龙眼Dlf3h基因的克隆、表达及其生物信息学分析

本研究应用聚合酶链式反应(PCR)技术对龙眼黄烷酮-3-羟化酶基因(Dlf3h)进行克隆;运用实时荧光定量PCR (Quantitative real time PCR)技术对Dlf3h基因在龙眼根、茎、叶组织中的表达进行分析;采用生物信息学方法对Dlf3h蛋白理化性质、信号肽、亚细胞定位、亲疏水性、二级结构、三级结构等进行预测。结果表明:成功克隆获得一条长度为1 098 bp的Dlf3h基因,由366个氨基酸组成;该基因在根中表达量最高,其次为叶,在茎中表达量最低;生物信息学分析表明Dlf3h没有信号肽和跨膜结构,是一种可溶性亲水蛋白,定位于细胞核内;二级结构元件主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,具有卷曲螺旋;Ramachandran评估表明应用SWISS-MODEL构建的三级结构模型可靠,其配体结合位点为217 His和275 His。本研究结果为进一步研究龙眼类黄酮合成的分子调控机制提供依据。