EFFECTORSEARCH:病原菌基因组中三型分泌系统效应蛋白的预测(英文)

病原菌为了生存和侵入寄主细胞,经过漫长的进化形成了多种可介导大分子转运的分子机制,细菌Ⅲ型分泌系统(T3SS)是其中最重要的一种。T3SS又被称为"细菌注射器",病原菌利用此系统可以将效应蛋白注射到靶细胞中。近年来发现,T3SS不仅存在于在人类、动物、甚至植物的多种致病菌中,在其它环境下的细菌中也存在。本文介绍了一种最新的生物信息学预测工具(EFFECTORSEARCH),可用于在微生物基因组中预测T3SS的基因,并且在本文中着重介绍了其在丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)基因组中T3SS基因的预测结果。