意大利蜜蜂DnaJC28的生物信息学分析

DnaJ家族基因在动植物热激胁迫响应过程发挥重要作用。前期,我们通过转录组数据筛选到意大利蜜蜂响应热激胁迫的热激蛋白家族的一个基因DnaJC28。本文旨在运用生物信息学的方法分析意大利蜜蜂DnaJC28理化性质、跨膜区、保守结构域、核定位和亚细胞定位、信号肽序列、修饰位点(磷酸化和糖基化)、同源性分析、亲缘关系、互作蛋白和蛋白质结构。理化性质分析得到:DnaJC28相对分子量约42389.89Da,含有115个氨基酸残基,是一种带正电的亲水性蛋白质。跨膜区预测分析结果显示:DnaJC28蛋白质不含有跨膜结构域,可能属于胞外蛋白。保守结构域预测显示:意大利蜜蜂DnaJC28蛋白质存在保守的J结构域,主要通过刺激重要伴侣Hsp70的ATP酶活性发挥作用。核定位和亚细胞定位预测结果显示:DnaJC28被预测为有极大的概率在细胞核中发挥作用,但发现在预测的DnaJC28编码蛋白中不存在经典的核定位信号。对此可解释为在热激胁迫条件下,定位于细胞质的亚型可以转移至细胞核内。信号肽预测结果显示:DnaJC28蛋白质无信号肽,属于非分泌性蛋白质。蛋白质修饰位点预测结果分析显示:DnaJC28蛋白质存在24个潜在的磷酸化位点和7个O-糖基化位点。蛋白质同源性预测结果显示:DnaJC28蛋白质具有保守性,可能在不同物种中发挥重要作用。亲缘关系预测结果显示:意大利蜜蜂的DnaJC28与蜜蜂属的大蜜蜂和蜜蜂科熊蜂属的欧洲熊蜂亲缘关系相近。蛋白质互作预测结果显示:意大利蜜蜂DnaJC28与Ac3和LOC552769这两种蛋白互作的可能性最高。蛋白质结构预测结果显示:二级结构主要包括α螺旋17个和无规则卷曲18个,不含β折叠结构。本研究可为进一步研究意大利蜜蜂DnaJC28的结构和功能提供参考。