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THE GENE EXPRESSION OF BDNF IN NORMAL RABBIT RETINA
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作者 王建明 胡海涛 +3 位作者 马东亮 孙乃学 赵世平 冯海晓 《Journal of Pharmaceutical Analysis》 SCIE CAS 2004年第2期188-189,192,共3页
Objective To investigate the distribution of bra in-derived neurotrophic factor(BDNF) protein in the rabbit retina. Methods Immune response material in the retina was observed using BDNF antibody by the method of i... Objective To investigate the distribution of bra in-derived neurotrophic factor(BDNF) protein in the rabbit retina. Methods Immune response material in the retina was observed using BDNF antibody by the method of immunohistochemistry. Results BDNF gene expression was mainly found in the RGCs, a lso in innernuclei cells and outernuclei cells in rabbit retina. Conclusion RGC is not only the target cell of BDNF, but also express the BDNF protein. BDNF from multi-sources participates in the regulati on of RGCs. 展开更多
关键词 brain-derived neurotrophic factor(BDNF) gene exp ression retina ganglion cell
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水稻基腐细菌ExpS感受蛋白中Hamp结构域的敲除及功能分析 被引量:1
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作者 杨利平 谭秀明 +1 位作者 周佳暖 刘琼光 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期48-52,共5页
双组分调控系统是细菌中普遍存在和非常保守的一种重要调节机制,研究水稻基腐细菌Dickeya zeae中双组分信号转导系统及其对致病性的调控具有重要的意义.本文通过同源重组、标记置换等分子遗传操作方法,成功敲除了水稻基腐病细菌双组分... 双组分调控系统是细菌中普遍存在和非常保守的一种重要调节机制,研究水稻基腐细菌Dickeya zeae中双组分信号转导系统及其对致病性的调控具有重要的意义.本文通过同源重组、标记置换等分子遗传操作方法,成功敲除了水稻基腐病细菌双组分系统感受蛋白ExpS中的Hamp功能域,获得了Hamp功能片段缺失突变株及互补体.致病性及毒素产生能力测定试验结果表明,Hamp在ExpS/ExpA双组分系统的信号转导途径中起重要作用,调控水稻基腐菌毒素的产生并影响水稻的致病性及烟草的HR反应. 展开更多
关键词 水稻基腐细菌 感受蛋白expS Hamp功能域 基因敲除 致病性
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巨桉EXP基因家族的生物信息学分析 被引量:2
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作者 詹妮 谢耀坚 +1 位作者 陈鸿鹏 刘果 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2018年第6期39-46,共8页
[目的]本研究有助于了解EXP基因家族的基本特征,为深入研究其功能搭建平台。[方法]本研究对从巨桉(Eucalyptus grandis Hill)中筛选出35个EXP基因家族成员(Egr EXP1 Egr EXP35),利用生物信息学方法对其基因特征与表达模式进行综合分析。... [目的]本研究有助于了解EXP基因家族的基本特征,为深入研究其功能搭建平台。[方法]本研究对从巨桉(Eucalyptus grandis Hill)中筛选出35个EXP基因家族成员(Egr EXP1 Egr EXP35),利用生物信息学方法对其基因特征与表达模式进行综合分析。[结果]巨桉EXP基因分布在8条染色体之上,EXP蛋白均定位在细胞质膜上发挥作用,大多数的家族成员具有信号肽。巨桉EXP编码的蛋白质由α-螺旋、延伸链、无规卷曲、β-转角组成。进化分析结果表明,巨桉EXP蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa) EXP蛋白的进化关系接近。35个巨桉EXP基因在巨桉未成熟木质部、成熟叶片、韧皮部、茎尖、木质部以及幼叶组织中表达模式存在显著差异。[结论]EXP基因家族各成员的表达模式不同,Egr EXP17、Egr EXP18可能在巨桉木材形成过程中起重要作用。 展开更多
关键词 巨桉 exp基因 生物信息学分析 表达模式
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膀胱癌患者尿脱落细胞中survivin基因的检测 被引量:10
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作者 蒲小勇 陈一戎 +4 位作者 王志平 付生军 卢建中 史庭恺 马宝良 《中国临床康复》 CSCD 2003年第8期1276-1277,F003,共3页
目的通过对膀胱癌患者尿液脱落细胞中人体细胞凋亡相关基因survivin的检测,探讨可早期发现、常规筛检膀胱癌,且不给患者带来痛苦的方法。方法留取31例膀胱癌患者、20例泌尿系其他良性疾病患者和10例健康志愿者的新鲜中段尿液200ml,用逆... 目的通过对膀胱癌患者尿液脱落细胞中人体细胞凋亡相关基因survivin的检测,探讨可早期发现、常规筛检膀胱癌,且不给患者带来痛苦的方法。方法留取31例膀胱癌患者、20例泌尿系其他良性疾病患者和10例健康志愿者的新鲜中段尿液200ml,用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测survivin的表达;同时行尿脱落细胞学检查。结果用RT-PCR检测尿液中survivin的敏感性为100%,与尿脱落细胞学检相比较,具有很高的敏感性。结论检测尿液中survivin可用于膀胱癌的术前诊断。 展开更多
关键词 膀胱癌 脱落细胞 SURVIVIN 基因 检测 逆转录聚合酶链反应 尿液
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早期小鼠胚胎发育的基因表达 被引量:6
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作者 朱新产 张涌 王宝维 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第2期272-276,共5页
A modification of the mRNA differential display method was used to an alyze differential gene expression during early embryonic development in the mou se. This method detects appropriate changes in the temporal patter... A modification of the mRNA differential display method was used to an alyze differential gene expression during early embryonic development in the mou se. This method detects appropriate changes in the temporal pattern of expressio n of amplicons and proteins by DD PCR and SDS PAGE analysis. In addition, it i ndicates that the activity of genes during early embryonic development was tempo ral; different degrees of activation→expression→translation occurring with cha nging spatio temporal and environmental conditions. The selectivity of gene exp r ession and levels of transcription and translation are a key controlled regulat ed position during early embryonic development in the mouse . 展开更多
关键词 胚胎发育 早期发育 基因表达 瞬时-空间变化模式 哺乳动物 分子调控机制
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应用DNA微阵列对骨髓增生异常综合征患者骨髓单个核细胞基因表达谱的初步研究(英文) 被引量:1
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作者 钱军 陈子兴 +1 位作者 岑建农 王玮 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2004年第5期595-600,共6页
为了探讨应用DNA微阵列研究骨髓增生异常综合征 (MDS)的基因表达谱的可行性 ,将 2例患者骨髓单个核细胞RNA各取等量混合后进行逆转录Cy5标记 ,与Cy3标记的正常对照cDNA混合 ,与H14 1微阵列杂交、扫描、软件分析。结果H14 1s芯片中共点样... 为了探讨应用DNA微阵列研究骨髓增生异常综合征 (MDS)的基因表达谱的可行性 ,将 2例患者骨髓单个核细胞RNA各取等量混合后进行逆转录Cy5标记 ,与Cy3标记的正常对照cDNA混合 ,与H14 1微阵列杂交、扫描、软件分析。结果H14 1s芯片中共点样 13484个基因克隆 ,其中 10 6 4个靶克隆是由针对同一基因内不同序列的cDNA片段重复点样至少 2次。重复点样检测结果表明 :在 2张芯片内各自完全一致的分别为 6 2 5个 (5 8.7% )和6 30个 (5 9.2 % ) ,而存在完全相反结果的cDNA片段分别有 2 1个 (2 .0 % )和 11个 (1.0 % )。 10 6 4个靶克隆中重复点样数据完整且分别在 2张芯片内结果一致的共有 4 11个 ,其中在 2张芯片间结果也完全一致的共有 4 0 0个(97 3% )。 2张芯片中MDS与正常对照比较存在差异表达的靶基因分别为 15 4 9和 1311个 ,而 2张芯片间表达差异一致的靶基因为 4 0 9个 ,其中 10 1个基因参与造血调控 ,主要涉及转录因子、细胞周期调节蛋白、代谢相关基因、表面黏附分子等。结论 :DNA微阵列可用于对MDS患者混合标本的表达谱分析 ,为深入研究MDS的发病分子机理提供线索 ,但需要进行重复实验以降低微阵列操作过程引起的表达偏差。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 DNA微阵列 基因表达谱 骨髓单个核细胞
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一种新的分类方法——属性均值聚类属性支持向量机(AMC-ASVM) 被引量:2
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作者 孙喜晨 贺仁亚 封举富 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第1期82-84,共3页
在属性均值聚类(AMC)与支持向量机(SVM)的基础上,提出了一个新的模式分类算法——基于(属性)聚类的属性支持向量机算法(AMC-ASVM)。主要思想是利用属性均值聚类网络得到的具有概率信息(权重)的样本,来训练属性支持向量机,从而得到分类... 在属性均值聚类(AMC)与支持向量机(SVM)的基础上,提出了一个新的模式分类算法——基于(属性)聚类的属性支持向量机算法(AMC-ASVM)。主要思想是利用属性均值聚类网络得到的具有概率信息(权重)的样本,来训练属性支持向量机,从而得到分类器。这种方法结合了属性聚类的稳定性与属性支持向量机可以利用加权样本的优点,适合处理具有强噪声的数据。另外,该方法也可以看作是堆近邻分类法的自然推广。在实验部分,将其用于结肠癌基因表达数据的处理。实验结果显示了AMC-ASVM在一定程度上优于最近邻,Boosting,堆近邻,SVM等方法。 展开更多
关键词 模式识别 属性均值聚类 支持向量机 基因表达数据
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XIAP基因在慢性髓系白血病中的表达及临床意义 被引量:5
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作者 王术国 管洪在 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2011年第2期321-323,共3页
本研究旨在检测慢性髓系白血病(CML)患者XIAP基因mRNA的表达情况,以探讨其在CML病情进展及预后中的意义。应用染色体R显带技术及实时PCR技术对71例CML患者和10名健康者进行染色体核型分析及XIAP mRNA检测。结果表明,XIAP mRNA在CML的加... 本研究旨在检测慢性髓系白血病(CML)患者XIAP基因mRNA的表达情况,以探讨其在CML病情进展及预后中的意义。应用染色体R显带技术及实时PCR技术对71例CML患者和10名健康者进行染色体核型分析及XIAP mRNA检测。结果表明,XIAP mRNA在CML的加速期和急变期的平均表达水平明显高于慢性期(p<0.01)。XIAP基因在不同核型组的平均表达水平无显著性差异。结论:CML患者加速期和急变期XIAP基因表达明显增高,XIAP基因与CML的病情进展密切相关。 展开更多
关键词 慢性髓系白血病 XIAP基因 基因表达
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BCR/ABL探针在骨髓增殖性疾病中的临床运用
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作者 马金龙 陈宝安 +10 位作者 唐萌 何友吉 丁家华 高冲 王骏 程坚 赵刚 厉智 沈礼 杜海珍 吴芬 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期958-962,共5页
本研究通过回顾分析荧光原位杂交(FISH)检测BCR/ABL融合基因结果,探讨其在慢性骨髓增殖性疾病(CMPD)和Ph+急性淋巴细胞白血病(Ph+ALL)的鉴别诊断及治疗后微小残留病(MRD)动态监测中的运用价值。初诊和治疗后病例分别使用BCR/ABL(ES)和BC... 本研究通过回顾分析荧光原位杂交(FISH)检测BCR/ABL融合基因结果,探讨其在慢性骨髓增殖性疾病(CMPD)和Ph+急性淋巴细胞白血病(Ph+ALL)的鉴别诊断及治疗后微小残留病(MRD)动态监测中的运用价值。初诊和治疗后病例分别使用BCR/ABL(ES)和BCR/ABL(DF)探针检测BCR/ABL融合基因。结果表明:初诊CMPD 49例,形态学符合CML骨髓象28例,确诊CML 23例,形态符合率23/28(82.1%),BCR/ABL阳性23/23,敏感度、特异度均为100%。确诊病例BCR/ABL阳性细胞率为81.3%±17.7%;allo-HSCT 13例,9例长期无病生存,4例复发,经供者淋巴细胞输注(DLI)、伊马替尼或allo-HSCT治疗后多次监测BCR/ABL阴性;伊马替尼治疗16例,其中11例于1年后多次监测BCR/ABL阴性,5例分别于6、7、10年后监测BCR/ABL阳性,其中1例经allo-HSCT成功,BCR/ABL转阴。结论:FISH技术是一项敏感、特异的诊断技术,针对初诊和治疗后病例分别运用两种不同的探针检测BCR/ABL融合基因,有助于准确、快速鉴别诊断CML、Ph+ALL,动态监测酪氨酸激酶抑制剂治疗和allo-HSCT后MRD。 展开更多
关键词 骨髓增殖性疾病 荧光原位杂交 BCR ABL融合基因 微小残留病
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CASP8、Fas基因多态性与汉族非霍奇金淋巴瘤患者预后的关系 被引量:1
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作者 黄燕 胡苏 崔文婷 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1493-1497,共5页
目的:探讨胱天蛋白酶8(CASP8)、脂肪酸合成酶(Fas)基因多态性与汉族非霍奇金淋巴瘤患者预后的关系。方法:回顾性分析85例汉族非霍奇金淋巴瘤患者的临床资料,检测CASP8、Fas基因多态性,统计预后情况,对比不同预后患者CASP8、Fas基因多态... 目的:探讨胱天蛋白酶8(CASP8)、脂肪酸合成酶(Fas)基因多态性与汉族非霍奇金淋巴瘤患者预后的关系。方法:回顾性分析85例汉族非霍奇金淋巴瘤患者的临床资料,检测CASP8、Fas基因多态性,统计预后情况,对比不同预后患者CASP8、Fas基因多态性,探讨基因多态性与患者预后不良的关系。结果:本组85例患者预后不良发生率为65.88%;预后不良与预后良好患者CASP8、Fas基因多态性均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;预后不良患者CASP8基因rs 1035142位点GG基因型频率、等位基因G频率,Fas基因rs 1377位点GA基因型频率、等位基因A频率均明显低于预后良好患者(P<0.05),CASP8基因rs 1035142位点GT、TT基因型频率、等位基因T频率,Fas基因rs 1377位点GG基因型频率和等位基因G频率均明显高于预后良好患者(P<0.05);预后不良患者Ann Arbor分期Ⅲ-Ⅳ期、高度恶性占比均明显高于预后良好患者(P<0.05);Logistic多元回归分析显示,Ann Arbor分期Ⅲ-Ⅳ期、中度恶性、高度恶性、CASP8 rs 1035142 GT基因型、CASP8 rs 1035142 TT基因型、Fas rs 1377 GG基因型均为患者预后不良的危险因素(P<0.05)。结论:汉族非霍奇金淋巴瘤患者预后不良发生率较高,Ann Arbor分期Ⅲ-Ⅳ期、中高度恶性、CASP8 rs 1035142 GT基因型、CASP8 rs 1035142 TT基因型、Fas rs 1377 GG基因型均是其预后不良的危险因素。 展开更多
关键词 胱天蛋白酶8 脂肪酸合成酶 基因多态性 非霍奇金淋巴瘤 预后
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Strategy for the mapping of interactive genes using bulked segregant analysis method and Mapmaker/Exp software 被引量:5
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作者 WU Weiren HUANG Biguang 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2006年第21期2619-2623,共5页
A qualitative trait is usually controlled by a single gene, but it may be sometimes controlled by two or even more genes. This phenomenon is called gene interaction. Rapidly searching for linked mo- lecular markers vi... A qualitative trait is usually controlled by a single gene, but it may be sometimes controlled by two or even more genes. This phenomenon is called gene interaction. Rapidly searching for linked mo- lecular markers via bulked segregant analysis (BSA) and then constructing regional linkage map with Mapmaker/Exp has become a common approach to mapping single major genes. However, methods and computer programs developed for mapping single major genes cannot be simply applied to interactive genes because the genetic patterns of gene interac- tions are quite different from that of single-gene in- heritance. Up to now, experimental methods for quickly screening molecular markers linked to inter- active genes and statistical methods and corre- sponding computer softwares for simultaneously analyzing the linkage relationships of multiple mo- lecular markers to an interactive gene have not been available. To solve this problem, in this paper, we propose a strategy for mapping interactive genes using BSA and Mapmaker/Exp. We demonstrate that all interactive genes can be mapped by the 'BSA + Mapmaker/Exp' strategy using F2 generation (in a few cases, F3 generation is also needed). As BSA and Mapmaker/Exp have been broadly used in gene mapping studies and are well known by many re- searchers, the strategies proposed in this paper will be useful for practical researches. 展开更多
关键词 基因相互作用 基因作图 制图软件 安全
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