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题名葱蝇Dorsal基因的克隆·表达及生物信息学分析
被引量:1
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作者
魏慧敏
陈斌
任爽
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机构
重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所
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出处
《安徽农业科学》
CAS
2012年第17期9332-9335,共4页
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基金
国家自然科学基金项目(30870340
31071968)
+1 种基金
重庆市教委科学技术研究项目(KJ100620)
重庆师范大学校级基金重点项目(2011XLZ12)
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文摘
[目的]探讨Dorsal与葱蝇滞育发育的关系。[方法]以葱蝇(Delia antiqua)为试虫,采用RACE方法克隆了葱蝇Dorsal的全长cDNA序列;将该序列推导的氨基酸序列在GenBank搜寻同源序列,与搜寻到的14个代表性昆虫Dorsal序列进行相似性比较,并进行系统进化分析;采用半定量RT-PCR方法分析了Dorsal基因在葱蝇非滞育、夏滞育、冬滞育蛹中的表达情况。[结果]克隆了葱蝇Dorsal基因的cDNA序列,全长2 412 bp,开放阅读框1 974 bp,编码657个氨基酸,等电点PI约8.5,分子量72.9 kDa。与GenBank中的其他14个昆虫代表性Dorsal序列相似性比较和进化分析显示葱蝇的Dorsal与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、拟暗果蝇(Drosophlia pseudoob-scura)的Dorsal序列相似性最大。半定量分析显示葱蝇Dorsal基因在葱蝇冬滞育、夏滞育、非滞育蛹滞育发育关键期的表达量均明显升高,尤其在滞育后期表达量最高,初步判断Dorsal基因与葱蝇滞育发育相关。[结论]为进一步开展Dorsal基因在昆虫滞育发育过程中的功能研究奠定了基础。
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关键词
dorsal基因
葱蝇
RACE
序列分析
系统发育树
半定量分析
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Keywords
dorsal
Delia antiqua
RACE
Sequence analysis
Phylogenetic analysis
Semi-quantitative RT-PCR
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分类号
S763.41
[农业科学—森林保护学]
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