河南汉族人群Penta E基因座的群体遗传学与法医学应用评价

目的通过对河南汉族无关个体常染色体的短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性的调查,了解相应群体遗传学数据在法医学应用中的意义。方法在河南随机选取1000例无血缘关系个体,提取静脉血DNA,用Golden Eye_20A荧光标记复合系统进行检验,得到STR分型后,用相关软件进行统计分析并计算法医学应用参数。结果河南地区汉族群体Penta E基因座发现27个等位基因,其基因型分布符合Hardy-Weiberg平衡(P>0.05)。其个人识别能力(DP)和非父排除率(PE)为0.957和0.835。结论Penta E基因座在群体遗传学研究和法医学个人识别中有较高的应用价值。

Penta E基因座的遗传多态性及稀有等位基因分析

目的研究福建地区汉族群体PentaE基因座的遗传多态性并对出现的稀有等位基因进行分析，探讨该基因座的遗传学应用价值。方法采用聚合酶链反应一短串联重复序列技术对851名福建汉族无关个体进行PentaE基因座多态性分析，测定稀有等位基因的DNA序列，并统计分析494个亲权鉴定案例（共计674次减数分裂）中PentaE基因座的突变情况。结果在851名福建汉族无关个体中，共发现PentaE基因座的26个等位基因，基因频率范围为0．0006～0．1528；共检出7个稀有等位基因，并首次获得稀有等位基因28．4的DNA序列[AAAGA]29。统计福建汉族群体PentaE基因座的遗传学参数，其中多态信息含量为0．91，非父排除率为0．817，个体识别率为0．986及突变率为0．0015。结论福建汉族群体的PentaE基因座具有高度的多态性及较低的突变率，具有良好的遗传学应用前景。DNA测序技术对稀有等位基因的确认及命名具有重要的价值。

一例大片段重复序列Penta E基因座off-ladder等位基因的测序鉴定

目的鉴定一例Penta E基因座的罕见大片段短串联重复序列(short tandem repeat,STR)分型标准外(off ladder,OL)等位基因的序列构成。方法用PowerPlex■21检测系统对一对父女进行STR分型。用Chelex-100法提取其DNA,进行Penta E基因座的PCR扩增,纯化回收扩增片段后进行克隆测序。结果Penta E基因座检出OL等位基因,根据其片段大小,推测为26等位基因。Penta E基因座中的OL等位基因含有26个[AAAGA]重复,是一个新的等位基因,涉及重复单元完整的重复。结论对于STR分型中出现的分型标准外的等位基因或微变异等位基因宜进行测序分析,对于OL等位基因的正确分型将丰富STRBase数据库,对提高基因座个体识别和亲权鉴定能力具有十分重要的意义。

重庆苗族群体Penta E基因座遗传多态性

Penta E基因座位于人类第15号染色体长臂上,该基因座在不同人种、不同地区的遗传多态性具有一定的差异。本文对重庆苗族451个无关个体的血样进行Penta E基因座的多态性进行调查,为相关研究和应用提供数据支持[1]。1材料与方法1.1样本来源血液样本来自重庆市苗族居民聚居地区的451名无关个体。

Penta E基因座稀有等位基因32的确认

1案例资料1.1简要案情本鉴定中心日常检案中一起亲子鉴定案件,案件样本为血液样本。1.2初次检验采用chelex-100方法提取血液样本DNA,使用AGCU EX22人类荧光标记STR复合扩增检测试剂(无锡中德美联生物技术有限公司)在9700扩增仪(美国Applied Biosystems公司)上进行复合PCR扩增,使用3130XL型号遗传分析仪(美国Applied Biosystems公司)进行毛细管电泳,使用GeneMapper ID v3.2软件处理电泳数据。

淋巴细胞抗原6复合物基因座E抑制新型冠状病毒不同变异株刺突蛋白介导的感染侵入

目的研究淋巴细胞抗原6复合物,基因座E(lymphocyte antigen 6 complex,locus E,LY6E)对新型冠状病毒(severe acute respiratpry syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)不同变异株刺突蛋白(spike protein,S蛋白)介导的感染侵入的抑制作用。方法构建来源于人的血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)表达质粒;建立Flp-In T-Rex 293/LY6E诱导表达细胞系和Flp-In T-Rex 293/氯霉素乙酰转移酶(chloramphenicol acetyltransferase,CAT)诱导表达细胞系,转染人ACE2表达质粒,并通过免疫印迹方法检测ACE2和LY6E在T-Rex 293细胞中的表达情况;构建SARS-CoV-2(Wuhan-Hu-1株系、D614G突变株系、Delta突变株系,以及Omicron BA.1、BA.2、BA.2.12.1、BA.3、BA.4/5、BF.7突变株系)和拉沙热病毒(Lassa fever virus,LASV)假病毒感染系统,利用假病毒荧光素酶报告基因检测LY6E对SARS-CoV-2及其突变株刺突蛋白介导侵入的抑制作用;通过Nano-Glo活细胞检测系统,检测LY6E对SARS-CoV-2突变株刺突蛋白介导的合胞体形成的抑制作用;构建甲型流感病毒(influenza A virus,IAV)假病毒感染系统,经两性霉素B处理后,利用假病毒荧光素酶报告基因检测LY6E对SARS-CoV-2及其突变株刺突蛋白介导侵入的抑制作用。结果构建的Flp-In T-Rex293/LY6E诱导表达细胞系对SARS-CoV-2(Wuhan-Hu-1株系、D614G突变株系、Delta突变株系,以及Omicron BA.1突变株系)假病毒侵入细胞有明显抑制作用,SARS-CoV-2假病毒感染四环素(tetracycline,Tet)处理组与非处理组的相对感染率差异有统计学意义[SARS-CoV-2野生型株系假病毒(WTpp):t=33.920,P<0.001;SARS-CoV-2突变株系假病毒(D614Gpp):t=31.478,P<0.001;Deltapp:t=30.257,P<0.001;Omicronpp:t=21.041,P<0.001];LY6E对SARS-CoV-2不同突变株S蛋白介导的合胞体形成有明显抑制作用,LY6E表达组与未表达组的相对荧光单位差异有统计学意义(D614G:t=18.90,P<0.001;Delta:t=22.28,P<0.001;BA.1:t=8.995,P<0.001;BA.2:t=13.57,P<0.001;BA.2.12.1:t=15.48,P<0.001;BA.3:t=13.65,P<0.001;BA.4/5:t=16.74,P<0.001;BF.7:t=22.29,P<0.001);两性霉素B处理没有改变Flp-In T-Rex 293/LY6E诱导表达细胞系对SARS-CoV-2(Wuhan-Hu-1株系、D614G突变株系、Delta突变株系,以及Omicron BA.1突变株系)假病毒侵入细胞的抑制作用,也没有改变LY6E对IAV感染的增强作用,IAV假病毒感染Tet处理组与非处理组的相对感染率差异有统计学意义(t=3.343,P<0.05)。结论LY6E抑制SARS-CoV-2野生型(Wuhan-Hu-1株系)及多种突变株(D614G突变株系、Delta突变株系,以及Omicron突变株系)刺突蛋白介导的感染侵入;两性霉素B没有改变LY6E对SARS-CoV-2(Wuhan-Hu-1株系、D614G突变株系、Delta突变株系,以及Omicron突变株系)的抑制作用。