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凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析
被引量:
1
1
作者
杜江丽
张晓军
+4 位作者
张小溪
袁剑波
高羿
李富花
相建海
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期771-781,共11页
E75是对虾蜕皮激素信号通路的关键调控因子。为了深入了解E75基因的结构和功能,本实验从转录组数据中筛选得到注释为凡纳滨对虾E75基因的转录本,经与基因组序列比对分析,鉴定发现凡纳滨对虾E75基因至少存在6种可变剪接体,分别命名为LvE7...
E75是对虾蜕皮激素信号通路的关键调控因子。为了深入了解E75基因的结构和功能,本实验从转录组数据中筛选得到注释为凡纳滨对虾E75基因的转录本,经与基因组序列比对分析,鉴定发现凡纳滨对虾E75基因至少存在6种可变剪接体,分别命名为LvE75-1、LvE75-2、LvE75-3、LvE75-4、LvE75-5和LvE75-6。其中LvE75-1/2/4/5/6均包含DBD和LBD结构域,与果蝇E75A/C有相同的结构域,而LvE75-3仅包含LBD结构域,与果蝇E75D相同。在凡纳滨对虾蜕皮过程中,LvE75-1/2/3/4在D3~D4时期高表达,而LvE75-5和LvE75-6表达量很低。在成体组织中,LvE75各种剪切形式在所有检测的组织中均有表达,且在表皮、肠和鳃中表达较高,在肝胰脏、血细胞和淋巴组织中仅LvE75-3表达较高。实验通过双链RNA干扰LvE75基因的表达,在干扰样品中,检测到Halloween基因中的spo、phm和dib表达下调,shd表达上调,表明LvE75可能通过调控Halloween基因的表达来影响蜕皮激素的合成;同时E75基因的干扰也使同为蜕皮激素早期应答基因的Br-C基因和Ftz-F1基因表达下调,HR3基因表达上调,表明LvE75基因对蜕皮信号通路上下游基因均有作用。在LvE75基因持续干扰12 d后,凡纳滨对虾的蜕皮率显著低于对照组,而死亡率显著高于对照组,说明LvE75基因对凡纳滨对虾的蜕皮和生存具有重要作用。
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关键词
凡纳滨对虾
e75基因
蜕皮
可变剪接
RNA干扰
下载PDF
职称材料
不同饵料投喂对南美白对虾亲虾性腺成熟及E75基因表达的影响
被引量:
4
2
作者
吕峰
巩杰
+3 位作者
倪建忠
张跃群
张敏
陆德祥
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018年第15期198-199,202,共3页
为了筛选出安全、高效、优质的南美白对虾亲虾催熟饵料,并进一步研究南美白对虾性腺发育调控机制,开发有效的催熟技术,将南美白对虾亲虾120尾分成4组(每组30尾),A组饲喂鲢鱼肉,B组饲喂蚯蚓,C组饲喂沙蚕,D组饲喂配合亲虾饲料,分析比较...
为了筛选出安全、高效、优质的南美白对虾亲虾催熟饵料,并进一步研究南美白对虾性腺发育调控机制,开发有效的催熟技术,将南美白对虾亲虾120尾分成4组(每组30尾),A组饲喂鲢鱼肉,B组饲喂蚯蚓,C组饲喂沙蚕,D组饲喂配合亲虾饲料,分析比较不同饵料对南美白对虾亲虾性腺发育的影响,并通过荧光定量RT-PCR技术对各亲虾肝胰腺和卵巢中E75基因表达水平进行研究。结果表明:南美白对虾亲虾肝胰腺和卵巢组织中E75基因mRNA相对表达量在催熟后均明显升高,沙蚕对南美白对虾亲虾性腺发育有促进效果,E75基因mRNA可作为南美白对虾繁殖性能选育的指标。
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关键词
南美白对虾
卵巢
肝胰腺
发育
促熟
e75基因
下载PDF
职称材料
题名
凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析
被引量:
1
1
作者
杜江丽
张晓军
张小溪
袁剑波
高羿
李富花
相建海
机构
中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室
青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室
中国科学院大学
出处
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期771-781,共11页
基金
国家自然科学基金(31672632
31702320
41876167)~~
文摘
E75是对虾蜕皮激素信号通路的关键调控因子。为了深入了解E75基因的结构和功能,本实验从转录组数据中筛选得到注释为凡纳滨对虾E75基因的转录本,经与基因组序列比对分析,鉴定发现凡纳滨对虾E75基因至少存在6种可变剪接体,分别命名为LvE75-1、LvE75-2、LvE75-3、LvE75-4、LvE75-5和LvE75-6。其中LvE75-1/2/4/5/6均包含DBD和LBD结构域,与果蝇E75A/C有相同的结构域,而LvE75-3仅包含LBD结构域,与果蝇E75D相同。在凡纳滨对虾蜕皮过程中,LvE75-1/2/3/4在D3~D4时期高表达,而LvE75-5和LvE75-6表达量很低。在成体组织中,LvE75各种剪切形式在所有检测的组织中均有表达,且在表皮、肠和鳃中表达较高,在肝胰脏、血细胞和淋巴组织中仅LvE75-3表达较高。实验通过双链RNA干扰LvE75基因的表达,在干扰样品中,检测到Halloween基因中的spo、phm和dib表达下调,shd表达上调,表明LvE75可能通过调控Halloween基因的表达来影响蜕皮激素的合成;同时E75基因的干扰也使同为蜕皮激素早期应答基因的Br-C基因和Ftz-F1基因表达下调,HR3基因表达上调,表明LvE75基因对蜕皮信号通路上下游基因均有作用。在LvE75基因持续干扰12 d后,凡纳滨对虾的蜕皮率显著低于对照组,而死亡率显著高于对照组,说明LvE75基因对凡纳滨对虾的蜕皮和生存具有重要作用。
关键词
凡纳滨对虾
e75基因
蜕皮
可变剪接
RNA干扰
Keywords
Litop
e
na
e
us vannam
e
i
e
75
g
e
n
e
molting
alt
e
rnativ
e
ly splicing
RNAi
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
S917.4 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
不同饵料投喂对南美白对虾亲虾性腺成熟及E75基因表达的影响
被引量:
4
2
作者
吕峰
巩杰
倪建忠
张跃群
张敏
陆德祥
机构
南通科技职业学院环境与生物工程学院
南通大学海洋学院
南通市水产技术推广站
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018年第15期198-199,202,共3页
基金
南通市2015应用基础研究社会民生创新现代农业项目“南美白对虾卵巢发育相关基因的克隆及在催熟生产中的应用研究”(MS12015072)
文摘
为了筛选出安全、高效、优质的南美白对虾亲虾催熟饵料,并进一步研究南美白对虾性腺发育调控机制,开发有效的催熟技术,将南美白对虾亲虾120尾分成4组(每组30尾),A组饲喂鲢鱼肉,B组饲喂蚯蚓,C组饲喂沙蚕,D组饲喂配合亲虾饲料,分析比较不同饵料对南美白对虾亲虾性腺发育的影响,并通过荧光定量RT-PCR技术对各亲虾肝胰腺和卵巢中E75基因表达水平进行研究。结果表明:南美白对虾亲虾肝胰腺和卵巢组织中E75基因mRNA相对表达量在催熟后均明显升高,沙蚕对南美白对虾亲虾性腺发育有促进效果,E75基因mRNA可作为南美白对虾繁殖性能选育的指标。
关键词
南美白对虾
卵巢
肝胰腺
发育
促熟
e75基因
分类号
S945.49 [农业科学—水产养殖]
Q786 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析
杜江丽
张晓军
张小溪
袁剑波
高羿
李富花
相建海
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
下载PDF
职称材料
2
不同饵料投喂对南美白对虾亲虾性腺成熟及E75基因表达的影响
吕峰
巩杰
倪建忠
张跃群
张敏
陆德祥
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018
4
下载PDF
职称材料
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