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思茅松HDR基因全长cDNA克隆与序列分析
被引量:
5
1
作者
王毅
周旭
+3 位作者
毕玮
杨宇明
李江
王娟
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期721-727,共7页
1-羟基-2-甲基-2-E-丁烯基-4-焦磷酸还原酶(HDR)是甲基-D-赤藓醇-4-磷酸(MEP)途径中的最后一个酶,在植物萜类生物合成中起主控作用。该研究根据思茅松(Pinus kesiya var.langbianensis)树皮转录组数据分析结果,首先获得了思茅松HDR基因...
1-羟基-2-甲基-2-E-丁烯基-4-焦磷酸还原酶(HDR)是甲基-D-赤藓醇-4-磷酸(MEP)途径中的最后一个酶,在植物萜类生物合成中起主控作用。该研究根据思茅松(Pinus kesiya var.langbianensis)树皮转录组数据分析结果,首先获得了思茅松HDR基因片段,然后根据所获得的基因片段设计特异引物,提取受伤后的思茅松树皮的RNA,并运用RT-PCR和RACE技术从思茅松树皮中克隆得到完整的HDR基因(Pk HDR)。生物信息学分析表明:克隆获得的Pk HDR1基因c DNA全长序列为1 876 bp,含有1个1 464 bp的开放阅读框(ORF),编码487个氨基酸。同源性分析结果表明:思茅松HDR蛋白与赤松(Pinus densiflora)HDR蛋白的相似性高达99%。亚细胞定位及结构域分析结果表明:思茅松Pk HDR氨基酸序列中包含转运肽序列(A1-A61)及植物HDR蛋白多个保守的功能位点(A143,A234,A288,A371)。系统进化分析结果表明:Pk HDR蛋白与赤松HDR蛋白的亲缘关系最为接近。半定量PCR检测结果表明:树皮的创伤促进思茅松HDR基因的表达。该研究成功克隆获得HDR基因,并确定其与松脂代谢密切相关,为阐明思茅松松脂生物合成机制和分子育种提供了参考。
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关键词
思茅松
CDNA
克隆
基因功能分析
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职称材料
氨气对4~6周龄肉鸡免疫器官中MUC5AC及E-cd基因表达的影响
2
作者
张进良
刘洪涌
+5 位作者
郭艳
李晴
杨广礼
张辽
崔艳艳
席丽
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第7期1-5,共5页
为了研究鸡处于高浓度氨气环境中免疫系统的变化,试验采用实时荧光定量PCR方法检测经15,30,60,0 mg/m3氨气处理(A~D组)后的4~6周龄肉鸡法氏囊、胸腺及脾脏等免疫器官中相关免疫基因MUC5AC和E-cd的表达情况。结果表明:6周龄时,B组肉鸡法...
为了研究鸡处于高浓度氨气环境中免疫系统的变化,试验采用实时荧光定量PCR方法检测经15,30,60,0 mg/m3氨气处理(A~D组)后的4~6周龄肉鸡法氏囊、胸腺及脾脏等免疫器官中相关免疫基因MUC5AC和E-cd的表达情况。结果表明:6周龄时,B组肉鸡法氏囊中MUC5AC与E-cd基因的相对表达水平为D组的10倍左右(P<0.05);胸腺中MUC5AC基因相对表达水平为D组的5倍左右(P<0.05),E-cd基因相对表达水平也升高但与D组比较差异不显著(P>0.05);脾脏中MUC5AC基因相对表达水平也升高但与D组比较差异不显著(P>0.05),而E-cd基因相对表达水平与D组比较差异显著(P<0.05)。B组4周龄肉鸡法氏囊中E-cd和MUC5AC基因相对表达水平升高,6周龄肉鸡胸腺中E-cd和MUC5AC基因相对表达水平也有升高趋势;C组各周龄肉鸡脾脏中MUC5AC基因的相对表达水平降低。说明在肉鸡长时间受到氨气刺激时,MUC5AC和E-cd基因的表达水平存在器官差异,法氏囊具有囊腔,与胸腺和脾脏相比,E-cd基因的总体相对表达水平升高,这与上皮细胞结构的完整性有关。
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关键词
氨气
免疫器官
MUC5AC基因
e-cd
基因
基因表达
肉鸡
原文传递
题名
思茅松HDR基因全长cDNA克隆与序列分析
被引量:
5
1
作者
王毅
周旭
毕玮
杨宇明
李江
王娟
机构
云南林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室
云南林业学科院
西南林业大学
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期721-727,共7页
基金
国家林业公益性行业科研专项(201304105)
云南省应用基础研究重点项目(2013FA054)
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016)
文摘
1-羟基-2-甲基-2-E-丁烯基-4-焦磷酸还原酶(HDR)是甲基-D-赤藓醇-4-磷酸(MEP)途径中的最后一个酶,在植物萜类生物合成中起主控作用。该研究根据思茅松(Pinus kesiya var.langbianensis)树皮转录组数据分析结果,首先获得了思茅松HDR基因片段,然后根据所获得的基因片段设计特异引物,提取受伤后的思茅松树皮的RNA,并运用RT-PCR和RACE技术从思茅松树皮中克隆得到完整的HDR基因(Pk HDR)。生物信息学分析表明:克隆获得的Pk HDR1基因c DNA全长序列为1 876 bp,含有1个1 464 bp的开放阅读框(ORF),编码487个氨基酸。同源性分析结果表明:思茅松HDR蛋白与赤松(Pinus densiflora)HDR蛋白的相似性高达99%。亚细胞定位及结构域分析结果表明:思茅松Pk HDR氨基酸序列中包含转运肽序列(A1-A61)及植物HDR蛋白多个保守的功能位点(A143,A234,A288,A371)。系统进化分析结果表明:Pk HDR蛋白与赤松HDR蛋白的亲缘关系最为接近。半定量PCR检测结果表明:树皮的创伤促进思茅松HDR基因的表达。该研究成功克隆获得HDR基因,并确定其与松脂代谢密切相关,为阐明思茅松松脂生物合成机制和分子育种提供了参考。
关键词
思茅松
CDNA
克隆
基因功能分析
Keywords
HDR
半定量PCR
Pinus kesiya var.langbianensis
1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase
gene
cD-NA clone
gene
function analysis
RT-PCR
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
氨气对4~6周龄肉鸡免疫器官中MUC5AC及E-cd基因表达的影响
2
作者
张进良
刘洪涌
郭艳
李晴
杨广礼
张辽
崔艳艳
席丽
机构
商丘师范学院生物与食品学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第7期1-5,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31501993)
河南省教育厅高等学校重点科研项目(17B230004
+2 种基金
16A230024)
河南省科技厅科技攻关项目(132102210551)
商丘师范学院2011年度青年科研基金项目(2011QN19)。
文摘
为了研究鸡处于高浓度氨气环境中免疫系统的变化,试验采用实时荧光定量PCR方法检测经15,30,60,0 mg/m3氨气处理(A~D组)后的4~6周龄肉鸡法氏囊、胸腺及脾脏等免疫器官中相关免疫基因MUC5AC和E-cd的表达情况。结果表明:6周龄时,B组肉鸡法氏囊中MUC5AC与E-cd基因的相对表达水平为D组的10倍左右(P<0.05);胸腺中MUC5AC基因相对表达水平为D组的5倍左右(P<0.05),E-cd基因相对表达水平也升高但与D组比较差异不显著(P>0.05);脾脏中MUC5AC基因相对表达水平也升高但与D组比较差异不显著(P>0.05),而E-cd基因相对表达水平与D组比较差异显著(P<0.05)。B组4周龄肉鸡法氏囊中E-cd和MUC5AC基因相对表达水平升高,6周龄肉鸡胸腺中E-cd和MUC5AC基因相对表达水平也有升高趋势;C组各周龄肉鸡脾脏中MUC5AC基因的相对表达水平降低。说明在肉鸡长时间受到氨气刺激时,MUC5AC和E-cd基因的表达水平存在器官差异,法氏囊具有囊腔,与胸腺和脾脏相比,E-cd基因的总体相对表达水平升高,这与上皮细胞结构的完整性有关。
关键词
氨气
免疫器官
MUC5AC基因
e-cd
基因
基因表达
肉鸡
Keywords
ammonia
immune organ
MUC5AC
gene
e-cd gene
gene
expression
broiler
分类号
S815.5 [农业科学—畜牧学]
S831 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
思茅松HDR基因全长cDNA克隆与序列分析
王毅
周旭
毕玮
杨宇明
李江
王娟
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2015
5
下载PDF
职称材料
2
氨气对4~6周龄肉鸡免疫器官中MUC5AC及E-cd基因表达的影响
张进良
刘洪涌
郭艳
李晴
杨广礼
张辽
崔艳艳
席丽
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021
0
原文传递
已选择
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