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广东省登革Ⅰ型病毒E/NS1基因片段核苷酸序列分析 被引量:2
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作者 郑夔 江立敏 +2 位作者 罗会明 何剑峰 董新民 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期382-384,共3页
目的 分析广东省 1979~ 1999年不同地区登革Ⅰ型病毒地方分离株和国外毒株之间的遗传关系 ,并探讨其可能来源。方法 提取病毒RNA ,用一步法逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)扩增E/NS1连接区基因片断 ,克隆于pBluescriptⅡSK质粒上进行序... 目的 分析广东省 1979~ 1999年不同地区登革Ⅰ型病毒地方分离株和国外毒株之间的遗传关系 ,并探讨其可能来源。方法 提取病毒RNA ,用一步法逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)扩增E/NS1连接区基因片断 ,克隆于pBluescriptⅡSK质粒上进行序列测定 ,并将测序结果与Genbank中其他登革Ⅰ型病毒E/NS1基因片段的 2 4 0bp核苷酸进行比较 ,用计算机软件分析结果。结果 广东省分离到的 14株登革Ⅰ型毒株中 ,基本可分为两个基因亚型 ,它们与印度尼西亚毒株的核苷酸最大同源性为 99 2 % ,与菲律宾毒株的核苷酸最大同源性为 10 0 % ,与泰国毒株的核苷酸最大同源性为 98 8%。结论 广东省的登革Ⅰ型病毒可能来源于菲律宾、印度尼西亚和泰国等东南亚和西太平洋国家。 展开更多
关键词 广东 登革I型病毒 e/ns1基因片段 核革酸序列分析 登革热病毒 登革热 逆转录聚合酶链反应
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庚型肝炎病毒杭州株E_2/NS_1基因区的克隆及序列分析
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作者 陈勇 洪艳 +2 位作者 杨连华 凌志强 俞为群 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期29-30,共2页
目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2 /NS1区部分核酸序列。方法 选择 1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者 ,从其血清中分离HGVRNA ,通过逆转录套式聚合酶链反应(RT nPCR)法 ,扩增该散发性HGV(HZ 2株 )E2 /NS1区部分cDNA片段 ,然后克隆... 目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2 /NS1区部分核酸序列。方法 选择 1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者 ,从其血清中分离HGVRNA ,通过逆转录套式聚合酶链反应(RT nPCR)法 ,扩增该散发性HGV(HZ 2株 )E2 /NS1区部分cDNA片段 ,然后克隆到质粒 pGEX 4T 3中 ,并进行核苷酸序列分析。结果 HGV杭州株与河北株 (HGVC96 4、美国株 )(HGU44 40 2 )的核苷酸同源性为 92 5 %和 89 8% ,氨基酸同源性为 98 0 %和 93 9%。 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 e2/ns1基因 CDNA克隆 序列分析
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散发性庚型肝炎病毒部分核苷酸序列分析
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作者 陈勇 洪艳 《浙江省医学科学院学报》 2000年第1期1-3,共3页
目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2/NS1区部分核苷酸序列。方法 选择1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者,从其血清中分离HGVRNA,通过逆转录-套式聚合酶链反应(RT-nPCR)法,扩增该散发性HGV(HZ-2株)E2/NS1区部分cDNA片段,然后克隆... 目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2/NS1区部分核苷酸序列。方法 选择1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者,从其血清中分离HGVRNA,通过逆转录-套式聚合酶链反应(RT-nPCR)法,扩增该散发性HGV(HZ-2株)E2/NS1区部分cDNA片段,然后克隆到质粒pGEX-4T-3中,并进行核苷酸序列分析结果 HGV杭州株与河北株(HGVC964)、美国株(HGU44402)的核苷酸同源性为92.5%和89.8%。氨基酸同源性为98.0%和93.9%。结论 该项研究将为HGV诊断试剂盒 的研制及基因工程疫苗的研制提供资料。 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 e2/ns1基因 CDNA克隆 序列分析
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广东登革Ⅰ型病毒株变异性的初步研究 被引量:1
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作者 王振果 唐青 赵秀芹 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期160-163,共4页
目的 通过探讨广东部分登革Ⅰ型病毒的变异性 ,初步了解我国毒株的可能来源。方法 对来自广东省不同年代的登革Ⅰ型毒株LD 2 5 (1985年 )、LD 36 (1991年 )和登革Ⅰ型血清 95 142(1995年 ) ,采用RT PCR方法扩增其E/NS1部分基因片段 ... 目的 通过探讨广东部分登革Ⅰ型病毒的变异性 ,初步了解我国毒株的可能来源。方法 对来自广东省不同年代的登革Ⅰ型毒株LD 2 5 (1985年 )、LD 36 (1991年 )和登革Ⅰ型血清 95 142(1995年 ) ,采用RT PCR方法扩增其E/NS1部分基因片段 ,然后克隆测序。将所测序列中的 2 40bp的片段与国际上已知的多个登革Ⅰ型毒株的相应序列进行比较 ,并以 6 %的核苷酸差异 (divergence)作为分亚型的标准。结果 LD 2 5与LD 36、95 142分别属于两个不同的亚型 ,其中LD 2 5与泰国 1980年毒株及中国台湾 1987年、1988年毒株的同源性高达 (97 1~ 98 8) % ,属于一个亚型。LD 36和 95 142则与菲律宾 (1988年 )、澳大利亚 (1981年 )、印度尼西亚 (1978年 )及瑙鲁 (1974年 )等地的毒株同源性高达(97 5~ 10 0 ) % ,同属于另一个亚型。结论 广东登革Ⅰ型病毒可能不仅是从一个地方传入 ,来源比较复杂。 展开更多
关键词 登革病毒 e/ns1基因 核苷酸序列 变异性
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