Ⅲ型中国株HCV E2/NS1基因的扩增及其哺乳动物细胞表达质粒克隆构建

Ⅲ型中国株ＨＣＶＥ２／ＮＳ１基因的扩增及其哺乳动物细胞表达质粒克隆构建吴朝栋陶其敏杜绍财常锦红（北京医科大学人民医院肝病研究所，北京１０００４４）Ｅ２／ＮＳ１基因被认为是丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）基因组的结构区基因，具有较大的变异性［１］，而且在不同的...

Ⅲ型中国株HCVE2/NS1基因与已知分离株的同源性比较

利用逆转录套式ＰＣＲ扩增Ⅲ型中国株ＨＣＶＥ２／ＮＳ１基因片段，将其克隆到ｐｃＤＮＡ３载体上．采用双脱氧链终止法测定插入片段的核苷酸序列．并与已知分离株的相应区域进行同源性比较．首次克隆出Ⅲ型中国株ＨＣＶＥ２／ＮＳ１基因（ＨＣ－Ｗ１４），其核苷酸序列与Ⅲ型日本株ＨＣＶ（ＨＣ－Ｊ６）该区域同源性为８８．３７％，其推定的氨基酸同源性为８９．２９％．而与已知的非Ⅲ型株ＨＣＶ该区域相比，核苷酸及氨基酸的同源性均相对较低．Ⅲ型中国株ＨＣＶ与Ⅱ型中国株ＨＣＶ在Ｅ２／ＮＳ１区域有较大的变异，揭示研制我国的ＨＣＶ疫苗应该考虑这种基因型之间的变异性．

庚型肝炎病毒杭州株E_2/NS_1基因区的克隆及序列分析

目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2 /NS1区部分核酸序列。方法 选择 1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者 ,从其血清中分离HGVRNA ,通过逆转录套式聚合酶链反应(RT nPCR)法 ,扩增该散发性HGV(HZ 2株 )E2 /NS1区部分cDNA片段 ,然后克隆到质粒 pGEX 4T 3中 ,并进行核苷酸序列分析。结果 HGV杭州株与河北株 (HGVC96 4、美国株 )(HGU44 40 2 )的核苷酸同源性为 92 5 %和 89 8% ,氨基酸同源性为 98 0 %和 93 9%。

合并感染HIV对1b型HCV E2/NS1包膜区基因影响

目的研究人类免疫缺陷病毒(HIV)感染对1 b型丙型肝炎病毒(HCV)E2/NS1包膜区基因变异的影响,探讨2组间E2/NS1区基因序列同源性差异,为HCV/HIV合并感染者中HCV的治疗提供依据。方法对河南省某有偿献血村进行随访,将得到的所有HCV阳性病例255例根据合并HIV感染的情况分成2组,并对其基因分型,然后进行逆转录(RT)-巢式PCR扩增1 b型HCV E2/NS1包膜区基因,继而进行单链构象多态性分析(SSCP)、纯化后测序。结果 HCV单纯感染组和HIV/HCV合并感染组SSCP平均条带数分别为(3.4±0.55)、(2.6±0.55)条,差异有统计学意义(t=2.32,P=0.049);HCV单纯感染组和HIV/HCV合并感染组HCV E2/NS1包膜区同源性分别为76.7%和87.6%,差异有统计学意义(χ2=20.13,P<0.001);2组第一高变区(HVR-1)同源性分别为59.3%和81.9%,差异有统计学意义(χ2=10.39,P=0.001);2组第3高变区(HVR-3)同源性分别为71.7%和83.9%,差异有统计学意义(χ2=4.60,P=0.03);单纯HCV组中变异性较高的氨基酸位点在HCV/HIV合并感染组中表现出较高的保守性。结论 HIV感染对1b型HCV E2/NS1包膜区基因变异具有抑制作用,且其主要体现在HVR-1和HVR-3区。

Comparison between homologies of E2/NS1 gene from genotype Ⅲ Chinese isolates of hepatitis C virus and that from reported isolates

ＨｅｐａｔｉｔｉｓＣｖｉｒｕｓ（ＨＣＶ）ｉｓｔｈｅｍａｊｏｒｃａｕｓａｔｉｖｅａｇｅｎｔｏｆｎｏｎＡ，ｎｏｎＢｈｅｐａｔｉｔｉｓｔｈｒｏｕｇｈｏｕｔｔｈｅｗｏｒｌｄ．１Ｒｅｃｅｎｔｌｙ，ｉｔｗａｓｓｕｇｇｅｓｔｅｄｔｈａｔｐｒｏｄｕｃｔｅｎｃｏｄ...

丙型肝炎病毒基因组部分E2／NS1蛋白基因在大肠杆菌中的表达

在大肠杆菌中表达了丙型肝炎病毒基因组的部分Ｅ２／ＮＳ１蛋白（氨基酸３６４－５１２）。表达蛋白经ＳＤＳ－ＰＡＧＥ分析，主要表达带的分子量在～４３０００左右。表达蛋白用于检测已用Ｃ３３ｃ及Ｑ２２检测过的血清，发现Ｅ２ＮＳ１引抗体阳性率占Ｃ３３ｃ及Ｑ２２抗体阳性血清的２０％，尚没有发现单独Ｅ２／ＮＳ１抗体阳性的血清。

散发性庚型肝炎病毒部分核苷酸序列分析

目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2/NS1区部分核苷酸序列。方法 选择1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者，从其血清中分离HGVRNA，通过逆转录-套式聚合酶链反应（RT-nPCR)法，扩增该散发性HGV（HZ-2株）E2/NS1区部分cDNA片段，然后克隆到质粒pGEX-4T-3中，并进行核苷酸序列分析结果 HGV杭州株与河北株（HGVC964）、美国株（HGU44402）的核苷酸同源性为92.5%和89.8%。氨基酸同源性为98.0%和93.9%。结论 该项研究将为HGV诊断试剂盒 的研制及基因工程疫苗的研制提供资料。

1b型丙型肝炎病毒基因组不同区域基因变异对干扰素疗效的影响

本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2／NS1（含HVR1和HVR2）、NSSA区准种异质性进行了检测，对HVR区准种异质性程度与干扰素（IFN）疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区（ISDR）等热点问题进行了探讨，为1b型慢性丙型肝炎患者应用IFN抗病毒治疗时进行疗效预测提供理论依据。