为亲水性的.dir基因编码的蛋白质参与木质素的形成,与植物体的病菌防御有关.该基因的Genbank登录号为DQ462418(基因)和ABE73781(蛋白).

苯并三氮唑型超DIR成色剂的合成及应用研究

以黄成色剂为母体合成了七只苯并三氮唑型超DIR成色剂 ,总收率 6 5 % ,对该系列成色剂在黄、品、青三层中的应用性能进行了测定。结果表明该系列成色剂普遍具有较强的DIR效应 ,以 5 %比例应用时可使染料云颗粒度降低 1 5 2 %。

日本新DIR成色剂的开发

本文介绍日本富士与小西六胶片公司近年来新开发的DIR(释放显影抑制剂)成色剂,有电子转移型定时DIR成色剂、漂白流出型定时DIR成色剂、水解型DIR成色剂及放出含DI释放剂的成色剂(DIRR成色剂)。阐明了它们的应用原理及其使用效果。

番茄DIR基因家族鉴定及其对非生物胁迫响应的分析

【目的】鉴定番茄DIR基因家族所有成员,并对其基因结构、编码蛋白的理化性质、系统进化、染色体定位、共线性、启动子元件、表达模式、互作转录因子及内源竞争RNA预测等进行了解析,为探究DIR在番茄生长发育和逆境胁迫中的作用提供参考。【方法】采用生物信息学方法,基于全基因组数据对番茄DIR基因家族成员进行鉴定,运用Phytozome、MEME、PlantCARE、opsRNATarget和plantcircnet等在线网站获取染色体位置、保守基序、顺式作用元件、存在互作的转录因子、miRNA和circRNA等信息。利用Mapteace、TBtools、Cytoscape、OmicShare等作图软件及工具绘制染色体定位图、进化树、DIR与转录因子关系图、ceRNA网络等。采用NCBI的基因数据库结合转录组测序及qRT-PCR试验研究DIR基因家族在逆境下的表达情况。【结果】共鉴定到番茄中27个DIR基因,将其命名为SlDIR1—SlDIR27,分别位于12条染色体上,且大部分基因位于染色体末端,其基因结构、基序和结构域相对保守,其中22个SlDIR具有一个外显子的经典结构。番茄DIR基因家族同拟南芥的共线性关系远高于水稻和大豆。基于系统进化关系将27个番茄DIR成员分为3个不同的亚家族。转录组数据表明大部分DIR基因在番茄根部具有较高的表达量。此外,DIR基因的启动子区域含有多个与干旱、低温等非生物胁迫,以及MeJA、ABA、SA等激素诱导相关的顺式作用元件,且预测到与激素、生长发育、非生物胁迫相关的ERF、E2F/DP、MYB等互作转录因子。结合转录组数据分析,分别有5、10、10和13个SlDIR在农药、干旱、盐和冷胁迫后显著上调表达,其中,SlDIR23受到以上4种胁迫的诱导表达,而SlDIR8、SlDIR13和SlDIR20特异性响应冷胁迫的诱导,SlDIR17特异性响应盐胁迫。番茄DIR的ceRNA调控表明,miR-156与靶基因SlDIR8可能共同作用调控番茄的逆境胁迫。【结论】共鉴定出番茄DIR家族基因27个,不均匀地分布在12条染色体上,在根部有较高的表达量。SlDIR1、SlDIR13和SlDIR14等具有MeJA、ABA、SA等激素响应元件,其中,SlDIR6仅具有MeJA元件,SlDIR27仅具有SA响应元件。另外,SlDIR2、SlDIR14、SlDIR23等参与干旱、盐、低温等多种逆境胁迫,其中SlDIR23在不同胁迫处理下均可被激活。此外,DIR基因和转录因子、非编码RNA相互作用,共同参与调控番茄植株的逆境胁迫。

柯达定时超DIR成色剂

本文概述了柯达公司1988年提出的定时超DIR成色剂的结构及作用机理,并例举了制备及应用实例。

连翘2个DIR基因的分子特征与表达分析

目的:克隆连翘DIR基因并分析其分子特征和表达特性。方法:克隆两条连翘的DIR基因全长序列,并采用实时荧光定量PCR法对该基因在连翘不同组织以及茉莉酸甲酯诱导下的表达进行分析。结果:克隆得到两个DIR基因(FsDIR1,MF168408;FsDIR2,MF168409),长度分别为558 bp和564 bp,编码氨基酸数目分别为185和187;系统进化树分析表明,FsDIR1属于DIR-a亚家族,FsDIR2属于DIR-b/d亚家族。连翘不同组织实时荧光定量PCR结果表明FsDIR1和FsDIR2在花瓣中表达量最低,而在雌蕊中最高。茉莉酸甲酯诱导后,叶片中连翘苷和连翘酯苷A含量升高,但FsDIR1和FsDIR2的表达量均显著下降。结论:本研究克隆了两个连翘DIR基因,为研究DIR基因在连翘木脂素类化合物生物合成及参与植物的抗性反应中的功能奠定了基础。

直接修改DOS使DIR命令能够列出隐含文件及目录

DOS 5.0中利用带参数的DIR命令,可以列出盘中的隐含文件及隐含目录,然而DOS 3.3X版本中却没有此功能。笔者曾编制了一个具有六个功能的查询隐含文件及目录的实用程序[参见本刊94.2期],但它较适合于集中、大量查找显示的情况。当仅查看当前所处的子目录下的隐含文件及目录时(而不是全盘中的),假若上面的查询实用程序不在当前目录下,则必须退出该目录并进入到查询程序所在的目录中。这样,仅仅为了查看当前目录。

DIR的缺憾及弥补

MS DOS 5.0以上版本对DIR命令的功能作了较大的扩充,使之不仅可以列出普通的文件名和子目录名,还可以有选择地列出具有隐藏或其它属性的文件名和子目录名;不仅可以列出当前目录下的文件名和子目录名,还可以列出整个盘上的文件名和子目录名。大大地方便了用户的目录操作。 可是笔者在使用中发现,如果希望列出整个盘上各级子目录中的所有隐藏文件和子目录名。

新一代电力ICT网络中基于DiR保护环的生存性路由算法

电力通信网中对业务的可靠性保护占用过多的网络资源,通过研究智能电网业务的可靠性要求对网络资源利用率的影响,提出了一种基于区分可靠性保护环的生存性路由算法。在网络单链路失效条件下,以链路代价和链路失效概率为约束条件,通过寻找最小通路代价的保护环,使连接请求建立在满足失效概率要求和最小化通路代价的光通道上。仿真结果表明,所提算法提高了网络资源的利用效率,满足智能电网的可靠性需求,减少了网络资源的占用,性能优于传统方法。

朝仓花椒DIR基因家族的鉴定及分析

本研究通过NCBI的BLAST比对分析,最终从朝仓花椒转录组数据库筛选出28条朝仓花椒Dirigent(DIR)蛋白家族的编码基因序列。利用MEGA、MEME、DNAMAN等软件对该蛋白家族进行生物信息学分析,结果显示:从朝仓花椒转录组中获得的28个DIR基因,经过鉴定,在进化上分为6个小组,每个小组的基因数量分别为7、5、1、0、5、10。该家族的蛋白等电点均小于7,均偏酸性,且多数属于稳定蛋白。多基因序列比对比发现,该家族蛋白均具有一个高保守性的DIR结构域。空间结构的分析预测ZpDIR蛋白多为多链线性折叠卷曲蛋白,且以线性无链非规则多链卷曲蛋白为主。

DIR-MCFC中催化剂抗碱中毒的研究

总结了直接内重整熔融碳酸盐燃料电池(DIR-MCFC)的碱中毒问题,讨论了内重整催化剂中毒,碱影响催化剂的催化活性等关键问题,从催化剂改良、设置阻碱隔板和优化操作条件等3个方面,论述了DIR-MCFC中催化剂抗碱中毒的研究进展,指出了需要关注的一些关键问题。