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牛呼吸道合胞体病毒一步法实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用
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作者 梁晓珊 宁鹏 +6 位作者 李小龙 鲍显伟 李昊 石亚楠 王雪妍 郭雪莲 许立华 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第3期94-98,共5页
为建立一种牛呼吸道合胞体病毒(Bovine respiratory syncytial virus, BRSV)快速简便的检测方法,本研究基于BRSV M基因保守区序列,设计特异性引物及探针,通过优化反应条件,建立用于BRSV检测的一步法实时荧光定量PCR,并验证了该方法的敏... 为建立一种牛呼吸道合胞体病毒(Bovine respiratory syncytial virus, BRSV)快速简便的检测方法,本研究基于BRSV M基因保守区序列,设计特异性引物及探针,通过优化反应条件,建立用于BRSV检测的一步法实时荧光定量PCR,并验证了该方法的敏感性、特异性和重复性;同时利用建立的检测方法对采集的临床样本进行检测。结果表明:本研究所建立的BRSV荧光定量检测方法,其特异性好,仅对BRSV存在特异性扩增;敏感性高,最低可达10 copies/μL;稳定性好,组内变异系数和组间变异系数小。使用所建立的BRSV一步法实时荧光定量PCR对宁夏地区94份临床样品进行检测,阳性率为5.3%(5/94)。上述结果表明,本研究建立的检测方法可为BRSV的快速诊断提供有力的技术支持。 展开更多
关键词 牛呼吸道合胞体病毒 实时荧光定量pcr M基因 诊断
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猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF7基因实时荧光定量PCR检测方法的建立
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作者 安乐乐 罗迅 +2 位作者 杨宣叶 胡欣妍 赵永清 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第9期1681-1688,共8页
为建立一种快速、高效检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的实时荧光定量PCR方法,本研究根据GenBank公布的中国流行PRRSV病毒株基因序列,制备包含PRRSV ORF7基因的重组质粒标准品,同时,针对PRRSV保守区域ORF7基因序列设计特异性引物和探... 为建立一种快速、高效检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的实时荧光定量PCR方法,本研究根据GenBank公布的中国流行PRRSV病毒株基因序列,制备包含PRRSV ORF7基因的重组质粒标准品,同时,针对PRRSV保守区域ORF7基因序列设计特异性引物和探针,并优化引物和探针终浓度,建立PRRSV Taq Man实时荧光定量PCR检测方法。以质粒标准品为模板构建检测方法线性模型,评估灵敏度、重复性和特异性,并在疑似临床样品中初步应用。本研究建立的PRRSV Taq Man荧光定量PCR检测方法线性关系良好,线性决定系数为0.9975;病毒载量检测限度为1μL 3.32×10^(1)拷贝;变异系数在组内和组间重复中均小于1.500%;仅与PRRSV发生特异性反应,未与其他病毒发生交叉反应。临床样品qPCR检测阳性率为36.92%,高于PCR检测阳性率(26.15%),阳性符合率为100%。基于PRRSV ORF7基因构建的Taq Man荧光定量PCR检测方法线性关系良好、灵敏度高、重复性好、特异性强,可快速、高效检测临床样品PRRSV,为PRRSV早期诊断、及时防控和流行病学调查提供了科学的技术支撑。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征 ORF7基因 Taq Man实时荧光定量pcr 早期诊断
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鉴别猪伪狂犬病病毒gI/gE基因部分缺失疫苗株和野毒株的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立
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作者 李倩倩 黄英 +7 位作者 陈翔鸿 宋文博 杨柳 龙云志 余道兵 梁巩 黄超 汤细彪 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期68-74,共7页
为建立一种鉴别猪伪狂犬病病毒(PRV)gI/gE基因部分缺失疫苗株和野毒株的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法,本试验依据PRV HB-98株和HB2000株的gE和gI基因缺失片段设计特异性引物和探针,优化反应体系,绘制标准曲线,进行特异性试验和敏感性... 为建立一种鉴别猪伪狂犬病病毒(PRV)gI/gE基因部分缺失疫苗株和野毒株的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法,本试验依据PRV HB-98株和HB2000株的gE和gI基因缺失片段设计特异性引物和探针,优化反应体系,绘制标准曲线,进行特异性试验和敏感性试验,对临床样本和疫苗样本进行检测,并与商品化试剂盒的检测结果进行对比。结果显示,本试验建立的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的标准曲线R^(2)为0.9971;该方法特异性强,能区分PRV与其他常见的猪病原体;敏感性高,最低检测限为10 copies/μL;对临床样本的检测结果与商品化试剂盒的检测结果一致;能够区分PRV gI/gE基因部分缺失的疫苗株和野毒株。结果表明,本试验建立了一种特异性强、灵敏度高、适用范围广的鉴别诊断PRV gI/gE基因部分缺失疫苗株和野毒株的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病病毒(PRV) gI/gE基因部分缺失疫苗株 鉴别诊断 TaqMan实时荧光定量pcr
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应用同源基因定量PCR方法快速检测Down综合征 被引量:2
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作者 邹永华 倪斌 +1 位作者 谢智群 叶志纯 《中国优生与遗传杂志》 2001年第2期16-17,共2页
本文设计一对引物 ,用聚合酶链反应同时扩增位于 2 1号染色体的人肝型磷酸果糖激酶基因 (PFKL -CH2 1)以及与其高度同源的位于 1号染色体上人肌型磷酸果糖激酶基因 (PFKM -CH1) ,然后同光密度扫描进行定量比较分析 ,结果显示 ,在 31例... 本文设计一对引物 ,用聚合酶链反应同时扩增位于 2 1号染色体的人肝型磷酸果糖激酶基因 (PFKL -CH2 1)以及与其高度同源的位于 1号染色体上人肌型磷酸果糖激酶基因 (PFKM -CH1) ,然后同光密度扫描进行定量比较分析 ,结果显示 ,在 31例正常人这两个同源基因的扩增产量比值 0 .939± 0 .16 1;而 16例Down综合征患者的比值约为 1.5 89± 0 .16 4,两组相比有高度显著性差异 (P <0 .0 0 1) ,正常组与异常组的比值分布不存在重叠区 ,阴阳性结果易于判断 ,因此这种同源基因定量聚合酶联反应有可能发展成一种新的快速诊断Down综合征的方法。 展开更多
关键词 同源基因 定量聚合酶链反应 down综合征 快速诊断
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应用荧光定量PCR产前诊断21三体综合征 被引量:2
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作者 经承学 谢湘芝 +1 位作者 张茜 许代娣 《广西医学》 CAS 2004年第5期624-626,共3页
目的 建立荧光定量PCR技术产前检测 2 1三体综合征。方法 采用PCR方法同时扩增位于 2 1号染色体上的人肝型磷酸果糖激酶基因 (humanliver typephosphofructokinasegene ,PFKL CH2 1 )和位于 1号染色体上的人肌型磷酸果糖激酶基因(huma... 目的 建立荧光定量PCR技术产前检测 2 1三体综合征。方法 采用PCR方法同时扩增位于 2 1号染色体上的人肝型磷酸果糖激酶基因 (humanliver typephosphofructokinasegene ,PFKL CH2 1 )和位于 1号染色体上的人肌型磷酸果糖激酶基因(humanmuscle typephosphofructkinasegene ,PFKM CH1 ) ,使用SYBRGreenⅠ荧光染料处理产物、琼脂糖电泳后在凝胶成像系统进行分析 ,得出扩增产物的荧光强度对比值。用此方法检测 2 0例 2 1三体综合征患儿和 2 1例正常人外周血及 1 1例孕妇绒毛或脐带血。结果  2 6例 2 1三体综合征患儿PFKL CH2 1 /PFKM CH1 扩增产物的荧光强度对比值为 1 5 98± 0 1 78,而正常人PFKL CH2 1 /PFKM CH1 扩增产物的荧光强度对比值为 1 0 0 0± 0 0 5 0 ,两者间差别有显著意义。 1 0例孕妇绒毛或脐带血细胞DNA的PFKL -CH2 1 /PFKM -CH1 扩增产物的荧光强度对比值均在 1 0 0± 0 1 0之间 (正常人 x± 2SD) ,1例为 1 5 8,与染色体核型分析结果相符合。结论 SYBRGreenⅠ荧光定量PCR技术产前检测 2 1三体综合征具有准确、快速、安全、实用等特点 ,有较高的临床使用价值。 展开更多
关键词 荧光定量pcr技术 产前诊断 21三体综合征 染色体病 凝胶成像系统
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改良多重实时荧光定量PCR法测定抑癌基因MGMT、p16、CDH13和RASSF1A甲基化在肺癌早期诊断中的作用 被引量:6
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作者 钟云华 李燕 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2019年第1期33-38,共6页
目的:建立改良多重实时荧光定量PCR法,检测抑癌基因MGMR、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化,探讨其在肺癌早期诊断中的应用。方法:选取30例病理确诊为肺癌的患者作为肺癌组,30例病理确诊为良性病变的患者作为对照组。建立改良实时荧光定量... 目的:建立改良多重实时荧光定量PCR法,检测抑癌基因MGMR、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化,探讨其在肺癌早期诊断中的应用。方法:选取30例病理确诊为肺癌的患者作为肺癌组,30例病理确诊为良性病变的患者作为对照组。建立改良实时荧光定量PCR体系。检测受试者血清MGMT、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化,对比两组基因甲基化阳性率,计算四项基因甲基化单独及联合用于肺癌早期诊断的敏感度和特异度。结果:肺癌组受试者血清MGMT、p16、CDH13和RASSF1A显著高于对照组(P<0.05);MGMT、p16、CDH13和RASSF1A四项基因甲基化联合检测用于肺癌早期诊断的敏感度和特异度显著高于单项指标检测(P<0.05)。结论:建立了多重实时荧光定量PCR法用于MGMT、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化检测,联合检测用于肺癌早期诊断具有较高的敏感度和特异度。 展开更多
关键词 改良多重实时荧光定量pcr 抑癌基因 MGMT P16 CDH13 RASSF1A 肺癌早期诊断
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D21S11位点定量PCR快速基因诊断先天愚型 被引量:1
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作者 张励 金春莲 +2 位作者 李福才 王若梅 孙开来 《中国优生与遗传杂志》 1999年第5期3-4,共2页
为了探讨定量PCR方法在分子水平对Down 综合征基因诊断意义,本实验以STR(D21S11) 做为遗传标记,合成特异引物对11 例正常人(6 例外周血,5 例羊水)及28 例先天愚型患者外周血进行同位素标记PCR 扩增后... 为了探讨定量PCR方法在分子水平对Down 综合征基因诊断意义,本实验以STR(D21S11) 做为遗传标记,合成特异引物对11 例正常人(6 例外周血,5 例羊水)及28 例先天愚型患者外周血进行同位素标记PCR 扩增后定量分析,结果显示11 例正常人中10 人呈DNA 含量为1 :1 关系的两条电泳带,1 人为1 条带。28 例患者中24 人呈DNA含量为2 :1 的两条带,3 人为DNA 含量为1 :1:1 关系的三条带,1 人为1 条带。实验表明D21S11 位点STR多态是对Down 综合征基因诊断很有应用价值的遗传标记,应用定量PCR的方法可在24 小时内对先天愚型做出快速、准确的产前及临床基因诊断。 展开更多
关键词 先天愚型 定量pcr 基因诊断 染色体病
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猪繁殖与呼吸综合征病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:3
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作者 吴忆春 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第2期20-24,共5页
为建立猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法,采用RT-PCR扩增PRRSV N基因266bp片段,并克隆到pMD18-T载体中,以纯化的重组质粒为模板进行荧光定量PCR扩增,建立了PRRSV荧光定量PCR检测方法,该方法检测灵敏... 为建立猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法,采用RT-PCR扩增PRRSV N基因266bp片段,并克隆到pMD18-T载体中,以纯化的重组质粒为模板进行荧光定量PCR扩增,建立了PRRSV荧光定量PCR检测方法,该方法检测灵敏度可达1.3×101拷贝/μL,与猪瘟病毒(CSFV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪日本脑炎病毒(JEV)均不发生交叉反应,具有很好的特异性和重复性。结果表明,建立的PRRSV实时荧光定量PCR具有特异、敏感、快速、定量、重复性好等优点,可用于临床猪繁殖与呼吸综合征病毒病(PRRS)的诊断。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 N基因 实时荧光定量pcr
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实时荧光定量PCR检测宫腔脱落细胞中P27^(kip1)及cylin E基因的表达及意义
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作者 李菊香 潘云燕 +8 位作者 曹玲 文惠方 葛万文 杨佩琦 沈明辉 张尚弟 常运朝 胡巍 车团结 《检验医学与临床》 CAS 2015年第12期1681-1683,共3页
目的探讨宫腔脱落细胞中P27kip1、cyclin E基因的表达在子宫内膜癌早期诊断中的意义。方法收集健康志愿者及子宫内膜癌患者宫腔脱落细胞样本共80例;提取总RNA,采用实时荧光定量PCR法检测目的基因的表达,比较健康志愿者及子宫内膜癌患者... 目的探讨宫腔脱落细胞中P27kip1、cyclin E基因的表达在子宫内膜癌早期诊断中的意义。方法收集健康志愿者及子宫内膜癌患者宫腔脱落细胞样本共80例;提取总RNA,采用实时荧光定量PCR法检测目的基因的表达,比较健康志愿者及子宫内膜癌患者宫腔脱落细胞中P27kip1、cyclin E基因表达量的差异。结果荧光定量PCR结果显示,P27kip1基因在健康志愿者宫腔脱落细胞中的表达显著高于子宫内膜癌患者,差异有统计学意义(P<0.05),并随恶性程度升高,P27kip1的表达水平降低,两者比较差异有统计学意义(P<0.05);cyclin E基因的表达随恶性程度的增高而增高,两者比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论联合检测P27kip1和cyclin E基因可作为子宫内膜癌早期诊断的依据。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 子宫内膜癌 P27KIP1 CYCLIN E 早期诊断
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用实时荧光定量PCR选择急性呼吸窘迫综合征患者血清microRNA内参照基因
10
作者 李建春 毛璞 +7 位作者 李希 潘莹 吴苏龙 庞晓清 许智恒 黄勇波 刘晓青 黎毅敏 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2015年第3期166-169,共4页
目的探讨用实时荧光定量PCR检测急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者血清微小RNA(microRNA,miRNA)的表达并选择最优内参照基因。方法用实时荧光定量PCR检测40例ARDS患者及20例体检健康者血清中5个miRNA候选内参照基因miR-16-5p、miR-93-5p、mi... 目的探讨用实时荧光定量PCR检测急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者血清微小RNA(microRNA,miRNA)的表达并选择最优内参照基因。方法用实时荧光定量PCR检测40例ARDS患者及20例体检健康者血清中5个miRNA候选内参照基因miR-16-5p、miR-93-5p、miR-101-3p、miR-191-5p和U6,并用ge Norm法、Norm Finder法、bestkeeper法和相对△Ct法4种算法分析内参照基因稳定性,通过对4种算法稳定值进行排序并计算几何均数的方法分析综合稳定值。结果比较5个候选内参照基因在ARDS患者和体检健康者的表达水平,差异均无统计学意义(P均>0.05)。4种算法综合分析显示,miR-16-5p以最小的稳定值1.32成为综合稳定性最高的内参照基因,其次是miR-101-3p、U6、miR-93-5p和miR-191-5p。结论实时荧光定量PCR法确定ARDS患者血清miRNA最优的内参照基因为miR-16-5p。 展开更多
关键词 急性呼吸窘迫综合征 实时荧光定量pcr 血清微小RNA 内参照基因
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非损伤性PCR-ELISA定量法产前诊断唐氏综合征
11
作者 马晓丽 孙海基 《中国优生与遗传杂志》 2003年第4期28-28,52,共2页
目的 探讨非损伤性PCR -ELISA定量法产前诊断在预防唐氏综合征患儿出生中的应用价值。方法 对 2 0 0例孕 14~ 17w来我院进行孕期保健的孕妇 ,利用快速一步法半定量金标法进行产前筛查。富集阳性孕妇外周血中胎儿有核红细胞 ,并提取其... 目的 探讨非损伤性PCR -ELISA定量法产前诊断在预防唐氏综合征患儿出生中的应用价值。方法 对 2 0 0例孕 14~ 17w来我院进行孕期保健的孕妇 ,利用快速一步法半定量金标法进行产前筛查。富集阳性孕妇外周血中胎儿有核红细胞 ,并提取其DNA进行Down′sPFKL、PFKM特异性引物扩增、PCR -ELISA定量诊断。结果 筛查出 1例阳性孕妇 ,非损伤性PCR -ELISA定量法进一步诊断此孕妇为阳性。结论 非损伤性PCR -ELISA定量法 ,将使唐氏综合征的防治成为可能。 展开更多
关键词 非损伤pcr-ELISA 产前诊断 唐氏综合征
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牛传染性鼻气管炎病毒SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测方法的建立及应用 被引量:13
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作者 任亚初 楚会萌 +8 位作者 程凯慧 解晓莉 张亮 孙阳阳 杨美 杨宏军 唐月新 刘文浩 李开荣 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1032-1036,共5页
为快速定量检测牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV),本研究根据IBRV的 D基因保守序列,设计合成一对特异性引物,建立了能够快速检测IBRV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法。特异性试验结果显示,该方法与引起牛消化道和呼吸道疾病的其它几种病毒均... 为快速定量检测牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV),本研究根据IBRV的 D基因保守序列,设计合成一对特异性引物,建立了能够快速检测IBRV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法。特异性试验结果显示,该方法与引起牛消化道和呼吸道疾病的其它几种病毒均无交叉反应,特异性较强;敏感性试验结果显示,该方法对质粒标准品的最低检出限达6.1×10~1拷贝/μL,敏感性较高且高于普通PCR方法;重复性实验结果显示,批内、批间变异系数均小于3.0%,重复性良好。利用该方法检测了3个规模化奶牛场送检的47份奶牛鼻拭子样品,结果显示检出了12份阳性样品,与常规PCR检测方法的相比,总符合率为97.87%。本研究建立的检测IBRV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法准确可靠,为IBRV的早期快速检测和定量分析提供了技术支撑。 展开更多
关键词 牛传染性鼻气管炎 荧光定量pcr GD基因 诊断
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基于实时荧光定量PCR技术检测桑丁香假单胞菌 被引量:5
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作者 包奇 曹梦琪 +6 位作者 周雨 郑煜 李长龙 王海燕 王俊 盛晟 吴福安 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期210-218,共9页
由桑丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae pv.mori,以下简称Psm)引起的桑疫病是一种毁灭性的桑树细菌性病害,建立对病原菌的早期检测技术,有利于及时制定病害的防控技术措施。依据致病性相关基因hrp Z的片段设计的一对引物能够在Psm中特... 由桑丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae pv.mori,以下简称Psm)引起的桑疫病是一种毁灭性的桑树细菌性病害,建立对病原菌的早期检测技术,有利于及时制定病害的防控技术措施。依据致病性相关基因hrp Z的片段设计的一对引物能够在Psm中特异性地扩增出195 bp大小的条带,而用于对其他致病变种的丁香假单胞菌和其他种属病原菌的扩增则没有此条带。利用Psm14-7菌株基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR(q PCR)扩增,模板DNA质量浓度在6×10^(-5)~6 ng/μL范围内与扩增所得Ct值呈现良好的线性关系,线性方程为y=-3.224 69x+14.034 45(R^2=0.997 09),检测的最低限为(60±0.001 2)fg/μL;以Psm14-7菌液为模板进行q PCR,菌液浓度在1×10~2~1×10~8CFU/m L范围内与Ct值呈现良好的线性关系,线性方程为y=-4.562 15x+46.911 67(R^2=0.988 72),最低检测限为(10~2±0.008 3)CFU/m L。于桑树植株人工接种Psm后不同时间,对出现各种症状植株中的菌群数量进行q PCR检测,结果显示:接种后的第4~8天可能为病原菌诱导桑树的过敏性反应和系统获得性抗性关键时期,影响到了Psm的增殖速度;能引起健康桑树暴发桑疫病的致病菌最低浓度为(1.5×10~8±0.076 8)CFU/g。建立的q PCR检测方法,对由Psm引起的桑疫病的田间早期诊断和及时防控具有一定指导意义。 展开更多
关键词 桑疫病 桑丁香假单胞菌 HRP Z基因 实时荧光定量pcr 早期诊断
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定量荧光PCR在唐氏综合征快速产前诊断中的应用研究 被引量:5
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作者 王希玲 蒋秀蓉 王仁礼 《生殖与避孕》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期214-219,共6页
目的 :了解中国人 D2 1 S1 1、D2 1 S1 2 70、D2 1 S2 2 6、D2 1 S1 41 1四个短串联重复序列 ( STR)位点的多态性信息含量 ( PIC) ,建立定量荧光 PCR快速产前诊断唐氏综合征的方法。方法 :以染色体2 1 q2 1~ q2 2 .3区段内四个短串联... 目的 :了解中国人 D2 1 S1 1、D2 1 S1 2 70、D2 1 S2 2 6、D2 1 S1 41 1四个短串联重复序列 ( STR)位点的多态性信息含量 ( PIC) ,建立定量荧光 PCR快速产前诊断唐氏综合征的方法。方法 :以染色体2 1 q2 1~ q2 2 .3区段内四个短串联重复序列作为遗传标记 ,采用定量荧光 PCR对 5 0例正常人外周血 DNA进行分析 ,计算中国人该四对 STR位标的多态性信息含量 ( PIC) ,并用该方法对 1 1例正常孕妇羊水 DNA进行分析 ,及对唐氏综合征血清生化指标筛查阳性孕妇羊水标本进行产前诊断。结果 :D2 1 S1 1、D2 1 S1 2 70、D2 1 S2 2 6、D2 1 S1 41 1的多态性信息含量分别是 0 .90 2、0 .889、0 .5 2 1、0 .775 ,建立了定量荧光 PCR产前诊断唐氏综合征的方法。应用该技术产前诊断出 3例唐氏综合征患儿 ,并经染色体核型分析所证实。结论 :以上四对 STR在中国人中均具有较高多态性信息含量 ,可应用于唐氏综合征的定量荧光 展开更多
关键词 短串联重复序列 定量荧光pcr 唐氏综合征 产前诊断
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利用实时荧光定量PCR技术快速诊断唐氏综合征的研究 被引量:2
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作者 黄仲军 朱健生 +6 位作者 尹耕心 国天义 翟勇 汪竞成 徐东岚 杜华荣 傅克勤 《中国计划生育学杂志》 2012年第5期346-348,共3页
目的:建立实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)技术,快速诊断唐氏综合征。方法:应用RT-qPCR方法同时扩增位于21号染色体上的唐氏综合征特异区域基因片段(DSCR3)和12号染色体上的磷酸甘油醛脱氢酶基因,根据相对定量指标ΔCT值区分唐氏综... 目的:建立实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)技术,快速诊断唐氏综合征。方法:应用RT-qPCR方法同时扩增位于21号染色体上的唐氏综合征特异区域基因片段(DSCR3)和12号染色体上的磷酸甘油醛脱氢酶基因,根据相对定量指标ΔCT值区分唐氏综合征患者和正常人。结果:正常人组和唐氏综合征患者组ΔCT值差异有统计学意义(P<0.001),且无交叉重叠。结论:RT-qPCR技术快速诊断唐氏综合征方法可行,具有简单、快速、特异性高等特点。 展开更多
关键词 唐氏综合征 实时荧光定量聚合酶链反应 相对定量 快速诊断
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DDK综合症部分相关基因的实时定量PCR分析 被引量:1
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作者 陈修栋 桂宏翔 +4 位作者 赵枭阳 王善强 杨亚蒙 景亚星 郑振宇 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2013年第7期141-144,149,共5页
为筛选与DDK综合症相关的基因,对其中4个表达量差异显著的基因(EGF、Bcl-2、Mcl-1、EGF-R)进行荧光定量PCR分析,以确定这些基因是否和DDK综合症相关。选用8~10周龄的清洁级小鼠,雌雄比例1∶1方式合笼交配,以DDK♀×BALB/c♂交配组... 为筛选与DDK综合症相关的基因,对其中4个表达量差异显著的基因(EGF、Bcl-2、Mcl-1、EGF-R)进行荧光定量PCR分析,以确定这些基因是否和DDK综合症相关。选用8~10周龄的清洁级小鼠,雌雄比例1∶1方式合笼交配,以DDK♀×BALB/c♂交配组合为试验组、BALB/c♀×BALB/c♂交配组合为对照组,依据胚胎发育时间,对植入前期2细胞期、4细胞期、8细胞期的胚胎进行观察和采集,提取总RNA并进行反转录,应用荧光定量PCR技术,比较所选的候选基因在不同交配组合中各胚胎时期的表达差异。结果表明,与对照组相比,EGF、Bcl-2、Mcl-1 3个基因在3个时期表达差异都极显著;EGF-R基因在4细胞期、8细胞期2个时期表达差异极显著。表明DDK综合症和所选的4个候选基因的作用相关。 展开更多
关键词 DDK综合症 荧光定量pcr 基因差异表达分析
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甲基化荧光定量PCR快速检测自闭症男童中脆性X综合征的临床应用 被引量:1
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作者 陈剑虹 黄淑君 +2 位作者 马健 周伟平 张亮 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第2期142-145,211,共5页
目的建立一种经济、快速的检测男性脆性X综合征检测方法。方法应用甲基化实时荧光定量PCR法(qMSP)检测已知脆性X综合征男性患者和正常男性的脆性X智力低下基因1(FMR1)启动子区甲基化状态,测试该方法的灵敏度和特异性。应用该方法对特殊... 目的建立一种经济、快速的检测男性脆性X综合征检测方法。方法应用甲基化实时荧光定量PCR法(qMSP)检测已知脆性X综合征男性患者和正常男性的脆性X智力低下基因1(FMR1)启动子区甲基化状态,测试该方法的灵敏度和特异性。应用该方法对特殊学校54例自闭症男童进行病因学检查,并对阳性样本用侧翼PCR(F⁃PCR)进行复核。结果在特殊学校的54例自闭症男童样本中发现1例FMR1甲基化阳性,F⁃PCR方法复核为CGG重复数为全突变,其母亲为前突变携带者。结合临床症状,该自闭症男童可以确诊为脆性X综合征,检出率为1.85%(1/54)。结论本文所建立的qMSP方法可以对FMR1基因的CpG甲基化状态进行快速分析,可作为男性疑似脆性X综合征检测的可靠方法。 展开更多
关键词 脆性X综合征 FMR1基因 甲基化荧光定量pcr
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实时荧光定量PCR技术的优化及其在恙虫病东方体诊断中的应用 被引量:5
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作者 何凤屏 徐新 +9 位作者 王江桥 柯昌文 罗君 唐建红 周海燕 王箭 周建英 管振祺 刘玉兰 郑礼杰 《国际检验医学杂志》 CAS 2012年第12期1422-1424,共3页
目的建立一种优化的实时荧光定量PCR技术,并用于诊断粤北山区恙虫病东方体(Ot)基因型。方法采用优化实时荧光定量PCR技术对感染Ot的患者和鼠类的血液和组织标本检测Ot DNA载量并分析其基因型,并与未优化实时荧光定量PCR和巢式PCR的检测... 目的建立一种优化的实时荧光定量PCR技术,并用于诊断粤北山区恙虫病东方体(Ot)基因型。方法采用优化实时荧光定量PCR技术对感染Ot的患者和鼠类的血液和组织标本检测Ot DNA载量并分析其基因型,并与未优化实时荧光定量PCR和巢式PCR的检测结果进行比较。结果采用优化实时荧光定量PCR技术检测660例发热患者,有224例检测到Ot,其中108例是发热5d内的早期患恙虫病患者,以及在55份鼠类的标本中有12份能检测到感染Ot,均为Gilliam型;未优化实时荧光定量PCR在患病7d以上才能检测到Ot。同时,在鼠类基因扩增片段还显示出与Gilliam、Karp、Kato3株国际参考株不同,经巢式PCR分型证实为Kawasaki型,与巢式PCR基因分型的结果相符。结论优化实时荧光定量PCR技术可作为早期诊断恙虫病的实验方法,用于快速分析Ot基因型,适合在基层医院推广应用。 展开更多
关键词 恙虫病东方体 聚合酶链反应 基因分型
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qPCR快速检测金黄色葡萄球菌及MRSA方法的建立及评价 被引量:2
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作者 窦宇红 梁鸿 +4 位作者 何玥 刘和录 刘琼 马彩凤 李玉霞 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2018年第9期764-769,共6页
目的建立q PCR法快速检测金黄色葡萄球菌及其mec A基因,以期快速精准诊断金黄色葡萄球菌感染及初步判断耐药情况。方法从NCBI数据库下载金黄色葡萄球菌nuc、atl、ica B、fnb A、hla、srap基因序列用于鉴定标志筛选,mec A基因序列用于MRS... 目的建立q PCR法快速检测金黄色葡萄球菌及其mec A基因,以期快速精准诊断金黄色葡萄球菌感染及初步判断耐药情况。方法从NCBI数据库下载金黄色葡萄球菌nuc、atl、ica B、fnb A、hla、srap基因序列用于鉴定标志筛选,mec A基因序列用于MRSA标志筛选;经DNA MAN比对后,选择各基因保守区分别设计1~2套引物、探针,建立单重及双重q PCR,用临床分离株及标准菌株筛选出检测性能最好的基因片段作为检测标志物,建立金黄色葡萄球菌鉴定和耐药双重q PCR检测方法,并进行性能评价。结果经筛选,金黄色葡萄球菌atl基因(CP009361.1:1010217~1010341)、mec A基因(KF058908.1:1715~1843)两片段检测性能最优,将其作为标志物建立双重q PCR法。该方法的检测下限均低至4 copies/反应;扩增线性范围均达2.0×102~8copies/m L。335份金黄色葡萄球菌(含94份MRSA)培养阳性的患者样本中,q PCR法分别检出SA 335份,MRSA 94份;95份金黄色葡萄球菌培养阴性的患者样本中,q PCR法分别检出SA 17份,MRSA 4份,经PCR产物测序,与标准菌株同源性均≥90%。双重q PCR法从样品处理到报告结果≤2.0 h。结论 q PCR法方法简便、快速、灵敏度高、特异性好,可望提高金黄色葡萄球菌感染的诊断能力并实现快速检测,为尽早精准治疗赢得时间。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 MRSA atl基因 MECA基因 精准诊断 qpcr
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Quantitative Detection of ID4 Gene Aberrant Methylation in the Differentiation of Myelodysplastic Syndrome from Aplastic Anemia
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作者 Mian-Yang Li Yuan-Yuan Xu +8 位作者 Hui-Yuan Kang Xin-Rong Wang Li Gao Jian Cen Wei Wang Nan Wang Yong-Hui Li Li-Li Wang Li Yu 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2015年第15期2019-2025,共7页
Background:The diagnosis of myelodysplastic syndrome (MDS),especially hypoplastic MDS,and MDS with low blast counts or normal karyotype may be problematic.This study characterized ID4 gene methylation in patients w... Background:The diagnosis of myelodysplastic syndrome (MDS),especially hypoplastic MDS,and MDS with low blast counts or normal karyotype may be problematic.This study characterized ID4 gene methylation in patients with MDS and aplastic anemia (AA).Methods:The methylation status ofID4 was analyzed by bisulfite sequencing polymerase chain reaction (PCR) and quantitative real-time methylation-specific PCR (MethyLight PCR) in 100 patients with MDS and 31 patients with AA.Results:The MDS group had a higher ID4 gene methylation positivity rate (22.22%) and higher methylation levels (0.21 [0-3.79]) than the AA group (P 〈 0.05).Furthermore,there were significant differences between the hypoplastic MDS and AA groups,the MDS with low blast count and the AA groups,and the MDS with normal karyotype and the AA groups.The combination of genetic and epigenetic markers was used in much more patients with MDS (62.5% [35/56]) than the use of genetic markers only (51.79% [29/56]).Conclusions:These results showed that the detection ofID4 methylation positivity rates and levels could be a useful biomarker for MDS diagnosis. 展开更多
关键词 diagnosis ID4 gene Myelodysplastic syndrome METHYLATION quantitative
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