【目的】研究远端缺失同源盒3(distal-less homeobox 3,DLX3)基因在结肠癌中的表达情况,探讨DLX3在癌症产生与进展过程中起到的作用和临床意义。【方法】利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)得到结肠癌公共数据集,获取DLX...【目的】研究远端缺失同源盒3(distal-less homeobox 3,DLX3)基因在结肠癌中的表达情况,探讨DLX3在癌症产生与进展过程中起到的作用和临床意义。【方法】利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)得到结肠癌公共数据集,获取DLX3 mRNA表达谱和患者相关的临床信息。利用相关生物信息学方法,分析DLX3在结肠癌中的表达量与临床病理指标的相关性以及对预后的影响。用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测DLX3在结肠癌中调控的可能通路。【结果】由TCGA数据库结肠癌数据集分析可得,DLX3在肿瘤组织中呈高表达,表达量与年龄、TNM分期和肿瘤有无转移显著相关(P<0.05)。DLX3高表达的患者总体生存期明显低于DLX3低表达的患者(P<0.05)。多因素COX回归分析提示DLX3的表达水平、年龄及TNM分期是影响结肠癌患者总体生存期的独立危险因素(P<0.05)。DLX3高表达的样本存在Wnt/β-catenin和Kras两个通路基因集的富集(P<0.05,FDR<0.25)。【结论】DLX3可能在结肠癌的发生发展过程中起到重要作用,具备成为判断结肠癌预后和潜在治疗靶点的临床应用前景。展开更多
文摘【目的】研究远端缺失同源盒3(distal-less homeobox 3,DLX3)基因在结肠癌中的表达情况,探讨DLX3在癌症产生与进展过程中起到的作用和临床意义。【方法】利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)得到结肠癌公共数据集,获取DLX3 mRNA表达谱和患者相关的临床信息。利用相关生物信息学方法,分析DLX3在结肠癌中的表达量与临床病理指标的相关性以及对预后的影响。用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测DLX3在结肠癌中调控的可能通路。【结果】由TCGA数据库结肠癌数据集分析可得,DLX3在肿瘤组织中呈高表达,表达量与年龄、TNM分期和肿瘤有无转移显著相关(P<0.05)。DLX3高表达的患者总体生存期明显低于DLX3低表达的患者(P<0.05)。多因素COX回归分析提示DLX3的表达水平、年龄及TNM分期是影响结肠癌患者总体生存期的独立危险因素(P<0.05)。DLX3高表达的样本存在Wnt/β-catenin和Kras两个通路基因集的富集(P<0.05,FDR<0.25)。【结论】DLX3可能在结肠癌的发生发展过程中起到重要作用,具备成为判断结肠癌预后和潜在治疗靶点的临床应用前景。
