目的预测、筛选及合成尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T Lymphocyte,CTL)表位,初步鉴定EWS-FLI1表位肽。方法综合运用BIMAS、SYFPEITHI、Predep和IEDB方案对EWS-FLI1蛋白进行HLA-A^*0201限制性CTL...目的预测、筛选及合成尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T Lymphocyte,CTL)表位,初步鉴定EWS-FLI1表位肽。方法综合运用BIMAS、SYFPEITHI、Predep和IEDB方案对EWS-FLI1蛋白进行HLA-A^*0201限制性CTL表位的预测,应用多项式方案、量化基序方案对预测的CTL表位进行筛选,并将筛选的CTL表位与HLA-A^*0201分子进行动力学模拟,应用标准Fmoc方案合成CTL表位肽;通过表位多肽刺激CTL释放颗粒溶素的检测,以及靶细胞杀伤实验验证表位多肽的免疫效应。结果综合预测得出了8个可能的表位肽,进一步筛选确定其中4个肽为候选合成表位,应用分子动力模拟初步验证了4个候选表位肽与HLA-A2.1分子的结合力,合成的各条肽经色谱分析纯度均在98%以上,经质谱分析各肽的分子量测定值与理论值相符,颗粒溶素释放实验及靶细胞杀伤实验证实了筛选的表位均能产生刺激效应,其中,表位肽QIQLWQFLL(EWS-FLI1 304)的刺激效应最为显著。结论综合运用多个方案可提高预测效率,分子动力学模拟可初步验证表位肽与HLA-A^*0201的结合力,所合成的多肽为高纯度肽,通过免疫学实验初步鉴定了EWS-FLI1的表位。展开更多
目的通过Meta分析探讨甲状腺癌组织中黏蛋白1(MUC1)表达的临床意义及其与各临床病理参数的相关性。方法检索维普、万方、中国知网、中国生物医学文献、PubMed、Web of Science、Embase、Cochrane中英文数据库中关于MUC1在甲状腺癌中表...目的通过Meta分析探讨甲状腺癌组织中黏蛋白1(MUC1)表达的临床意义及其与各临床病理参数的相关性。方法检索维普、万方、中国知网、中国生物医学文献、PubMed、Web of Science、Embase、Cochrane中英文数据库中关于MUC1在甲状腺癌中表达及其意义的文献,以比值比(OR)和95%置信区间(95%CI)为效应指标,采用STATA 14软件进行Meta分析,并对发表偏倚及敏感性进行检验。结果共纳入13项病例对照研究,甲状腺癌病例组共1157例,非甲状腺癌对照组共509例。结果显示,甲状腺癌病例组MUC1表达明显高于非甲状腺癌对照组(OR=9.78,95%CI:7.49~12.78,P<0.001);伴有淋巴结转移的甲状腺癌组织中MUC1表达高于无淋巴结转移的甲状腺癌组织(OR=3.08,95%CI:1.37~6.92,P<0.05);TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期的甲状腺癌组织中MUC1表达高于TNM分期为Ⅰ~Ⅱ期的甲状腺癌组织(OR=1.88,95%CI:1.22~2.90,P<0.05)。结论与非甲状腺癌对照组比较,甲状腺癌病例组MUC1呈高表达,且MUC1高表达与淋巴结转移、TNM分期密切相关。MUC1与甲状腺癌的发生和发展存在相关性,有望成为甲状腺癌分子研究领域的一项新靶标。展开更多
文摘目的预测、筛选及合成尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T Lymphocyte,CTL)表位,初步鉴定EWS-FLI1表位肽。方法综合运用BIMAS、SYFPEITHI、Predep和IEDB方案对EWS-FLI1蛋白进行HLA-A^*0201限制性CTL表位的预测,应用多项式方案、量化基序方案对预测的CTL表位进行筛选,并将筛选的CTL表位与HLA-A^*0201分子进行动力学模拟,应用标准Fmoc方案合成CTL表位肽;通过表位多肽刺激CTL释放颗粒溶素的检测,以及靶细胞杀伤实验验证表位多肽的免疫效应。结果综合预测得出了8个可能的表位肽,进一步筛选确定其中4个肽为候选合成表位,应用分子动力模拟初步验证了4个候选表位肽与HLA-A2.1分子的结合力,合成的各条肽经色谱分析纯度均在98%以上,经质谱分析各肽的分子量测定值与理论值相符,颗粒溶素释放实验及靶细胞杀伤实验证实了筛选的表位均能产生刺激效应,其中,表位肽QIQLWQFLL(EWS-FLI1 304)的刺激效应最为显著。结论综合运用多个方案可提高预测效率,分子动力学模拟可初步验证表位肽与HLA-A^*0201的结合力,所合成的多肽为高纯度肽,通过免疫学实验初步鉴定了EWS-FLI1的表位。
文摘目的通过Meta分析探讨甲状腺癌组织中黏蛋白1(MUC1)表达的临床意义及其与各临床病理参数的相关性。方法检索维普、万方、中国知网、中国生物医学文献、PubMed、Web of Science、Embase、Cochrane中英文数据库中关于MUC1在甲状腺癌中表达及其意义的文献,以比值比(OR)和95%置信区间(95%CI)为效应指标,采用STATA 14软件进行Meta分析,并对发表偏倚及敏感性进行检验。结果共纳入13项病例对照研究,甲状腺癌病例组共1157例,非甲状腺癌对照组共509例。结果显示,甲状腺癌病例组MUC1表达明显高于非甲状腺癌对照组(OR=9.78,95%CI:7.49~12.78,P<0.001);伴有淋巴结转移的甲状腺癌组织中MUC1表达高于无淋巴结转移的甲状腺癌组织(OR=3.08,95%CI:1.37~6.92,P<0.05);TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期的甲状腺癌组织中MUC1表达高于TNM分期为Ⅰ~Ⅱ期的甲状腺癌组织(OR=1.88,95%CI:1.22~2.90,P<0.05)。结论与非甲状腺癌对照组比较,甲状腺癌病例组MUC1呈高表达,且MUC1高表达与淋巴结转移、TNM分期密切相关。MUC1与甲状腺癌的发生和发展存在相关性,有望成为甲状腺癌分子研究领域的一项新靶标。