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基于网络药理学和分子对接探讨独活续断汤治疗腰椎间盘突出症作用机制
被引量:
4
1
作者
谷金玉
万田豪
+5 位作者
李法杰
候晓宙
夏迪
李凯明
贾海光
张清
《辽宁中医药大学学报》
CAS
2023年第1期66-73,共8页
目的 从网络药理学和分子对接角度探讨独活续断汤治疗腰椎间盘突出症(lumbar disc herniation,LDH)的潜在作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索获得候选中药成分,并借助SwissTargetPrediction、TargetNet、CTD、GeneCards、DisGeNET等数...
目的 从网络药理学和分子对接角度探讨独活续断汤治疗腰椎间盘突出症(lumbar disc herniation,LDH)的潜在作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索获得候选中药成分,并借助SwissTargetPrediction、TargetNet、CTD、GeneCards、DisGeNET等数据库对药物成分靶点和腰椎间盘突出症靶标进行检索筛选,将药物成分靶点与疾病靶标取交集,通过CytoScape 3.8.0软件进行可视化构建“中药-有效成分-治疗靶点”网络,借助STRING 11.0数据库构建PPI蛋白互作网络,并进行拓扑分析,筛选出网络中发挥重要作用的蛋白质。将潜在治疗靶点导入RStudio软件并利用clusterProfiler包对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后,利用AutoDock Vina(Vina)平台分子对接,对活性化合物和关键靶点相结合的活性进行验证。结果通过筛选共获得116个潜在治疗靶点。独活续断汤中槲皮素、山柰酚、β谷甾醇等成分对AKT1、IL6、STAT3、TP53、MAPK1、VEGFA等相关靶点通过IL-17、TNF等信号通路以下调炎症因子、调控成骨细胞及破骨细胞分化和生长、下调细胞中自噬水平、抑制脂肪生成及氧化应激等功能治疗腰椎间盘突出症。分子对接验证显示活性化合物与相应关键靶点具有较好的结合能力。结论 总体上预测了独活续断汤治疗LDH的活性成分、作用靶点和通路,为独活续断汤治疗LDH实验研究和临床应用提供了科学参考和方向。
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关键词
独活
续断
汤
腰椎间盘突出症
网络药理
分子对接
潜在靶点
信号通路
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨独活续断汤治疗腰椎间盘突出症作用机制
被引量:
4
1
作者
谷金玉
万田豪
李法杰
候晓宙
夏迪
李凯明
贾海光
张清
机构
中国中医科学院望京医院
中国中医科学院西苑医院
出处
《辽宁中医药大学学报》
CAS
2023年第1期66-73,共8页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助项目(ZZ15-XY-PT-12)
中国中医科学院科技创新工程-重大攻关项目(中医骨伤学科)专项(CI2021A02003)
首都卫生发展科研专项项目(2018-2-4162)。
文摘
目的 从网络药理学和分子对接角度探讨独活续断汤治疗腰椎间盘突出症(lumbar disc herniation,LDH)的潜在作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索获得候选中药成分,并借助SwissTargetPrediction、TargetNet、CTD、GeneCards、DisGeNET等数据库对药物成分靶点和腰椎间盘突出症靶标进行检索筛选,将药物成分靶点与疾病靶标取交集,通过CytoScape 3.8.0软件进行可视化构建“中药-有效成分-治疗靶点”网络,借助STRING 11.0数据库构建PPI蛋白互作网络,并进行拓扑分析,筛选出网络中发挥重要作用的蛋白质。将潜在治疗靶点导入RStudio软件并利用clusterProfiler包对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后,利用AutoDock Vina(Vina)平台分子对接,对活性化合物和关键靶点相结合的活性进行验证。结果通过筛选共获得116个潜在治疗靶点。独活续断汤中槲皮素、山柰酚、β谷甾醇等成分对AKT1、IL6、STAT3、TP53、MAPK1、VEGFA等相关靶点通过IL-17、TNF等信号通路以下调炎症因子、调控成骨细胞及破骨细胞分化和生长、下调细胞中自噬水平、抑制脂肪生成及氧化应激等功能治疗腰椎间盘突出症。分子对接验证显示活性化合物与相应关键靶点具有较好的结合能力。结论 总体上预测了独活续断汤治疗LDH的活性成分、作用靶点和通路,为独活续断汤治疗LDH实验研究和临床应用提供了科学参考和方向。
关键词
独活
续断
汤
腰椎间盘突出症
网络药理
分子对接
潜在靶点
信号通路
Keywords
duhuo
xuduan
decoction
(
独活
续断
汤
)
lumbar disc herniation
network pharmacology
molecular docking simulation
potential target
signal path
分类号
R681.53 [医药卫生—骨科学]
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作者
出处
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1
基于网络药理学和分子对接探讨独活续断汤治疗腰椎间盘突出症作用机制
谷金玉
万田豪
李法杰
候晓宙
夏迪
李凯明
贾海光
张清
《辽宁中医药大学学报》
CAS
2023
4
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参考文献
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