藏猪和大约克夏猪EDNRA基因多态性及表达差异分析

内皮素受体A(EDNRA)是内皮素受体家族成员。为探索EDNRA基因与猪脂肪代谢性状的相关性,本研究选取饲养日龄为180 d的健康去势藏公猪和大约克夏公猪作为试验对象,采用了荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测EDNRA基因在肝脏、肾脏、背脂和腹脂中mRNA相对表达量,运用Sanger测序法对EDNRA基因的5′侧翼区进行多态性分析。结果表明,EDNRA基因在2个猪种组织中的相对表达量趋势基本一致,表现为藏猪在肝脏和背脂中的相对表达量显著低于大约克夏猪(P<0.05),而在肾脏和腹脂中的相对表达量为藏猪极显著低于大约克夏猪(P<0.01),通过对单核苷酸多态性(SNP)进行筛选,筛选到4个SNP位点:g.11574354T>C、g.11574355G>A、g.11574363T>A、g.11574379T>A,且猪种中的等位基因频率存在显著差异(P<0.05)。推测EDNRA基因可能是调控脂肪代谢的关键基因,为进一步研究猪的脂肪调控机制奠定了基础。

山羊EDNRA基因编码区克隆与组织表达规律分析

【目的】旨在探究EDNRA基因在山羊心脏、肝、脾、肺、肾、大脑、网膜脂肪组织中的表达情况。【方法】采用克隆、测序的方法得到山羊EDNRA基因CDS全长的碱基序列,用生物信息学软件进行序列分析、亲水性/疏水性分析、潜在的信号肽位点分析、亚细胞定位分析、蛋白质的二级结构和三级结构预测及系统进化树分析,最后采用实时荧光定量PCR(qPCR)测定EDNRA基因在山羊心脏、肝、脾、肺、肾、大脑、网膜脂肪组织中mRNA的表达量。【结果】成功克隆了EDNRA的CDS序列,得到山羊EDNRA基因包含一个1 284 bp的最长开放阅读框。该序列编码427个氨基酸,含信号肽序列(第1到第20位氨基酸)以及7型跨膜受体同系物结构域。基因编码产物具有疏水性,属分泌蛋白,有35个磷酸化修饰位点。二级结构主要为α-螺旋。系统进化树分析表明,山羊EDNRA基因和绵羊、牛以及野牛的亲缘关系较近。qPCR结果表明,山羊EDNRA基因在心脏中的表达量最高,在肝、脾、肾、大脑、网膜组织中的表达量较低,而在肺中表达最少。【结论】EDNRA可能在心脏行使功能过程中发挥重要作用。

青藏高原藏族高原红细胞增多症与EDNRA基因遗传多态性的关系

目的 探讨EDNRA基因的遗传多态性是否和青藏高原藏族的高原红细胞增多症（HAPC）易感性有关.方法 采用病例对照研究策略,研究了63名HAPC藏族和131名健康的、年龄和性别相匹配的对照藏族,所有的藏族都来自中国青海省海拔3 500米以上的玉树地区.采用Sequenom Mass ARRAY的方法检测了所有研究对象EDNRA基因的5个SNP位点（rs10003447,rs1801708,rs2048894,rs5335 and rs6841581）基因型和等位基因分布,比较各SNP位点在两组之间的差异.结果 发现EDNRA基因的5个SNP位点等位基因在HAPC组和健康对照组的分布差异无统计学意义（P=0.742;P=0.733;P=0.828;P=0.417;P=0.096）.结论 虽然EDNRA基因多态性和藏族适应高原有关但是和藏族HAPC的易感性无关。

EDNRA和EDNRB基因单核苷酸位点多态性与缺血性脑卒中的相关性

目的 探讨中国北方地区汉族人群内皮素受体（EDNR）A和EDNRB基因中单核苷酸多态性（SNP）与缺血性脑卒中（IS）的相关性。方法 检测EDNRA基因的3个位点：rs1801708、rs5333、rs5335和EDNRB基因的2个位点：rs3818416、rs5351在对照组、IS组中的多态分布。结果在男性群体中,EDNRA基因rs5335位点突变纯合型CC发病危险度明显降低（P=0.016;OR=0.52;95%CI=0.31~0.88）;在女性群体中,EDNRA基因rs1801708位点中,突变纯合型AA发病危险度明显高于G基因携带者（P=0.019;OR=2.65;95%CI=1.18~6.00）。结论 EDNRA基因rs5335位点的C等位基因能够降低北方汉族男性人群IS的发病风险,rs1801708位点的A等位基因能够增加北方汉族女性人群IS的发病风险。

下颌发育不良及问号耳畸形患者的致病基因突变遗传分析

探讨具有下颌发育不良及问号耳畸形临床表型的患者家系的临床及遗传学特征.分析2个具有下颌发育不良及问号耳畸形患者家系的临床资料,使用全外显子组测序等遗传学检测方法,寻找候选基因并深入分析相关的基因突变.通过全外显子组检测,在两个患者家系中分别发现PLCB4基因纯合错义突变(Chr20:9364985;NM_000933;exon11;c.991T>C;p.Y331H)和EDNRA基因杂合插入造成的移码突变(Chr4:148457092;NM_001957;exon5;c.811_812insT;p.T271fs),这两个突变均未报道过,且与患者的临床表型具有高度相关性.PLCB4和EDNRA均作用于EDN1-EDNRA-DLX信号通路,该通路已报道对人类咽弓发育和下颌骨分化起到至关重要的作用,检测到的两个突变极有可能与患者的临床表现高度相关.本研究发现了两个致病基因中未报道过的疑似致病突变,提出EDNRA基因缺陷同样可能与耳髁突综合征(ACS)表型相关,为研究人类下颌骨发育的致病因素和遗传机制提供了重要的病例和遗传学数据,进一步证明了EDN1-EDNRA-DLX信号通路在人类下颌骨发育过程中的重要作用.