miR-381-5p靶向ERCC4调节乳腺癌细胞顺铂耐药的生物信息学分析

目的利用生物信息学方法分析miR-381-5p序列,预测其靶基因,寻找miR-381-5p在人野生乳腺癌细胞(MDA-MB-231)耐受顺铂过程中所调控的相关基因,为后续的深入研究提供理论依据。方法应用RNAhybrid2.1.2、Miranda3.3a、TargetScan7.03种在线工具预测miR-381-5p靶基因,取其交集靶基因;对交集靶基因进行Gene Ontology(GO)分子功能、生物学过程分析;根据分析结果,筛选出与miR-381-5p有关的显著差异表达基因。结果应用3种在线软件预测获得52个交集靶基因;GO分子功能集中于蛋白质N端结合、转录因子结合、双链DNA结合等(P<0.01);生物学过程集中于同型半胱氨酸代谢过程、细胞生物合成过程的调控、核染色体隔离等(P<0.01);miR-381-5p可负调控LHPP、HOXC5、LBX2、ERCC4、CREB3L3、IPCEF1、CD151、RAB43、TCF21与MTHFD1这10个靶基因,ERCC4表达差异最为显著。结论分析结果初步提示miR-381-5p可能通过调控ERCC4的表达来参与乳腺癌耐顺铂过程,为后续的实验性研究与治疗策略提供了线索。