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EGLN1基因两个位点多态性与藏族人群高原低氧适应的关系 被引量:8
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作者 吕坡 范杰 席焕久 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期419-422,共4页
目的探讨西藏藏族人群EGLN1基因2个SNP(单核苷酸多态性)位点rs479200(C/T)、rs480902(T/C)多态性与高原低氧适应的相关性。方法选取世居西藏拉萨藏族150人及辽宁汉族150人的血样,提取白细胞基因组DNA,应用限制性片段长度多态性-聚合酶... 目的探讨西藏藏族人群EGLN1基因2个SNP(单核苷酸多态性)位点rs479200(C/T)、rs480902(T/C)多态性与高原低氧适应的相关性。方法选取世居西藏拉萨藏族150人及辽宁汉族150人的血样,提取白细胞基因组DNA,应用限制性片段长度多态性-聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术检测EGLN1基因2个SNP位点,分析其多态性特征。结果 rs479200位点等位基因C等位基因频率在藏族人和汉族人分别为71.33%和38.17%,rs480902位点等位基因T等位基因频率在藏族人和汉族人分别为66.67%和36.67%,两组比较差异显著(P<0.01);rs479200位点TT、TC和CC基因型频率在藏族人和汉族人分别为6.67%和56.67%、29.33%和33.33%、64%和10%,rs480902位点TT、TC和CC基因型频率在藏族人和汉族人分别为60.67%和9.33%、30.66%和28.67%、8.67%和62%。两位点TC基因型两组比较差异无统计学意义;TT和CC基因型两组比较差异均显著(P<0.01)。结论 EGLN1基因rs479200(C/T)和rs480902(T/C)SNP位点多态性与西藏藏族适应高原低氧环境存在相关性。rs479200位点的CC基因型和rs480902位点的TT基因型可能更有利于适应低氧环境。 展开更多
关键词 egln1 高原低氧适应 单核苷酸多态性(SNP) 限制性片段长度多态性-聚合酶链反应(PCR-RFLP) 藏族
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哺乳动物低氧适应性基因EGLN1的适应性进化与共进化特征 被引量:3
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作者 耿荣庆 王兰萍 +3 位作者 洪键 范忠军 常洪 冀德君 《家畜生态学报》 北大核心 2013年第1期11-14,共4页
EGLN1基因是一个关键的氧传感基因,也是低氧适应的重要调控基因之一。用生物信息学方法分析了哺乳动物EGLN1基因的适应性进化和共进化特征。结果表明,基于SLAC、FEL和REL方法在EGLN1基因中都检测到正选择位点,表明EGLN1基因在进化过程... EGLN1基因是一个关键的氧传感基因,也是低氧适应的重要调控基因之一。用生物信息学方法分析了哺乳动物EGLN1基因的适应性进化和共进化特征。结果表明,基于SLAC、FEL和REL方法在EGLN1基因中都检测到正选择位点,表明EGLN1基因在进化过程中受到了正选择作用,产生了适应性进化。在EGLN1基因编码区还识别出共进化位点,推测这些位点间可能存在直接或间接的相互作用,对维持蛋白质的结构和功能起着重要作用。 展开更多
关键词 哺乳动物 egln1基因 适应性进化 共进化
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miR-218-5p靶向EGLN3抑制肺腺癌增殖、迁移和侵袭 被引量:3
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作者 王江波 梁皓 陆允平 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2022年第11期57-67,共11页
目的 微小RNA(microRNAs, miRNA)参与了多种癌症的发生发展,有研究证明微小RNA-218-5p(microRNA-218-5p, miR-218-5p)在癌症的发展中发挥着重要作用。然而,miR-218-5p影响肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)发展的具体机制尚未明确。方... 目的 微小RNA(microRNAs, miRNA)参与了多种癌症的发生发展,有研究证明微小RNA-218-5p(microRNA-218-5p, miR-218-5p)在癌症的发展中发挥着重要作用。然而,miR-218-5p影响肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)发展的具体机制尚未明确。方法 通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据分析肺腺癌组织中miR-218-5p的表达情况,实时荧光定量PCR(quantitative real time polymerase chain reaction, qRT-PCR)检测miR-218-5p和EGLN3在人肺正常细胞系和人肺腺癌细胞系中的表达。蛋白质印迹法(Western blot)检测miR-218-5p对AKT/mTOR信号通路关键蛋白表达的影响以及细胞中EGLN3的蛋白表达。使用生物信息学方法预测并通过荧光素酶报告基因检测证实miR-218-5p与EGLN3的靶向关系。细胞活力和细胞毒性检测(cell counting kit-8, CCK-8)、细胞克隆形成、细胞划痕、Transwell实验检测miR-218-5p与EGLN3对肺腺癌细胞功能的影响。结果 miR-218-5p在肺腺癌中低表达,过表达miR-218-5p可抑制肺腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭,并抑制AKT/mTOR信号通路的激活。miR-218-5p的下游靶基因EGLN3在肺腺癌中高表达。过表达EGLN3减弱了miR-218-5p过表达对肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用。结论 miR-218-5p靶向下调EGLN3抑制肺腺癌细胞的增殖、迁移与侵袭,这些结果为肺腺癌的新治疗方法和检测手段的开发提供了新的参考依据。 展开更多
关键词 miR-218-5p egln3 肺腺癌 增殖 迁移 侵袭
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哺乳动物低氧适应性基因EGLN1的密码子偏好性与聚类分析 被引量:6
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作者 宋乔乔 钟金城 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第10期35-39,共5页
为了研究哺乳动物低氧适应性基因EGLN1的密码子偏好性和进化关系,试验采用多种分析软件对18种哺乳动物的EGLN1基因进行了分析。结果表明:18种哺乳动物共同偏好使用的密码子有7个,藏羚羊和山羊偏向使用以A或U结尾的密码子,其余物种均偏... 为了研究哺乳动物低氧适应性基因EGLN1的密码子偏好性和进化关系,试验采用多种分析软件对18种哺乳动物的EGLN1基因进行了分析。结果表明:18种哺乳动物共同偏好使用的密码子有7个,藏羚羊和山羊偏向使用以A或U结尾的密码子,其余物种均偏向使用以G或C结尾的密码子。EGLN1基因在不同物种编码时偏好使用的密码子存在差异;AGU、CUU、CCA、GCU是野牦牛、藏羚羊、山羊共有的偏好性密码子;UCU、AGU、CUU、CCA、GCU、GAA、GCU是藏羚羊、山羊共有的偏好性密码子;CCA、GCU、AAA是藏羚羊、马共有的偏好性密码子;这些密码子主要在野牦牛、藏羚羊、山羊、马中偏好使用,在其他物种中使用较少。野牦牛对编码Tyr、Cys的密码子没有偏好性,藏羚羊、山羊对编码Asn的密码子没有偏好性。基于EGLN1基因密码子偏好性的聚类与基于EGLN1基因CDS序列的分类结果不完全一致,总体上亲缘关系相近的物种密码子偏好性差异小。说明密码子使用的偏好性可以作为物种分类的一种指标。 展开更多
关键词 哺乳动物 遗传密码 低氧适应性 egln1基因 密码子偏好性 聚类分析
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siRNA沉默EGLN1基因对低氧下大鼠肺动脉平滑肌细胞生长的影响 被引量:1
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作者 孙莉 嘎琴 +1 位作者 杨全余 靳国恩 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期787-791,共5页
目的:体外培养大鼠肺动脉平滑肌细胞(PASMCs),利用小干扰RNA技术转染PASMCs干扰EGLN1基因表达,检测细胞活力变化,从而验证EGLN1在PASMCs活力变化中的作用。方法:采用原代培养PASMCs,构建出特异的EGLN1 siRNA脂质体并转染到PASMCs;分别... 目的:体外培养大鼠肺动脉平滑肌细胞(PASMCs),利用小干扰RNA技术转染PASMCs干扰EGLN1基因表达,检测细胞活力变化,从而验证EGLN1在PASMCs活力变化中的作用。方法:采用原代培养PASMCs,构建出特异的EGLN1 siRNA脂质体并转染到PASMCs;分别在常氧和低氧下进行细胞培养,采用Western blot检测PASMCs的EGLN1蛋白、VEGF蛋白表达水平;用CCK-8法检测细胞活力,探讨低氧条件下沉默EGLN1基因表达后对PASMCs活力的影响。结果:低氧下PASMCs活力变化和VEGF的蛋白水平表达较常氧下增加并呈时间依赖性;EGLN1沉默后,无论低氧和常氧下,PASMCs活力变化和VEGF的蛋白水平表达均受到抑制。结论:EGLN1基因参与调控低氧下大鼠PASMCs的生长,其调节可能是通过VEGF的介导而完成的。 展开更多
关键词 低氧 egln1基因 大鼠肺动脉平滑肌细胞 细胞活力
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藏鸡和白来航鸡胚胎肝脏EGLN1基因的差异表达分析 被引量:1
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作者 王翔宇 鲍海港 吴常信 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2016年第11期1-4,共4页
本研究旨在研究低氧孵化条件下,藏鸡和低地鸡胚胎肝脏egl-9家族低氧诱导因子1(egl-9family hypoxia-inducible factor 1,EGLN1)基因的表达差异及其与藏鸡胚胎低氧适应的关系。以15%氧浓度下孵化至16 d的藏鸡和白来航鸡胚为研究对象,利用... 本研究旨在研究低氧孵化条件下,藏鸡和低地鸡胚胎肝脏egl-9家族低氧诱导因子1(egl-9family hypoxia-inducible factor 1,EGLN1)基因的表达差异及其与藏鸡胚胎低氧适应的关系。以15%氧浓度下孵化至16 d的藏鸡和白来航鸡胚为研究对象,利用Real-time PCR和western-blot方法对鸡EGLN1基因肝脏组织表达特点进行研究。结果表明:随着氧浓度的降低,白来航鸡胚肝脏中EGLN1基因m RNA表达量极显著下降(P<0.01);在低氧条件下,白来航鸡胚中EGLN1基因的表达量显著地低于藏鸡胚胎(P<0.05);白来航鸡中EGLN1基因蛋白表达量随着氧浓度下降而下降,趋势与m RNA表达量一致。而藏鸡EGLN1基因的转录和翻译水平均为受到氧气浓度降低的影响。由此可知,鸡胚通过下调EGLN1基因表达从而应对低氧反应。上述结果为进一步研究EGLN1基因与低氧适应的关系提供了依据。 展开更多
关键词 egln1基因 低氧 基因表达 藏鸡 白来航鸡
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藏绵羊EGLN1基因表达、变异特征及其适应性分析
7
作者 刘秀 张亚强 +5 位作者 李少斌 王继卿 胡江 沙玉柱 张伟 罗玉柱 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第1期226-231,共6页
为揭示藏绵羊高原低氧的适应机制,选择与高原动物低氧适应相关的EGLN1基因为研究对象,分析绵羊群体中该基因的遗传变异特征,为进一步寻求分子育种提供依据。采用荧光定量PCR及PCR-SSCP技术检测了藏绵羊和湖羊不同组织EGLN1基因表达量及... 为揭示藏绵羊高原低氧的适应机制,选择与高原动物低氧适应相关的EGLN1基因为研究对象,分析绵羊群体中该基因的遗传变异特征,为进一步寻求分子育种提供依据。采用荧光定量PCR及PCR-SSCP技术检测了藏绵羊和湖羊不同组织EGLN1基因表达量及其intron6-intron7区的核苷酸变异特征。结果显示:EGLN1基因在2个绵羊群体各组织间均有表达且存在组织差异性。其中,湖羊各组织的表达量均高于藏绵羊,在心脏、肝脏和肾脏组织差异最大。在2个绵羊群体EGLN1基因intron6-intron7区检测到了6个SNPs、1个碱基的插入和1个碱基的缺失位点,2个群体间等位基因和基因型频率存在统计学差异(P <0. 05),藏绵羊优势等位基因B以及优势基因型AB的频率极显著高于湖羊(P <0. 01)。说明藏绵羊EGLN1基因部分外显子及内含子区遗传变异程度高,多态性丰富,选择潜力大,可作为藏绵羊适应高原低氧环境的候选基因。研究结果将为藏绵羊的遗传改良和种质创新提供基础数据。 展开更多
关键词 藏绵羊 egln1基因 基因表达 变异特征 适应性
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EGLN1基因多态性位点rs479200、rs2790870与高原肺水肿的关系
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作者 陈芃 李永平 +1 位作者 王亚平 杨应忠 《新疆医科大学学报》 CAS 2015年第2期161-165,共5页
目的探讨EGLN1基因多态性位点rs479200、rs2790870与高原肺水肿(High-altitude pulmonary edema,HAPE)的关系。方法采用病例对照研究,选取HAPE患者128例(HAPE组)及性别、年龄等相匹配的127例为对照组。采用PCR-测序法检测EGLN1基因的rs4... 目的探讨EGLN1基因多态性位点rs479200、rs2790870与高原肺水肿(High-altitude pulmonary edema,HAPE)的关系。方法采用病例对照研究,选取HAPE患者128例(HAPE组)及性别、年龄等相匹配的127例为对照组。采用PCR-测序法检测EGLN1基因的rs479200、rs2790870单核苷酸位点的多态性。结果HAPE组和对照组间rs479200和rs2790870位点的C等位基因频率分别为42.2%、42.5%和52.3%、58.3%,T等位基因频率分别为57.8%、57.5%和47.7%、41.7%,两组C、T等位基因频率分布差异无统计学意义(P>0.05);HAPE组和对照组间rs479200位点TT、TC和CC基因型频率分别为35.2%、45.3%、19.5%和36.2%、42.5%、21.3%,两组比较差异无统计学意义(P>0.05)。HAPE组和对照组间rs2790870位点TT、TC和CC基因型频率分别为24.2%、46.9%、28.9%和21.3%、40.9%、37.8%,两组比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论 EGLN1基因多态性位点rs479200、rs2790870的基因型及等位基因频率无差异,提示在本研究中与HAPE的发病无关。 展开更多
关键词 高原肺水肿 egln1基因 单核苷酸多态性
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rno-miR-161靶向EGLN2抑制血管性痴呆大鼠额叶铁死亡 被引量:1
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作者 周贤熙 周丽亭 +5 位作者 马春媚 孔洁琛 苏俊芳 邓汝东 刘爱军 陈东风 《中国临床解剖学杂志》 CSCD 北大核心 2022年第6期665-670,共6页
目的探讨rno-miR-161调控egl-9家族缺氧诱导因子2(EGLN2)对血管性痴呆(vascular dementia,VD)大鼠额叶铁死亡的影响。方法24只雄性SD大鼠按随机原则分为模型组和假手术组,模型组结扎双侧颈总动脉,假手术组不结扎双侧颈总动脉。术后4周... 目的探讨rno-miR-161调控egl-9家族缺氧诱导因子2(EGLN2)对血管性痴呆(vascular dementia,VD)大鼠额叶铁死亡的影响。方法24只雄性SD大鼠按随机原则分为模型组和假手术组,模型组结扎双侧颈总动脉,假手术组不结扎双侧颈总动脉。术后4周水迷宫检测行为学。RT-qPCR检测VD模型大鼠额叶rno-miR-161的变化,RT-qPCR和Western blotting检测EGLN2和谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)的表达。生物信息学预测及双荧光素酶报告基因验证rno-miR-161与EGLN2是否存在靶向调控关系。RT-qPCR及Western blotting检测rno-miR-161-mimic和rno-miR-161-inhibitor对EGLN2表达的影响。siEGLN2转染PC12细胞,检测GPX4的表达。结果与假手术组相比,模型组大鼠额叶rno-miR-161表达下降、EGLN2表达上升、GPX4表达下降。rno-miR-161直接靶向EGLN2。rno-miR-161-mimic抑制EGLN2的表达,rno-miR-161inhibitor导致EGLN2表达升高。siEGLN2促进GPX4表达。结论VD大鼠额叶中rno-miR-161靶向EGLN2抑制铁死亡。 展开更多
关键词 血管性痴呆 rno-miR-161 egln2 铁死亡 GPX4
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藏汉人群EPAS1、EGLN1基因特异SNP位点遗传多态性 被引量:5
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作者 杨鑫 胡萌 +4 位作者 张子龙 骆继怀 哈飞 马丽英 孙红兵 《刑事技术》 2016年第4期340-344,共5页
目的对青海、甘肃境内518名藏族无关个体和平原地区134名汉族无关个体EPAS1和EGLN1基因的10个SNP位点做遗传多态性分析。方法使用SNa Pshot?多重分析试剂盒分析藏汉人群rs12907901、rs13419896、rs150877473、rs1562453、rs186996510、r... 目的对青海、甘肃境内518名藏族无关个体和平原地区134名汉族无关个体EPAS1和EGLN1基因的10个SNP位点做遗传多态性分析。方法使用SNa Pshot?多重分析试剂盒分析藏汉人群rs12907901、rs13419896、rs150877473、rs1562453、rs186996510、rs2491406、rs2491407、rs4953360、rs4953361、rs7589621共10个SNP位点的基因型、等位基因频率等遗传学参数。结果根据基因型频率分析,汉族群体上述位点所有基因型频率符合Hardy-Weinberg平衡,藏族人群rs150877473、rs1562453、rs186996510、rs7589621共4个位点不符合Hardy-Weinberg平衡(p<0.05),同时两组人群rs13419896、rs1562453、rs186996510、rs7589621、rs4953360共5个位点存在显著差异;根据等位基因频率分析,藏汉人群在rs150877473、rs1562453、rs186996510、rs7589621共4个位点存在显著差异。结论本研究验证了EPAS1、EGLN1基因在藏汉群体间的差异性,为SNP分子遗传标记应用于刑事科学实践提供了理论支持。 展开更多
关键词 EPAS1 egln1 SNP 遗传多态性
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藏猪EGLN1基因exon 4及部分内含子变异研究
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作者 李卓航 寸博文 +2 位作者 文禹粱 赵生国 蔡原 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2019年第8期53-55,共3页
青藏高原的高寒低氧极端环境影响动物的正常生存和物种繁衍,藏猪在长期的适应性驯化中对低氧环境有着更强的适应能力。本研究对高海拔猪种藏猪(甘孜藏猪、迪庆藏猪、西藏藏猪和合作藏猪)和八眉猪以及低海拔猪种烟台黑猪、长白猪和大白猪... 青藏高原的高寒低氧极端环境影响动物的正常生存和物种繁衍,藏猪在长期的适应性驯化中对低氧环境有着更强的适应能力。本研究对高海拔猪种藏猪(甘孜藏猪、迪庆藏猪、西藏藏猪和合作藏猪)和八眉猪以及低海拔猪种烟台黑猪、长白猪和大白猪EGLN1基因exon 4及部分内含子的核苷酸序列进行测定和分析。结果表明:在EGLN1基因exon 4序列的266bp处发生了C→T的颠换,藏猪和八眉猪在该位点均为C,而烟台黑猪和引入的选育猪种长白猪、大白猪在该位点出现了C/T杂合现象;基于变异位点的等位基因C和T共界定了3种基因型(CC、CT、TT),C和CC分别是高海拔地方猪种藏猪和八眉猪的唯一等位基因和基因型;而在低海拔选育猪种中,CC基因型频率仅为0.20,其他2种基因型均为0.40,T为优势等位基因,频率达到0.60,而等位基因C的频率仅为0.40。本研究认为,高海拔猪种(2 300 m以上)藏猪和八眉猪与低海拔猪种烟台黑猪、长白猪和大白猪在EGLN1基因上存在特征性遗传变异,根据等位基因(C和T)及基因型(CC、CT、TT)在海拔上的特征差异,推测可能与不同地理区域条件下的长期适应性驯化有关。 展开更多
关键词 藏猪 egln1基因 核苷酸变异 多态性
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基于生物信息学方法分析EGLN1在肾透明细胞癌中的表达及意义 被引量:2
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作者 姚宇同 刘岩 +1 位作者 戴露 夏彬彬 《激光生物学报》 CAS 2021年第2期185-192,共8页
为探究egl-9家族缺氧诱导因子1(EGLN1)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达情况及临床意义,基于TCGA数据库中ccRCC患者的基因表达数据分析EGLN1在ccRCC组织和正常肾组织中的差异表达情况,应用UALCAN平台分析ccRCC中EGLN1在不同角度下的表达... 为探究egl-9家族缺氧诱导因子1(EGLN1)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达情况及临床意义,基于TCGA数据库中ccRCC患者的基因表达数据分析EGLN1在ccRCC组织和正常肾组织中的差异表达情况,应用UALCAN平台分析ccRCC中EGLN1在不同角度下的表达差异。基于TCGA数据库中ccRCC的临床数据,对EGLN1高低表达组进行生存分析,对EGLN1表达量与总生存期的相关性进行Cox分析,同时对临床数据中EGLN1基因表达情况进行基因富集分析。通过STRING数据库检索了编码蛋白间可能的潜在相互作用,并构建了蛋白质互作网络将其表示出来。获取EGLN1相关蛋白,并通过GEPIA平台进行相关分析。分析TCGA数据库中样本表达数据可知,EGLN1在ccRCC中的表达高于正常肾组织。应用UALCAN平台分析发现,EGLN1的高表达与患者的年龄有一定的相关性。生存分析显示EGLN1高表达时,ccRCC患者预后较好。单因素及多因素Cox分析提示EGLN1的表达量是ccRCC患者生存期的独立风险因素。基因富集分析提示EGLN1基因的表达与肾细胞癌(RCC)、癌症途径、泛素介导蛋白水解途径、细胞凋亡通路等密切相关。结果显示,EGLN1可能成为评估ccRCC预后的分子标志。 展开更多
关键词 egln1 肾透明细胞癌 癌症基因组图谱 生物信息学 COX分析
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EGLN家族在胶质瘤中的研究进展
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作者 何伟波 何正文 《肿瘤药学》 CAS 2021年第4期432-437,共6页
人脯氨酰羟化酶(EGLN)是双加氧酶超家族成员,可直接感受氧分压的变化,是调节缺氧诱导因子(HIF)脯氨酸残基产生羟化降解反应的重要因素,通过影响缺氧诱导因子的转录活性、介导蛋白酶分解和调节亚基的多聚泛素化等发挥作用。近年来,EGLN... 人脯氨酰羟化酶(EGLN)是双加氧酶超家族成员,可直接感受氧分压的变化,是调节缺氧诱导因子(HIF)脯氨酸残基产生羟化降解反应的重要因素,通过影响缺氧诱导因子的转录活性、介导蛋白酶分解和调节亚基的多聚泛素化等发挥作用。近年来,EGLN调节通路和信号机制相关研究的不断深入,为多种疾病的发生、发展及治疗提供了潜在靶点和新的启示。本文拟对EGLN家族在胶质瘤中的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 egln家族 胶质瘤 缺氧诱导因子
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不同海拔下大鼠肺组织中EGLN1基因的表达及其与肺动脉压的相关性 被引量:1
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作者 李生花 李胜 +4 位作者 孙莉 白振忠 杨全余 嘎琴 靳国恩 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第32期2592-2597,共6页
目的探讨不同海拔下大鼠肺组织中Eg1九同源物1(EGLN1)基因表达及其与平均肺动脉压(mPAP)的相关性。方法121只雄性Wistar大鼠用随机数字表法随机分为低海拔组(11只)、中海拔组和高海拔组,后两组又各分为低氧第1、3、7、15和30天5... 目的探讨不同海拔下大鼠肺组织中Eg1九同源物1(EGLN1)基因表达及其与平均肺动脉压(mPAP)的相关性。方法121只雄性Wistar大鼠用随机数字表法随机分为低海拔组(11只)、中海拔组和高海拔组,后两组又各分为低氧第1、3、7、15和30天5小组,每小组11只。低海拔组于498m地区进行生理信号采集和组织样本的收集,中海拔组置于2260m自然环境,高海拔组置于低压氧舱,模拟海拔为4500m。中海拔组和高海拔组在低氧暴露第1、3、7、15和30天进行生理信号采集和组织样本的收集。用生理信号采集系统测定mPAP;Western印迹法测定肺组织EGLNl蛋白表达水平,用Pearson相关性分析其蛋白是否与低氧下肺动脉高压的形成有关;用实时定量-PCR测定肺组织EGLN1 mRNA水平,用2^-△△ct倍数法分析PCR数据,评估低氧下EGLN1基因是否为肺动脉高压形成的初始原因。结果低海拔组mPAP为(20.0±3.2)mmHg(1mmHg=0.133kPa);中海拔组mPAP于第15天开始有所升高,第30天为(22.7±4.1)mmHg,但与低海拔组差异无统计学意义(P〉0.05);高海拔组mPAP于暴露低氧第7天[(28.7±7.7)mmHg]就显著高于低海拔组(P〈0.05),第30天[(42.3±9.1)mmHg]升高更明显(P〈0.001)。高海拔组EGLN1蛋白表达水平随暴露低氧时间的延长而逐渐下降,且均显著低于低海拔组和中海拔组(均P〈0.05),EGLN1蛋白表达水平与mPAP呈负相关(r=-0.662,P〈0.05)。高海拔组EGLN1 mRNA表达水平显著升高,是中海拔组的72倍和低海拔组的近300倍(均P〈0.001)。结论大鼠肺组织EGLN1基因表达随海拔升高而升高;但其蛋白水平却相反,并与mPAP呈负相关。 展开更多
关键词 高血压 肺性 高海拔 egln1基因 大鼠
原文传递
世居不同高海拔藏族EGLN1多态与海拔水平的关联研究
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作者 王博洋 巴桑卓玛 +8 位作者 李蕾 央拉 刘兰 崔超英 龚嘎兰孜 尼玛玉珍 多吉 王笑峰 金力 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期484-490,共7页
在世居高原藏族人群中探索Egl-9家族同源物1基因(EGLN1)遗传变异与不同的高海拔水平及生理表型的关联.募集178例居住于海拔2 700m个体(LHA组),245例3 700m个体(MHA组),179例4 700m个体(HHA组).分型EGLN1 4个连锁的单核苷酸多态(SNP)rs27... 在世居高原藏族人群中探索Egl-9家族同源物1基因(EGLN1)遗传变异与不同的高海拔水平及生理表型的关联.募集178例居住于海拔2 700m个体(LHA组),245例3 700m个体(MHA组),179例4 700m个体(HHA组).分型EGLN1 4个连锁的单核苷酸多态(SNP)rs2790882,rs480902,rs2486736和rs2739513,并进行它们与不同高海拔、肺功能、血氧饱和度(SaO2)的关联分析.4个SNPs的常见等位基因频率均随LHA、MHA、HHA递增(所有P<0.05);其单倍域中常见CTCC单倍型频率从LHA的52.5%增加至MHA的59.8%及HHA的62.3%(P=0.001 2).4个SNPs在HHA组SaO2水平随少见纯合子、杂合子和常见纯合子均递增(所有P<0.05),且CT/CC携带者的SaO2水平比少见单倍型TC/TT升高了1.6%(P=0.001 5).高原藏族人从海拔2 700m升高到3 700m及4 700mEGLN1基因受到了选择.在极高海拔时,EGLN1基因变异影响SaO2水平. 展开更多
关键词 藏族 高原适应 egln1 单核苷酸多态 关联研究 动脉血氧饱和度
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An EGLN1 mutation may regulate hypoxic response in cyanotic congenital heart disease through the PHD2/HIF-1A pathway 被引量:8
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作者 Yuanlin Zhou Na Ouyang +3 位作者 Lingjuan Liu Jie Tian Xupei Huang Tiewei Lu 《Genes & Diseases》 SCIE 2019年第1期35-42,共8页
Cyanotic congenital heart disease(CCHD),a term describing the most severe congenital heart diseases are characterized by the anatomic malformation of a right to left shunt.Although the incidence of CCHD are far less t... Cyanotic congenital heart disease(CCHD),a term describing the most severe congenital heart diseases are characterized by the anatomic malformation of a right to left shunt.Although the incidence of CCHD are far less than the that of congenital heart diseases(CHD),patients with CCHD always present severe clinical features such as hypoxia,dyspnea,and heart failure.Chronic hypoxia induces hypoxemia that significantly contributes to poor prognosis in CCHD.Current studies have demonstrated that the prolyl-4-hydroxylase2(PHD2,encoded by EGLN1)/hypoxia-inducible factor-1A(HIF-1A)pathway is a key regulator of hypoxic response.Thus,we aim to assess the associations of single polymorphisms(SNPs)of the EGLN1 gene and hypoxic response in CCHD.A missense variant of EGLN1 c.380G>C(rs1209790)was found in 46 patients(46/126),with lower hypoxia incidence and higher rate of collateral vessel formation,compared with the wild type(P<0.05).In vitro experiments,during hypoxia,EGLN1 mutation reduced EGLN1 expression compared with the wild type,with higher HIF-1A,VEGF and EPO expression levels in the mutant.No difference in HK1 expression was observed between the mutant and wild type.CCHD patients with c.380G>C showed improved response to hypoxia compared with the wild-type counterparts.The EGLN1 c.380G>C mutation improves hypoxic response through the PHD2/HIF-1A pathway,which may provide a molecular mechanism for hypoxic response in CCHD.The effects of the EGLN1 c.380G>C mutation on CCHD prognosis deserve further investigation. 展开更多
关键词 Cyanotic congenital heart disease egln1 Hypoxic response MUTATION POLYMORPHISM
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EGLN3在肺腺癌中表达的Meta分析
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作者 杨硕 马洪明 +1 位作者 关晓婷 陈正贤 《中华肺部疾病杂志(电子版)》 2023年第1期31-38,共8页
目的 分析EGLN3在肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)中的作用。方法 (1)通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库下载535例肺腺癌样本和59例正常样本,分析EGLN3在肺腺癌和正常肺组织中的表达差异;(2)使用R语言分析EG... 目的 分析EGLN3在肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)中的作用。方法 (1)通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库下载535例肺腺癌样本和59例正常样本,分析EGLN3在肺腺癌和正常肺组织中的表达差异;(2)使用R语言分析EGLN3的表达水平及其在肺腺癌中的临床意义;(3)通过Kaplan-Meier方法、单因素和多因素COX回归分析和生存预测列线图确定EGLN3的表达水平与肺腺癌预后的关系;(4)通过基因集富集分析(GSEA)筛选EGLN3相关的生物学途径;(5)细胞实验:通过蛋白质印迹法(WB)验证EGLN3在肺腺癌细胞中是否存在差异表达;对EGLN3基因进行过表达和干扰表达,采用CCK-8增殖实验、划痕实验和Transwell侵袭实验,明确表达水平对肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。结果 (1)EGLN3在肺腺癌组织中表达水平高于正常肺组织细胞;(2)EGLN3表达水平与肺腺癌病理分期相关,病理分期越高,对应EGLN3表达水平越高;(3)EGLN3表达水平与肺腺癌总生存期(OS)独立预后相关,EGLN3高表达肺腺癌较EGLN3低表达肺腺癌OS、疾病特异性生存期(DSS)和无进展间隔(PFI)差;(4)基因集富集分析预测EGLN3可能参与的信号通路包括激活MYC基因、上皮细胞-间充质转化(EMT)、DNA复制、细胞周期、mTORC1通路、G2/M检查点、E2F转录过程、P53信号通路等;(5)细胞实验:EGLN3在肺腺癌细胞中表达水平高于人支气管上皮样细胞;CCK-8增殖实验、划痕实验和Transwell侵袭实验显示,EGLN3过表达促进肺腺癌细胞增殖、侵袭和迁移,EGLN3干扰表达抑制肺腺癌细胞增殖、侵袭和迁移。结论 EGLN3在肺腺癌细胞中存在高表达,提示肺腺癌预后不良,可作为肺腺癌预后的预测因素。EGLN3表达可促进肺腺癌细胞增殖、侵袭和迁移。 展开更多
关键词 egln3 肺腺癌 生物信息学 META分析
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氧敏感基因EGLN1与COPD的发病机制 被引量:1
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作者 余静 王云超 +2 位作者 张春艳 王啟秀 王新华 《生命的化学》 CAS 2022年第7期1263-1271,共9页
慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的发生发展是环境和遗传因素交互作用产生的结果,成因复杂。COPD患者的症状与正常人长期暴露于高海拔低氧环境下的症状相似,氧感知通路的发现也证实了氧敏感相关基因在低... 慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的发生发展是环境和遗传因素交互作用产生的结果,成因复杂。COPD患者的症状与正常人长期暴露于高海拔低氧环境下的症状相似,氧感知通路的发现也证实了氧敏感相关基因在低氧环境暴露下的作用。EGLN1编码的脯氨酸羟化酶作为氧感知通路的核心氧感受器,能够直接感受氧分压;同时,EGLN1基因被抑制时,能够促进EPO、VEGF以及一些炎症基因的表达,导致弹性蛋白酶失衡以及炎症反应,进而加剧COPD的发生发展。本文系统阐述了EGLN1与COPD发病风险的研究进展,旨在对EGLN1在COPD发展过程中的表达调控作用进行进一步探讨,从而拟对高海拔地区COPD相关危险因素研究以及遗传标记物研究提供新的思路。 展开更多
关键词 egln1 COPD 氧敏感基因 遗传变异
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EGLN3对口腔鳞状细胞癌患者的临床预后作用 被引量:1
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作者 徐佳 余周庆 +1 位作者 彭治凯 郑杰 《临床口腔医学杂志》 2018年第1期18-21,共4页
目的:研究EGLN3基因对口腔鳞状细胞癌患者预后的影响意义。方法:通过二次分析口腔鳞状细胞癌基因表达数据集GSE42743,明确EGLN3基因在口腔鳞状细胞癌组织和其相应的正常口腔黏膜组织中的表达差异,探讨EGLN3(egl-9 family hypoxia induci... 目的:研究EGLN3基因对口腔鳞状细胞癌患者预后的影响意义。方法:通过二次分析口腔鳞状细胞癌基因表达数据集GSE42743,明确EGLN3基因在口腔鳞状细胞癌组织和其相应的正常口腔黏膜组织中的表达差异,探讨EGLN3(egl-9 family hypoxia inducible factor 3,egl-9家庭缺氧诱导因子3)基因与口腔鳞状细胞癌患者的年龄、性别、吸烟情况、肿瘤部位、T分期、PN分期(pathological N分期)、CN分期(clinical N分期)以及AJCC(American Joint Committee on Cancer,美国肿瘤研究联合委员会)分期、总生存期及口腔鳞状细胞癌特异性总生存期间的关系,并运用基因集富集分析方法进一步探讨EGLN3基因对口腔鳞状细胞癌细胞的具体作用机制。结果:EGLN3基因在口腔鳞状细胞癌组织中的表达显著高于癌旁正常组织(P<0.0001),高表达EGLN3的口腔鳞状细胞癌患者的T分期、CN分期(临床分期)、PN分期(病理分期)、AJCC分期方面明显劣于EGLN3低表达组口腔鳞状细胞癌患者(P=0.017,P=0.001,P=0.04,以及P=0.02),EGLN3低表达组口腔鳞状细胞癌患者的总生存期与口腔鳞状细胞癌特异性总生存期均显著优于EGLN3高表达组口腔鳞状细胞癌患者(两组P值均<0.0001)。GSEA(gene set enrichment analysis,基因集富集分析)分析提示EGLN3基因可能通过m TORC1、E2 F、MYC、NOTCH信号通路以及PI3 K-AKTm TOR、蛋白分泌、有丝分裂、细胞周期G2M检查点,糖酵解、胆固醇代谢、去折叠蛋白反应等多种生物学过程作用于口腔鳞状细胞癌细胞。结论:EGLN3基因是口腔鳞状细胞癌患者的独立预后不良因素。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 egln3基因 临床预后
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rno-miR-9a-5p靶向Egln3调控嗜铬细胞瘤凋亡机制
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作者 林紫霜 王安琪 彭贻界 《生物技术》 CAS 2022年第5期592-597,616,共7页
[目的]探讨嗜铬细胞瘤抵抗细胞凋亡的潜在机制。[方法]顺铂处理或不处理嗜铬细胞瘤细胞PC-12后,通过蛋白质组学检测两者蛋白表达差异。通过siRNA敲低上述差异基因,检测嗜铬细胞瘤细胞PC-12的凋亡水平。[结果]顺铂处理后,BIM和Egln3蛋白... [目的]探讨嗜铬细胞瘤抵抗细胞凋亡的潜在机制。[方法]顺铂处理或不处理嗜铬细胞瘤细胞PC-12后,通过蛋白质组学检测两者蛋白表达差异。通过siRNA敲低上述差异基因,检测嗜铬细胞瘤细胞PC-12的凋亡水平。[结果]顺铂处理后,BIM和Egln3蛋白表达量增高,Egln3的mRNA水平显著上升(P<0.05)。过表达Egln3后,BIM的表达显著上升。敲低Egln3后,BIM的表达显著下降。Egln3能够降低BIM的泛素化水平。敲低BIM和Egln3后嗜铬细胞瘤的凋亡水平显著上升(P<0.05)。过表达BIM和Egln3后,嗜铬细胞瘤的凋亡水平显著下降(P<0.05)。过表达rno-miR-9a-5p后,Egln3的表达水平下降。敲低rno-miR-9a-5p后,Egln3的表达水平上升。过表达rno-miR-9a-5p后,嗜铬细胞瘤凋亡水平上升(P<0.05);敲低rno-miR-9a-5p后,嗜铬细胞瘤凋亡水平下降(P<0.05)。[结论]rno-miR-9a-5p通过靶向Egln3及Egln3的mRNA,降低了Egln3的蛋白表达,抑制了蛋白酶体途径对促凋亡蛋白BIM的降解,随后增强了嗜铬细胞瘤细胞PC-12的凋亡水平。 展开更多
关键词 rno-miR-9a-5p egln3 嗜铬细胞瘤 凋亡 BIM PC-12
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