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3种兔球虫ITS-1序列测定与系统发育分析
被引量:
2
1
作者
顾小龙
刘红彬
+2 位作者
崔平
索勋
方素芳
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期984-987,共4页
从河北省兔场分别单卵囊分离孢子化大型艾美耳球虫卵囊、黄艾美耳球虫卵囊及肠艾美耳球虫卵囊,接种无球虫兔后获得纯种卵囊,CTAB法提取孢子化卵囊基因组DNA。利用艾美耳属球虫18SrDNA和5.8SrDNA保守引物,PCR扩增3种兔球虫ITS-1片段,产...
从河北省兔场分别单卵囊分离孢子化大型艾美耳球虫卵囊、黄艾美耳球虫卵囊及肠艾美耳球虫卵囊,接种无球虫兔后获得纯种卵囊,CTAB法提取孢子化卵囊基因组DNA。利用艾美耳属球虫18SrDNA和5.8SrDNA保守引物,PCR扩增3种兔球虫ITS-1片段,产物纯化后测序。将3种球虫ITS-1测序结果与GenBank发布的兔球虫ITS-1序列进行比对和遗传距离比较,绘制系统发育树。结果表明,大型艾美耳球虫、黄艾美耳球虫及肠艾美耳球虫河北株分别扩增出424、455、434bp的ITS-1片段。大型艾美耳球虫、黄艾美耳球虫及肠艾美耳球虫河北株与GenBank中发布的同种兔球虫ITS-1序列相似性分别为97.4%、97.9%和96.9%。系统发育树显示兔球虫ITS-1序列形成1个单系群,该单系群根据寄生部位分为2个姊妹群。
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关键词
大型艾美耳球虫
黄艾美耳球虫
肠艾美耳球虫
ITS-1
rDNA
测序
系统发育分析
原文传递
题名
3种兔球虫ITS-1序列测定与系统发育分析
被引量:
2
1
作者
顾小龙
刘红彬
崔平
索勋
方素芳
机构
河北北方学院动物科技学院
河北北方学院基础医学院
中国农业大学动物医学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期984-987,共4页
基金
国家兔产业体系资助项目(nycytx-44)
张家口市科技局项目
河北省张家口市科技局项目(1012004C-2)
文摘
从河北省兔场分别单卵囊分离孢子化大型艾美耳球虫卵囊、黄艾美耳球虫卵囊及肠艾美耳球虫卵囊,接种无球虫兔后获得纯种卵囊,CTAB法提取孢子化卵囊基因组DNA。利用艾美耳属球虫18SrDNA和5.8SrDNA保守引物,PCR扩增3种兔球虫ITS-1片段,产物纯化后测序。将3种球虫ITS-1测序结果与GenBank发布的兔球虫ITS-1序列进行比对和遗传距离比较,绘制系统发育树。结果表明,大型艾美耳球虫、黄艾美耳球虫及肠艾美耳球虫河北株分别扩增出424、455、434bp的ITS-1片段。大型艾美耳球虫、黄艾美耳球虫及肠艾美耳球虫河北株与GenBank中发布的同种兔球虫ITS-1序列相似性分别为97.4%、97.9%和96.9%。系统发育树显示兔球虫ITS-1序列形成1个单系群,该单系群根据寄生部位分为2个姊妹群。
关键词
大型艾美耳球虫
黄艾美耳球虫
肠艾美耳球虫
ITS-1
rDNA
测序
系统发育分析
Keywords
e. ma gna
e
. f la v
e
sc
e
ns
e
. int
e
stinalis
ITS-1 rDNA
s
e
qu
e
nc
e
phylog
e
n
e
tic analysis
分类号
S852.723 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
3种兔球虫ITS-1序列测定与系统发育分析
顾小龙
刘红彬
崔平
索勋
方素芳
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
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